MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_011989	ACA	2	6	383016	383021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147362
7502	NC_011989	CATCA	2	10	383033	383042	40 %	20 %	0 %	40 %	222147362
7503	NC_011989	CG	3	6	383113	383118	0 %	0 %	50 %	50 %	222147362
7504	NC_011989	CTA	2	6	383134	383139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147362
7505	NC_011989	CAT	2	6	383177	383182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147362
7506	NC_011989	ATT	2	6	383226	383231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147362
7507	NC_011989	GGCGA	2	10	383258	383267	20 %	0 %	60 %	20 %	222147362
7508	NC_011989	GCG	2	6	383330	383335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147362
7509	NC_011989	CGA	2	6	383362	383367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147362
7510	NC_011989	TGC	3	9	383383	383391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147362
7511	NC_011989	GCCA	2	8	383408	383415	25 %	0 %	25 %	50 %	222147362
7512	NC_011989	GCAG	2	8	383458	383465	25 %	0 %	50 %	25 %	222147362
7513	NC_011989	TCG	2	6	383493	383498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147362
7514	NC_011989	GTG	2	6	383555	383560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147362
7515	NC_011989	GGAT	2	8	383577	383584	25 %	25 %	50 %	0 %	222147362
7516	NC_011989	CGA	2	6	383587	383592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147362
7517	NC_011989	CGA	2	6	383620	383625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147362
7518	NC_011989	CTGG	2	8	383627	383634	0 %	25 %	50 %	25 %	222147362
7519	NC_011989	CT	3	6	383644	383649	0 %	50 %	0 %	50 %	222147362
7520	NC_011989	ATAG	2	8	383695	383702	50 %	25 %	25 %	0 %	222147362
7521	NC_011989	TTA	2	6	383703	383708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_011989	ACA	2	6	383712	383717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_011989	GCC	2	6	383755	383760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7524	NC_011989	GCCT	2	8	383801	383808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7525	NC_011989	AGGAA	2	10	383894	383903	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_011989	GAA	2	6	383917	383922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147363
7527	NC_011989	GGC	2	6	383941	383946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147363
7528	NC_011989	CTG	2	6	383951	383956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147363
7529	NC_011989	CTCCAC	3	18	384000	384017	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	222147363
7530	NC_011989	CGC	2	6	384018	384023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147363
7531	NC_011989	GAT	3	9	384064	384072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147363
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7533	NC_011989	GAAG	2	8	384142	384149	50 %	0 %	50 %	0 %	222147363
7534	NC_011989	GCT	2	6	384158	384163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147363
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7536	NC_011989	CCG	3	9	384353	384361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147363
7537	NC_011989	GAC	2	6	384383	384388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147363
7538	NC_011989	TGA	2	6	384403	384408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147363
7539	NC_011989	GCGA	2	8	384477	384484	25 %	0 %	50 %	25 %	222147363
7540	NC_011989	GGT	2	6	384488	384493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147363
7541	NC_011989	GAT	2	6	384511	384516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147363
7542	NC_011989	GGT	2	6	384533	384538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147363
7543	NC_011989	CTG	2	6	384557	384562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147363
7544	NC_011989	GCG	2	6	384614	384619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147363
7545	NC_011989	GCT	2	6	384697	384702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147363
7546	NC_011989	TTGC	2	8	384710	384717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7547	NC_011989	T	6	6	384790	384795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_011989	CAT	2	6	384827	384832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_011989	TCC	2	6	384849	384854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147364
7550	NC_011989	CGG	2	6	384871	384876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147364
7551	NC_011989	CTG	2	6	384902	384907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147364
7552	NC_011989	GCGCAG	2	12	384934	384945	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222147364
7553	NC_011989	CTGG	2	8	384967	384974	0 %	25 %	50 %	25 %	222147364
7554	NC_011989	CGG	2	6	385048	385053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147364
7555	NC_011989	CATT	2	8	385054	385061	25 %	50 %	0 %	25 %	222147364
7556	NC_011989	CCA	2	6	385066	385071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147364
7557	NC_011989	GGC	2	6	385073	385078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147364
7558	NC_011989	CTG	2	6	385082	385087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147364
7559	NC_011989	CGG	2	6	385111	385116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147364
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7563	NC_011989	TCG	2	6	385431	385436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147364
7564	NC_011989	TGA	2	6	385444	385449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147364
7565	NC_011989	TTG	2	6	385503	385508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147364
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7572	NC_011989	CGGCG	2	10	385909	385918	0 %	0 %	60 %	40 %	222147364
7573	NC_011989	GCCA	2	8	386021	386028	25 %	0 %	25 %	50 %	222147364
7574	NC_011989	GCA	2	6	386095	386100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147364
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7578	NC_011989	TGA	2	6	386272	386277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147364
7579	NC_011989	GCG	2	6	386331	386336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147364
7580	NC_011989	TGC	2	6	386339	386344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147364
7581	NC_011989	GGC	2	6	386357	386362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147364
7582	NC_011989	TGA	2	6	386371	386376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147364
7583	NC_011989	TCT	2	6	386377	386382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147364
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7585	NC_011989	TCG	3	9	386563	386571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147364
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7587	NC_011989	GCC	2	6	386715	386720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7588	NC_011989	TCA	2	6	386758	386763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_011989	C	6	6	386769	386774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7590	NC_011989	GA	3	6	386896	386901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_011989	GAGC	2	8	387011	387018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7592	NC_011989	AC	3	6	387048	387053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7593	NC_011989	CGT	2	6	387175	387180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_011989	A	7	7	387239	387245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_011989	GAA	2	6	387280	387285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_011989	TG	3	6	387384	387389	0 %	50 %	50 %	0 %	222147365
7597	NC_011989	GGA	2	6	387392	387397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147365
7598	NC_011989	GGCCA	2	10	387455	387464	20 %	0 %	40 %	40 %	222147365
7599	NC_011989	GCC	2	6	387473	387478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147365
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7602	NC_011989	GGT	2	6	387614	387619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147365
7603	NC_011989	GCA	2	6	387651	387656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147365
7604	NC_011989	ATGA	2	8	387671	387678	50 %	25 %	25 %	0 %	222147365
7605	NC_011989	CGG	2	6	387810	387815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147365
7606	NC_011989	TCG	2	6	387921	387926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147365
7607	NC_011989	CCA	2	6	387931	387936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147365
7608	NC_011989	TGAT	2	8	387984	387991	25 %	50 %	25 %	0 %	222147365
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7611	NC_011989	GGCG	2	8	388075	388082	0 %	0 %	75 %	25 %	222147365
7612	NC_011989	TCG	2	6	388095	388100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147365
7613	NC_011989	TGA	2	6	388189	388194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147365
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7990	NC_011989	CGG	2	6	408100	408105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147384
7991	NC_011989	GCA	2	6	408226	408231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147384
7992	NC_011989	GGA	2	6	408236	408241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147384
7993	NC_011989	CGC	2	6	408277	408282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147384
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7995	NC_011989	GCC	2	6	408431	408436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147384
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7997	NC_011989	GCC	3	9	408512	408520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147384
7998	NC_011989	ATG	2	6	408540	408545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147384
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8000	NC_011989	AGC	2	6	408624	408629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147384

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