MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011989	CGC	2	6	620644	620649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12002	NC_011989	ACT	2	6	620693	620698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_011989	TCA	2	6	620703	620708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_011989	GAT	2	6	620831	620836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147557
12005	NC_011989	GCG	2	6	620838	620843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12006	NC_011989	GCCA	2	8	620867	620874	25 %	0 %	25 %	50 %	222147557
12007	NC_011989	ACG	2	6	620916	620921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12008	NC_011989	A	6	6	620949	620954	100 %	0 %	0 %	0 %	222147557
12009	NC_011989	CG	3	6	620959	620964	0 %	0 %	50 %	50 %	222147557
12010	NC_011989	CCA	2	6	620980	620985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147557
12011	NC_011989	CGC	2	6	621007	621012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147557
12012	NC_011989	CGCT	2	8	621075	621082	0 %	25 %	25 %	50 %	222147557
12013	NC_011989	GGC	2	6	621132	621137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12014	NC_011989	CCG	2	6	621155	621160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147557
12015	NC_011989	CTGA	2	8	621192	621199	25 %	25 %	25 %	25 %	222147557
12016	NC_011989	ACG	2	6	621237	621242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12017	NC_011989	CGG	2	6	621299	621304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12018	NC_011989	GTC	2	6	621315	621320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12019	NC_011989	AAG	2	6	621324	621329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147557
12020	NC_011989	GGA	2	6	621332	621337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147557
12021	NC_011989	AGA	2	6	621469	621474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147557
12022	NC_011989	ATGG	2	8	621509	621516	25 %	25 %	50 %	0 %	222147557
12023	NC_011989	GCC	2	6	621646	621651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147557
12024	NC_011989	GAC	2	6	621732	621737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12025	NC_011989	CGCGC	2	10	621832	621841	0 %	0 %	40 %	60 %	222147557
12026	NC_011989	CCA	2	6	621859	621864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147557
12027	NC_011989	CGG	2	6	621911	621916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12028	NC_011989	TTG	2	6	621930	621935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147557
12029	NC_011989	TGC	2	6	621979	621984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12030	NC_011989	TCAACA	2	12	622006	622017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222147557
12031	NC_011989	CGG	2	6	622148	622153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12032	NC_011989	GGC	2	6	622192	622197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12033	NC_011989	GTC	2	6	622251	622256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12034	NC_011989	CGC	2	6	622267	622272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147557
12035	NC_011989	CCGC	2	8	622307	622314	0 %	0 %	25 %	75 %	222147557
12036	NC_011989	TCG	2	6	622317	622322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12037	NC_011989	TAT	2	6	622332	622337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147557
12038	NC_011989	GCA	2	6	622378	622383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12039	NC_011989	GGT	2	6	622467	622472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147557
12040	NC_011989	CGG	2	6	622489	622494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12041	NC_011989	GGCC	2	8	622529	622536	0 %	0 %	50 %	50 %	222147557
12042	NC_011989	GACC	2	8	622541	622548	25 %	0 %	25 %	50 %	222147557
12043	NC_011989	GGA	2	6	622595	622600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147557
12044	NC_011989	GCAA	2	8	622615	622622	50 %	0 %	25 %	25 %	222147557
12045	NC_011989	CGCC	2	8	622634	622641	0 %	0 %	25 %	75 %	222147557
12046	NC_011989	ATG	2	6	622666	622671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147557
12047	NC_011989	CGG	2	6	622682	622687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147557
12048	NC_011989	TGG	2	6	622709	622714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147557
12049	NC_011989	GGCA	2	8	622739	622746	25 %	0 %	50 %	25 %	222147557
12050	NC_011989	GTC	2	6	622782	622787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147557
12051	NC_011989	GCC	2	6	622797	622802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147557
12052	NC_011989	GAA	2	6	622847	622852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147557
12053	NC_011989	TAT	2	6	622869	622874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147557
12054	NC_011989	TCA	2	6	622878	622883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147557
12055	NC_011989	TCGC	2	8	623013	623020	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12056	NC_011989	TCA	2	6	623022	623027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12057	NC_011989	GAA	2	6	623069	623074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_011989	GCA	2	6	623091	623096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147558
12059	NC_011989	CGGA	2	8	623126	623133	25 %	0 %	50 %	25 %	222147558
12060	NC_011989	GCG	3	9	623154	623162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147558
12061	NC_011989	GCA	2	6	623204	623209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147558
12062	NC_011989	TCAA	2	8	623249	623256	50 %	25 %	0 %	25 %	222147558
12063	NC_011989	GAG	2	6	623299	623304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147558
12064	NC_011989	CCCG	2	8	623374	623381	0 %	0 %	25 %	75 %	222147558
12065	NC_011989	GCC	2	6	623394	623399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147558
12066	NC_011989	GCT	2	6	623400	623405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147558
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12069	NC_011989	TGG	2	6	623591	623596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147558
12070	NC_011989	CAG	2	6	623662	623667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147558
12071	NC_011989	ATG	2	6	623681	623686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147558
12072	NC_011989	GAT	2	6	623854	623859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147558
12073	NC_011989	GCG	2	6	623871	623876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147558
12074	NC_011989	GGGA	2	8	623955	623962	25 %	0 %	75 %	0 %	222147558
12075	NC_011989	AT	3	6	624128	624133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_011989	TCA	2	6	624147	624152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12081	NC_011989	T	6	6	624611	624616	0 %	100 %	0 %	0 %	222147559
12082	NC_011989	GCG	2	6	624753	624758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147560
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12085	NC_011989	TGA	2	6	624903	624908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147560
12086	NC_011989	GC	3	6	624917	624922	0 %	0 %	50 %	50 %	222147560
12087	NC_011989	GTT	2	6	624928	624933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147560
12088	NC_011989	CAT	2	6	624934	624939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147560
12089	NC_011989	GAC	2	6	624985	624990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147560
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12091	NC_011989	CGA	3	9	625236	625244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147560
12092	NC_011989	CCG	2	6	625307	625312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147560
12093	NC_011989	GGC	2	6	625432	625437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147560
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12097	NC_011989	T	7	7	625656	625662	0 %	100 %	0 %	0 %	222147560
12098	NC_011989	TCA	2	6	625697	625702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147560
12099	NC_011989	TCGG	2	8	625720	625727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12100	NC_011989	CT	3	6	625857	625862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12101	NC_011989	CGC	2	6	625954	625959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12102	NC_011989	GGC	2	6	625985	625990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147561
12103	NC_011989	GATT	2	8	626098	626105	25 %	50 %	25 %	0 %	222147561
12104	NC_011989	GCG	2	6	626141	626146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147561
12105	NC_011989	CA	3	6	626171	626176	50 %	0 %	0 %	50 %	222147561
12106	NC_011989	CTG	2	6	626253	626258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147561
12107	NC_011989	CAG	2	6	626273	626278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147561
12108	NC_011989	CGGA	2	8	626300	626307	25 %	0 %	50 %	25 %	222147561
12109	NC_011989	TGG	2	6	626311	626316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147561
12110	NC_011989	CAG	2	6	626348	626353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147561
12111	NC_011989	TCA	2	6	626383	626388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147561
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12114	NC_011989	ATG	2	6	626517	626522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147561
12115	NC_011989	CGGCG	2	10	626524	626533	0 %	0 %	60 %	40 %	222147561
12116	NC_011989	AGG	3	9	626569	626577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147561
12117	NC_011989	GCA	2	6	626578	626583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147561
12118	NC_011989	CAAG	2	8	626710	626717	50 %	0 %	25 %	25 %	222147561
12119	NC_011989	CTT	2	6	626725	626730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147561
12120	NC_011989	TGA	2	6	626875	626880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147561
12121	NC_011989	CAG	2	6	626912	626917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147561
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12123	NC_011989	CGG	2	6	626953	626958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147561
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12227	NC_011989	GGC	2	6	632753	632758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12228	NC_011989	GCCAAT	2	12	633016	633027	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222147568
12229	NC_011989	GATGA	2	10	633223	633232	40 %	20 %	40 %	0 %	222147568
12230	NC_011989	GCA	2	6	633255	633260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147568
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12233	NC_011989	TGA	2	6	633305	633310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147568
12234	NC_011989	GTCAAG	2	12	633535	633546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222147569
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12237	NC_011989	CT	3	6	633788	633793	0 %	50 %	0 %	50 %	222147570
12238	NC_011989	CAA	2	6	633826	633831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147570
12239	NC_011989	CTCG	2	8	633839	633846	0 %	25 %	25 %	50 %	222147570
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12479	NC_011989	TTTG	2	8	644643	644650	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12480	NC_011989	A	6	6	644657	644662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12481	NC_011989	TAA	2	6	644731	644736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12482	NC_011989	AAC	2	6	644743	644748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12483	NC_011989	GTTGG	2	10	644749	644758	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12484	NC_011989	CCTTCA	2	12	644835	644846	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12485	NC_011989	GGC	2	6	644890	644895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147582
12486	NC_011989	GAC	2	6	644932	644937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147582
12487	NC_011989	CAGAA	2	10	644939	644948	60 %	0 %	20 %	20 %	222147582
12488	NC_011989	GCC	2	6	644987	644992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147582
12489	NC_011989	TGC	2	6	645064	645069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147582
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12491	NC_011989	CG	3	6	645150	645155	0 %	0 %	50 %	50 %	222147582
12492	NC_011989	GGACAA	2	12	645166	645177	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222147582
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12497	NC_011989	ACGGT	2	10	645324	645333	20 %	20 %	40 %	20 %	222147582
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12500	NC_011989	ACG	2	6	645537	645542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147582

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