MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011989	GCAG	2	8	594544	594551	25 %	0 %	50 %	25 %	222147540
11502	NC_011989	CCGATC	2	12	594576	594587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222147540
11503	NC_011989	CTG	2	6	594660	594665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
11504	NC_011989	ACC	2	6	594674	594679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147540
11505	NC_011989	CG	3	6	594686	594691	0 %	0 %	50 %	50 %	222147540
11506	NC_011989	GCG	2	6	594768	594773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147540
11507	NC_011989	TGCAT	2	10	594780	594789	20 %	40 %	20 %	20 %	222147540
11508	NC_011989	CGT	2	6	594851	594856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
11509	NC_011989	CGT	2	6	594889	594894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
11510	NC_011989	CAGG	2	8	594923	594930	25 %	0 %	50 %	25 %	222147540
11511	NC_011989	ATC	2	6	594981	594986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147540
11512	NC_011989	GTT	2	6	595132	595137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147540
11513	NC_011989	GAT	2	6	595217	595222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147540
11514	NC_011989	GGA	2	6	595280	595285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147540
11515	NC_011989	ACA	2	6	595350	595355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147540
11516	NC_011989	GCG	2	6	595417	595422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147540
11517	NC_011989	TGG	2	6	595428	595433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147540
11518	NC_011989	CGCAA	2	10	595442	595451	40 %	0 %	20 %	40 %	222147540
11519	NC_011989	TCG	2	6	595572	595577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
11520	NC_011989	CGC	2	6	595629	595634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147540
11521	NC_011989	CTGA	2	8	595688	595695	25 %	25 %	25 %	25 %	222147540
11522	NC_011989	ACA	3	9	595713	595721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147540
11523	NC_011989	AGC	2	6	595868	595873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147540
11524	NC_011989	CTG	2	6	595922	595927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
11525	NC_011989	CGC	2	6	595957	595962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147540
11526	NC_011989	TCG	3	9	595990	595998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147541
11527	NC_011989	GAC	2	6	596032	596037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147541
11528	NC_011989	TCG	3	9	596075	596083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147541
11529	NC_011989	ACC	2	6	596153	596158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147541
11530	NC_011989	CAA	2	6	596265	596270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147541
11531	NC_011989	CATTC	2	10	596274	596283	20 %	40 %	0 %	40 %	222147541
11532	NC_011989	ACG	2	6	596297	596302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_011989	TCA	2	6	596327	596332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_011989	G	9	9	596350	596358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_011989	GAT	2	6	596374	596379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_011989	CTG	2	6	596387	596392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_011989	TG	3	6	596391	596396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_011989	GCC	2	6	596455	596460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11539	NC_011989	TGA	2	6	596486	596491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_011989	GCT	2	6	596622	596627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147542
11541	NC_011989	CAC	2	6	596654	596659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147542
11542	NC_011989	TGA	2	6	596685	596690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147542
11543	NC_011989	GCGTG	2	10	596695	596704	0 %	20 %	60 %	20 %	222147542
11544	NC_011989	GCT	3	9	596800	596808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147543
11545	NC_011989	CCA	2	6	596977	596982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147543
11546	NC_011989	GATC	2	8	597006	597013	25 %	25 %	25 %	25 %	222147543
11547	NC_011989	ACTT	2	8	597069	597076	25 %	50 %	0 %	25 %	222147543
11548	NC_011989	CAT	2	6	597195	597200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
11549	NC_011989	GAC	2	6	597226	597231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147543
11550	NC_011989	AAG	2	6	597284	597289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147543
11551	NC_011989	CTA	2	6	597316	597321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
11552	NC_011989	CCA	2	6	597451	597456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147543
11553	NC_011989	TTCA	2	8	597630	597637	25 %	50 %	0 %	25 %	222147543
11554	NC_011989	CAT	2	6	597854	597859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
11555	NC_011989	ATC	3	9	597876	597884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
11556	NC_011989	CTT	2	6	597902	597907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147543
11557	NC_011989	ATCC	2	8	597944	597951	25 %	25 %	0 %	50 %	222147543
11558	NC_011989	ACA	2	6	597973	597978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147543
11559	NC_011989	GCG	2	6	598048	598053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147543
11560	NC_011989	ACC	2	6	598068	598073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147543
11561	NC_011989	GATC	2	8	598142	598149	25 %	25 %	25 %	25 %	222147543
11562	NC_011989	CTG	2	6	598157	598162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147543
11563	NC_011989	ATA	2	6	598174	598179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147543
11564	NC_011989	GTT	2	6	598197	598202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147543
11565	NC_011989	GGT	2	6	598293	598298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147543
11566	NC_011989	CCG	2	6	598348	598353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147543
11567	NC_011989	CAA	2	6	598379	598384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147543
11568	NC_011989	TTG	2	6	598399	598404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147543
11569	NC_011989	CGG	2	6	598421	598426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147543
11570	NC_011989	GGC	2	6	598457	598462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147543
11571	NC_011989	GAGC	2	8	598577	598584	25 %	0 %	50 %	25 %	222147543
11572	NC_011989	AAG	2	6	598657	598662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147543
11573	NC_011989	GCTG	2	8	598693	598700	0 %	25 %	50 %	25 %	222147543
11574	NC_011989	CTG	2	6	598745	598750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147543
11575	NC_011989	CG	3	6	598785	598790	0 %	0 %	50 %	50 %	222147543
11576	NC_011989	TGG	2	6	598795	598800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147543
11577	NC_011989	A	6	6	598932	598937	100 %	0 %	0 %	0 %	222147544
11578	NC_011989	GATA	2	8	598965	598972	50 %	25 %	25 %	0 %	222147544
11579	NC_011989	CG	3	6	598996	599001	0 %	0 %	50 %	50 %	222147544
11580	NC_011989	CTC	2	6	599059	599064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147544
11581	NC_011989	AGC	2	6	599087	599092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147544
11582	NC_011989	GAC	2	6	599285	599290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147544
11583	NC_011989	GTC	2	6	599327	599332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147544
11584	NC_011989	CCAT	2	8	599348	599355	25 %	25 %	0 %	50 %	222147544
11585	NC_011989	CGTGG	2	10	599369	599378	0 %	20 %	60 %	20 %	222147544
11586	NC_011989	CAA	2	6	599458	599463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147544
11587	NC_011989	GCAGT	2	10	599469	599478	20 %	20 %	40 %	20 %	222147544
11588	NC_011989	TCG	2	6	599487	599492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147544
11589	NC_011989	GTC	2	6	599523	599528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147544
11590	NC_011989	TCT	2	6	599607	599612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147544
11591	NC_011989	AGT	2	6	599667	599672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_011989	CCT	2	6	599692	599697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_011989	T	6	6	599798	599803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_011989	CCA	2	6	599835	599840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11595	NC_011989	CTG	2	6	599845	599850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_011989	TGT	2	6	599878	599883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_011989	CAT	2	6	599932	599937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_011989	TGA	2	6	599999	600004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_011989	TTGCG	2	10	600107	600116	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11600	NC_011989	TAA	2	6	600179	600184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_011989	TGA	2	6	600185	600190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_011989	ATCG	2	8	600204	600211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11603	NC_011989	TTTA	2	8	600224	600231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_011989	CGA	2	6	600355	600360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_011989	TCG	2	6	600389	600394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
11606	NC_011989	GTC	2	6	600475	600480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
11607	NC_011989	GCT	2	6	600501	600506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
11608	NC_011989	GTC	2	6	600520	600525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
11609	NC_011989	CAG	2	6	600538	600543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147545
11610	NC_011989	CCG	2	6	600605	600610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11611	NC_011989	GGA	2	6	600618	600623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_011989	GC	3	6	600790	600795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_011989	GGC	2	6	600873	600878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_011989	CAT	2	6	600917	600922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_011989	TCT	2	6	601026	601031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_011989	ATG	2	6	601040	601045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_011989	TGG	2	6	601140	601145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_011989	CGA	2	6	601178	601183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_011989	GCG	2	6	601258	601263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_011989	TCCAA	2	10	601288	601297	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11622	NC_011989	CCA	2	6	601358	601363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147546
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11991	NC_011989	CTG	2	6	620155	620160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147556
11992	NC_011989	CGG	2	6	620181	620186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147556
11993	NC_011989	GGT	2	6	620212	620217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147556
11994	NC_011989	GGC	2	6	620218	620223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147556
11995	NC_011989	GATC	2	8	620280	620287	25 %	25 %	25 %	25 %	222147556
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11998	NC_011989	GTA	2	6	620541	620546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11999	NC_011989	CATT	2	8	620555	620562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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