MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011988	TGCC	2	8	570493	570500	0 %	25 %	25 %	50 %	222106589
11002	NC_011988	GGC	2	6	570665	570670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11003	NC_011988	CAG	2	6	570677	570682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11004	NC_011988	GCG	2	6	570701	570706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11005	NC_011988	CTT	2	6	570782	570787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106590
11006	NC_011988	TGC	2	6	570815	570820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11007	NC_011988	GAC	2	6	570833	570838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11008	NC_011988	CGG	2	6	570856	570861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11009	NC_011988	AGC	2	6	570863	570868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11010	NC_011988	CCG	2	6	570926	570931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106590
11011	NC_011988	GGGC	2	8	570942	570949	0 %	0 %	75 %	25 %	222106590
11012	NC_011988	GAT	2	6	570968	570973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11013	NC_011988	ATC	2	6	571032	571037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106590
11014	NC_011988	ACCG	2	8	571067	571074	25 %	0 %	25 %	50 %	222106590
11015	NC_011988	TCA	2	6	571233	571238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106590
11016	NC_011988	GTC	2	6	571265	571270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11017	NC_011988	TTGGC	2	10	571273	571282	0 %	40 %	40 %	20 %	222106590
11018	NC_011988	GCT	2	6	571323	571328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11019	NC_011988	TCA	2	6	571365	571370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106590
11020	NC_011988	TCCAGG	2	12	571423	571434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11021	NC_011988	GAT	3	9	571463	571471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11022	NC_011988	GAC	2	6	571505	571510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11023	NC_011988	CAG	2	6	571517	571522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11024	NC_011988	ATC	2	6	571614	571619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106590
11025	NC_011988	GAT	2	6	571631	571636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11026	NC_011988	GTC	2	6	571682	571687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11027	NC_011988	GTT	2	6	571708	571713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106590
11028	NC_011988	TGA	2	6	571777	571782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11029	NC_011988	CGC	2	6	571783	571788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106590
11030	NC_011988	CAG	3	9	571964	571972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11031	NC_011988	GC	3	6	572013	572018	0 %	0 %	50 %	50 %	222106590
11032	NC_011988	AGGC	2	8	572065	572072	25 %	0 %	50 %	25 %	222106590
11033	NC_011988	CGC	2	6	572133	572138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106590
11034	NC_011988	CATCCG	2	12	572197	572208	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106590
11035	NC_011988	AGA	2	6	572230	572235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106590
11036	NC_011988	CAG	2	6	572255	572260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11037	NC_011988	G	7	7	572279	572285	0 %	0 %	100 %	0 %	222106590
11038	NC_011988	CAG	2	6	572384	572389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11039	NC_011988	GAT	2	6	572420	572425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11040	NC_011988	GGC	2	6	572503	572508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11041	NC_011988	CAG	2	6	572516	572521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11042	NC_011988	GCG	2	6	572587	572592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11043	NC_011988	GATA	2	8	572686	572693	50 %	25 %	25 %	0 %	222106590
11044	NC_011988	TCG	2	6	572712	572717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11045	NC_011988	CAG	3	9	572750	572758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11046	NC_011988	TCA	2	6	572764	572769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106590
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11048	NC_011988	GCG	2	6	572800	572805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11049	NC_011988	CGG	2	6	572811	572816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11050	NC_011988	GCG	2	6	572840	572845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11051	NC_011988	CGG	2	6	572848	572853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106590
11052	NC_011988	TCG	2	6	572910	572915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11053	NC_011988	ATG	2	6	572973	572978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11054	NC_011988	CGTCAC	2	12	573061	573072	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106590
11055	NC_011988	ATTG	2	8	573100	573107	25 %	50 %	25 %	0 %	222106590
11056	NC_011988	CAG	2	6	573116	573121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106590
11057	NC_011988	CG	3	6	573152	573157	0 %	0 %	50 %	50 %	222106590
11058	NC_011988	TCT	2	6	573160	573165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106590
11059	NC_011988	TGG	2	6	573333	573338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106590
11060	NC_011988	TAG	2	6	573357	573362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11061	NC_011988	GCCA	2	8	573365	573372	25 %	0 %	25 %	50 %	222106590
11062	NC_011988	GAT	2	6	573413	573418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
11063	NC_011988	GCTC	2	8	573498	573505	0 %	25 %	25 %	50 %	222106590
11064	NC_011988	GAT	2	6	573548	573553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106590
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11067	NC_011988	GATA	2	8	573802	573809	50 %	25 %	25 %	0 %	222106590
11068	NC_011988	CTG	2	6	573845	573850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106590
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11070	NC_011988	GCA	2	6	574140	574145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106591
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11083	NC_011988	TGT	2	6	575064	575069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106591
11084	NC_011988	GGAT	2	8	575099	575106	25 %	25 %	50 %	0 %	222106591
11085	NC_011988	CGG	2	6	575107	575112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106591
11086	NC_011988	TGGC	2	8	575145	575152	0 %	25 %	50 %	25 %	222106591
11087	NC_011988	TGA	2	6	575160	575165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106591
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11091	NC_011988	CCT	2	6	575457	575462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106591
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11099	NC_011988	GCAG	2	8	575868	575875	25 %	0 %	50 %	25 %	222106591
11100	NC_011988	GCCC	2	8	575877	575884	0 %	0 %	25 %	75 %	222106591
11101	NC_011988	CGA	2	6	576021	576026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106591
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11104	NC_011988	CATG	2	8	576228	576235	25 %	25 %	25 %	25 %	222106591
11105	NC_011988	GCG	2	6	576243	576248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106591
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11107	NC_011988	CCGTG	2	10	576351	576360	0 %	20 %	40 %	40 %	222106591
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11118	NC_011988	CGC	2	6	576867	576872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106591
11119	NC_011988	GGC	2	6	576953	576958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106591
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11122	NC_011988	ATA	2	6	577048	577053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106591
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11126	NC_011988	TGG	2	6	577290	577295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_011988	TGG	2	6	577322	577327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11221	NC_011988	T	6	6	581768	581773	0 %	100 %	0 %	0 %	222106595
11222	NC_011988	AT	3	6	581777	581782	50 %	50 %	0 %	0 %	222106595
11223	NC_011988	CTGG	2	8	581784	581791	0 %	25 %	50 %	25 %	222106595
11224	NC_011988	GTC	2	6	581869	581874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106595
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11227	NC_011988	GAC	2	6	582097	582102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11228	NC_011988	TGA	2	6	582156	582161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11229	NC_011988	TGA	2	6	582208	582213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106596
11230	NC_011988	CAGC	2	8	582219	582226	25 %	0 %	25 %	50 %	222106596
11231	NC_011988	CGC	2	6	582263	582268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106596
11232	NC_011988	CGA	2	6	582363	582368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106596
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11234	NC_011988	TCG	2	6	582431	582436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106596
11235	NC_011988	GC	3	6	582446	582451	0 %	0 %	50 %	50 %	222106596
11236	NC_011988	CATG	2	8	582501	582508	25 %	25 %	25 %	25 %	222106596
11237	NC_011988	ACG	2	6	582557	582562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106596
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11240	NC_011988	GCC	2	6	582774	582779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106596
11241	NC_011988	CCAG	2	8	582825	582832	25 %	0 %	25 %	50 %	222106596
11242	NC_011988	AGG	2	6	582843	582848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106596
11243	NC_011988	TCA	2	6	582980	582985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106596
11244	NC_011988	CAGC	2	8	583002	583009	25 %	0 %	25 %	50 %	222106596
11245	NC_011988	CGC	2	6	583036	583041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106596
11246	NC_011988	GTC	2	6	583055	583060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106596
11247	NC_011988	TCC	2	6	583124	583129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106596
11248	NC_011988	GCGCA	2	10	583159	583168	20 %	0 %	40 %	40 %	222106596
11249	NC_011988	ATCGAC	2	12	583189	583200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222106596
11250	NC_011988	TGG	2	6	583227	583232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106596
11251	NC_011988	ATGGC	2	10	583241	583250	20 %	20 %	40 %	20 %	222106596
11252	NC_011988	GAGAAT	2	12	583273	583284	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222106596
11253	NC_011988	ACGG	2	8	583285	583292	25 %	0 %	50 %	25 %	222106596
11254	NC_011988	GT	3	6	583293	583298	0 %	50 %	50 %	0 %	222106596
11255	NC_011988	TGT	2	6	583453	583458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106597
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11258	NC_011988	GCGCC	2	10	583522	583531	0 %	0 %	40 %	60 %	222106597
11259	NC_011988	CGC	2	6	583559	583564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106597
11260	NC_011988	TCG	2	6	583843	583848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106597
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11262	NC_011988	TGTCGC	2	12	583961	583972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106597
11263	NC_011988	ATGC	2	8	583998	584005	25 %	25 %	25 %	25 %	222106597
11264	NC_011988	CAC	2	6	584025	584030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106597
11265	NC_011988	T	6	6	584324	584329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11266	NC_011988	GAAT	2	8	584349	584356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11267	NC_011988	CAG	2	6	584357	584362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11270	NC_011988	GAC	2	6	584682	584687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106598
11271	NC_011988	TCC	2	6	584732	584737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106598
11272	NC_011988	AGG	2	6	584744	584749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106598
11273	NC_011988	GAT	2	6	584787	584792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106598
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11277	NC_011988	AGAC	2	8	585067	585074	50 %	0 %	25 %	25 %	222106598
11278	NC_011988	TATTT	2	10	585143	585152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11279	NC_011988	TGA	2	6	585274	585279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106599
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11312	NC_011988	GCAGG	2	10	587271	587280	20 %	0 %	60 %	20 %	222106600
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11321	NC_011988	GCCT	2	8	587622	587629	0 %	25 %	25 %	50 %	222106600
11322	NC_011988	AAG	2	6	587809	587814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106600
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11347	NC_011988	CGC	2	6	588932	588937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106600
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11349	NC_011988	CGA	2	6	589022	589027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106600
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11351	NC_011988	GCC	2	6	589174	589179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106600
11352	NC_011988	AAGAT	2	10	589216	589225	60 %	20 %	20 %	0 %	222106600
11353	NC_011988	GGC	2	6	589272	589277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11354	NC_011988	TGT	2	6	589290	589295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11355	NC_011988	CTG	2	6	589297	589302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11356	NC_011988	GCT	2	6	589415	589420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106601
11357	NC_011988	GC	3	6	589473	589478	0 %	0 %	50 %	50 %	222106601
11358	NC_011988	TCAT	2	8	589491	589498	25 %	50 %	0 %	25 %	222106601
11359	NC_011988	AGC	2	6	589509	589514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106601
11360	NC_011988	CGC	2	6	589534	589539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106601
11361	NC_011988	GCC	2	6	589547	589552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106601
11362	NC_011988	GGA	2	6	589553	589558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106601
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11364	NC_011988	TGG	2	6	589692	589697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106601
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11379	NC_011988	GTT	2	6	590699	590704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11381	NC_011988	GC	3	6	590762	590767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11382	NC_011988	CTCC	2	8	590772	590779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11383	NC_011988	CG	3	6	590787	590792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11384	NC_011988	GCC	2	6	590799	590804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11385	NC_011988	TGA	2	6	590818	590823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11387	NC_011988	TGT	2	6	590878	590883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11388	NC_011988	TTGT	2	8	590894	590901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11389	NC_011988	CGG	2	6	590982	590987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11390	NC_011988	TA	3	6	590999	591004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11391	NC_011988	T	6	6	591022	591027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11392	NC_011988	GGGA	2	8	591059	591066	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11393	NC_011988	ACGC	2	8	591080	591087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11394	NC_011988	GAG	2	6	591113	591118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11395	NC_011988	ATG	2	6	591125	591130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106602
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11398	NC_011988	CCA	2	6	591216	591221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106602
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11402	NC_011988	GCT	2	6	591442	591447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106602
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11407	NC_011988	GGA	2	6	591634	591639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106602
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11411	NC_011988	CGG	2	6	591768	591773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106602
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11433	NC_011988	CTG	2	6	592764	592769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106603
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11440	NC_011988	CAGC	2	8	593056	593063	25 %	0 %	25 %	50 %	222106603
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11446	NC_011988	GATT	2	8	593213	593220	25 %	50 %	25 %	0 %	222106603
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11464	NC_011988	GAT	2	6	594040	594045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106604
11465	NC_011988	TTC	2	6	594046	594051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106604
11466	NC_011988	ATCT	2	8	594061	594068	25 %	50 %	0 %	25 %	222106604
11467	NC_011988	TCGT	2	8	594109	594116	0 %	50 %	25 %	25 %	222106604
11468	NC_011988	CTG	2	6	594211	594216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106604
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11470	NC_011988	GAT	2	6	594253	594258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11471	NC_011988	CGA	2	6	594276	594281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106605
11472	NC_011988	ATCA	2	8	594311	594318	50 %	25 %	0 %	25 %	222106605
11473	NC_011988	T	6	6	594377	594382	0 %	100 %	0 %	0 %	222106605
11474	NC_011988	AGA	3	9	594385	594393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106605
11475	NC_011988	GC	3	6	594431	594436	0 %	0 %	50 %	50 %	222106605
11476	NC_011988	CAGA	2	8	594451	594458	50 %	0 %	25 %	25 %	222106605
11477	NC_011988	GCC	2	6	594530	594535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106605
11478	NC_011988	AGGC	2	8	594681	594688	25 %	0 %	50 %	25 %	222106605
11479	NC_011988	GGC	2	6	594800	594805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106605
11480	NC_011988	ACC	2	6	594950	594955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106605
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11482	NC_011988	TTG	2	6	595035	595040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106605
11483	NC_011988	GCA	2	6	595146	595151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106605
11484	NC_011988	GGAGCA	2	12	595216	595227	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222106605
11485	NC_011988	GC	3	6	595345	595350	0 %	0 %	50 %	50 %	222106606
11486	NC_011988	CCA	2	6	595399	595404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106606
11487	NC_011988	GAG	2	6	595443	595448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106606
11488	NC_011988	GAT	2	6	595470	595475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106606
11489	NC_011988	CGC	2	6	595525	595530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106606
11490	NC_011988	TGA	2	6	595630	595635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106606
11491	NC_011988	ACGGCG	2	12	595687	595698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222106606
11492	NC_011988	GC	3	6	595707	595712	0 %	0 %	50 %	50 %	222106606
11493	NC_011988	ATC	2	6	595716	595721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106606
11494	NC_011988	GCCGT	2	10	595794	595803	0 %	20 %	40 %	40 %	222106606
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11497	NC_011988	CCAT	2	8	595852	595859	25 %	25 %	0 %	50 %	222106606
11498	NC_011988	CTG	2	6	595881	595886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106606
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