MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_011989	TA	3	6	2850100	2850105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56502	NC_011989	GGA	2	6	2850108	2850113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56503	NC_011989	TCA	2	6	2850117	2850122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56504	NC_011989	GGC	2	6	2850141	2850146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56505	NC_011989	T	6	6	2850245	2850250	0 %	100 %	0 %	0 %	222149524
56506	NC_011989	A	6	6	2850285	2850290	100 %	0 %	0 %	0 %	222149524
56507	NC_011989	TGCGA	2	10	2850299	2850308	20 %	20 %	40 %	20 %	222149524
56508	NC_011989	GGC	2	6	2850334	2850339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149524
56509	NC_011989	TTG	2	6	2850406	2850411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149524
56510	NC_011989	GCT	2	6	2850421	2850426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149524
56511	NC_011989	GGC	2	6	2850555	2850560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149524
56512	NC_011989	TGCG	2	8	2850606	2850613	0 %	25 %	50 %	25 %	222149524
56513	NC_011989	CCG	2	6	2850619	2850624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149524
56514	NC_011989	CCA	2	6	2850689	2850694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149524
56515	NC_011989	GC	3	6	2850766	2850771	0 %	0 %	50 %	50 %	222149524
56516	NC_011989	AGGC	2	8	2850823	2850830	25 %	0 %	50 %	25 %	222149524
56517	NC_011989	CGC	2	6	2850851	2850856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149524
56518	NC_011989	TC	3	6	2850902	2850907	0 %	50 %	0 %	50 %	222149524
56519	NC_011989	TGC	2	6	2850925	2850930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149524
56520	NC_011989	GTC	3	9	2851131	2851139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149524
56521	NC_011989	GGC	3	9	2851143	2851151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149524
56522	NC_011989	CCG	2	6	2851217	2851222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149524
56523	NC_011989	GCC	2	6	2851266	2851271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149524
56524	NC_011989	AAG	2	6	2851309	2851314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149524
56525	NC_011989	CGG	2	6	2851325	2851330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149524
56526	NC_011989	TGA	2	6	2851378	2851383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149524
56527	NC_011989	TCG	2	6	2851426	2851431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149524
56528	NC_011989	GGC	2	6	2851482	2851487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149524
56529	NC_011989	GGGC	2	8	2851534	2851541	0 %	0 %	75 %	25 %	222149524
56530	NC_011989	CGG	2	6	2851556	2851561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149524
56531	NC_011989	CCG	2	6	2851579	2851584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149524
56532	NC_011989	TGC	2	6	2851628	2851633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149524
56533	NC_011989	TCG	2	6	2851704	2851709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149525
56534	NC_011989	CTGG	2	8	2851732	2851739	0 %	25 %	50 %	25 %	222149525
56535	NC_011989	ACCG	2	8	2851750	2851757	25 %	0 %	25 %	50 %	222149525
56536	NC_011989	GC	3	6	2851777	2851782	0 %	0 %	50 %	50 %	222149525
56537	NC_011989	GCG	2	6	2851800	2851805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149525
56538	NC_011989	CTCGG	2	10	2851820	2851829	0 %	20 %	40 %	40 %	222149525
56539	NC_011989	GTC	2	6	2851841	2851846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149525
56540	NC_011989	G	6	6	2851878	2851883	0 %	0 %	100 %	0 %	222149525
56541	NC_011989	CCG	2	6	2851888	2851893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149525
56542	NC_011989	CTG	2	6	2851895	2851900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149525
56543	NC_011989	CAA	2	6	2851906	2851911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149525
56544	NC_011989	ACCG	2	8	2851925	2851932	25 %	0 %	25 %	50 %	222149525
56545	NC_011989	GAG	2	6	2852021	2852026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149525
56546	NC_011989	GAA	2	6	2852057	2852062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149525
56547	NC_011989	GCC	2	6	2852129	2852134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149525
56548	NC_011989	AT	3	6	2852152	2852157	50 %	50 %	0 %	0 %	222149525
56549	NC_011989	GCAA	2	8	2852178	2852185	50 %	0 %	25 %	25 %	222149525
56550	NC_011989	CG	3	6	2852249	2852254	0 %	0 %	50 %	50 %	222149525
56551	NC_011989	GGC	2	6	2852264	2852269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149525
56552	NC_011989	GGC	2	6	2852351	2852356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149525
56553	NC_011989	CGG	2	6	2852385	2852390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149525
56554	NC_011989	TGG	2	6	2852412	2852417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149525
56555	NC_011989	CGG	2	6	2852467	2852472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149525
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56558	NC_011989	TGGA	2	8	2852597	2852604	25 %	25 %	50 %	0 %	222149525
56559	NC_011989	CTCAAC	2	12	2852675	2852686	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222149525
56560	NC_011989	GATC	2	8	2852704	2852711	25 %	25 %	25 %	25 %	222149525
56561	NC_011989	TCA	2	6	2852764	2852769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149525
56562	NC_011989	GC	3	6	2852795	2852800	0 %	0 %	50 %	50 %	222149525
56563	NC_011989	GAC	2	6	2852950	2852955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149525
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56565	NC_011989	GCAG	2	8	2852980	2852987	25 %	0 %	50 %	25 %	222149525
56566	NC_011989	GCA	2	6	2853058	2853063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56567	NC_011989	CAGA	2	8	2853093	2853100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56568	NC_011989	T	7	7	2853108	2853114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56569	NC_011989	GAT	2	6	2853180	2853185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56570	NC_011989	ATTT	2	8	2853259	2853266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56571	NC_011989	AAAC	2	8	2853290	2853297	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56572	NC_011989	GAC	2	6	2853376	2853381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56573	NC_011989	GC	3	6	2853417	2853422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56574	NC_011989	ACA	2	6	2853440	2853445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56575	NC_011989	TC	3	6	2853504	2853509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56576	NC_011989	AATAA	2	10	2853540	2853549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56577	NC_011989	TAAATT	2	12	2853550	2853561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56578	NC_011989	T	7	7	2853634	2853640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56579	NC_011989	AG	3	6	2853660	2853665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56580	NC_011989	AATGA	2	10	2853675	2853684	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56581	NC_011989	AAG	2	6	2853711	2853716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56582	NC_011989	AG	3	6	2853715	2853720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56583	NC_011989	ATC	2	6	2853731	2853736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56584	NC_011989	ACA	2	6	2853857	2853862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56585	NC_011989	AT	3	6	2853928	2853933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56586	NC_011989	TGA	3	9	2853951	2853959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149526
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56588	NC_011989	TCA	2	6	2854416	2854421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149526
56589	NC_011989	ACA	2	6	2854442	2854447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149526
56590	NC_011989	CAT	2	6	2854479	2854484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149526
56591	NC_011989	CTG	2	6	2854565	2854570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149526
56592	NC_011989	CAG	2	6	2854672	2854677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149526
56593	NC_011989	GGC	2	6	2854759	2854764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149526
56594	NC_011989	TGGC	2	8	2854777	2854784	0 %	25 %	50 %	25 %	222149526
56595	NC_011989	AAC	2	6	2854785	2854790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149526
56596	NC_011989	ATC	2	6	2854844	2854849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149526
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56599	NC_011989	CCGTC	2	10	2855054	2855063	0 %	20 %	20 %	60 %	222149526
56600	NC_011989	TCCA	2	8	2855097	2855104	25 %	25 %	0 %	50 %	222149526
56601	NC_011989	AAG	2	6	2855252	2855257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149526
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56605	NC_011989	TGC	2	6	2855563	2855568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149526
56606	NC_011989	CG	3	6	2855608	2855613	0 %	0 %	50 %	50 %	222149526
56607	NC_011989	CGG	2	6	2855617	2855622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149526
56608	NC_011989	CGA	2	6	2855623	2855628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149526
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56615	NC_011989	CG	3	6	2856010	2856015	0 %	0 %	50 %	50 %	222149526
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56619	NC_011989	CGC	2	6	2856134	2856139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149526
56620	NC_011989	CGC	2	6	2856162	2856167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149526
56621	NC_011989	CGA	2	6	2856202	2856207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149526
56622	NC_011989	CGC	2	6	2856234	2856239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149526
56623	NC_011989	CTG	2	6	2856243	2856248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149526
56624	NC_011989	GCCATC	2	12	2856308	2856319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222149526
56625	NC_011989	TATCGA	2	12	2856340	2856351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222149526
56626	NC_011989	GAT	2	6	2856356	2856361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149526
56627	NC_011989	ATC	2	6	2856446	2856451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149526
56628	NC_011989	AGCA	2	8	2856455	2856462	50 %	0 %	25 %	25 %	222149526
56629	NC_011989	TCG	2	6	2856486	2856491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149526
56630	NC_011989	TCGG	2	8	2856495	2856502	0 %	25 %	50 %	25 %	222149526
56631	NC_011989	GCA	2	6	2856544	2856549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149526
56632	NC_011989	CGCC	2	8	2856601	2856608	0 %	0 %	25 %	75 %	222149526
56633	NC_011989	CGA	2	6	2856820	2856825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149527
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56635	NC_011989	CCT	2	6	2856940	2856945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149527
56636	NC_011989	GATC	2	8	2856974	2856981	25 %	25 %	25 %	25 %	222149527
56637	NC_011989	GC	3	6	2857102	2857107	0 %	0 %	50 %	50 %	222149527
56638	NC_011989	GAT	2	6	2857184	2857189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149527
56639	NC_011989	TGA	2	6	2857195	2857200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149527
56640	NC_011989	GCC	2	6	2857269	2857274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149527
56641	NC_011989	TCG	2	6	2857357	2857362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149527
56642	NC_011989	CTG	2	6	2857392	2857397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149527
56643	NC_011989	GAAC	2	8	2857412	2857419	50 %	0 %	25 %	25 %	222149527
56644	NC_011989	CGG	2	6	2857444	2857449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149527
56645	NC_011989	TGGCT	2	10	2857521	2857530	0 %	40 %	40 %	20 %	222149527
56646	NC_011989	GAC	2	6	2857559	2857564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149527
56647	NC_011989	CCTT	2	8	2857573	2857580	0 %	50 %	0 %	50 %	222149527
56648	NC_011989	CTG	2	6	2857581	2857586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149527
56649	NC_011989	GCCC	2	8	2857607	2857614	0 %	0 %	25 %	75 %	222149527
56650	NC_011989	TCA	2	6	2857651	2857656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149527
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56652	NC_011989	GCCATG	2	12	2857740	2857751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149527
56653	NC_011989	CG	3	6	2857824	2857829	0 %	0 %	50 %	50 %	222149528
56654	NC_011989	GTC	2	6	2857844	2857849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149528
56655	NC_011989	CCG	2	6	2857852	2857857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149528
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56658	NC_011989	A	6	6	2857927	2857932	100 %	0 %	0 %	0 %	222149528
56659	NC_011989	CG	3	6	2858089	2858094	0 %	0 %	50 %	50 %	222149528
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56667	NC_011989	TCC	2	6	2858367	2858372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149528
56668	NC_011989	TGCC	2	8	2858441	2858448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56669	NC_011989	TGC	2	6	2858456	2858461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56671	NC_011989	ATCA	2	8	2858588	2858595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56672	NC_011989	ATG	2	6	2858658	2858663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56677	NC_011989	GCA	2	6	2858884	2858889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149529
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56720	NC_011989	AC	3	6	2860782	2860787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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56736	NC_011989	CCT	2	6	2861281	2861286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149531
56737	NC_011989	GC	3	6	2861308	2861313	0 %	0 %	50 %	50 %	222149531
56738	NC_011989	GCT	2	6	2861366	2861371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149531
56739	NC_011989	CCCG	2	8	2861410	2861417	0 %	0 %	25 %	75 %	222149531
56740	NC_011989	CCA	2	6	2861437	2861442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149531
56741	NC_011989	CAT	2	6	2861450	2861455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149531
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56743	NC_011989	CGC	2	6	2861624	2861629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149531
56744	NC_011989	CCG	2	6	2861630	2861635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149531
56745	NC_011989	CGC	2	6	2861644	2861649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149531
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56747	NC_011989	GCA	2	6	2861663	2861668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149531
56748	NC_011989	GGGC	2	8	2861683	2861690	0 %	0 %	75 %	25 %	222149531
56749	NC_011989	GCTC	2	8	2861701	2861708	0 %	25 %	25 %	50 %	222149531
56750	NC_011989	CGG	2	6	2861795	2861800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149531
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56754	NC_011989	TGTGG	2	10	2861957	2861966	0 %	40 %	60 %	0 %	222149531
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56756	NC_011989	CGTGG	2	10	2862075	2862084	0 %	20 %	60 %	20 %	222149531
56757	NC_011989	CGC	2	6	2862196	2862201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149531
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56759	NC_011989	TGC	2	6	2862318	2862323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56760	NC_011989	TGA	2	6	2862342	2862347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56761	NC_011989	TCA	2	6	2862450	2862455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56762	NC_011989	AACGC	2	10	2862506	2862515	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56763	NC_011989	TAT	2	6	2862526	2862531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56764	NC_011989	CGA	2	6	2862591	2862596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56765	NC_011989	CAC	2	6	2862600	2862605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56766	NC_011989	TCCA	2	8	2862733	2862740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56767	NC_011989	CGT	2	6	2862803	2862808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149532
56768	NC_011989	TCTG	2	8	2862823	2862830	0 %	50 %	25 %	25 %	222149532
56769	NC_011989	ATG	2	6	2862844	2862849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149532
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56773	NC_011989	CGG	2	6	2863211	2863216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149532
56774	NC_011989	GCA	2	6	2863220	2863225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149532
56775	NC_011989	TGT	2	6	2863267	2863272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149532
56776	NC_011989	GATG	2	8	2863274	2863281	25 %	25 %	50 %	0 %	222149532
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56778	NC_011989	CAA	2	6	2863355	2863360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149532
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56782	NC_011989	GCGG	2	8	2863547	2863554	0 %	0 %	75 %	25 %	222149532
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56802	NC_011989	CTG	2	6	2864439	2864444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149534
56803	NC_011989	TCT	2	6	2864455	2864460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149534
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56822	NC_011989	GCTG	2	8	2865236	2865243	0 %	25 %	50 %	25 %	222149534
56823	NC_011989	GTC	2	6	2865249	2865254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149534
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56825	NC_011989	AG	3	6	2865311	2865316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56826	NC_011989	CAC	2	6	2865340	2865345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149535
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56833	NC_011989	TCCTG	2	10	2865750	2865759	0 %	40 %	20 %	40 %	222149535
56834	NC_011989	GTT	2	6	2865838	2865843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149535
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56838	NC_011989	A	7	7	2866071	2866077	100 %	0 %	0 %	0 %	222149535
56839	NC_011989	ACG	2	6	2866110	2866115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149535
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56842	NC_011989	CGG	3	9	2866237	2866245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149535
56843	NC_011989	CGC	2	6	2866350	2866355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56844	NC_011989	GGC	2	6	2866378	2866383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56845	NC_011989	CTGA	2	8	2866398	2866405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56846	NC_011989	CA	3	6	2866500	2866505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56847	NC_011989	CG	3	6	2866531	2866536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56848	NC_011989	TAT	2	6	2866549	2866554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56849	NC_011989	TGCAA	2	10	2866555	2866564	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56850	NC_011989	CGTAA	2	10	2866620	2866629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56851	NC_011989	ATA	2	6	2866694	2866699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56852	NC_011989	ATCGT	2	10	2866756	2866765	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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56854	NC_011989	GGA	2	6	2866856	2866861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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56966	NC_011989	AT	3	6	2872604	2872609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56967	NC_011989	TCGCTT	2	12	2872619	2872630	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56968	NC_011989	CCG	2	6	2872634	2872639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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56972	NC_011989	CGT	2	6	2872793	2872798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149539
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