MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_011989	CGG	2	6	3221456	3221461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149842
64002	NC_011989	GCA	2	6	3221606	3221611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64003	NC_011989	AGGTGA	2	12	3221693	3221704	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222149842
64004	NC_011989	GCT	2	6	3221745	3221750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64005	NC_011989	CGT	2	6	3221787	3221792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64006	NC_011989	TGC	2	6	3221798	3221803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64007	NC_011989	TGC	2	6	3221831	3221836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64008	NC_011989	ATCGT	2	10	3221950	3221959	20 %	40 %	20 %	20 %	222149842
64009	NC_011989	CGGTCG	2	12	3221996	3222007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222149842
64010	NC_011989	TGC	2	6	3222101	3222106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64011	NC_011989	AAT	2	6	3222149	3222154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149842
64012	NC_011989	GTC	2	6	3222231	3222236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64013	NC_011989	ACC	2	6	3222243	3222248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149842
64014	NC_011989	CGA	2	6	3222266	3222271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64015	NC_011989	TGC	2	6	3222347	3222352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64016	NC_011989	CACCGT	2	12	3222408	3222419	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222149842
64017	NC_011989	TGA	2	6	3222500	3222505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64018	NC_011989	GCC	2	6	3222519	3222524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64019	NC_011989	CCG	2	6	3222613	3222618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64020	NC_011989	TCG	2	6	3222643	3222648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64021	NC_011989	ACC	2	6	3222661	3222666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149842
64022	NC_011989	CAG	2	6	3222711	3222716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64023	NC_011989	GCC	2	6	3222744	3222749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64024	NC_011989	GTC	2	6	3222774	3222779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64025	NC_011989	ATC	2	6	3222781	3222786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149842
64026	NC_011989	GCC	2	6	3222789	3222794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64027	NC_011989	TTG	2	6	3222829	3222834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149842
64028	NC_011989	TGA	2	6	3222875	3222880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64029	NC_011989	TGA	2	6	3222908	3222913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64030	NC_011989	GAA	2	6	3222986	3222991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149842
64031	NC_011989	CCG	2	6	3223003	3223008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64032	NC_011989	GTC	2	6	3223018	3223023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64033	NC_011989	CCAC	2	8	3223126	3223133	25 %	0 %	0 %	75 %	222149842
64034	NC_011989	CGG	2	6	3223229	3223234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149842
64035	NC_011989	CAC	2	6	3223238	3223243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149842
64036	NC_011989	GCC	2	6	3223278	3223283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64037	NC_011989	ATG	2	6	3223294	3223299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64038	NC_011989	GTC	2	6	3223365	3223370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64039	NC_011989	GCC	2	6	3223515	3223520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64040	NC_011989	GAT	2	6	3223659	3223664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64041	NC_011989	TCG	2	6	3223720	3223725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64042	NC_011989	GCC	2	6	3223752	3223757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64043	NC_011989	GAACCG	2	12	3223783	3223794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64044	NC_011989	TTC	2	6	3223831	3223836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149842
64045	NC_011989	ATG	3	9	3223870	3223878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64046	NC_011989	GAT	2	6	3223929	3223934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64047	NC_011989	CCG	2	6	3223951	3223956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64048	NC_011989	CACGGT	2	12	3223977	3223988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64049	NC_011989	ACC	2	6	3223995	3224000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149842
64050	NC_011989	ACG	2	6	3224068	3224073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64051	NC_011989	CCG	2	6	3224078	3224083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64052	NC_011989	CCG	2	6	3224086	3224091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64053	NC_011989	GCC	2	6	3224110	3224115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64054	NC_011989	GCC	2	6	3224124	3224129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64055	NC_011989	TTG	2	6	3224263	3224268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149842
64056	NC_011989	ACG	2	6	3224344	3224349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64057	NC_011989	GAT	2	6	3224367	3224372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64058	NC_011989	ATG	2	6	3224410	3224415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64059	NC_011989	GATC	2	8	3224441	3224448	25 %	25 %	25 %	25 %	222149842
64060	NC_011989	GCC	2	6	3224496	3224501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64061	NC_011989	TAT	2	6	3224534	3224539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222149842
64062	NC_011989	CGGAGC	2	12	3224564	3224575	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222149842
64063	NC_011989	CGAG	2	8	3224576	3224583	25 %	0 %	50 %	25 %	222149842
64064	NC_011989	ATC	2	6	3224700	3224705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149842
64065	NC_011989	GCC	2	6	3224706	3224711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64066	NC_011989	CGC	2	6	3224771	3224776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64067	NC_011989	GGT	2	6	3224880	3224885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149842
64068	NC_011989	ATG	2	6	3224893	3224898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64069	NC_011989	TTG	3	9	3224947	3224955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149842
64070	NC_011989	TCG	2	6	3224983	3224988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64071	NC_011989	GATC	2	8	3224993	3225000	25 %	25 %	25 %	25 %	222149842
64072	NC_011989	GCC	2	6	3225003	3225008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64073	NC_011989	ATA	2	6	3225028	3225033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149842
64074	NC_011989	GAT	2	6	3225054	3225059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149842
64075	NC_011989	GCC	2	6	3225087	3225092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64076	NC_011989	GATC	2	8	3225131	3225138	25 %	25 %	25 %	25 %	222149842
64077	NC_011989	GCC	2	6	3225141	3225146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64078	NC_011989	CCT	2	6	3225155	3225160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149842
64079	NC_011989	CCA	2	6	3225187	3225192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149842
64080	NC_011989	GCC	2	6	3225258	3225263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64081	NC_011989	AC	3	6	3225290	3225295	50 %	0 %	0 %	50 %	222149842
64082	NC_011989	CGTGA	2	10	3225303	3225312	20 %	20 %	40 %	20 %	222149842
64083	NC_011989	CGA	2	6	3225329	3225334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64084	NC_011989	ATC	2	6	3225390	3225395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149842
64085	NC_011989	GTC	2	6	3225450	3225455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64086	NC_011989	GCCA	2	8	3225462	3225469	25 %	0 %	25 %	50 %	222149842
64087	NC_011989	GCC	3	9	3225501	3225509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64088	NC_011989	CGC	2	6	3225566	3225571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64089	NC_011989	CGA	2	6	3225749	3225754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149842
64090	NC_011989	GCC	2	6	3225882	3225887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149842
64091	NC_011989	CAT	2	6	3225917	3225922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149842
64092	NC_011989	CCA	3	9	3225955	3225963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149842
64093	NC_011989	AAT	2	6	3226002	3226007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149842
64094	NC_011989	TTA	2	6	3226060	3226065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222149842
64095	NC_011989	CAA	2	6	3226115	3226120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149842
64096	NC_011989	GAAGC	2	10	3226168	3226177	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64097	NC_011989	GCC	2	6	3226331	3226336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149843
64098	NC_011989	CGA	2	6	3226362	3226367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149843
64099	NC_011989	AGA	2	6	3226379	3226384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149843
64100	NC_011989	CAC	2	6	3226399	3226404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149843
64101	NC_011989	ATG	2	6	3226499	3226504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149843
64102	NC_011989	CCG	2	6	3226539	3226544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149843
64103	NC_011989	CAG	2	6	3226555	3226560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149843
64104	NC_011989	CAG	2	6	3226576	3226581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149843
64105	NC_011989	CGA	2	6	3226617	3226622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149843
64106	NC_011989	AGCG	2	8	3226646	3226653	25 %	0 %	50 %	25 %	222149843
64107	NC_011989	CCAGC	2	10	3226684	3226693	20 %	0 %	20 %	60 %	222149843
64108	NC_011989	GCC	2	6	3226703	3226708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149843
64109	NC_011989	GC	3	6	3226722	3226727	0 %	0 %	50 %	50 %	222149843
64110	NC_011989	CAC	2	6	3226914	3226919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149843
64111	NC_011989	CT	3	6	3226926	3226931	0 %	50 %	0 %	50 %	222149843
64112	NC_011989	CTC	2	6	3226944	3226949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64113	NC_011989	CCG	2	6	3226979	3226984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64114	NC_011989	CGA	2	6	3227009	3227014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64115	NC_011989	GCG	2	6	3227042	3227047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64116	NC_011989	CCG	2	6	3227075	3227080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149844
64117	NC_011989	GC	3	6	3227097	3227102	0 %	0 %	50 %	50 %	222149844
64118	NC_011989	GCG	2	6	3227172	3227177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149844
64119	NC_011989	GCACCG	2	12	3227189	3227200	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222149844
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64220	NC_011989	TGAA	2	8	3232286	3232293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64221	NC_011989	ATC	2	6	3232336	3232341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64222	NC_011989	AGA	2	6	3232450	3232455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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64229	NC_011989	TCC	2	6	3232663	3232668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149847
64230	NC_011989	CGA	2	6	3232695	3232700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149847
64231	NC_011989	CGG	2	6	3232752	3232757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
64232	NC_011989	CCG	2	6	3232832	3232837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149847
64233	NC_011989	GGC	3	9	3232876	3232884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
64234	NC_011989	CCCTAT	2	12	3232972	3232983	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222149847
64235	NC_011989	ATC	2	6	3233011	3233016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149847
64236	NC_011989	TCAAGG	2	12	3233102	3233113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222149847
64237	NC_011989	ACG	2	6	3233126	3233131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149847
64238	NC_011989	GGC	3	9	3233203	3233211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
64239	NC_011989	CCGTG	2	10	3233229	3233238	0 %	20 %	40 %	40 %	222149847
64240	NC_011989	GCC	2	6	3233308	3233313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149847
64241	NC_011989	ATC	2	6	3233326	3233331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149847
64242	NC_011989	CCA	2	6	3233408	3233413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149847
64243	NC_011989	GGC	2	6	3233419	3233424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
64244	NC_011989	GTGAT	2	10	3233483	3233492	20 %	40 %	40 %	0 %	222149847
64245	NC_011989	CCCGG	2	10	3233542	3233551	0 %	0 %	40 %	60 %	222149847
64246	NC_011989	CCA	3	9	3233564	3233572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149847
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64248	NC_011989	GCT	2	6	3233613	3233618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149847
64249	NC_011989	GCTG	2	8	3233626	3233633	0 %	25 %	50 %	25 %	222149847
64250	NC_011989	TCCG	2	8	3233707	3233714	0 %	25 %	25 %	50 %	222149847
64251	NC_011989	TTC	2	6	3233797	3233802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149847
64252	NC_011989	GGC	2	6	3233803	3233808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
64253	NC_011989	CAA	2	6	3233865	3233870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149847
64254	NC_011989	ATG	2	6	3233984	3233989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149847
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64256	NC_011989	GC	3	6	3234077	3234082	0 %	0 %	50 %	50 %	222149847
64257	NC_011989	CGC	2	6	3234120	3234125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149847
64258	NC_011989	CG	3	6	3234188	3234193	0 %	0 %	50 %	50 %	222149847
64259	NC_011989	TC	3	6	3234291	3234296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64260	NC_011989	GC	3	6	3234304	3234309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64261	NC_011989	A	6	6	3234320	3234325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64262	NC_011989	CTG	2	6	3234373	3234378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149848
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64266	NC_011989	CAA	2	6	3234420	3234425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149848
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64270	NC_011989	GTCCT	2	10	3234613	3234622	0 %	40 %	20 %	40 %	222149848
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64291	NC_011989	TGG	2	6	3235629	3235634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149849
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64302	NC_011989	CTG	2	6	3236277	3236282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149850
64303	NC_011989	CGC	2	6	3236384	3236389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149850
64304	NC_011989	CGA	2	6	3236414	3236419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149850
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64331	NC_011989	CAG	2	6	3237791	3237796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149851
64332	NC_011989	CAT	2	6	3237800	3237805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149851
64333	NC_011989	TGA	2	6	3237814	3237819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149851
64334	NC_011989	TTGC	2	8	3237842	3237849	0 %	50 %	25 %	25 %	222149851
64335	NC_011989	CAG	2	6	3237851	3237856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149851
64336	NC_011989	CGACA	2	10	3237917	3237926	40 %	0 %	20 %	40 %	222149851
64337	NC_011989	CAG	3	9	3237959	3237967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149851
64338	NC_011989	GCCA	2	8	3238037	3238044	25 %	0 %	25 %	50 %	222149851
64339	NC_011989	TCC	2	6	3238058	3238063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149851
64340	NC_011989	CAC	2	6	3238129	3238134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149851
64341	NC_011989	ATCAGC	2	12	3238410	3238421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222149851
64342	NC_011989	GCCA	2	8	3238430	3238437	25 %	0 %	25 %	50 %	222149851
64343	NC_011989	CGCGC	2	10	3238483	3238492	0 %	0 %	40 %	60 %	222149851
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64345	NC_011989	CCA	2	6	3238552	3238557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149851
64346	NC_011989	TGC	2	6	3238586	3238591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149851
64347	NC_011989	TCAG	2	8	3238593	3238600	25 %	25 %	25 %	25 %	222149851
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64379	NC_011989	GCCG	2	8	3239824	3239831	0 %	0 %	50 %	50 %	222149851
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64392	NC_011989	GCC	2	6	3240725	3240730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149852
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64424	NC_011989	GCC	2	6	3242561	3242566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149854
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64462	NC_011989	CAA	2	6	3244295	3244300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149855
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64464	NC_011989	TCA	2	6	3244389	3244394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149855
64465	NC_011989	CAA	2	6	3244414	3244419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149855
64466	NC_011989	GGCA	2	8	3244496	3244503	25 %	0 %	50 %	25 %	222149856
64467	NC_011989	CAG	2	6	3244507	3244512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149856
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64474	NC_011989	CAA	2	6	3244915	3244920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149856
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64482	NC_011989	GGCC	2	8	3245267	3245274	0 %	0 %	50 %	50 %	222149857
64483	NC_011989	CAG	2	6	3245310	3245315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149857
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64492	NC_011989	GACA	2	8	3245518	3245525	50 %	0 %	25 %	25 %	222149857
64493	NC_011989	GCA	2	6	3245543	3245548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149857
64494	NC_011989	GC	3	6	3245634	3245639	0 %	0 %	50 %	50 %	222149857
64495	NC_011989	GGC	2	6	3245644	3245649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149857
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64497	NC_011989	GCCAGA	2	12	3245713	3245724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149857
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64499	NC_011989	CAG	2	6	3245814	3245819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149857
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