MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_011988	ATC	2	6	1129218	1129223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107035
22002	NC_011988	CGC	2	6	1129271	1129276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107035
22003	NC_011988	GGCG	2	8	1129292	1129299	0 %	0 %	75 %	25 %	222107035
22004	NC_011988	CGA	2	6	1129394	1129399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107035
22005	NC_011988	TGC	2	6	1129402	1129407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107035
22006	NC_011988	GGT	2	6	1129493	1129498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107035
22007	NC_011988	CAC	2	6	1129526	1129531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107035
22008	NC_011988	ATC	2	6	1129539	1129544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107035
22009	NC_011988	CGAT	2	8	1129546	1129553	25 %	25 %	25 %	25 %	222107035
22010	NC_011988	GGC	2	6	1129554	1129559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107035
22011	NC_011988	TGG	2	6	1129622	1129627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107036
22012	NC_011988	TCA	2	6	1129657	1129662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107036
22013	NC_011988	CGC	2	6	1129684	1129689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107036
22014	NC_011988	A	7	7	1129753	1129759	100 %	0 %	0 %	0 %	222107036
22015	NC_011988	GCG	2	6	1129801	1129806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107036
22016	NC_011988	GTT	2	6	1129866	1129871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107036
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22021	NC_011988	TGG	2	6	1130059	1130064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107036
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22023	NC_011988	GC	3	6	1130142	1130147	0 %	0 %	50 %	50 %	222107036
22024	NC_011988	CGG	3	9	1130200	1130208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107036
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22032	NC_011988	CTG	2	6	1130577	1130582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107036
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22043	NC_011988	GAT	2	6	1131384	1131389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107037
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22054	NC_011988	CCAGC	2	10	1132113	1132122	20 %	0 %	20 %	60 %	222107037
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22061	NC_011988	GCCC	2	8	1132337	1132344	0 %	0 %	25 %	75 %	222107038
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22098	NC_011988	CTTC	2	8	1134281	1134288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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22117	NC_011988	TGG	2	6	1135072	1135077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107040
22118	NC_011988	GCT	2	6	1135110	1135115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107040
22119	NC_011988	CTG	2	6	1135164	1135169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107040
22120	NC_011988	GGCG	2	8	1135199	1135206	0 %	0 %	75 %	25 %	222107040
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22124	NC_011988	GTGG	2	8	1135556	1135563	0 %	25 %	75 %	0 %	222107041
22125	NC_011988	TCT	2	6	1135618	1135623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107041
22126	NC_011988	TGC	2	6	1135627	1135632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107041
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22128	NC_011988	CCG	2	6	1135743	1135748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107041
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22131	NC_011988	GCT	3	9	1135934	1135942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107042
22132	NC_011988	CTG	2	6	1135966	1135971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107042
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22153	NC_011988	CTGTT	2	10	1137375	1137384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22154	NC_011988	TC	4	8	1137409	1137416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22155	NC_011988	AAG	2	6	1137450	1137455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22157	NC_011988	TCCC	2	8	1137612	1137619	0 %	25 %	0 %	75 %	222107043
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22163	NC_011988	TGT	2	6	1137829	1137834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22230	NC_011988	GGC	2	6	1141511	1141516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107047
22231	NC_011988	ACCTT	2	10	1141534	1141543	20 %	40 %	0 %	40 %	222107047
22232	NC_011988	CCAGCT	2	12	1141637	1141648	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222107047
22233	NC_011988	ATC	2	6	1141714	1141719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107047
22234	NC_011988	ATCA	2	8	1141737	1141744	50 %	25 %	0 %	25 %	222107047
22235	NC_011988	GCG	2	6	1141747	1141752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107047
22236	NC_011988	TTG	3	9	1141777	1141785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107047
22237	NC_011988	TTC	2	6	1141798	1141803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107047
22238	NC_011988	GC	3	6	1141841	1141846	0 %	0 %	50 %	50 %	222107047
22239	NC_011988	GCC	2	6	1141851	1141856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107047
22240	NC_011988	GCC	2	6	1141860	1141865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107047
22241	NC_011988	GAC	2	6	1141872	1141877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107047
22242	NC_011988	CAT	2	6	1141883	1141888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107047
22243	NC_011988	GC	3	6	1141974	1141979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22244	NC_011988	GGACC	2	10	1141997	1142006	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22245	NC_011988	GAG	2	6	1142075	1142080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107048
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22247	NC_011988	ATC	2	6	1142132	1142137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107048
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22254	NC_011988	ATC	2	6	1142654	1142659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107048
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22324	NC_011988	GATC	2	8	1145952	1145959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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22336	NC_011988	ACG	2	6	1146534	1146539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107052
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22340	NC_011988	TGCGC	3	15	1146609	1146623	0 %	20 %	40 %	40 %	222107052
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22342	NC_011988	TGC	2	6	1146817	1146822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107052
22343	NC_011988	A	6	6	1146848	1146853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22344	NC_011988	CAA	2	6	1146854	1146859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22345	NC_011988	TCG	2	6	1146866	1146871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22346	NC_011988	GCG	2	6	1146984	1146989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107053
22347	NC_011988	GCT	2	6	1147100	1147105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107053
22348	NC_011988	GATG	2	8	1147271	1147278	25 %	25 %	50 %	0 %	222107053
22349	NC_011988	CAGCCT	2	12	1147285	1147296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222107053
22350	NC_011988	GCA	2	6	1147313	1147318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22351	NC_011988	GAG	2	6	1147331	1147336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22352	NC_011988	GAA	2	6	1147346	1147351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107054
22353	NC_011988	T	6	6	1147374	1147379	0 %	100 %	0 %	0 %	222107054
22354	NC_011988	CCG	2	6	1147401	1147406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107054
22355	NC_011988	TGC	2	6	1147435	1147440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107054
22356	NC_011988	CGC	2	6	1147444	1147449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107054
22357	NC_011988	AAG	2	6	1147686	1147691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107054
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22359	NC_011988	CGG	2	6	1147724	1147729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107054
22360	NC_011988	CGA	2	6	1147748	1147753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107054
22361	NC_011988	TTA	2	6	1147760	1147765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107054
22362	NC_011988	GAT	2	6	1147907	1147912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107054
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22365	NC_011988	CGC	2	6	1148043	1148048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107054
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22369	NC_011988	GTG	2	6	1148234	1148239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107055
22370	NC_011988	CGG	3	9	1148271	1148279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107055
22371	NC_011988	CGG	2	6	1148355	1148360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107055
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22373	NC_011988	GGA	2	6	1148550	1148555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107055
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22376	NC_011988	TGT	2	6	1148809	1148814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107056
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22381	NC_011988	GGC	2	6	1149077	1149082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107056
22382	NC_011988	TGA	2	6	1149092	1149097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107056
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22388	NC_011988	CGG	4	12	1149515	1149526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107056
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22393	NC_011988	CAGC	2	8	1149867	1149874	25 %	0 %	25 %	50 %	222107057
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22403	NC_011988	GCC	3	9	1150504	1150512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107057
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22409	NC_011988	A	6	6	1151004	1151009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22410	NC_011988	GGGC	2	8	1151048	1151055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22411	NC_011988	ATG	2	6	1151132	1151137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22412	NC_011988	T	6	6	1151166	1151171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22413	NC_011988	CAT	2	6	1151214	1151219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107058
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22423	NC_011988	GC	3	6	1151656	1151661	0 %	0 %	50 %	50 %	222107058
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22450	NC_011988	GCT	2	6	1153026	1153031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107058
22451	NC_011988	GGA	2	6	1153047	1153052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107058
22452	NC_011988	CTGT	2	8	1153090	1153097	0 %	50 %	25 %	25 %	222107058
22453	NC_011988	ATG	2	6	1153100	1153105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107058
22454	NC_011988	CTG	2	6	1153117	1153122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107058
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22458	NC_011988	TCG	2	6	1153379	1153384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107058
22459	NC_011988	TGA	2	6	1153400	1153405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107058
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22461	NC_011988	TCA	2	6	1153511	1153516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107058
22462	NC_011988	TTCC	2	8	1153551	1153558	0 %	50 %	0 %	50 %	222107058
22463	NC_011988	TGC	2	6	1153634	1153639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107058
22464	NC_011988	CGG	2	6	1153770	1153775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107058
22465	NC_011988	GGT	2	6	1153834	1153839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107058
22466	NC_011988	AG	3	6	1153845	1153850	50 %	0 %	50 %	0 %	222107058
22467	NC_011988	CGA	2	6	1153851	1153856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107058
22468	NC_011988	GGT	2	6	1153878	1153883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107058
22469	NC_011988	CGC	2	6	1153947	1153952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107058
22470	NC_011988	TGG	2	6	1153958	1153963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107058
22471	NC_011988	GGTC	2	8	1153986	1153993	0 %	25 %	50 %	25 %	222107058
22472	NC_011988	TTC	2	6	1154031	1154036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107058
22473	NC_011988	TGA	2	6	1154067	1154072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107058
22474	NC_011988	GA	3	6	1154086	1154091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22475	NC_011988	GAC	2	6	1154097	1154102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22476	NC_011988	TGA	2	6	1154114	1154119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22477	NC_011988	GAT	2	6	1154124	1154129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22478	NC_011988	ATA	2	6	1154238	1154243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22479	NC_011988	ATT	2	6	1154308	1154313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107059
22480	NC_011988	CG	3	6	1154314	1154319	0 %	0 %	50 %	50 %	222107059
22481	NC_011988	CTG	2	6	1154623	1154628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107059
22482	NC_011988	CT	3	6	1154690	1154695	0 %	50 %	0 %	50 %	222107059
22483	NC_011988	GC	3	6	1154698	1154703	0 %	0 %	50 %	50 %	222107059
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22487	NC_011988	TC	3	6	1154841	1154846	0 %	50 %	0 %	50 %	222107059
22488	NC_011988	GC	4	8	1154910	1154917	0 %	0 %	50 %	50 %	222107059
22489	NC_011988	GCC	2	6	1154939	1154944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107059
22490	NC_011988	TGA	2	6	1154952	1154957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107059
22491	NC_011988	TGG	2	6	1154974	1154979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107059
22492	NC_011988	TTC	2	6	1155027	1155032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107059
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22494	NC_011988	GC	3	6	1155088	1155093	0 %	0 %	50 %	50 %	222107059
22495	NC_011988	GA	3	6	1155100	1155105	50 %	0 %	50 %	0 %	222107059
22496	NC_011988	CGATGC	2	12	1155106	1155117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222107059
22497	NC_011988	GCTG	2	8	1155129	1155136	0 %	25 %	50 %	25 %	222107059
22498	NC_011988	CGGCT	2	10	1155146	1155155	0 %	20 %	40 %	40 %	222107059
22499	NC_011988	GCC	2	6	1155164	1155169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107059
22500	NC_011988	CGA	2	6	1155250	1155255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107059

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