MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011988	TCT	2	6	1001736	1001741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106941
19502	NC_011988	GTTG	2	8	1001776	1001783	0 %	50 %	50 %	0 %	222106941
19503	NC_011988	AGT	2	6	1001806	1001811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106941
19504	NC_011988	GCC	2	6	1001957	1001962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106941
19505	NC_011988	GTC	2	6	1002009	1002014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106941
19506	NC_011988	GCT	2	6	1002113	1002118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106941
19507	NC_011988	GA	3	6	1002120	1002125	50 %	0 %	50 %	0 %	222106941
19508	NC_011988	GGC	2	6	1002145	1002150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106941
19509	NC_011988	TCC	2	6	1002174	1002179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106941
19510	NC_011988	CAT	2	6	1002196	1002201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106941
19511	NC_011988	GC	3	6	1002203	1002208	0 %	0 %	50 %	50 %	222106941
19512	NC_011988	CTG	2	6	1002233	1002238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106941
19513	NC_011988	GAA	2	6	1002347	1002352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106941
19514	NC_011988	GCTC	2	8	1002404	1002411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19515	NC_011988	TCGC	2	8	1002420	1002427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19516	NC_011988	GCA	2	6	1002457	1002462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19517	NC_011988	GCG	2	6	1002514	1002519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19518	NC_011988	ATA	2	6	1002679	1002684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106942
19519	NC_011988	GAC	2	6	1002709	1002714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
19520	NC_011988	TGA	2	6	1002860	1002865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106942
19521	NC_011988	TGA	2	6	1002894	1002899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106942
19522	NC_011988	CAG	2	6	1002973	1002978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
19523	NC_011988	GCGCC	2	10	1003064	1003073	0 %	0 %	40 %	60 %	222106942
19524	NC_011988	TGCA	2	8	1003111	1003118	25 %	25 %	25 %	25 %	222106942
19525	NC_011988	CAG	2	6	1003201	1003206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
19526	NC_011988	GC	4	8	1003239	1003246	0 %	0 %	50 %	50 %	222106942
19527	NC_011988	CGGTC	2	10	1003272	1003281	0 %	20 %	40 %	40 %	222106942
19528	NC_011988	TCA	2	6	1003293	1003298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106942
19529	NC_011988	ATC	2	6	1003325	1003330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106942
19530	NC_011988	TCG	2	6	1003355	1003360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106942
19531	NC_011988	CCA	2	6	1003398	1003403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106942
19532	NC_011988	AATCG	2	10	1003450	1003459	40 %	20 %	20 %	20 %	222106942
19533	NC_011988	TTC	2	6	1003468	1003473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106942
19534	NC_011988	CAG	2	6	1003564	1003569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
19535	NC_011988	TC	3	6	1003647	1003652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19536	NC_011988	GCG	2	6	1003655	1003660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19537	NC_011988	GC	3	6	1003678	1003683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19538	NC_011988	AACCG	2	10	1003785	1003794	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19539	NC_011988	GAA	2	6	1003846	1003851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106943
19540	NC_011988	CGGTA	2	10	1003972	1003981	20 %	20 %	40 %	20 %	222106943
19541	NC_011988	GGTT	2	8	1004061	1004068	0 %	50 %	50 %	0 %	222106943
19542	NC_011988	CCA	2	6	1004136	1004141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106943
19543	NC_011988	GAT	2	6	1004179	1004184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106943
19544	NC_011988	ATG	2	6	1004186	1004191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106943
19545	NC_011988	CGG	2	6	1004220	1004225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106943
19546	NC_011988	GTCGCT	2	12	1004248	1004259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106943
19547	NC_011988	CAG	2	6	1004311	1004316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106943
19548	NC_011988	GGA	2	6	1004336	1004341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106943
19549	NC_011988	CTG	2	6	1004462	1004467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106943
19550	NC_011988	GCG	2	6	1004513	1004518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106943
19551	NC_011988	AGC	2	6	1004587	1004592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106943
19552	NC_011988	GGT	2	6	1004599	1004604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106943
19553	NC_011988	GCA	2	6	1004638	1004643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19554	NC_011988	A	7	7	1004671	1004677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19555	NC_011988	AT	3	6	1004814	1004819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19556	NC_011988	GAT	2	6	1004872	1004877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19557	NC_011988	GGCAA	2	10	1004891	1004900	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19558	NC_011988	GAT	2	6	1004947	1004952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19559	NC_011988	CAA	2	6	1005073	1005078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19560	NC_011988	AGC	2	6	1005126	1005131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19561	NC_011988	ATTC	2	8	1005135	1005142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19562	NC_011988	TAT	2	6	1005243	1005248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19563	NC_011988	TTGT	2	8	1005250	1005257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19564	NC_011988	A	6	6	1005273	1005278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19565	NC_011988	TGC	2	6	1005292	1005297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19566	NC_011988	CATAT	2	10	1005319	1005328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19567	NC_011988	CAT	2	6	1005361	1005366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19568	NC_011988	A	7	7	1005372	1005378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19569	NC_011988	GAG	2	6	1005470	1005475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106944
19570	NC_011988	CTG	2	6	1005500	1005505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106944
19571	NC_011988	TGC	2	6	1005517	1005522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106944
19572	NC_011988	GGC	2	6	1005529	1005534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106944
19573	NC_011988	AC	3	6	1005574	1005579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19574	NC_011988	TGT	2	6	1005637	1005642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19575	NC_011988	GC	3	6	1005749	1005754	0 %	0 %	50 %	50 %	222106945
19576	NC_011988	TCG	2	6	1005789	1005794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106945
19577	NC_011988	GGC	2	6	1005869	1005874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106945
19578	NC_011988	TGC	3	9	1005910	1005918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106945
19579	NC_011988	AAT	2	6	1005968	1005973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106945
19580	NC_011988	GA	3	6	1006107	1006112	50 %	0 %	50 %	0 %	222106945
19581	NC_011988	T	6	6	1006159	1006164	0 %	100 %	0 %	0 %	222106945
19582	NC_011988	CCG	2	6	1006249	1006254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19583	NC_011988	CGT	2	6	1006266	1006271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19584	NC_011988	AAC	2	6	1006295	1006300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19585	NC_011988	TTAC	2	8	1006318	1006325	25 %	50 %	0 %	25 %	222106946
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19587	NC_011988	CCG	2	6	1006371	1006376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106946
19588	NC_011988	CGA	2	6	1006383	1006388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106946
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19590	NC_011988	GC	3	6	1006486	1006491	0 %	0 %	50 %	50 %	222106946
19591	NC_011988	TGA	2	6	1006503	1006508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106946
19592	NC_011988	GAC	2	6	1006513	1006518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106946
19593	NC_011988	CCGG	2	8	1006568	1006575	0 %	0 %	50 %	50 %	222106946
19594	NC_011988	CGA	2	6	1006626	1006631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106946
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19599	NC_011988	GCT	2	6	1006867	1006872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106947
19600	NC_011988	GAGG	2	8	1006933	1006940	25 %	0 %	75 %	0 %	222106947
19601	NC_011988	GCT	2	6	1006977	1006982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106947
19602	NC_011988	TGCTTC	2	12	1007011	1007022	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222106947
19603	NC_011988	CAA	2	6	1007121	1007126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19604	NC_011988	GAT	2	6	1007188	1007193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19605	NC_011988	GC	3	6	1007213	1007218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19606	NC_011988	CGG	2	6	1007296	1007301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19607	NC_011988	CTT	2	6	1007308	1007313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19608	NC_011988	CGA	2	6	1007419	1007424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106948
19609	NC_011988	CCGA	2	8	1007502	1007509	25 %	0 %	25 %	50 %	222106948
19610	NC_011988	GA	3	6	1007508	1007513	50 %	0 %	50 %	0 %	222106948
19611	NC_011988	CGA	2	6	1007515	1007520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106948
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19613	NC_011988	GCG	2	6	1007584	1007589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19614	NC_011988	ATG	2	6	1007599	1007604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19615	NC_011988	T	6	6	1007618	1007623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19616	NC_011988	GCA	2	6	1007644	1007649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106949
19617	NC_011988	GCA	2	6	1007653	1007658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106949
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19619	NC_011988	TTG	2	6	1007847	1007852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106949
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19732	NC_011988	GAT	2	6	1014066	1014071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106953
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19737	NC_011988	TGG	2	6	1014187	1014192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106953
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19744	NC_011988	CGA	2	6	1014410	1014415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106953
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19852	NC_011988	CG	3	6	1019511	1019516	0 %	0 %	50 %	50 %	222106956
19853	NC_011988	AGC	2	6	1019573	1019578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106956
19854	NC_011988	A	6	6	1019602	1019607	100 %	0 %	0 %	0 %	222106956
19855	NC_011988	ATC	2	6	1019944	1019949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106957
19856	NC_011988	GGA	2	6	1019970	1019975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106957
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19858	NC_011988	CCG	2	6	1020022	1020027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106957
19859	NC_011988	TGAT	2	8	1020158	1020165	25 %	50 %	25 %	0 %	222106957
19860	NC_011988	GTG	2	6	1020175	1020180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106957
19861	NC_011988	GCA	2	6	1020197	1020202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106957
19862	NC_011988	TGTCCA	2	12	1020255	1020266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222106957
19863	NC_011988	TGG	2	6	1020326	1020331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106957
19864	NC_011988	ACC	2	6	1020334	1020339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106957
19865	NC_011988	T	6	6	1020348	1020353	0 %	100 %	0 %	0 %	222106957
19866	NC_011988	CAG	2	6	1020393	1020398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106957
19867	NC_011988	TTGA	2	8	1020496	1020503	25 %	50 %	25 %	0 %	222106957
19868	NC_011988	CAA	2	6	1020588	1020593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106957
19869	NC_011988	TTG	2	6	1020607	1020612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106957
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19871	NC_011988	TGG	2	6	1020833	1020838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106957
19872	NC_011988	CG	3	6	1020948	1020953	0 %	0 %	50 %	50 %	222106957
19873	NC_011988	GCG	2	6	1020955	1020960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106957
19874	NC_011988	GC	3	6	1021086	1021091	0 %	0 %	50 %	50 %	222106957
19875	NC_011988	CCTG	2	8	1021092	1021099	0 %	25 %	25 %	50 %	222106957
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19878	NC_011988	CA	3	6	1021240	1021245	50 %	0 %	0 %	50 %	222106958
19879	NC_011988	CTG	2	6	1021248	1021253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106958
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19889	NC_011988	GCT	2	6	1021736	1021741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106958
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19904	NC_011988	GCG	2	6	1022373	1022378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106959
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19935	NC_011988	CTG	2	6	1023900	1023905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19969	NC_011988	CAG	2	6	1025798	1025803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106960
19970	NC_011988	TGCC	2	8	1025856	1025863	0 %	25 %	25 %	50 %	222106960
19971	NC_011988	CAG	2	6	1025864	1025869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106960
19972	NC_011988	CGT	2	6	1025919	1025924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106960
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