MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_011989	CGG	3	9	2923869	2923877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58002	NC_011989	GAC	2	6	2923913	2923918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149588
58003	NC_011989	ACC	2	6	2923976	2923981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149588
58004	NC_011989	TACGAC	2	12	2924018	2924029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222149588
58005	NC_011989	ATC	2	6	2924030	2924035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149588
58006	NC_011989	CTG	2	6	2924036	2924041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149588
58007	NC_011989	TTG	2	6	2924214	2924219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149588
58008	NC_011989	TCGT	2	8	2924235	2924242	0 %	50 %	25 %	25 %	222149588
58009	NC_011989	ATC	3	9	2924267	2924275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149588
58010	NC_011989	TGG	2	6	2924320	2924325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149588
58011	NC_011989	GCT	2	6	2924368	2924373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149588
58012	NC_011989	TGG	2	6	2924428	2924433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149588
58013	NC_011989	ATC	2	6	2924456	2924461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149588
58014	NC_011989	AAG	2	6	2924486	2924491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149588
58015	NC_011989	GCC	2	6	2924501	2924506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149588
58016	NC_011989	GGT	2	6	2924507	2924512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149588
58017	NC_011989	TGC	2	6	2924550	2924555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149588
58018	NC_011989	AT	3	6	2924575	2924580	50 %	50 %	0 %	0 %	222149588
58019	NC_011989	CCA	2	6	2924647	2924652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58020	NC_011989	CG	3	6	2924663	2924668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58021	NC_011989	A	6	6	2924684	2924689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58022	NC_011989	T	6	6	2924709	2924714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58023	NC_011989	GAA	2	6	2924720	2924725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58024	NC_011989	GA	3	6	2924770	2924775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58025	NC_011989	AAC	2	6	2924791	2924796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58026	NC_011989	GGC	2	6	2924841	2924846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149589
58027	NC_011989	CAG	2	6	2924895	2924900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149589
58028	NC_011989	CAT	2	6	2924931	2924936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149589
58029	NC_011989	AGA	2	6	2924966	2924971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149589
58030	NC_011989	GC	3	6	2925023	2925028	0 %	0 %	50 %	50 %	222149589
58031	NC_011989	GAT	2	6	2925048	2925053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149589
58032	NC_011989	CG	3	6	2925092	2925097	0 %	0 %	50 %	50 %	222149589
58033	NC_011989	ACGA	2	8	2925156	2925163	50 %	0 %	25 %	25 %	222149589
58034	NC_011989	TTC	2	6	2925190	2925195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149589
58035	NC_011989	GCG	2	6	2925270	2925275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58036	NC_011989	CGC	2	6	2925306	2925311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58037	NC_011989	TGG	2	6	2925417	2925422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58038	NC_011989	GCG	2	6	2925432	2925437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58039	NC_011989	GCA	2	6	2925491	2925496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149590
58040	NC_011989	CGG	2	6	2925504	2925509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149590
58041	NC_011989	TTCGCC	2	12	2925520	2925531	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222149590
58042	NC_011989	GAT	2	6	2925554	2925559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149590
58043	NC_011989	TCG	2	6	2925560	2925565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149590
58044	NC_011989	CTT	2	6	2925612	2925617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149590
58045	NC_011989	CGG	2	6	2925649	2925654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149590
58046	NC_011989	GCA	2	6	2925660	2925665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149590
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58051	NC_011989	GC	3	6	2925809	2925814	0 %	0 %	50 %	50 %	222149590
58052	NC_011989	TTTTC	2	10	2925837	2925846	0 %	80 %	0 %	20 %	222149590
58053	NC_011989	GGC	2	6	2925847	2925852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149590
58054	NC_011989	ATCG	2	8	2925889	2925896	25 %	25 %	25 %	25 %	222149590
58055	NC_011989	CCGA	2	8	2925902	2925909	25 %	0 %	25 %	50 %	222149590
58056	NC_011989	AACCG	2	10	2925944	2925953	40 %	0 %	20 %	40 %	222149590
58057	NC_011989	GC	3	6	2925963	2925968	0 %	0 %	50 %	50 %	222149590
58058	NC_011989	GGCATC	2	12	2925988	2925999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149590
58059	NC_011989	CAG	2	6	2926015	2926020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149590
58060	NC_011989	CAT	2	6	2926059	2926064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149590
58061	NC_011989	ATG	2	6	2926198	2926203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58062	NC_011989	TCA	2	6	2926253	2926258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58063	NC_011989	TCA	2	6	2926275	2926280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58064	NC_011989	GAG	2	6	2926302	2926307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58065	NC_011989	CAT	2	6	2926325	2926330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149591
58066	NC_011989	GTT	2	6	2926383	2926388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149591
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58068	NC_011989	GCG	2	6	2926477	2926482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149591
58069	NC_011989	TCT	2	6	2926630	2926635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149591
58070	NC_011989	GAT	2	6	2926685	2926690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149591
58071	NC_011989	CCG	2	6	2926708	2926713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149591
58072	NC_011989	TGG	2	6	2926762	2926767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149591
58073	NC_011989	GAA	2	6	2926790	2926795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149591
58074	NC_011989	CAA	2	6	2926796	2926801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149591
58075	NC_011989	TCC	2	6	2926878	2926883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149591
58076	NC_011989	CTG	2	6	2926946	2926951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58077	NC_011989	CCG	2	6	2927060	2927065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149592
58078	NC_011989	GCC	2	6	2927101	2927106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149592
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58081	NC_011989	GAA	2	6	2927203	2927208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149592
58082	NC_011989	GCC	2	6	2927245	2927250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149592
58083	NC_011989	GCC	3	9	2927311	2927319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149592
58084	NC_011989	CG	3	6	2927344	2927349	0 %	0 %	50 %	50 %	222149592
58085	NC_011989	AGA	2	6	2927358	2927363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149592
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58087	NC_011989	CAGA	2	8	2927587	2927594	50 %	0 %	25 %	25 %	222149592
58088	NC_011989	CGA	2	6	2927646	2927651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149592
58089	NC_011989	GCC	3	9	2927659	2927667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149592
58090	NC_011989	AGG	2	6	2927702	2927707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149592
58091	NC_011989	TGC	2	6	2927717	2927722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149592
58092	NC_011989	GCC	2	6	2927794	2927799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149593
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58097	NC_011989	GC	4	8	2927921	2927928	0 %	0 %	50 %	50 %	222149593
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58099	NC_011989	GAT	2	6	2927951	2927956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149593
58100	NC_011989	CCGC	2	8	2927965	2927972	0 %	0 %	25 %	75 %	222149593
58101	NC_011989	AAGG	2	8	2927973	2927980	50 %	0 %	50 %	0 %	222149593
58102	NC_011989	CTG	2	6	2928003	2928008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149593
58103	NC_011989	GCT	2	6	2928044	2928049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149593
58104	NC_011989	TCT	2	6	2928077	2928082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149593
58105	NC_011989	CGCGC	2	10	2928172	2928181	0 %	0 %	40 %	60 %	222149594
58106	NC_011989	CAC	2	6	2928303	2928308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149594
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58108	NC_011989	ACA	2	6	2928416	2928421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149594
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58115	NC_011989	CCAG	2	8	2928838	2928845	25 %	0 %	25 %	50 %	222149594
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58117	NC_011989	GCA	2	6	2928866	2928871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149594
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58253	NC_011989	AAGGA	2	10	2935065	2935074	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58254	NC_011989	GGCA	2	8	2935077	2935084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58255	NC_011989	CGG	2	6	2935097	2935102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58256	NC_011989	CAGAT	2	10	2935103	2935112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58257	NC_011989	CCTGCC	2	12	2935186	2935197	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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58262	NC_011989	GCTC	2	8	2935282	2935289	0 %	25 %	25 %	50 %	222149601
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58293	NC_011989	GCT	2	6	2936597	2936602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58333	NC_011989	CCGGCT	2	12	2938534	2938545	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222149602
58334	NC_011989	GGC	2	6	2938630	2938635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149602
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58337	NC_011989	GACAA	2	10	2938818	2938827	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58338	NC_011989	GTC	2	6	2938879	2938884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149603
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58341	NC_011989	TTCC	2	8	2939002	2939009	0 %	50 %	0 %	50 %	222149603
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58346	NC_011989	AGC	2	6	2939456	2939461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149603
58347	NC_011989	GC	3	6	2939469	2939474	0 %	0 %	50 %	50 %	222149603
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