MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_011989	GAT	2	6	2774445	2774450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149457
55003	NC_011989	CGGG	2	8	2774460	2774467	0 %	0 %	75 %	25 %	222149457
55004	NC_011989	GTGC	2	8	2774473	2774480	0 %	25 %	50 %	25 %	222149457
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55007	NC_011989	AGC	2	6	2774620	2774625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149457
55008	NC_011989	A	6	6	2774659	2774664	100 %	0 %	0 %	0 %	222149457
55009	NC_011989	TCG	2	6	2774717	2774722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149457
55010	NC_011989	CGA	2	6	2774784	2774789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149457
55011	NC_011989	GAT	2	6	2774790	2774795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149457
55012	NC_011989	CAG	2	6	2774891	2774896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149457
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55014	NC_011989	TCA	2	6	2775016	2775021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149457
55015	NC_011989	A	7	7	2775049	2775055	100 %	0 %	0 %	0 %	222149457
55016	NC_011989	CTGG	2	8	2775069	2775076	0 %	25 %	50 %	25 %	222149457
55017	NC_011989	CAG	2	6	2775111	2775116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149457
55018	NC_011989	CAA	2	6	2775213	2775218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149457
55019	NC_011989	CCG	2	6	2775251	2775256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149457
55020	NC_011989	TGG	2	6	2775266	2775271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149457
55021	NC_011989	CG	3	6	2775414	2775419	0 %	0 %	50 %	50 %	222149457
55022	NC_011989	CTG	2	6	2775445	2775450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149457
55023	NC_011989	GAG	2	6	2775487	2775492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149457
55024	NC_011989	CGC	2	6	2775507	2775512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149457
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55027	NC_011989	GTC	2	6	2775670	2775675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149457
55028	NC_011989	CGG	2	6	2775701	2775706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149457
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55030	NC_011989	GCC	3	9	2775923	2775931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149458
55031	NC_011989	CAT	2	6	2775973	2775978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149458
55032	NC_011989	GC	3	6	2775984	2775989	0 %	0 %	50 %	50 %	222149458
55033	NC_011989	GCG	2	6	2776068	2776073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149458
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55054	NC_011989	ACC	2	6	2777156	2777161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149459
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55061	NC_011989	AGG	2	6	2777846	2777851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55062	NC_011989	TGA	2	6	2777853	2777858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55092	NC_011989	CCGAT	2	10	2779202	2779211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55093	NC_011989	CA	3	6	2779229	2779234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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55107	NC_011989	CTGCG	2	10	2780016	2780025	0 %	20 %	40 %	40 %	222149462
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55114	NC_011989	CCAGCA	2	12	2780381	2780392	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222149462
55115	NC_011989	GATC	2	8	2780393	2780400	25 %	25 %	25 %	25 %	222149462
55116	NC_011989	CTG	2	6	2780406	2780411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149462
55117	NC_011989	CGA	2	6	2780421	2780426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149462
55118	NC_011989	TCCG	2	8	2780445	2780452	0 %	25 %	25 %	50 %	222149462
55119	NC_011989	GGC	2	6	2780461	2780466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149462
55120	NC_011989	GCGCC	2	10	2780500	2780509	0 %	0 %	40 %	60 %	222149462
55121	NC_011989	ACA	2	6	2780533	2780538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149462
55122	NC_011989	GCA	2	6	2780543	2780548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149462
55123	NC_011989	CACC	2	8	2780555	2780562	25 %	0 %	0 %	75 %	222149462
55124	NC_011989	CCG	2	6	2780627	2780632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149462
55125	NC_011989	CAG	2	6	2780634	2780639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149462
55126	NC_011989	GAT	2	6	2780640	2780645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149462
55127	NC_011989	CGC	3	9	2780699	2780707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149462
55128	NC_011989	GCA	2	6	2780715	2780720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149462
55129	NC_011989	ACC	2	6	2780731	2780736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149462
55130	NC_011989	GCCAGC	2	12	2780776	2780787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222149462
55131	NC_011989	GCC	2	6	2780929	2780934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149462
55132	NC_011989	GC	3	6	2780978	2780983	0 %	0 %	50 %	50 %	222149462
55133	NC_011989	TCAT	2	8	2781076	2781083	25 %	50 %	0 %	25 %	222149462
55134	NC_011989	TCAC	2	8	2781178	2781185	25 %	25 %	0 %	50 %	222149462
55135	NC_011989	CGCC	2	8	2781350	2781357	0 %	0 %	25 %	75 %	222149462
55136	NC_011989	GC	3	6	2781415	2781420	0 %	0 %	50 %	50 %	222149462
55137	NC_011989	TCC	2	6	2781442	2781447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149462
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55141	NC_011989	CAG	2	6	2781606	2781611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149462
55142	NC_011989	CGC	2	6	2781632	2781637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149462
55143	NC_011989	CCG	2	6	2781695	2781700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149462
55144	NC_011989	GCT	2	6	2781740	2781745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149462
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55147	NC_011989	CTCG	2	8	2781920	2781927	0 %	25 %	25 %	50 %	222149462
55148	NC_011989	GCG	2	6	2781977	2781982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149462
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55152	NC_011989	GCCGC	2	10	2782244	2782253	0 %	0 %	40 %	60 %	222149462
55153	NC_011989	GGC	2	6	2782281	2782286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149462
55154	NC_011989	GCCA	2	8	2782349	2782356	25 %	0 %	25 %	50 %	222149462
55155	NC_011989	GAT	2	6	2782479	2782484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149462
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55159	NC_011989	GC	3	6	2782619	2782624	0 %	0 %	50 %	50 %	222149462
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55178	NC_011989	AACGA	2	10	2783682	2783691	60 %	0 %	20 %	20 %	222149462
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55182	NC_011989	CCG	2	6	2783838	2783843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55183	NC_011989	AAC	2	6	2783848	2783853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55184	NC_011989	ACAAA	2	10	2783872	2783881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55185	NC_011989	A	6	6	2783893	2783898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55186	NC_011989	GCA	2	6	2783941	2783946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55187	NC_011989	CGCCA	2	10	2783993	2784002	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55188	NC_011989	T	6	6	2784023	2784028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55189	NC_011989	CGTC	2	8	2784062	2784069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55190	NC_011989	CAT	2	6	2784109	2784114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55191	NC_011989	ATC	2	6	2784134	2784139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55192	NC_011989	TCG	2	6	2784321	2784326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149463
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55200	NC_011989	TAG	2	6	2784542	2784547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55201	NC_011989	GCCC	2	8	2784559	2784566	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55202	NC_011989	ATG	2	6	2784571	2784576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55203	NC_011989	GGCG	2	8	2784577	2784584	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55204	NC_011989	GCG	2	6	2784614	2784619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55205	NC_011989	GCC	2	6	2784638	2784643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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55207	NC_011989	A	6	6	2784695	2784700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55208	NC_011989	AT	3	6	2784715	2784720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55209	NC_011989	TGT	2	6	2784900	2784905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149464
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55218	NC_011989	GCA	2	6	2785215	2785220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149464
55219	NC_011989	GCCGG	2	10	2785260	2785269	0 %	0 %	60 %	40 %	222149464
55220	NC_011989	GC	3	6	2785305	2785310	0 %	0 %	50 %	50 %	222149464
55221	NC_011989	CTG	2	6	2785414	2785419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149464
55222	NC_011989	CCA	2	6	2785427	2785432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149464
55223	NC_011989	CAA	2	6	2785470	2785475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149464
55224	NC_011989	GCC	2	6	2785510	2785515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149464
55225	NC_011989	GCT	2	6	2785569	2785574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149464
55226	NC_011989	GAA	2	6	2785575	2785580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149464
55227	NC_011989	ATC	2	6	2785592	2785597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149464
55228	NC_011989	TGA	2	6	2785649	2785654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149464
55229	NC_011989	CAA	2	6	2785698	2785703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149464
55230	NC_011989	AGCGCG	2	12	2785715	2785726	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222149464
55231	NC_011989	GCC	2	6	2785780	2785785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149464
55232	NC_011989	CTG	2	6	2785933	2785938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149464
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55472	NC_011989	CGT	2	6	2796779	2796784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149473
55473	NC_011989	GAT	2	6	2796824	2796829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149473
55474	NC_011989	ATCG	2	8	2796836	2796843	25 %	25 %	25 %	25 %	222149473
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