MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011988	GCC	2	6	518949	518954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106555
10002	NC_011988	TGGTCA	2	12	518955	518966	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222106555
10003	NC_011988	GCA	2	6	518967	518972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106555
10004	NC_011988	TTCCT	2	10	518974	518983	0 %	60 %	0 %	40 %	222106555
10005	NC_011988	ATT	2	6	519131	519136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106555
10006	NC_011988	TGA	2	6	519156	519161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106555
10007	NC_011988	TTG	2	6	519183	519188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106555
10008	NC_011988	TG	3	6	519187	519192	0 %	50 %	50 %	0 %	222106555
10009	NC_011988	TCAT	2	8	519198	519205	25 %	50 %	0 %	25 %	222106555
10010	NC_011988	GAC	2	6	519260	519265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106555
10011	NC_011988	CG	3	6	519294	519299	0 %	0 %	50 %	50 %	222106555
10012	NC_011988	GCTC	2	8	519318	519325	0 %	25 %	25 %	50 %	222106555
10013	NC_011988	CGC	2	6	519385	519390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106555
10014	NC_011988	CGC	2	6	519405	519410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106555
10015	NC_011988	GCT	3	9	519424	519432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106555
10016	NC_011988	GGA	2	6	519457	519462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106555
10017	NC_011988	TGA	2	6	519477	519482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106555
10018	NC_011988	GTCA	2	8	519548	519555	25 %	25 %	25 %	25 %	222106555
10019	NC_011988	CGA	2	6	519576	519581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106555
10020	NC_011988	TGG	2	6	519678	519683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106555
10021	NC_011988	TTG	2	6	519698	519703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106555
10022	NC_011988	ATG	2	6	519707	519712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106555
10023	NC_011988	ACA	2	6	519881	519886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106555
10024	NC_011988	TGC	2	6	519919	519924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106555
10025	NC_011988	GCC	2	6	519936	519941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106555
10026	NC_011988	AAAT	2	8	520059	520066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_011988	A	7	7	520119	520125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_011988	ACC	2	6	520206	520211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_011988	CCTG	2	8	520286	520293	0 %	25 %	25 %	50 %	222106556
10030	NC_011988	AAC	2	6	520309	520314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106556
10031	NC_011988	ATGC	2	8	520346	520353	25 %	25 %	25 %	25 %	222106556
10032	NC_011988	TCG	2	6	520442	520447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106556
10033	NC_011988	ATT	2	6	520498	520503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106556
10034	NC_011988	CCT	2	6	520573	520578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106556
10035	NC_011988	TCGACC	2	12	520597	520608	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106556
10036	NC_011988	GCCA	2	8	520617	520624	25 %	0 %	25 %	50 %	222106556
10037	NC_011988	GCC	2	6	520734	520739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106556
10038	NC_011988	TGC	2	6	520877	520882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106556
10039	NC_011988	CGT	2	6	520962	520967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106557
10040	NC_011988	AGA	2	6	520977	520982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106557
10041	NC_011988	GA	3	6	520989	520994	50 %	0 %	50 %	0 %	222106557
10042	NC_011988	TTC	2	6	521053	521058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106557
10043	NC_011988	TCGT	2	8	521074	521081	0 %	50 %	25 %	25 %	222106557
10044	NC_011988	GCCA	2	8	521089	521096	25 %	0 %	25 %	50 %	222106557
10045	NC_011988	CCG	2	6	521129	521134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106557
10046	NC_011988	CGG	2	6	521307	521312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106557
10047	NC_011988	GCGCGA	2	12	521414	521425	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222106557
10048	NC_011988	AGG	2	6	521528	521533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106557
10049	NC_011988	CGCC	2	8	521562	521569	0 %	0 %	25 %	75 %	222106557
10050	NC_011988	CGG	2	6	521658	521663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106557
10051	NC_011988	CCG	2	6	521674	521679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106557
10052	NC_011988	TTC	2	6	521686	521691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106557
10053	NC_011988	GAA	2	6	521700	521705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106557
10054	NC_011988	TGA	2	6	521712	521717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106557
10055	NC_011988	GTC	2	6	521734	521739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106557
10056	NC_011988	TCGA	2	8	521782	521789	25 %	25 %	25 %	25 %	222106557
10057	NC_011988	GC	3	6	521869	521874	0 %	0 %	50 %	50 %	222106557
10058	NC_011988	CGA	2	6	521891	521896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106557
10059	NC_011988	CCCG	2	8	521901	521908	0 %	0 %	25 %	75 %	222106557
10060	NC_011988	CCG	2	6	521948	521953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106557
10061	NC_011988	TCG	2	6	522065	522070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106557
10062	NC_011988	GTT	2	6	522187	522192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106557
10063	NC_011988	CGG	2	6	522225	522230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106557
10064	NC_011988	TCA	2	6	522245	522250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106557
10065	NC_011988	TGA	2	6	522266	522271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106557
10066	NC_011988	GCT	2	6	522315	522320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106557
10067	NC_011988	CTT	2	6	522359	522364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_011988	GC	3	6	522423	522428	0 %	0 %	50 %	50 %	222106558
10069	NC_011988	GGC	2	6	522474	522479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106558
10070	NC_011988	CAC	2	6	522575	522580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106558
10071	NC_011988	CTG	2	6	522590	522595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106558
10072	NC_011988	CGC	2	6	522614	522619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106558
10073	NC_011988	AGCG	2	8	522620	522627	25 %	0 %	50 %	25 %	222106558
10074	NC_011988	TCAT	2	8	522636	522643	25 %	50 %	0 %	25 %	222106558
10075	NC_011988	GGC	2	6	522677	522682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106558
10076	NC_011988	TCA	2	6	522738	522743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106558
10077	NC_011988	CTG	2	6	522803	522808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106558
10078	NC_011988	GCA	2	6	522892	522897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106558
10079	NC_011988	ATC	2	6	523079	523084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106558
10080	NC_011988	ATT	2	6	523134	523139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106558
10081	NC_011988	CT	3	6	523161	523166	0 %	50 %	0 %	50 %	222106558
10082	NC_011988	GATC	2	8	523198	523205	25 %	25 %	25 %	25 %	222106558
10083	NC_011988	GCT	2	6	523267	523272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106558
10084	NC_011988	A	6	6	523378	523383	100 %	0 %	0 %	0 %	222106559
10085	NC_011988	CAGA	2	8	523404	523411	50 %	0 %	25 %	25 %	222106559
10086	NC_011988	GTC	2	6	523426	523431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106559
10087	NC_011988	CTG	2	6	523462	523467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106559
10088	NC_011988	CCA	2	6	523535	523540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106559
10089	NC_011988	CGGTG	2	10	523551	523560	0 %	20 %	60 %	20 %	222106559
10090	NC_011988	GT	3	6	523678	523683	0 %	50 %	50 %	0 %	222106560
10091	NC_011988	GCA	3	9	523689	523697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10092	NC_011988	TGC	2	6	523699	523704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10093	NC_011988	ATCT	2	8	523719	523726	25 %	50 %	0 %	25 %	222106560
10094	NC_011988	GCCG	2	8	523744	523751	0 %	0 %	50 %	50 %	222106560
10095	NC_011988	CTG	2	6	523878	523883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10096	NC_011988	TAT	2	6	523914	523919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106560
10097	NC_011988	CCA	2	6	523937	523942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106560
10098	NC_011988	CCGG	2	8	523958	523965	0 %	0 %	50 %	50 %	222106560
10099	NC_011988	CTG	2	6	523989	523994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10100	NC_011988	CTT	2	6	524057	524062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106560
10101	NC_011988	GAT	2	6	524067	524072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106560
10102	NC_011988	GTC	2	6	524154	524159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10103	NC_011988	GGC	2	6	524165	524170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106560
10104	NC_011988	TAT	2	6	524214	524219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106560
10105	NC_011988	GTC	2	6	524234	524239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10106	NC_011988	TC	3	6	524238	524243	0 %	50 %	0 %	50 %	222106560
10107	NC_011988	TAC	2	6	524250	524255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106560
10108	NC_011988	CAG	2	6	524300	524305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10109	NC_011988	CAT	2	6	524358	524363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106560
10110	NC_011988	GCT	2	6	524396	524401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106560
10111	NC_011988	AGGA	2	8	524553	524560	50 %	0 %	50 %	0 %	222106561
10112	NC_011988	TCC	2	6	524577	524582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106561
10113	NC_011988	GCT	2	6	524668	524673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106561
10114	NC_011988	CGC	2	6	524785	524790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106561
10115	NC_011988	GGC	2	6	524824	524829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106561
10116	NC_011988	TGCG	2	8	524850	524857	0 %	25 %	50 %	25 %	222106561
10117	NC_011988	GCTG	2	8	524937	524944	0 %	25 %	50 %	25 %	222106561
10118	NC_011988	CGCT	2	8	524987	524994	0 %	25 %	25 %	50 %	222106561
10119	NC_011988	GAC	2	6	525005	525010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106561
10120	NC_011988	CAA	2	6	525019	525024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106561
10121	NC_011988	GCC	2	6	525029	525034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106561
10122	NC_011988	TGG	2	6	525078	525083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106561
10123	NC_011988	GAT	2	6	525164	525169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106561
10124	NC_011988	CAG	2	6	525172	525177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106561
10125	NC_011988	AT	3	6	525193	525198	50 %	50 %	0 %	0 %	222106561
10126	NC_011988	TCG	2	6	525200	525205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106561
10127	NC_011988	CG	3	6	525219	525224	0 %	0 %	50 %	50 %	222106561
10128	NC_011988	GCA	2	6	525271	525276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106561
10129	NC_011988	T	6	6	525304	525309	0 %	100 %	0 %	0 %	222106561
10130	NC_011988	ACCGA	2	10	525325	525334	40 %	0 %	20 %	40 %	222106561
10131	NC_011988	ATCG	2	8	525456	525463	25 %	25 %	25 %	25 %	222106562
10132	NC_011988	CTG	2	6	525513	525518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106562
10133	NC_011988	TCA	2	6	525607	525612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106562
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10137	NC_011988	GGC	2	6	525927	525932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106562
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10140	NC_011988	GAG	2	6	526137	526142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106562
10141	NC_011988	CCGG	2	8	526183	526190	0 %	0 %	50 %	50 %	222106562
10142	NC_011988	AGGC	2	8	526294	526301	25 %	0 %	50 %	25 %	222106562
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10146	NC_011988	CAA	2	6	526400	526405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106562
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10150	NC_011988	AGCG	2	8	526514	526521	25 %	0 %	50 %	25 %	222106562
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10152	NC_011988	TGGC	2	8	526568	526575	0 %	25 %	50 %	25 %	222106563
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10161	NC_011988	CAG	2	6	527230	527235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106564
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10230	NC_011988	AGCA	2	8	530938	530945	50 %	0 %	25 %	25 %	222106566
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10232	NC_011988	CGGC	2	8	530971	530978	0 %	0 %	50 %	50 %	222106566
10233	NC_011988	GGC	2	6	530991	530996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106566
10234	NC_011988	GGTC	2	8	531034	531041	0 %	25 %	50 %	25 %	222106566
10235	NC_011988	GCA	2	6	531075	531080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106566
10236	NC_011988	GGAA	2	8	531129	531136	50 %	0 %	50 %	0 %	222106566
10237	NC_011988	CAC	2	6	531201	531206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106566
10238	NC_011988	GGGAAA	2	12	531274	531285	50 %	0 %	50 %	0 %	222106566
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10240	NC_011988	CAT	2	6	531376	531381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106566
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10242	NC_011988	TTG	2	6	531662	531667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106566
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10251	NC_011988	CTTCGT	2	12	532080	532091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222106566
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10266	NC_011988	ATGC	2	8	532675	532682	25 %	25 %	25 %	25 %	222106567
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10289	NC_011988	CGGA	2	8	533837	533844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10346	NC_011988	GA	3	6	537127	537132	50 %	0 %	50 %	0 %	222106569
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10354	NC_011988	TCA	2	6	537446	537451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106569
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10358	NC_011988	TGT	2	6	537704	537709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106569
10359	NC_011988	GCTC	2	8	537738	537745	0 %	25 %	25 %	50 %	222106569
10360	NC_011988	GCT	2	6	537861	537866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106569
10361	NC_011988	ATC	2	6	538010	538015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106569
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10363	NC_011988	CTG	2	6	538109	538114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106569
10364	NC_011988	GAC	2	6	538129	538134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106569
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10367	NC_011988	TC	3	6	538243	538248	0 %	50 %	0 %	50 %	222106569
10368	NC_011988	GCT	2	6	538251	538256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106569
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10371	NC_011988	T	6	6	538351	538356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10372	NC_011988	TCCAT	2	10	538400	538409	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10373	NC_011988	G	6	6	538412	538417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10374	NC_011988	GCTGG	2	10	538471	538480	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10375	NC_011988	T	6	6	538515	538520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10376	NC_011988	ATTTT	2	10	538585	538594	20 %	80 %	0 %	0 %	222106570
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10391	NC_011988	AGC	2	6	539127	539132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106570
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10412	NC_011988	CCTT	2	8	540304	540311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10414	NC_011988	TCGTT	2	10	540422	540431	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10440	NC_011988	TCAT	2	8	542055	542062	25 %	50 %	0 %	25 %	222106573
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10468	NC_011988	GCCA	2	8	543722	543729	25 %	0 %	25 %	50 %	222106573
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10473	NC_011988	ATGG	2	8	543941	543948	25 %	25 %	50 %	0 %	222106573
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10479	NC_011988	CGG	2	6	544297	544302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106573
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10481	NC_011988	GAC	2	6	544328	544333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106573
10482	NC_011988	CAG	2	6	544405	544410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106573
10483	NC_011988	TCA	2	6	544464	544469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106573
10484	NC_011988	GGC	2	6	544577	544582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106573
10485	NC_011988	TCAGCG	2	12	544666	544677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106573
10486	NC_011988	CAGG	2	8	544683	544690	25 %	0 %	50 %	25 %	222106573
10487	NC_011988	TTC	2	6	544746	544751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106573
10488	NC_011988	GGAT	2	8	544776	544783	25 %	25 %	50 %	0 %	222106573
10489	NC_011988	TTC	2	6	544794	544799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106573
10490	NC_011988	GCA	2	6	544925	544930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106573
10491	NC_011988	GCG	2	6	544952	544957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106573
10492	NC_011988	TGCG	2	8	544988	544995	0 %	25 %	50 %	25 %	222106573
10493	NC_011988	CGA	2	6	545085	545090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106573
10494	NC_011988	TG	3	6	545143	545148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10495	NC_011988	GA	4	8	545175	545182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_011988	GGC	2	6	545209	545214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106574
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10500	NC_011988	GTC	2	6	545488	545493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106574

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