MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 62332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_011761	GCCC	2	8	648237	648244	0 %	0 %	25 %	75 %	218667526
14003	NC_011761	TCG	2	6	648275	648280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667526
14004	NC_011761	CGA	2	6	648366	648371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667526
14005	NC_011761	GGT	2	6	648390	648395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667526
14006	NC_011761	CGC	2	6	648436	648441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667526
14007	NC_011761	CG	3	6	648498	648503	0 %	0 %	50 %	50 %	218667526
14008	NC_011761	CCGC	2	8	648516	648523	0 %	0 %	25 %	75 %	218667526
14009	NC_011761	GAG	2	6	648568	648573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667526
14010	NC_011761	GCCCC	2	10	648584	648593	0 %	0 %	20 %	80 %	218667526
14011	NC_011761	GCC	2	6	648608	648613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667526
14012	NC_011761	GC	3	6	648639	648644	0 %	0 %	50 %	50 %	218667526
14013	NC_011761	CCG	2	6	648645	648650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667526
14014	NC_011761	GT	3	6	648758	648763	0 %	50 %	50 %	0 %	218667526
14015	NC_011761	CGCCA	2	10	648781	648790	20 %	0 %	20 %	60 %	218667526
14016	NC_011761	GAT	2	6	648880	648885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667526
14017	NC_011761	GCC	2	6	648917	648922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667526
14018	NC_011761	GCC	4	12	648937	648948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667526
14019	NC_011761	GAA	2	6	649122	649127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667526
14020	NC_011761	GTG	2	6	649175	649180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667526
14021	NC_011761	GGC	2	6	649219	649224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667526
14022	NC_011761	TGA	2	6	649263	649268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667526
14023	NC_011761	TTG	2	6	649307	649312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218667526
14024	NC_011761	GC	4	8	649384	649391	0 %	0 %	50 %	50 %	218667526
14025	NC_011761	CTG	2	6	649442	649447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667526
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14028	NC_011761	TTC	2	6	649587	649592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218666151
14029	NC_011761	CCG	3	9	649615	649623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666151
14030	NC_011761	CAC	2	6	649647	649652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666151
14031	NC_011761	CCA	2	6	649682	649687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666151
14032	NC_011761	GC	3	6	649696	649701	0 %	0 %	50 %	50 %	218666151
14033	NC_011761	TCGC	2	8	649718	649725	0 %	25 %	25 %	50 %	218666151
14034	NC_011761	GCC	2	6	649726	649731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666151
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14036	NC_011761	CGATGG	2	12	649787	649798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218666151
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14040	NC_011761	CAG	2	6	649868	649873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665552
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14047	NC_011761	TCC	2	6	650507	650512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218665552
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14053	NC_011761	A	6	6	650729	650734	100 %	0 %	0 %	0 %	218665552
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14062	NC_011761	GTG	2	6	651077	651082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_011761	CAC	2	6	651092	651097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_011761	GCT	2	6	651134	651139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_011761	GCC	2	6	651195	651200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14066	NC_011761	CGC	2	6	651393	651398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665895
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14105	NC_011761	TGG	2	6	653024	653029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666074
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14108	NC_011761	GGCG	2	8	653277	653284	0 %	0 %	75 %	25 %	218667464
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14361	NC_011761	CGAT	2	8	664714	664721	25 %	25 %	25 %	25 %	218665348
14362	NC_011761	G	6	6	664757	664762	0 %	0 %	100 %	0 %	218665348
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14365	NC_011761	CGC	2	6	664916	664921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665348
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14368	NC_011761	CTGG	2	8	665070	665077	0 %	25 %	50 %	25 %	218665348
14369	NC_011761	TTG	2	6	665200	665205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218665348
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14373	NC_011761	CGA	3	9	665519	665527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665348
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14377	NC_011761	CGA	2	6	665762	665767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665348
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14382	NC_011761	CGC	2	6	665882	665887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665348
14383	NC_011761	CAT	2	6	665972	665977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665348
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14386	NC_011761	GCC	3	9	666091	666099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665348
14387	NC_011761	CGTG	2	8	666136	666143	0 %	25 %	50 %	25 %	218665348
14388	NC_011761	TCTGCA	2	12	666253	666264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218665392
14389	NC_011761	ACCG	2	8	666324	666331	25 %	0 %	25 %	50 %	218665392
14390	NC_011761	CGT	2	6	666343	666348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665392
14391	NC_011761	GAG	2	6	666425	666430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665392
14392	NC_011761	GGC	4	12	666548	666559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665392
14393	NC_011761	GCG	2	6	666655	666660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665392
14394	NC_011761	GC	3	6	666667	666672	0 %	0 %	50 %	50 %	218665392
14395	NC_011761	AGC	2	6	666730	666735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665392
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14398	NC_011761	GGC	2	6	666970	666975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666007
14399	NC_011761	GCG	2	6	666983	666988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666007
14400	NC_011761	TTG	2	6	667055	667060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218666007
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14402	NC_011761	CTG	2	6	667162	667167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666007
14403	NC_011761	GGC	2	6	667228	667233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666007
14404	NC_011761	GTT	2	6	667300	667305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218666007
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14408	NC_011761	GTC	2	6	667402	667407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666007
14409	NC_011761	GC	3	6	667466	667471	0 %	0 %	50 %	50 %	218666726
14410	NC_011761	GCG	2	6	667483	667488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666726
14411	NC_011761	CTT	2	6	667529	667534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218666726
14412	NC_011761	TGA	2	6	667556	667561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666726
14413	NC_011761	CGC	2	6	667614	667619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666726
14414	NC_011761	GCCT	2	8	667665	667672	0 %	25 %	25 %	50 %	218666726
14415	NC_011761	CAC	2	6	667734	667739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666726
14416	NC_011761	TGA	2	6	667766	667771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666726
14417	NC_011761	GACG	2	8	667818	667825	25 %	0 %	50 %	25 %	218666726
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14419	NC_011761	GTG	2	6	667846	667851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666726
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14421	NC_011761	GTA	2	6	667920	667925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666726
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14423	NC_011761	CGA	2	6	667952	667957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666726
14424	NC_011761	GCTG	2	8	667973	667980	0 %	25 %	50 %	25 %	218666726
14425	NC_011761	GCA	2	6	668009	668014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666726
14426	NC_011761	CCT	2	6	668039	668044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667016
14427	NC_011761	ACG	2	6	668096	668101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667016
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14430	NC_011761	AG	3	6	668268	668273	50 %	0 %	50 %	0 %	218667016
14431	NC_011761	CGG	2	6	668333	668338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667016
14432	NC_011761	CCG	2	6	668343	668348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667016
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14434	NC_011761	GAC	2	6	668413	668418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667016
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14438	NC_011761	AC	3	6	668545	668550	50 %	0 %	0 %	50 %	218667016
14439	NC_011761	AAC	2	6	668568	668573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218667016
14440	NC_011761	GGCC	2	8	668614	668621	0 %	0 %	50 %	50 %	218667016
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14442	NC_011761	T	6	6	668657	668662	0 %	100 %	0 %	0 %	218667016
14443	NC_011761	CCA	2	6	668668	668673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667016
14444	NC_011761	AT	3	6	668677	668682	50 %	50 %	0 %	0 %	218667016
14445	NC_011761	CGAAAT	2	12	668722	668733	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218667016
14446	NC_011761	CTC	2	6	668786	668791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667016
14447	NC_011761	GGC	2	6	668840	668845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667016
14448	NC_011761	GC	3	6	668904	668909	0 %	0 %	50 %	50 %	218667016
14449	NC_011761	GC	3	6	668913	668918	0 %	0 %	50 %	50 %	218667016
14450	NC_011761	C	7	7	669003	669009	0 %	0 %	0 %	100 %	218667016
14451	NC_011761	AGG	2	6	669068	669073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667016
14452	NC_011761	GCA	2	6	669085	669090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667016
14453	NC_011761	TAC	2	6	669120	669125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14454	NC_011761	TGG	2	6	669186	669191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665188
14455	NC_011761	GGC	2	6	669230	669235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665188
14456	NC_011761	CGG	2	6	669264	669269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665188
14457	NC_011761	TG	3	6	669273	669278	0 %	50 %	50 %	0 %	218665188
14458	NC_011761	GAG	2	6	669306	669311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665188
14459	NC_011761	ATG	2	6	669316	669321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665839
14460	NC_011761	TGGCGC	2	12	669362	669373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218665839
14461	NC_011761	GGCAG	2	10	669393	669402	20 %	0 %	60 %	20 %	218665839
14462	NC_011761	TGG	2	6	669428	669433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665839
14463	NC_011761	CGG	2	6	669438	669443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665839
14464	NC_011761	CTG	2	6	669448	669453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665839
14465	NC_011761	GCG	3	9	669454	669462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665839
14466	NC_011761	CGTG	2	8	669587	669594	0 %	25 %	50 %	25 %	218665839
14467	NC_011761	TG	4	8	669596	669603	0 %	50 %	50 %	0 %	218665839
14468	NC_011761	GCT	2	6	669609	669614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665839
14469	NC_011761	CG	3	6	669618	669623	0 %	0 %	50 %	50 %	218665839
14470	NC_011761	CG	3	6	669627	669632	0 %	0 %	50 %	50 %	218665839
14471	NC_011761	GC	3	6	669644	669649	0 %	0 %	50 %	50 %	218665839
14472	NC_011761	ACC	2	6	669683	669688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218665839
14473	NC_011761	TTG	2	6	669736	669741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218665839
14474	NC_011761	CTG	2	6	669760	669765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665839
14475	NC_011761	T	6	6	669771	669776	0 %	100 %	0 %	0 %	218665839
14476	NC_011761	GGCGC	2	10	669780	669789	0 %	0 %	60 %	40 %	218665839
14477	NC_011761	TGG	2	6	669884	669889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665367
14478	NC_011761	GGA	2	6	669932	669937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665367
14479	NC_011761	GTGC	2	8	669939	669946	0 %	25 %	50 %	25 %	218665367
14480	NC_011761	GGGT	2	8	669954	669961	0 %	25 %	75 %	0 %	218665367
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