MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 5057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011982	TGAG	2	8	125586	125593	25 %	25 %	50 %	0 %	222080218
2502	NC_011982	CGG	2	6	125655	125660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080218
2503	NC_011982	GCC	2	6	125693	125698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080218
2504	NC_011982	CGA	2	6	125715	125720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080218
2505	NC_011982	GAG	2	6	125882	125887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080218
2506	NC_011982	ATC	2	6	125922	125927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080218
2507	NC_011982	GGCC	2	8	125953	125960	0 %	0 %	50 %	50 %	222080218
2508	NC_011982	CGAA	2	8	126078	126085	50 %	0 %	25 %	25 %	222080218
2509	NC_011982	AG	3	6	126146	126151	50 %	0 %	50 %	0 %	222080218
2510	NC_011982	TCG	2	6	126297	126302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080218
2511	NC_011982	TTG	2	6	126305	126310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080218
2512	NC_011982	TCGC	2	8	126500	126507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2513	NC_011982	GCGAA	2	10	126596	126605	40 %	0 %	40 %	20 %	222080219
2514	NC_011982	TGC	2	6	126666	126671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080219
2515	NC_011982	GAT	2	6	126688	126693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080219
2516	NC_011982	CGC	2	6	126724	126729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080219
2517	NC_011982	CTG	2	6	126785	126790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080219
2518	NC_011982	GAA	2	6	126845	126850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080219
2519	NC_011982	CGT	2	6	126907	126912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080219
2520	NC_011982	GCTTG	2	10	126991	127000	0 %	40 %	40 %	20 %	222080219
2521	NC_011982	CTG	2	6	127031	127036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080219
2522	NC_011982	TGC	2	6	127122	127127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080219
2523	NC_011982	ATG	2	6	127151	127156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080219
2524	NC_011982	CG	3	6	127167	127172	0 %	0 %	50 %	50 %	222080219
2525	NC_011982	CAC	2	6	127241	127246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080219
2526	NC_011982	TCT	2	6	127356	127361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080219
2527	NC_011982	GCT	2	6	127417	127422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080219
2528	NC_011982	GAT	2	6	127429	127434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080219
2529	NC_011982	CGAC	2	8	127473	127480	25 %	0 %	25 %	50 %	222080219
2530	NC_011982	TCG	2	6	127622	127627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080220
2531	NC_011982	CCGC	2	8	127675	127682	0 %	0 %	25 %	75 %	222080220
2532	NC_011982	TCG	2	6	127694	127699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080220
2533	NC_011982	TGC	2	6	127719	127724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080220
2534	NC_011982	GC	3	6	127783	127788	0 %	0 %	50 %	50 %	222080220
2535	NC_011982	ATC	2	6	127798	127803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080220
2536	NC_011982	GGC	2	6	127870	127875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080220
2537	NC_011982	CGT	2	6	127908	127913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080220
2538	NC_011982	CG	3	6	128080	128085	0 %	0 %	50 %	50 %	222080220
2539	NC_011982	TTC	2	6	128094	128099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080220
2540	NC_011982	TTATGG	2	12	128147	128158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222080220
2541	NC_011982	TC	3	6	128161	128166	0 %	50 %	0 %	50 %	222080220
2542	NC_011982	CCG	2	6	128227	128232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080220
2543	NC_011982	CGC	2	6	128285	128290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080220
2544	NC_011982	GCA	2	6	128449	128454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080221
2545	NC_011982	GCC	2	6	128487	128492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080221
2546	NC_011982	GGGGC	2	10	128765	128774	0 %	0 %	80 %	20 %	222080221
2547	NC_011982	CGG	2	6	128861	128866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080221
2548	NC_011982	TGA	2	6	128881	128886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080221
2549	NC_011982	CGA	2	6	128927	128932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080221
2550	NC_011982	ACC	2	6	128937	128942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080221
2551	NC_011982	CAG	2	6	128994	128999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080221
2552	NC_011982	CCG	2	6	129010	129015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080221
2553	NC_011982	TCA	2	6	129022	129027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080221
2554	NC_011982	CAA	2	6	129110	129115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080221
2555	NC_011982	AGC	2	6	129161	129166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080221
2556	NC_011982	CTT	2	6	129255	129260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080221
2557	NC_011982	TC	3	6	129272	129277	0 %	50 %	0 %	50 %	222080221
2558	NC_011982	CGG	2	6	129296	129301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080221
2559	NC_011982	ATC	2	6	129426	129431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080221
2560	NC_011982	GGC	2	6	129450	129455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080221
2561	NC_011982	GC	3	6	129507	129512	0 %	0 %	50 %	50 %	222080221
2562	NC_011982	GAT	2	6	129530	129535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080221
2563	NC_011982	GCT	2	6	129653	129658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080221
2564	NC_011982	TC	3	6	129673	129678	0 %	50 %	0 %	50 %	222080221
2565	NC_011982	CGG	2	6	129713	129718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080221
2566	NC_011982	CCAGCG	2	12	129719	129730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222080221
2567	NC_011982	CG	3	6	129740	129745	0 %	0 %	50 %	50 %	222080221
2568	NC_011982	CGA	2	6	129779	129784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080221
2569	NC_011982	ATC	2	6	129822	129827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080221
2570	NC_011982	ATG	2	6	129834	129839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080221
2571	NC_011982	TCA	2	6	129874	129879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080221
2572	NC_011982	GCC	2	6	129891	129896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080221
2573	NC_011982	GCA	2	6	129955	129960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080221
2574	NC_011982	GCTT	2	8	130003	130010	0 %	50 %	25 %	25 %	222080221
2575	NC_011982	CGG	2	6	130054	130059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080221
2576	NC_011982	GCC	2	6	130073	130078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080221
2577	NC_011982	CCG	2	6	130157	130162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080221
2578	NC_011982	GCG	2	6	130313	130318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080222
2579	NC_011982	GGC	2	6	130354	130359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080222
2580	NC_011982	CGC	2	6	130363	130368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080222
2581	NC_011982	CT	3	6	130412	130417	0 %	50 %	0 %	50 %	222080222
2582	NC_011982	TCG	2	6	130419	130424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080222
2583	NC_011982	TGC	2	6	130426	130431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080222
2584	NC_011982	GCA	3	9	130445	130453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080222
2585	NC_011982	CTCGAT	2	12	130460	130471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222080222
2586	NC_011982	ATT	2	6	130511	130516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080222
2587	NC_011982	GCGA	2	8	130550	130557	25 %	0 %	50 %	25 %	222080222
2588	NC_011982	GAG	2	6	130559	130564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080222
2589	NC_011982	GAT	2	6	130889	130894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080222
2590	NC_011982	CG	4	8	130908	130915	0 %	0 %	50 %	50 %	222080222
2591	NC_011982	CATT	2	8	130936	130943	25 %	50 %	0 %	25 %	222080222
2592	NC_011982	TGC	2	6	130979	130984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080222
2593	NC_011982	TCA	2	6	131298	131303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080222
2594	NC_011982	GAA	2	6	131321	131326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080222
2595	NC_011982	CCAAT	2	10	131361	131370	40 %	20 %	0 %	40 %	222080222
2596	NC_011982	GCG	2	6	131431	131436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080222
2597	NC_011982	GCA	2	6	131450	131455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080222
2598	NC_011982	GTT	2	6	131488	131493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080222
2599	NC_011982	GC	3	6	131575	131580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2600	NC_011982	CGG	2	6	131648	131653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_011982	CAC	2	6	131799	131804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_011982	GGA	2	6	131815	131820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_011982	CAG	2	6	131854	131859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080223
2604	NC_011982	GTC	2	6	131906	131911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080223
2605	NC_011982	TGAC	2	8	131967	131974	25 %	25 %	25 %	25 %	222080223
2606	NC_011982	TGGCT	2	10	132113	132122	0 %	40 %	40 %	20 %	222080223
2607	NC_011982	GTAGCC	2	12	132174	132185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222080223
2608	NC_011982	CGG	2	6	132202	132207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080223
2609	NC_011982	CTCA	2	8	132231	132238	25 %	25 %	0 %	50 %	222080223
2610	NC_011982	CCTCG	2	10	132244	132253	0 %	20 %	20 %	60 %	222080223
2611	NC_011982	GGC	2	6	132277	132282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080223
2612	NC_011982	TCG	3	9	132354	132362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080223
2613	NC_011982	GCGG	2	8	132371	132378	0 %	0 %	75 %	25 %	222080223
2614	NC_011982	TCCTCG	2	12	132429	132440	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222080223
2615	NC_011982	CGA	2	6	132505	132510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080223
2616	NC_011982	TGG	2	6	132541	132546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080223
2617	NC_011982	CAA	2	6	132574	132579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080223
2618	NC_011982	CGGA	2	8	132622	132629	25 %	0 %	50 %	25 %	222080223
2619	NC_011982	CGG	2	6	132649	132654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080223
2620	NC_011982	GTC	2	6	132662	132667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080223
2621	NC_011982	GCA	2	6	132708	132713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080223
2622	NC_011982	TCA	2	6	132744	132749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080223
2623	NC_011982	ATGGCT	2	12	132794	132805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222080223
2624	NC_011982	CTT	2	6	132903	132908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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