MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9003	NC_011988	GCA	2	6	468360	468365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106511
9004	NC_011988	ATG	2	6	468380	468385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106511
9005	NC_011988	GCA	2	6	468430	468435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106511
9006	NC_011988	GAT	2	6	468464	468469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106511
9007	NC_011988	GGAA	2	8	468550	468557	50 %	0 %	50 %	0 %	222106511
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9017	NC_011988	GGC	2	6	468975	468980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106512
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9023	NC_011988	TTGG	2	8	469271	469278	0 %	50 %	50 %	0 %	222106512
9024	NC_011988	GCC	2	6	469299	469304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106512
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9105	NC_011988	GTCG	2	8	473195	473202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9106	NC_011988	GCCA	2	8	473214	473221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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9245	NC_011988	ATC	2	6	480355	480360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106522
9246	NC_011988	GGC	2	6	480416	480421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106522
9247	NC_011988	ATC	2	6	480448	480453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106522
9248	NC_011988	GCG	2	6	480461	480466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106522
9249	NC_011988	CTG	2	6	480541	480546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9250	NC_011988	GTG	2	6	480619	480624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106522
9251	NC_011988	GATG	2	8	480630	480637	25 %	25 %	50 %	0 %	222106522
9252	NC_011988	ACC	2	6	480688	480693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106522
9253	NC_011988	AGT	2	6	480720	480725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106522
9254	NC_011988	CTG	2	6	480733	480738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9255	NC_011988	GTC	2	6	480763	480768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9256	NC_011988	TCC	2	6	480776	480781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106522
9257	NC_011988	GGCG	2	8	480788	480795	0 %	0 %	75 %	25 %	222106522
9258	NC_011988	ATC	2	6	480829	480834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106522
9259	NC_011988	TCG	2	6	480914	480919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9260	NC_011988	GAT	2	6	480922	480927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106522
9261	NC_011988	TCG	2	6	480932	480937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9262	NC_011988	GAAG	2	8	481005	481012	50 %	0 %	50 %	0 %	222106522
9263	NC_011988	ATCGCC	2	12	481027	481038	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106522
9264	NC_011988	TGG	2	6	481046	481051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106522
9265	NC_011988	CG	3	6	481223	481228	0 %	0 %	50 %	50 %	222106522
9266	NC_011988	CGG	2	6	481311	481316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106522
9267	NC_011988	TCT	2	6	481317	481322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106522
9268	NC_011988	TGG	2	6	481343	481348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106522
9269	NC_011988	CTGGCC	2	12	481354	481365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222106522
9270	NC_011988	CGGG	2	8	481397	481404	0 %	0 %	75 %	25 %	222106522
9271	NC_011988	TCC	2	6	481579	481584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106522
9272	NC_011988	CGA	2	6	481620	481625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9273	NC_011988	TCC	2	6	481684	481689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106522
9274	NC_011988	CGC	2	6	481718	481723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106522
9275	NC_011988	CGG	2	6	481749	481754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106522
9276	NC_011988	CCA	2	6	481811	481816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106522
9277	NC_011988	ATCT	2	8	481969	481976	25 %	50 %	0 %	25 %	222106522
9278	NC_011988	GAT	2	6	482106	482111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106522
9279	NC_011988	GCT	2	6	482124	482129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9280	NC_011988	GCT	2	6	482185	482190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9281	NC_011988	GGC	2	6	482238	482243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106522
9282	NC_011988	ATC	2	6	482419	482424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106522
9283	NC_011988	GGA	2	6	482476	482481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106522
9284	NC_011988	TCG	2	6	482552	482557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9285	NC_011988	GGC	2	6	482601	482606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106522
9286	NC_011988	TGA	2	6	482642	482647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106522
9287	NC_011988	TCA	2	6	482660	482665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106522
9288	NC_011988	CGT	2	6	482670	482675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9289	NC_011988	TGCG	2	8	482711	482718	0 %	25 %	50 %	25 %	222106522
9290	NC_011988	CTGG	2	8	482809	482816	0 %	25 %	50 %	25 %	222106522
9291	NC_011988	GCA	2	6	482832	482837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106522
9292	NC_011988	GGC	2	6	482883	482888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106522
9293	NC_011988	CGA	2	6	482966	482971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9294	NC_011988	T	6	6	483022	483027	0 %	100 %	0 %	0 %	222106523
9295	NC_011988	GCT	2	6	483042	483047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106523
9296	NC_011988	ACCAG	2	10	483070	483079	40 %	0 %	20 %	40 %	222106523
9297	NC_011988	GTA	2	6	483121	483126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106523
9298	NC_011988	TGG	2	6	483128	483133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106523
9299	NC_011988	ATG	2	6	483153	483158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106523
9300	NC_011988	GCAT	2	8	483178	483185	25 %	25 %	25 %	25 %	222106523
9301	NC_011988	AAGG	2	8	483233	483240	50 %	0 %	50 %	0 %	222106523
9302	NC_011988	GAAAAG	2	12	483249	483260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106523
9303	NC_011988	CGC	2	6	483322	483327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106523
9304	NC_011988	GGC	2	6	483333	483338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106523
9305	NC_011988	CAC	2	6	483344	483349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106523
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9308	NC_011988	GATG	2	8	483450	483457	25 %	25 %	50 %	0 %	222106523
9309	NC_011988	CCA	2	6	483484	483489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106523
9310	NC_011988	TGT	2	6	483534	483539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106523
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9314	NC_011988	GGC	2	6	483734	483739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106523
9315	NC_011988	G	6	6	483742	483747	0 %	0 %	100 %	0 %	222106523
9316	NC_011988	CAG	2	6	483776	483781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106523
9317	NC_011988	ATC	2	6	483785	483790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106523
9318	NC_011988	TGA	2	6	483838	483843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106523
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9320	NC_011988	CCA	2	6	483898	483903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106523
9321	NC_011988	AACC	2	8	483966	483973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9322	NC_011988	G	6	6	483982	483987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9323	NC_011988	TATT	2	8	484002	484009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9324	NC_011988	TCAT	2	8	484023	484030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9325	NC_011988	TTC	2	6	484055	484060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9326	NC_011988	GGA	2	6	484078	484083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9327	NC_011988	GAG	2	6	484142	484147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9328	NC_011988	GAG	2	6	484156	484161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9329	NC_011988	CTGT	2	8	484203	484210	0 %	50 %	25 %	25 %	222106524
9330	NC_011988	TCGA	2	8	484218	484225	25 %	25 %	25 %	25 %	222106524
9331	NC_011988	GAA	2	6	484251	484256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106524
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9334	NC_011988	TTGC	2	8	484446	484453	0 %	50 %	25 %	25 %	222106524
9335	NC_011988	GGTTG	2	10	484670	484679	0 %	40 %	60 %	0 %	222106524
9336	NC_011988	GCG	2	6	484699	484704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106524
9337	NC_011988	TCGCT	2	10	484705	484714	0 %	40 %	20 %	40 %	222106524
9338	NC_011988	TCG	2	6	484717	484722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106524
9339	NC_011988	TTGG	2	8	484808	484815	0 %	50 %	50 %	0 %	222106524
9340	NC_011988	GCG	2	6	484918	484923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106524
9341	NC_011988	CATGT	2	10	485013	485022	20 %	40 %	20 %	20 %	222106524
9342	NC_011988	GAC	2	6	485046	485051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106524
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9344	NC_011988	CGA	2	6	485216	485221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106524
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9347	NC_011988	CA	3	6	485400	485405	50 %	0 %	0 %	50 %	222106525
9348	NC_011988	TGG	2	6	485509	485514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106525
9349	NC_011988	CGA	2	6	485635	485640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106525
9350	NC_011988	CCTGG	2	10	485737	485746	0 %	20 %	40 %	40 %	222106525
9351	NC_011988	AC	3	6	485826	485831	50 %	0 %	0 %	50 %	222106525
9352	NC_011988	CCCGG	2	10	485840	485849	0 %	0 %	40 %	60 %	222106525
9353	NC_011988	AAAT	2	8	486011	486018	75 %	25 %	0 %	0 %	222106525
9354	NC_011988	AAGGA	2	10	486032	486041	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9355	NC_011988	CAT	2	6	486054	486059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106526
9356	NC_011988	TGC	2	6	486103	486108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106526
9357	NC_011988	AAT	2	6	486189	486194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106526
9358	NC_011988	CCG	2	6	486226	486231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106526
9359	NC_011988	CAG	2	6	486256	486261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106526
9360	NC_011988	TCGA	2	8	486349	486356	25 %	25 %	25 %	25 %	222106526
9361	NC_011988	CCG	2	6	486402	486407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106526
9362	NC_011988	CGAA	2	8	486467	486474	50 %	0 %	25 %	25 %	222106526
9363	NC_011988	CTCA	2	8	486510	486517	25 %	25 %	0 %	50 %	222106526
9364	NC_011988	GTT	2	6	486528	486533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106526
9365	NC_011988	TCG	2	6	486584	486589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106526
9366	NC_011988	ATC	2	6	486644	486649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106526
9367	NC_011988	AC	3	6	486650	486655	50 %	0 %	0 %	50 %	222106526
9368	NC_011988	TTC	2	6	486658	486663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106526
9369	NC_011988	TGGG	2	8	486713	486720	0 %	25 %	75 %	0 %	222106526
9370	NC_011988	A	6	6	486757	486762	100 %	0 %	0 %	0 %	222106526
9371	NC_011988	ACG	2	6	486854	486859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106526
9372	NC_011988	ATC	2	6	486928	486933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106526
9373	NC_011988	GGCGAG	2	12	487053	487064	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222106527
9374	NC_011988	ATC	2	6	487104	487109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106527
9375	NC_011988	ATT	2	6	487159	487164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106527
9376	NC_011988	TG	3	6	487272	487277	0 %	50 %	50 %	0 %	222106527
9377	NC_011988	AGG	2	6	487363	487368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106527
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9382	NC_011988	TGC	2	6	487543	487548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106528
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9386	NC_011988	GGCG	2	8	487658	487665	0 %	0 %	75 %	25 %	222106528
9387	NC_011988	CGG	4	12	487676	487687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106528
9388	NC_011988	CAT	2	6	487688	487693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106528
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9399	NC_011988	GTATCG	2	12	488287	488298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222106528
9400	NC_011988	GC	3	6	488350	488355	0 %	0 %	50 %	50 %	222106528
9401	NC_011988	TGG	2	6	488395	488400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106528
9402	NC_011988	GGC	2	6	488439	488444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106528
9403	NC_011988	ATT	2	6	488560	488565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9404	NC_011988	GGA	2	6	488639	488644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9405	NC_011988	GGTCG	2	10	488674	488683	0 %	20 %	60 %	20 %	222106529
9406	NC_011988	TTGAT	2	10	488718	488727	20 %	60 %	20 %	0 %	222106529
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9411	NC_011988	GA	4	8	488926	488933	50 %	0 %	50 %	0 %	222106529
9412	NC_011988	TGGC	2	8	489051	489058	0 %	25 %	50 %	25 %	222106529
9413	NC_011988	GCC	2	6	489092	489097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106529
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9437	NC_011988	CAG	2	6	490368	490373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9448	NC_011988	GC	3	6	490908	490913	0 %	0 %	50 %	50 %	222106531
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9480	NC_011988	TGA	2	6	492550	492555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106533
9481	NC_011988	TCCG	2	8	492576	492583	0 %	25 %	25 %	50 %	222106533
9482	NC_011988	TCAG	2	8	492643	492650	25 %	25 %	25 %	25 %	222106533
9483	NC_011988	CCG	3	9	492705	492713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106533
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9485	NC_011988	CCAC	2	8	492771	492778	25 %	0 %	0 %	75 %	222106533
9486	NC_011988	GCC	2	6	492905	492910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106533
9487	NC_011988	GGA	2	6	492952	492957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106533
9488	NC_011988	CCTG	3	12	492984	492995	0 %	25 %	25 %	50 %	222106533
9489	NC_011988	CGGCT	2	10	493009	493018	0 %	20 %	40 %	40 %	222106533
9490	NC_011988	CTG	2	6	493223	493228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9491	NC_011988	CGCC	2	8	493229	493236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9492	NC_011988	GC	3	6	493346	493351	0 %	0 %	50 %	50 %	222106534
9493	NC_011988	GTC	2	6	493376	493381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106534
9494	NC_011988	TCC	2	6	493404	493409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106534
9495	NC_011988	CGG	2	6	493467	493472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106534
9496	NC_011988	T	6	6	493520	493525	0 %	100 %	0 %	0 %	222106534
9497	NC_011988	TCG	2	6	493641	493646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106534
9498	NC_011988	GGCC	2	8	493663	493670	0 %	0 %	50 %	50 %	222106534
9499	NC_011988	CCATGC	2	12	493762	493773	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106534
9500	NC_011988	TCA	2	6	493825	493830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106534

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