MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_011988	TGA	2	6	1180874	1180879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23002	NC_011988	GGC	2	6	1180925	1180930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23003	NC_011988	GCT	2	6	1180934	1180939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23004	NC_011988	AGA	2	6	1180943	1180948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23005	NC_011988	CAT	2	6	1180963	1180968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23006	NC_011988	ACC	2	6	1180992	1180997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23007	NC_011988	GC	3	6	1181015	1181020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23008	NC_011988	CGC	4	12	1181018	1181029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23009	NC_011988	TGG	2	6	1181037	1181042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23010	NC_011988	CTG	2	6	1181123	1181128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23011	NC_011988	GAT	2	6	1181129	1181134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23012	NC_011988	TGC	2	6	1181191	1181196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23013	NC_011988	AGA	2	6	1181304	1181309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23014	NC_011988	GGC	2	6	1181341	1181346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23015	NC_011988	CACT	2	8	1181428	1181435	25 %	25 %	0 %	50 %	222107087
23016	NC_011988	TCA	2	6	1181464	1181469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107087
23017	NC_011988	GGC	2	6	1181513	1181518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23018	NC_011988	GGC	2	6	1181555	1181560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23019	NC_011988	GCG	2	6	1181612	1181617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23020	NC_011988	GCAAG	2	10	1181693	1181702	40 %	0 %	40 %	20 %	222107087
23021	NC_011988	CT	3	6	1181703	1181708	0 %	50 %	0 %	50 %	222107087
23022	NC_011988	CGG	2	6	1181711	1181716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23023	NC_011988	GCC	2	6	1181779	1181784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107087
23024	NC_011988	GGT	2	6	1181843	1181848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107087
23025	NC_011988	GCG	2	6	1181901	1181906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23026	NC_011988	GCCAT	2	10	1181908	1181917	20 %	20 %	20 %	40 %	222107087
23027	NC_011988	GCG	2	6	1181947	1181952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23028	NC_011988	GCG	2	6	1182037	1182042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23029	NC_011988	GGC	2	6	1182045	1182050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
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23031	NC_011988	GCT	2	6	1182275	1182280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107087
23032	NC_011988	GGA	2	6	1182335	1182340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107087
23033	NC_011988	CGC	2	6	1182372	1182377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107087
23034	NC_011988	ATG	2	6	1182384	1182389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107087
23035	NC_011988	GGC	2	6	1182530	1182535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
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23039	NC_011988	GAA	2	6	1182645	1182650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107087
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23041	NC_011988	GCT	2	6	1182746	1182751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107087
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23043	NC_011988	GCC	2	6	1182843	1182848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107087
23044	NC_011988	CG	3	6	1182859	1182864	0 %	0 %	50 %	50 %	222107087
23045	NC_011988	GC	3	6	1182869	1182874	0 %	0 %	50 %	50 %	222107087
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23052	NC_011988	ATT	2	6	1183054	1183059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107087
23053	NC_011988	GGC	3	9	1183091	1183099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23054	NC_011988	CGG	2	6	1183147	1183152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107087
23055	NC_011988	TGC	2	6	1183233	1183238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23056	NC_011988	GAA	2	6	1183256	1183261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23057	NC_011988	CGG	2	6	1183323	1183328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23058	NC_011988	T	6	6	1183376	1183381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23059	NC_011988	TCG	2	6	1183434	1183439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107088
23060	NC_011988	TGA	2	6	1183481	1183486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107088
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23063	NC_011988	GC	3	6	1183590	1183595	0 %	0 %	50 %	50 %	222107088
23064	NC_011988	GTT	2	6	1183701	1183706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107088
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23067	NC_011988	CAT	2	6	1183798	1183803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107089
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23070	NC_011988	TG	3	6	1183951	1183956	0 %	50 %	50 %	0 %	222107089
23071	NC_011988	GGC	2	6	1184015	1184020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107089
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23074	NC_011988	CAT	2	6	1184101	1184106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107089
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23079	NC_011988	GCG	2	6	1184472	1184477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107089
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23081	NC_011988	CGGA	2	8	1184612	1184619	25 %	0 %	50 %	25 %	222107089
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23092	NC_011988	GCA	2	6	1185171	1185176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107090
23093	NC_011988	GCTTT	2	10	1185191	1185200	0 %	60 %	20 %	20 %	222107090
23094	NC_011988	GA	4	8	1185373	1185380	50 %	0 %	50 %	0 %	222107090
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23100	NC_011988	TGT	2	6	1185669	1185674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107090
23101	NC_011988	GCCT	2	8	1185708	1185715	0 %	25 %	25 %	50 %	222107090
23102	NC_011988	GCA	2	6	1185718	1185723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107090
23103	NC_011988	TGC	2	6	1185804	1185809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107090
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23105	NC_011988	TGA	2	6	1186167	1186172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107090
23106	NC_011988	GC	3	6	1186179	1186184	0 %	0 %	50 %	50 %	222107090
23107	NC_011988	GC	3	6	1186186	1186191	0 %	0 %	50 %	50 %	222107090
23108	NC_011988	GAT	2	6	1186216	1186221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107090
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23110	NC_011988	GGTG	2	8	1186467	1186474	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23111	NC_011988	TGCC	2	8	1186502	1186509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23112	NC_011988	TGG	2	6	1186567	1186572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23113	NC_011988	ATT	2	6	1186667	1186672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23114	NC_011988	GTG	2	6	1186697	1186702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23115	NC_011988	TGC	2	6	1186723	1186728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23116	NC_011988	TGG	2	6	1186767	1186772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23117	NC_011988	TGA	2	6	1186863	1186868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23118	NC_011988	GACA	2	8	1187010	1187017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23119	NC_011988	GC	3	6	1187060	1187065	0 %	0 %	50 %	50 %	222107091
23120	NC_011988	GTGGC	2	10	1187126	1187135	0 %	20 %	60 %	20 %	222107091
23121	NC_011988	TGC	2	6	1187138	1187143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107091
23122	NC_011988	GGT	2	6	1187164	1187169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107091
23123	NC_011988	GCA	2	6	1187370	1187375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107091
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23127	NC_011988	CGG	2	6	1187513	1187518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23128	NC_011988	C	6	6	1187519	1187524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23129	NC_011988	A	6	6	1187529	1187534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23130	NC_011988	T	6	6	1187563	1187568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23131	NC_011988	GCG	2	6	1187737	1187742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107092
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23133	NC_011988	TAC	2	6	1187794	1187799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107092
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23137	NC_011988	GCA	2	6	1187901	1187906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107092
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23150	NC_011988	GGC	2	6	1188649	1188654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107093
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23154	NC_011988	TCTA	2	8	1188830	1188837	25 %	50 %	0 %	25 %	222107093
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23221	NC_011988	CG	4	8	1192030	1192037	0 %	0 %	50 %	50 %	222107095
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23230	NC_011988	TGA	2	6	1192242	1192247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107096
23231	NC_011988	ATC	2	6	1192266	1192271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107096
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23235	NC_011988	GAT	2	6	1192472	1192477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107096
23236	NC_011988	ATG	2	6	1192487	1192492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107096
23237	NC_011988	GCC	2	6	1192493	1192498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107096
23238	NC_011988	CAA	2	6	1192564	1192569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107096
23239	NC_011988	GGC	2	6	1192618	1192623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107096
23240	NC_011988	GAC	2	6	1192627	1192632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107096
23241	NC_011988	CGG	2	6	1192648	1192653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107096
23242	NC_011988	TGGG	2	8	1192776	1192783	0 %	25 %	75 %	0 %	222107096
23243	NC_011988	CCCG	2	8	1192815	1192822	0 %	0 %	25 %	75 %	222107096
23244	NC_011988	CAC	2	6	1192888	1192893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107096
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23246	NC_011988	GCC	2	6	1192979	1192984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107096
23247	NC_011988	TCA	2	6	1192986	1192991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107096
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23249	NC_011988	A	6	6	1193006	1193011	100 %	0 %	0 %	0 %	222107096
23250	NC_011988	TCG	2	6	1193076	1193081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107096
23251	NC_011988	TAT	2	6	1193141	1193146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107096
23252	NC_011988	CAT	2	6	1193175	1193180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107096
23253	NC_011988	CGA	2	6	1193196	1193201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107096
23254	NC_011988	CGA	2	6	1193305	1193310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107096
23255	NC_011988	TGCC	2	8	1193316	1193323	0 %	25 %	25 %	50 %	222107096
23256	NC_011988	ACC	2	6	1193447	1193452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107096
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23258	NC_011988	TCA	2	6	1193539	1193544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23259	NC_011988	CG	3	6	1193596	1193601	0 %	0 %	50 %	50 %	222107097
23260	NC_011988	TCG	2	6	1193602	1193607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107097
23261	NC_011988	ACTG	2	8	1193624	1193631	25 %	25 %	25 %	25 %	222107097
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23263	NC_011988	ACA	2	6	1193761	1193766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107097
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23265	NC_011988	GCG	3	9	1193856	1193864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107097
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23272	NC_011988	TTG	2	6	1194090	1194095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107098
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23302	NC_011988	CGCC	2	8	1195915	1195922	0 %	0 %	25 %	75 %	222107102
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23322	NC_011988	GA	3	6	1196786	1196791	50 %	0 %	50 %	0 %	222107103
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23332	NC_011988	TGTC	2	8	1197378	1197385	0 %	50 %	25 %	25 %	222107105
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23339	NC_011988	GCCA	2	8	1197602	1197609	25 %	0 %	25 %	50 %	222107105
23340	NC_011988	TGGG	2	8	1197615	1197622	0 %	25 %	75 %	0 %	222107105
23341	NC_011988	GGC	3	9	1197646	1197654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107105
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23343	NC_011988	GGC	2	6	1197670	1197675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107105
23344	NC_011988	CTG	2	6	1197678	1197683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107105
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23346	NC_011988	CTG	2	6	1197764	1197769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107105
23347	NC_011988	GAC	2	6	1197788	1197793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107105
23348	NC_011988	GGC	2	6	1197818	1197823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107105
23349	NC_011988	TGA	2	6	1197850	1197855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107105
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23351	NC_011988	CCA	2	6	1197969	1197974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107105
23352	NC_011988	TGA	2	6	1198072	1198077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107105
23353	NC_011988	ATGA	2	8	1198094	1198101	50 %	25 %	25 %	0 %	222107105
23354	NC_011988	CAT	2	6	1198132	1198137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107105
23355	NC_011988	TGA	2	6	1198140	1198145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107105
23356	NC_011988	TGA	2	6	1198165	1198170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107105
23357	NC_011988	CTG	2	6	1198197	1198202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107105
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23363	NC_011988	GCA	2	6	1198505	1198510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107105
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23367	NC_011988	GCA	2	6	1198778	1198783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107105
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23370	NC_011988	TGA	2	6	1199019	1199024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107105
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23455	NC_011988	CT	3	6	1203526	1203531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23456	NC_011988	AT	3	6	1203532	1203537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23457	NC_011988	CT	3	6	1203579	1203584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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23467	NC_011988	GC	3	6	1204167	1204172	0 %	0 %	50 %	50 %	222107110
23468	NC_011988	TGC	2	6	1204175	1204180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23469	NC_011988	GGC	2	6	1204196	1204201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107110
23470	NC_011988	AGG	2	6	1204204	1204209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107110
23471	NC_011988	GCG	2	6	1204218	1204223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107110
23472	NC_011988	GCA	2	6	1204224	1204229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23473	NC_011988	TGGT	2	8	1204234	1204241	0 %	50 %	50 %	0 %	222107110
23474	NC_011988	CCAAAG	2	12	1204256	1204267	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222107110
23475	NC_011988	AGC	3	9	1204282	1204290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23476	NC_011988	TCA	2	6	1204294	1204299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107110
23477	NC_011988	TAC	2	6	1204313	1204318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107110
23478	NC_011988	GTG	2	6	1204372	1204377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107110
23479	NC_011988	A	7	7	1204432	1204438	100 %	0 %	0 %	0 %	222107110
23480	NC_011988	GCG	2	6	1204451	1204456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107110
23481	NC_011988	AGA	2	6	1204502	1204507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107110
23482	NC_011988	ATC	2	6	1204515	1204520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107110
23483	NC_011988	GGAA	2	8	1204527	1204534	50 %	0 %	50 %	0 %	222107110
23484	NC_011988	TGG	2	6	1204611	1204616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107110
23485	NC_011988	AGC	2	6	1204667	1204672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
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23487	NC_011988	A	6	6	1204736	1204741	100 %	0 %	0 %	0 %	222107110
23488	NC_011988	ACG	2	6	1204794	1204799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23489	NC_011988	GATG	2	8	1204817	1204824	25 %	25 %	50 %	0 %	222107110
23490	NC_011988	CGC	2	6	1205027	1205032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107110
23491	NC_011988	CG	3	6	1205089	1205094	0 %	0 %	50 %	50 %	222107110
23492	NC_011988	TGC	2	6	1205185	1205190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23493	NC_011988	CAG	2	6	1205253	1205258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23494	NC_011988	AGC	2	6	1205295	1205300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23495	NC_011988	TTG	2	6	1205341	1205346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107110
23496	NC_011988	ACG	2	6	1205421	1205426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23497	NC_011988	GCA	2	6	1205443	1205448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107110
23498	NC_011988	GTT	2	6	1205579	1205584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23499	NC_011988	TTCT	2	8	1205598	1205605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23500	NC_011988	CAA	2	6	1205688	1205693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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