MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 5057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011982	TTC	2	6	26310	26315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080138
502	NC_011982	CAA	2	6	26494	26499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080138
503	NC_011982	AGC	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080138
504	NC_011982	GCA	2	6	26629	26634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080138
505	NC_011982	TCA	2	6	26694	26699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080138
506	NC_011982	GTT	2	6	26740	26745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011982	CCT	2	6	27043	27048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_011982	AGG	2	6	27053	27058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011982	CCG	3	9	27070	27078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_011982	CTT	2	6	27141	27146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080139
511	NC_011982	GCG	2	6	27151	27156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080139
512	NC_011982	ACG	2	6	27230	27235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080139
513	NC_011982	AGC	2	6	27261	27266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080139
514	NC_011982	TGG	2	6	27362	27367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080139
515	NC_011982	GCG	2	6	27423	27428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011982	GAA	2	6	27649	27654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011982	AAG	2	6	27680	27685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011982	CTG	2	6	27965	27970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011982	ATG	2	6	27981	27986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011982	ACA	2	6	28042	28047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011982	CCA	2	6	28111	28116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_011982	AGCAG	2	10	28145	28154	40 %	0 %	40 %	20 %	222080140
523	NC_011982	AGCGC	2	10	28173	28182	20 %	0 %	40 %	40 %	222080140
524	NC_011982	ATT	2	6	28224	28229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080140
525	NC_011982	AG	3	6	28239	28244	50 %	0 %	50 %	0 %	222080140
526	NC_011982	TTG	2	6	28270	28275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080140
527	NC_011982	CCG	2	6	28340	28345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080140
528	NC_011982	TAT	2	6	28362	28367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080140
529	NC_011982	T	6	6	28433	28438	0 %	100 %	0 %	0 %	222080140
530	NC_011982	GGC	2	6	28515	28520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011982	GAT	2	6	28574	28579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011982	TGGA	2	8	28583	28590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011982	TGGA	2	8	28633	28640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011982	TGA	2	6	28708	28713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011982	GCGA	2	8	28745	28752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_011982	CGC	2	6	28782	28787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_011982	GCC	2	6	28870	28875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_011982	CGG	2	6	28885	28890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011982	GC	3	6	28933	28938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_011982	TGA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011982	GCCG	2	8	29042	29049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_011982	GA	3	6	29081	29086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011982	CAGC	2	8	29102	29109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
544	NC_011982	GAT	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011982	GAC	2	6	29406	29411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080141
546	NC_011982	GC	4	8	29424	29431	0 %	0 %	50 %	50 %	222080141
547	NC_011982	CGC	2	6	29445	29450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080141
548	NC_011982	GAAGCG	2	12	29463	29474	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222080141
549	NC_011982	AGC	2	6	29531	29536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080141
550	NC_011982	CGG	2	6	29561	29566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080141
551	NC_011982	CG	3	6	29597	29602	0 %	0 %	50 %	50 %	222080141
552	NC_011982	GCC	2	6	29604	29609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080141
553	NC_011982	GCG	2	6	29695	29700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080141
554	NC_011982	GTTG	2	8	29741	29748	0 %	50 %	50 %	0 %	222080141
555	NC_011982	CAT	2	6	29760	29765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080141
556	NC_011982	TAG	2	6	29767	29772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080141
557	NC_011982	CG	3	6	29799	29804	0 %	0 %	50 %	50 %	222080141
558	NC_011982	TGA	2	6	29843	29848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080141
559	NC_011982	TC	3	6	29867	29872	0 %	50 %	0 %	50 %	222080141
560	NC_011982	GCG	2	6	29875	29880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080141
561	NC_011982	TCGC	2	8	29895	29902	0 %	25 %	25 %	50 %	222080141
562	NC_011982	GCGCTC	2	12	29907	29918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222080141
563	NC_011982	GGC	2	6	29928	29933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080141
564	NC_011982	CGA	2	6	29963	29968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080141
565	NC_011982	GCAG	2	8	29988	29995	25 %	0 %	50 %	25 %	222080141
566	NC_011982	GTC	2	6	30041	30046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080141
567	NC_011982	TCA	2	6	30056	30061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080141
568	NC_011982	AACA	2	8	30109	30116	75 %	0 %	0 %	25 %	222080141
569	NC_011982	GACC	2	8	30162	30169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_011982	CTCAAT	2	12	30210	30221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011982	CCTCCC	2	12	30266	30277	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
572	NC_011982	ATC	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011982	CCG	2	6	30311	30316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_011982	CGC	2	6	30317	30322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_011982	GCG	2	6	30325	30330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011982	CCA	2	6	30349	30354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_011982	GAC	2	6	30411	30416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_011982	CGTC	2	8	30423	30430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_011982	CAT	2	6	30443	30448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011982	TTC	2	6	30450	30455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011982	GCAA	2	8	30522	30529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_011982	GAT	2	6	30640	30645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011982	GCA	2	6	30651	30656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_011982	GGC	2	6	30659	30664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011982	ACGCC	2	10	30686	30695	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
586	NC_011982	TCG	2	6	30760	30765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080142
587	NC_011982	CAG	2	6	30840	30845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080142
588	NC_011982	TGC	2	6	30859	30864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080142
589	NC_011982	AAT	2	6	30918	30923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080142
590	NC_011982	GAC	2	6	30930	30935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080142
591	NC_011982	CGCA	2	8	31014	31021	25 %	0 %	25 %	50 %	222080142
592	NC_011982	GTC	2	6	31063	31068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080142
593	NC_011982	TCCAG	2	10	31091	31100	20 %	20 %	20 %	40 %	222080142
594	NC_011982	GTTC	2	8	31111	31118	0 %	50 %	25 %	25 %	222080142
595	NC_011982	GA	3	6	31145	31150	50 %	0 %	50 %	0 %	222080142
596	NC_011982	GTGCGC	2	12	31207	31218	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222080142
597	NC_011982	TTGC	2	8	31311	31318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_011982	CGTC	2	8	31342	31349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_011982	CGA	2	6	31425	31430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011982	GTG	2	6	31554	31559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011982	TCGC	2	8	31613	31620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
602	NC_011982	GCG	2	6	31626	31631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011982	GA	3	6	31691	31696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011982	GAA	2	6	31741	31746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011982	GGC	2	6	31757	31762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011982	ATC	2	6	31831	31836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011982	GCA	2	6	31861	31866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011982	CAA	2	6	31914	31919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011982	GAAC	2	8	31957	31964	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_011982	GCC	2	6	32051	32056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_011982	AAC	2	6	32175	32180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011982	TCC	2	6	32192	32197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_011982	CGC	2	6	32209	32214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_011982	TCAG	2	8	32286	32293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_011982	TTC	2	6	32294	32299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011982	GGC	5	15	32300	32314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_011982	CGG	2	6	32338	32343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011982	CGG	2	6	32356	32361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011982	TGGCGG	2	12	32362	32373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
620	NC_011982	T	8	8	32380	32387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011982	TAA	3	9	32406	32414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011982	GCA	2	6	32450	32455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_011982	CGC	2	6	32458	32463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_011982	ATTA	2	8	32519	32526	50 %	50 %	0 %	0 %	222080143
625	NC_011982	GAA	2	6	32561	32566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080143
626	NC_011982	CGC	2	6	32575	32580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080143
627	NC_011982	GAT	2	6	32605	32610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080143
628	NC_011982	ACC	2	6	32619	32624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080143
629	NC_011982	GCA	2	6	32647	32652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080143
630	NC_011982	TCCG	2	8	32673	32680	0 %	25 %	25 %	50 %	222080143
631	NC_011982	TGC	2	6	32840	32845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080143
632	NC_011982	TCCT	2	8	32861	32868	0 %	50 %	0 %	50 %	222080143
633	NC_011982	GCAA	2	8	32869	32876	50 %	0 %	25 %	25 %	222080143
634	NC_011982	CGC	2	6	32963	32968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080143
635	NC_011982	CCAG	2	8	32977	32984	25 %	0 %	25 %	50 %	222080143
636	NC_011982	CGA	2	6	33002	33007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080143
637	NC_011982	GCC	2	6	33056	33061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080143
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639	NC_011982	CAT	2	6	33135	33140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080143
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641	NC_011982	CGG	2	6	33168	33173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080143
642	NC_011982	CCA	2	6	33191	33196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080143
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646	NC_011982	TCG	2	6	33372	33377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080144
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657	NC_011982	TCA	2	6	33858	33863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080144
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660	NC_011982	CAT	2	6	33991	33996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080144
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664	NC_011982	GCC	2	6	34199	34204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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667	NC_011982	GAG	2	6	34349	34354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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669	NC_011982	AGG	2	6	34415	34420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_011982	GGC	2	6	34665	34670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_011982	CGC	2	6	34683	34688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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707	NC_011982	CGA	2	6	36116	36121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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729	NC_011982	GAT	2	6	37385	37390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
730	NC_011982	GGC	2	6	37394	37399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
731	NC_011982	CGG	2	6	37436	37441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
732	NC_011982	GAAG	2	8	37475	37482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
733	NC_011982	GC	3	6	37791	37796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
734	NC_011982	CAATGC	2	12	37826	37837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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736	NC_011982	AGACGA	2	12	37912	37923	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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739	NC_011982	ATC	2	6	38157	38162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
740	NC_011982	TCG	2	6	38191	38196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
741	NC_011982	ACA	2	6	38209	38214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
742	NC_011982	ACG	2	6	38235	38240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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744	NC_011982	CGG	2	6	38384	38389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
745	NC_011982	GAC	2	6	38426	38431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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749	NC_011982	CAGC	2	8	38576	38583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
750	NC_011982	TGC	2	6	38588	38593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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753	NC_011982	CGGT	2	8	38701	38708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
754	NC_011982	AGC	2	6	38737	38742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_011982	GAG	2	6	38748	38753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
756	NC_011982	GC	3	6	38760	38765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
757	NC_011982	ATCG	2	8	38882	38889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
758	NC_011982	GC	3	6	38940	38945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
759	NC_011982	GAA	2	6	39036	39041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
760	NC_011982	TCGA	2	8	39063	39070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
761	NC_011982	GCCG	2	8	39086	39093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
762	NC_011982	GC	3	6	39248	39253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
763	NC_011982	AGC	2	6	39312	39317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_011982	AAGC	2	8	39320	39327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
765	NC_011982	CAG	2	6	39350	39355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
766	NC_011982	CGC	2	6	39358	39363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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768	NC_011982	TCA	2	6	39467	39472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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904	NC_011982	GTC	2	6	46929	46934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080151
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