MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011989	AGGC	2	8	514883	514890	25 %	0 %	50 %	25 %	222147473
10002	NC_011989	GCC	2	6	514895	514900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147473
10003	NC_011989	GCGTC	2	10	515098	515107	0 %	20 %	40 %	40 %	222147473
10004	NC_011989	GTT	2	6	515123	515128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147473
10005	NC_011989	TCC	2	6	515209	515214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_011989	CGGC	2	8	515221	515228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_011989	TCC	2	6	515230	515235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_011989	GAA	2	6	515303	515308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_011989	AT	3	6	515385	515390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_011989	AGG	2	6	515421	515426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_011989	GTT	2	6	515468	515473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_011989	CTG	2	6	515492	515497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_011989	GCC	2	6	515511	515516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_011989	GGGGA	2	10	515553	515562	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_011989	GCC	2	6	515656	515661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147474
10016	NC_011989	TCG	2	6	515708	515713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10017	NC_011989	TGA	2	6	515766	515771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147474
10018	NC_011989	CGG	2	6	515782	515787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147474
10019	NC_011989	GCC	2	6	515857	515862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147474
10020	NC_011989	TGC	2	6	515863	515868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10021	NC_011989	GCCC	2	8	516021	516028	0 %	0 %	25 %	75 %	222147474
10022	NC_011989	TGGC	2	8	516057	516064	0 %	25 %	50 %	25 %	222147474
10023	NC_011989	AGT	2	6	516065	516070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147474
10024	NC_011989	GC	3	6	516112	516117	0 %	0 %	50 %	50 %	222147474
10025	NC_011989	GAA	2	6	516203	516208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147474
10026	NC_011989	CGC	2	6	516280	516285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147474
10027	NC_011989	GGAC	2	8	516337	516344	25 %	0 %	50 %	25 %	222147474
10028	NC_011989	CA	3	6	516361	516366	50 %	0 %	0 %	50 %	222147474
10029	NC_011989	GC	3	6	516387	516392	0 %	0 %	50 %	50 %	222147474
10030	NC_011989	CAG	2	6	516431	516436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10031	NC_011989	AGC	2	6	516474	516479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10032	NC_011989	TTGCCA	2	12	516534	516545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222147474
10033	NC_011989	TGG	2	6	516667	516672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147474
10034	NC_011989	CAT	2	6	516731	516736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147474
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10037	NC_011989	TC	3	6	516931	516936	0 %	50 %	0 %	50 %	222147474
10038	NC_011989	ATC	2	6	517051	517056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147474
10039	NC_011989	CTG	2	6	517070	517075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10040	NC_011989	GAC	2	6	517085	517090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10041	NC_011989	CAG	2	6	517172	517177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10042	NC_011989	TC	3	6	517186	517191	0 %	50 %	0 %	50 %	222147474
10043	NC_011989	GGC	2	6	517255	517260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147474
10044	NC_011989	CGA	2	6	517285	517290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10045	NC_011989	TCG	2	6	517296	517301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10046	NC_011989	GGC	2	6	517303	517308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147474
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10049	NC_011989	CGGGG	2	10	517445	517454	0 %	0 %	80 %	20 %	222147474
10050	NC_011989	ACCGT	2	10	517467	517476	20 %	20 %	20 %	40 %	222147474
10051	NC_011989	CCG	2	6	517531	517536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147474
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10057	NC_011989	GAT	2	6	517822	517827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147474
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10062	NC_011989	GC	3	6	518042	518047	0 %	0 %	50 %	50 %	222147474
10063	NC_011989	CGC	2	6	518050	518055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147474
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10069	NC_011989	GGC	2	6	518188	518193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147474
10070	NC_011989	GGC	3	9	518222	518230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147474
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10081	NC_011989	GC	3	6	518725	518730	0 %	0 %	50 %	50 %	222147474
10082	NC_011989	GCG	2	6	518921	518926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147474
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10085	NC_011989	CCT	2	6	519030	519035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147474
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10088	NC_011989	CTG	2	6	519117	519122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147474
10089	NC_011989	AATG	2	8	519169	519176	50 %	25 %	25 %	0 %	222147474
10090	NC_011989	CAA	2	6	519280	519285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147474
10091	NC_011989	TGG	2	6	519448	519453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_011989	GTC	2	6	519460	519465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_011989	GA	3	6	519542	519547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_011989	GC	3	6	519548	519553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_011989	CGAA	2	8	519589	519596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_011989	AC	3	6	519617	519622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_011989	T	6	6	519692	519697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_011989	CGG	2	6	519782	519787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_011989	TCA	2	6	519865	519870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147475
10100	NC_011989	TC	3	6	519899	519904	0 %	50 %	0 %	50 %	222147475
10101	NC_011989	CGG	3	9	519920	519928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147475
10102	NC_011989	TCT	2	6	519952	519957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147475
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10104	NC_011989	CGT	2	6	519971	519976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147475
10105	NC_011989	GGT	2	6	520001	520006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147475
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10107	NC_011989	TGC	2	6	520075	520080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147475
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10109	NC_011989	TGC	2	6	520180	520185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147475
10110	NC_011989	TGCGC	2	10	520226	520235	0 %	20 %	40 %	40 %	222147475
10111	NC_011989	AGC	2	6	520249	520254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147475
10112	NC_011989	GCC	2	6	520267	520272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147475
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10114	NC_011989	ATCT	2	8	520332	520339	25 %	50 %	0 %	25 %	222147475
10115	NC_011989	TCG	2	6	520372	520377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147475
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10121	NC_011989	AGGCCA	2	12	520519	520530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147475
10122	NC_011989	ATT	2	6	520531	520536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147475
10123	NC_011989	TGA	2	6	520564	520569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147475
10124	NC_011989	GC	3	6	520585	520590	0 %	0 %	50 %	50 %	222147475
10125	NC_011989	GCG	2	6	520621	520626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147475
10126	NC_011989	CTG	2	6	520641	520646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147475
10127	NC_011989	CTG	2	6	520650	520655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147475
10128	NC_011989	TGA	2	6	520693	520698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147475
10129	NC_011989	GTG	2	6	520722	520727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147475
10130	NC_011989	GAT	2	6	520741	520746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147475
10131	NC_011989	TCC	2	6	520758	520763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10132	NC_011989	GCG	2	6	520808	520813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147476
10133	NC_011989	CCA	2	6	520878	520883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147476
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10141	NC_011989	GCG	2	6	521391	521396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147476
10142	NC_011989	CTGCGC	2	12	521417	521428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222147476
10143	NC_011989	GTG	2	6	521429	521434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147476
10144	NC_011989	TGC	2	6	521464	521469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147476
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10150	NC_011989	GTC	2	6	521801	521806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147477
10151	NC_011989	CCG	2	6	521880	521885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147477
10152	NC_011989	AAGG	2	8	521897	521904	50 %	0 %	50 %	0 %	222147477
10153	NC_011989	CGA	2	6	521983	521988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147477
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10180	NC_011989	CAG	2	6	523587	523592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147478
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10226	NC_011989	GCTGC	2	10	526020	526029	0 %	20 %	40 %	40 %	222147480
10227	NC_011989	GCC	2	6	526101	526106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10228	NC_011989	TGG	2	6	526207	526212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147481
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10230	NC_011989	CGC	2	6	526384	526389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147481
10231	NC_011989	CCGGGG	2	12	526439	526450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147481
10232	NC_011989	CAA	2	6	526586	526591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147481
10233	NC_011989	CAAGGC	2	12	526664	526675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147481
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10235	NC_011989	CTG	2	6	526763	526768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147481
10236	NC_011989	CGT	2	6	526910	526915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147481
10237	NC_011989	CTG	2	6	526926	526931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147481
10238	NC_011989	GCC	2	6	527058	527063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147481
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10240	NC_011989	GCC	2	6	527106	527111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147481
10241	NC_011989	CAA	2	6	527132	527137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147481
10242	NC_011989	GCA	2	6	527198	527203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147481
10243	NC_011989	GAT	2	6	527256	527261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147481
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10245	NC_011989	CAA	2	6	527433	527438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147481
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10281	NC_011989	AGA	2	6	529688	529693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10284	NC_011989	GGT	2	6	529838	529843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10312	NC_011989	AAGA	2	8	530595	530602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10328	NC_011989	TATCT	2	10	531440	531449	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10329	NC_011989	C	6	6	531488	531493	0 %	0 %	0 %	100 %	222147485
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10346	NC_011989	GAGCC	2	10	532544	532553	20 %	0 %	40 %	40 %	222147485
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10356	NC_011989	CCCG	2	8	533216	533223	0 %	0 %	25 %	75 %	222147485
10357	NC_011989	CTGG	2	8	533254	533261	0 %	25 %	50 %	25 %	222147485
10358	NC_011989	TGC	2	6	533283	533288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147485
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10482	NC_011989	TGG	2	6	539372	539377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147490
10483	NC_011989	TCC	2	6	539399	539404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147490
10484	NC_011989	TCG	2	6	539477	539482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147490
10485	NC_011989	CCG	2	6	539506	539511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147490
10486	NC_011989	CTG	2	6	539534	539539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147490
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10488	NC_011989	GCTT	2	8	539614	539621	0 %	50 %	25 %	25 %	222147490
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10490	NC_011989	CGG	2	6	539643	539648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147490
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