MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_011988	CG	3	6	1078455	1078460	0 %	0 %	50 %	50 %	222106993
21003	NC_011988	TGA	2	6	1078504	1078509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106993
21004	NC_011988	CGG	2	6	1078602	1078607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106993
21005	NC_011988	GCG	2	6	1078610	1078615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106993
21006	NC_011988	GAC	2	6	1078670	1078675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106993
21007	NC_011988	TCTG	2	8	1078681	1078688	0 %	50 %	25 %	25 %	222106993
21008	NC_011988	TGG	2	6	1078714	1078719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106993
21009	NC_011988	TGC	2	6	1078768	1078773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106993
21010	NC_011988	TGC	2	6	1078776	1078781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106993
21011	NC_011988	GC	3	6	1078780	1078785	0 %	0 %	50 %	50 %	222106993
21012	NC_011988	GTC	2	6	1078898	1078903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106993
21013	NC_011988	TGG	2	6	1078924	1078929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106993
21014	NC_011988	GCCT	2	8	1078982	1078989	0 %	25 %	25 %	50 %	222106993
21015	NC_011988	GACGCT	2	12	1079005	1079016	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106993
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21017	NC_011988	GTG	2	6	1079112	1079117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106993
21018	NC_011988	GGC	2	6	1079122	1079127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106993
21019	NC_011988	CCG	2	6	1079143	1079148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106993
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21039	NC_011988	TGCCG	2	10	1080163	1080172	0 %	20 %	40 %	40 %	222106993
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21052	NC_011988	GC	3	6	1080705	1080710	0 %	0 %	50 %	50 %	222106994
21053	NC_011988	CAT	2	6	1080740	1080745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106994
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21070	NC_011988	ATG	2	6	1081753	1081758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21090	NC_011988	CTG	2	6	1083001	1083006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21108	NC_011988	GCTG	2	8	1084329	1084336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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21112	NC_011988	AAT	2	6	1084418	1084423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21113	NC_011988	GATG	2	8	1084439	1084446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21114	NC_011988	CT	3	6	1084581	1084586	0 %	50 %	0 %	50 %	222106997
21115	NC_011988	CGC	2	6	1084594	1084599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106997
21116	NC_011988	GCT	2	6	1084618	1084623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106997
21117	NC_011988	TTG	2	6	1084638	1084643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106997
21118	NC_011988	ATGGC	2	10	1084656	1084665	20 %	20 %	40 %	20 %	222106997
21119	NC_011988	CTCC	2	8	1084698	1084705	0 %	25 %	0 %	75 %	222106997
21120	NC_011988	GATT	2	8	1084743	1084750	25 %	50 %	25 %	0 %	222106997
21121	NC_011988	ATT	2	6	1084775	1084780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106997
21122	NC_011988	GCC	2	6	1084796	1084801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106997
21123	NC_011988	GGA	2	6	1084828	1084833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106997
21124	NC_011988	CTG	2	6	1084885	1084890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106997
21125	NC_011988	CATGC	2	10	1085010	1085019	20 %	20 %	20 %	40 %	222106998
21126	NC_011988	GT	3	6	1085023	1085028	0 %	50 %	50 %	0 %	222106998
21127	NC_011988	GCC	2	6	1085043	1085048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106998
21128	NC_011988	TGA	2	6	1085092	1085097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106998
21129	NC_011988	GTC	2	6	1085146	1085151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106998
21130	NC_011988	TCA	2	6	1085179	1085184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106998
21131	NC_011988	GCT	2	6	1085213	1085218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106998
21132	NC_011988	TGGC	2	8	1085219	1085226	0 %	25 %	50 %	25 %	222106998
21133	NC_011988	TCG	2	6	1085425	1085430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106998
21134	NC_011988	GGT	2	6	1085486	1085491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106998
21135	NC_011988	CAT	2	6	1085498	1085503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106998
21136	NC_011988	GCG	2	6	1085531	1085536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106998
21137	NC_011988	CTCG	2	8	1085564	1085571	0 %	25 %	25 %	50 %	222106998
21138	NC_011988	TGC	2	6	1085587	1085592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106998
21139	NC_011988	CTT	2	6	1085685	1085690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106998
21140	NC_011988	CTG	2	6	1085739	1085744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106998
21141	NC_011988	CATTG	2	10	1085766	1085775	20 %	40 %	20 %	20 %	222106998
21142	NC_011988	TTC	2	6	1085808	1085813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106998
21143	NC_011988	GCC	2	6	1085862	1085867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106998
21144	NC_011988	GTC	2	6	1085877	1085882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106998
21145	NC_011988	GTCG	2	8	1085912	1085919	0 %	25 %	50 %	25 %	222106998
21146	NC_011988	GCA	2	6	1085935	1085940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106998
21147	NC_011988	CGG	2	6	1085962	1085967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106998
21148	NC_011988	GGC	2	6	1085972	1085977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106998
21149	NC_011988	AAAC	2	8	1086004	1086011	75 %	0 %	0 %	25 %	222106998
21150	NC_011988	CTAT	2	8	1086042	1086049	25 %	50 %	0 %	25 %	222106999
21151	NC_011988	CCA	2	6	1086140	1086145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106999
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21153	NC_011988	TTG	2	6	1086269	1086274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106999
21154	NC_011988	GATGC	2	10	1086275	1086284	20 %	20 %	40 %	20 %	222106999
21155	NC_011988	GGC	2	6	1086497	1086502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107000
21156	NC_011988	CT	3	6	1086554	1086559	0 %	50 %	0 %	50 %	222107000
21157	NC_011988	GCT	2	6	1086605	1086610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107000
21158	NC_011988	ATC	2	6	1086682	1086687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107000
21159	NC_011988	GC	3	6	1086704	1086709	0 %	0 %	50 %	50 %	222107000
21160	NC_011988	AGGTC	2	10	1086728	1086737	20 %	20 %	40 %	20 %	222107000
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21163	NC_011988	TCC	2	6	1086945	1086950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107000
21164	NC_011988	GACG	2	8	1086981	1086988	25 %	0 %	50 %	25 %	222107000
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21166	NC_011988	CGT	2	6	1087016	1087021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107000
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21168	NC_011988	GACC	2	8	1087082	1087089	25 %	0 %	25 %	50 %	222107000
21169	NC_011988	AGCG	2	8	1087095	1087102	25 %	0 %	50 %	25 %	222107000
21170	NC_011988	AGG	2	6	1087105	1087110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107000
21171	NC_011988	CAACA	2	10	1087139	1087148	60 %	0 %	0 %	40 %	222107000
21172	NC_011988	CCAGTC	2	12	1087167	1087178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222107001
21173	NC_011988	CGAC	2	8	1087191	1087198	25 %	0 %	25 %	50 %	222107001
21174	NC_011988	ATC	2	6	1087241	1087246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107001
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21177	NC_011988	CTG	2	6	1087349	1087354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107001
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21180	NC_011988	CGCTG	2	10	1087438	1087447	0 %	20 %	40 %	40 %	222107001
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21183	NC_011988	CGA	2	6	1087626	1087631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107001
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21186	NC_011988	GGGT	2	8	1087749	1087756	0 %	25 %	75 %	0 %	222107001
21187	NC_011988	CAT	2	6	1087796	1087801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107001
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21189	NC_011988	CCG	2	6	1087941	1087946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107001
21190	NC_011988	ATG	2	6	1088003	1088008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107001
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21192	NC_011988	TTG	2	6	1088084	1088089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107001
21193	NC_011988	GCA	2	6	1088154	1088159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107001
21194	NC_011988	CCG	2	6	1088229	1088234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107001
21195	NC_011988	CTTTCG	2	12	1088262	1088273	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222107001
21196	NC_011988	GAT	2	6	1088278	1088283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107001
21197	NC_011988	TC	3	6	1088402	1088407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21198	NC_011988	ACCCC	2	10	1088443	1088452	20 %	0 %	0 %	80 %	222107002
21199	NC_011988	GAT	2	6	1088465	1088470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107002
21200	NC_011988	GGCC	2	8	1088552	1088559	0 %	0 %	50 %	50 %	222107002
21201	NC_011988	GCA	2	6	1088623	1088628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107002
21202	NC_011988	GGT	2	6	1088683	1088688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107002
21203	NC_011988	CAC	2	6	1088707	1088712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107002
21204	NC_011988	GAT	2	6	1088717	1088722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107002
21205	NC_011988	TCG	2	6	1088814	1088819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107002
21206	NC_011988	GCG	2	6	1088835	1088840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107002
21207	NC_011988	GAT	2	6	1088876	1088881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107002
21208	NC_011988	CAGG	2	8	1088935	1088942	25 %	0 %	50 %	25 %	222107002
21209	NC_011988	CGG	2	6	1088971	1088976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107002
21210	NC_011988	CCA	2	6	1088980	1088985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107002
21211	NC_011988	GCC	2	6	1089033	1089038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107002
21212	NC_011988	AGGGC	2	10	1089042	1089051	20 %	0 %	60 %	20 %	222107002
21213	NC_011988	GGA	2	6	1089061	1089066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107002
21214	NC_011988	TCA	2	6	1089075	1089080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107002
21215	NC_011988	CGA	3	9	1089082	1089090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107002
21216	NC_011988	CCG	2	6	1089180	1089185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107003
21217	NC_011988	GCC	2	6	1089205	1089210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107003
21218	NC_011988	CAA	2	6	1089219	1089224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107003
21219	NC_011988	TGGCAA	2	12	1089231	1089242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222107003
21220	NC_011988	ATC	2	6	1089373	1089378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107003
21221	NC_011988	CGC	3	9	1089405	1089413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107003
21222	NC_011988	AAC	2	6	1089443	1089448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107003
21223	NC_011988	GCA	2	6	1089477	1089482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107003
21224	NC_011988	GCCT	2	8	1089604	1089611	0 %	25 %	25 %	50 %	222107003
21225	NC_011988	GCA	2	6	1089681	1089686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107003
21226	NC_011988	CGA	2	6	1089692	1089697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107003
21227	NC_011988	GCG	2	6	1089762	1089767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107003
21228	NC_011988	CTC	2	6	1089913	1089918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107003
21229	NC_011988	CGCCA	2	10	1090081	1090090	20 %	0 %	20 %	60 %	222107003
21230	NC_011988	CGG	2	6	1090102	1090107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107003
21231	NC_011988	CAG	2	6	1090109	1090114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107003
21232	NC_011988	CGG	2	6	1090191	1090196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107003
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21465	NC_011988	GGC	3	9	1101721	1101729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107009
21466	NC_011988	GCT	2	6	1101748	1101753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107009
21467	NC_011988	ACG	2	6	1101796	1101801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107009
21468	NC_011988	CCAA	2	8	1101809	1101816	50 %	0 %	0 %	50 %	222107009
21469	NC_011988	TGA	2	6	1101837	1101842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107009
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21471	NC_011988	GCT	2	6	1101943	1101948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107009
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21500	NC_011988	TGG	2	6	1103614	1103619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107011

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