MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 62332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011761	ATGC	2	8	601204	601211	25 %	25 %	25 %	25 %	218667754
13002	NC_011761	ATG	2	6	601289	601294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667754
13003	NC_011761	GGA	2	6	601300	601305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667754
13004	NC_011761	TG	3	6	601313	601318	0 %	50 %	50 %	0 %	218667754
13005	NC_011761	GAT	3	9	601322	601330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667754
13006	NC_011761	TAG	2	6	601385	601390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_011761	GAC	2	6	601423	601428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666431
13008	NC_011761	GTG	2	6	601487	601492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666431
13009	NC_011761	CAG	2	6	601517	601522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666431
13010	NC_011761	AGC	2	6	601542	601547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666431
13011	NC_011761	GGC	2	6	601554	601559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666431
13012	NC_011761	TGG	2	6	601575	601580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666431
13013	NC_011761	CGGGC	2	10	601591	601600	0 %	0 %	60 %	40 %	218666431
13014	NC_011761	GTG	3	9	601689	601697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666431
13015	NC_011761	TGT	2	6	601709	601714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218666431
13016	NC_011761	GCA	2	6	601726	601731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666431
13017	NC_011761	GAA	2	6	601754	601759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666431
13018	NC_011761	G	6	6	601787	601792	0 %	0 %	100 %	0 %	218666431
13019	NC_011761	GCAG	2	8	601840	601847	25 %	0 %	50 %	25 %	218666431
13020	NC_011761	AGC	2	6	601957	601962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_011761	GATC	2	8	601970	601977	25 %	25 %	25 %	25 %	218667898
13022	NC_011761	CGA	2	6	602008	602013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667898
13023	NC_011761	TGC	2	6	602044	602049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667898
13024	NC_011761	CGG	2	6	602107	602112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667898
13025	NC_011761	CAG	2	6	602136	602141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667898
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13027	NC_011761	AGGC	2	8	602249	602256	25 %	0 %	50 %	25 %	218667898
13028	NC_011761	CAT	2	6	602405	602410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667898
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13032	NC_011761	ATG	2	6	602565	602570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667898
13033	NC_011761	GCG	2	6	602624	602629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667898
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13052	NC_011761	ATG	2	6	603823	603828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665449
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13055	NC_011761	TGG	2	6	603978	603983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13057	NC_011761	CTT	2	6	604035	604040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_011761	CG	3	6	604061	604066	0 %	0 %	50 %	50 %	218668123
13059	NC_011761	CGG	2	6	604191	604196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218668123
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13071	NC_011761	AT	3	6	604621	604626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_011761	GCG	2	6	604678	604683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666307
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13094	NC_011761	TCCC	2	8	605570	605577	0 %	25 %	0 %	75 %	218666307
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13109	NC_011761	TGG	2	6	606021	606026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666307
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13120	NC_011761	CCG	2	6	606405	606410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666307
13121	NC_011761	CGC	2	6	606449	606454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666307
13122	NC_011761	CAT	2	6	606571	606576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666482
13123	NC_011761	CGC	2	6	606577	606582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666482
13124	NC_011761	GC	3	6	606658	606663	0 %	0 %	50 %	50 %	218666482
13125	NC_011761	GAA	2	6	606689	606694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666482
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13128	NC_011761	GAG	2	6	607074	607079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218666259
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13130	NC_011761	GGC	2	6	607093	607098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666259
13131	NC_011761	GCAGGG	2	12	607108	607119	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	218666259
13132	NC_011761	GCT	2	6	607164	607169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666259
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13139	NC_011761	GTGG	2	8	607526	607533	0 %	25 %	75 %	0 %	218666259
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13145	NC_011761	GA	3	6	607683	607688	50 %	0 %	50 %	0 %	218666259
13146	NC_011761	CAG	2	6	607696	607701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666259
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13149	NC_011761	TGC	2	6	607962	607967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666259
13150	NC_011761	GCC	2	6	608036	608041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666259
13151	NC_011761	CTG	2	6	608063	608068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666259
13152	NC_011761	GC	3	6	608106	608111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13153	NC_011761	AC	3	6	608131	608136	50 %	0 %	0 %	50 %	218665838
13154	NC_011761	GGA	2	6	608253	608258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665838
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13170	NC_011761	GCC	2	6	609114	609119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13237	NC_011761	GGT	2	6	612007	612012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666304
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13239	NC_011761	CAA	2	6	612100	612105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218666304
13240	NC_011761	GCG	2	6	612108	612113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666304
13241	NC_011761	GCA	2	6	612129	612134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666304
13242	NC_011761	CG	3	6	612195	612200	0 %	0 %	50 %	50 %	218666304
13243	NC_011761	GAA	2	6	612242	612247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666304
13244	NC_011761	CGG	2	6	612274	612279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666304
13245	NC_011761	AAG	2	6	612374	612379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666304
13246	NC_011761	CCCA	2	8	612434	612441	25 %	0 %	0 %	75 %	218666304
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13248	NC_011761	GCC	2	6	612465	612470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666304
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13250	NC_011761	CGG	2	6	612529	612534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666304
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13252	NC_011761	AAC	2	6	612557	612562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218666304
13253	NC_011761	CGG	2	6	612591	612596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666304
13254	NC_011761	TCA	2	6	612615	612620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666304
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13257	NC_011761	CAAA	2	8	612700	612707	75 %	0 %	0 %	25 %	218666304
13258	NC_011761	GAA	2	6	612716	612721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666304
13259	NC_011761	AC	3	6	612730	612735	50 %	0 %	0 %	50 %	218666304
13260	NC_011761	CTG	2	6	612791	612796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666304
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13268	NC_011761	TCG	2	6	612996	613001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666304
13269	NC_011761	CTG	2	6	613070	613075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666304
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13272	NC_011761	GGC	2	6	613138	613143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666304
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13303	NC_011761	ATTT	2	8	614478	614485	25 %	75 %	0 %	0 %	218667559
13304	NC_011761	CTC	2	6	614516	614521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667559
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13307	NC_011761	AG	3	6	614651	614656	50 %	0 %	50 %	0 %	218667559
13308	NC_011761	TCG	2	6	614677	614682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667559
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13310	NC_011761	GAA	2	6	614766	614771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667559
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13312	NC_011761	TCG	2	6	614848	614853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667559
13313	NC_011761	GCA	2	6	614916	614921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667559
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13315	NC_011761	CAC	2	6	615029	615034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667559
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13317	NC_011761	TCC	2	6	615067	615072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667559
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13320	NC_011761	GAAA	2	8	615149	615156	75 %	0 %	25 %	0 %	218667559
13321	NC_011761	A	6	6	615154	615159	100 %	0 %	0 %	0 %	218667559
13322	NC_011761	GTT	2	6	615164	615169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218667559
13323	NC_011761	GAG	2	6	615411	615416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667559
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13325	NC_011761	TTG	2	6	615490	615495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218667559
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13327	NC_011761	GTTA	2	8	615581	615588	25 %	50 %	25 %	0 %	218667559
13328	NC_011761	GAA	2	6	615615	615620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667559
13329	NC_011761	CCG	2	6	615687	615692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667559
13330	NC_011761	TCG	2	6	615712	615717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667559
13331	NC_011761	TGA	2	6	615725	615730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667559
13332	NC_011761	TCG	2	6	615808	615813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667559
13333	NC_011761	CTG	2	6	615824	615829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667559
13334	NC_011761	CCCAG	2	10	615977	615986	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13335	NC_011761	CGC	2	6	616051	616056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13336	NC_011761	AGC	2	6	616088	616093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13337	NC_011761	TGA	2	6	616098	616103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13338	NC_011761	TTCA	2	8	616132	616139	25 %	50 %	0 %	25 %	218666689
13339	NC_011761	GGT	2	6	616167	616172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666689
13340	NC_011761	GGGC	2	8	616184	616191	0 %	0 %	75 %	25 %	218666689
13341	NC_011761	ATC	2	6	616226	616231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666689
13342	NC_011761	CGG	2	6	616290	616295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666689
13343	NC_011761	TCA	2	6	616349	616354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666689
13344	NC_011761	CTG	2	6	616459	616464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666689
13345	NC_011761	AGGC	2	8	616487	616494	25 %	0 %	50 %	25 %	218666689
13346	NC_011761	AGC	2	6	616529	616534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666689
13347	NC_011761	GAA	2	6	616542	616547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666689
13348	NC_011761	TCA	2	6	616556	616561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666689
13349	NC_011761	ACG	2	6	616616	616621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666689
13350	NC_011761	ACGGCA	2	12	616628	616639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666689
13351	NC_011761	GCT	2	6	616668	616673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666689
13352	NC_011761	CAG	2	6	616692	616697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666689
13353	NC_011761	AGG	2	6	616778	616783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218666689
13354	NC_011761	GCGCA	2	10	616834	616843	20 %	0 %	40 %	40 %	218666689
13355	NC_011761	GCC	2	6	616983	616988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666689
13356	NC_011761	GCA	2	6	617259	617264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666689
13357	NC_011761	ATC	2	6	617291	617296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218666689
13358	NC_011761	GAT	2	6	617302	617307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666689
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13366	NC_011761	TGGG	2	8	617876	617883	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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13456	NC_011761	ATT	2	6	622223	622228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13480	NC_011761	TTG	2	6	623483	623488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218667485
13481	NC_011761	GAGC	2	8	623526	623533	25 %	0 %	50 %	25 %	218667485
13482	NC_011761	GCC	2	6	623599	623604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667485
13483	NC_011761	TGG	2	6	623607	623612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667485
13484	NC_011761	CGC	2	6	623646	623651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667485
13485	NC_011761	CTG	2	6	623665	623670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667485
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