MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii AB0057 plasmid pAB0057

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011585	GA	3	6	3	8	50 %	0 %	50 %	0 %	213155359
2	NC_011585	ACTTAG	2	12	50	61	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	213155359
3	NC_011585	AAC	2	6	65	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155359
4	NC_011585	TTG	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213155359
5	NC_011585	ATCA	2	8	160	167	50 %	25 %	0 %	25 %	213155359
6	NC_011585	CG	3	6	228	233	0 %	0 %	50 %	50 %	213155359
7	NC_011585	A	6	6	253	258	100 %	0 %	0 %	0 %	213155359
8	NC_011585	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155359
9	NC_011585	GAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155359
10	NC_011585	TAG	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155359
11	NC_011585	TAG	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155359
12	NC_011585	AGAA	2	8	511	518	75 %	0 %	25 %	0 %	213155359
13	NC_011585	AAAT	2	8	593	600	75 %	25 %	0 %	0 %	213155359
14	NC_011585	AGA	3	9	680	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155359
15	NC_011585	T	6	6	731	736	0 %	100 %	0 %	0 %	213155359
16	NC_011585	A	7	7	900	906	100 %	0 %	0 %	0 %	213155359
17	NC_011585	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	213155360
18	NC_011585	A	6	6	1104	1109	100 %	0 %	0 %	0 %	213155360
19	NC_011585	ATC	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155360
20	NC_011585	AAG	2	6	1125	1130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155360
21	NC_011585	TGA	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155360
22	NC_011585	A	7	7	1144	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	213155360
23	NC_011585	A	6	6	1178	1183	100 %	0 %	0 %	0 %	213155360
24	NC_011585	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155360
25	NC_011585	CAA	2	6	1211	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155360
26	NC_011585	CAG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155360
27	NC_011585	CAC	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213155360
28	NC_011585	ACA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155360
29	NC_011585	CAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155360
30	NC_011585	AAT	2	6	1352	1357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155360
31	NC_011585	CACAA	2	10	1458	1467	60 %	0 %	0 %	40 %	213155360
32	NC_011585	A	6	6	1466	1471	100 %	0 %	0 %	0 %	213155360
33	NC_011585	ATT	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011585	GCT	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011585	GAA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011585	AAAAAG	2	12	1657	1668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011585	ATT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011585	TGA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011585	AAT	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011585	A	7	7	1751	1757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011585	TAT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011585	CCA	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213155361
43	NC_011585	TTA	2	6	1971	1976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155361
44	NC_011585	TATTAA	2	12	2014	2025	50 %	50 %	0 %	0 %	213155361
45	NC_011585	TA	3	6	2050	2055	50 %	50 %	0 %	0 %	213155361
46	NC_011585	TCA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155361
47	NC_011585	TGC	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155361
48	NC_011585	CTG	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155361
49	NC_011585	TAA	2	6	2348	2353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155361
50	NC_011585	A	6	6	2362	2367	100 %	0 %	0 %	0 %	213155361
51	NC_011585	TAAAC	2	10	2449	2458	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011585	ACT	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011585	TAA	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011585	T	6	6	2644	2649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011585	CTT	2	6	2666	2671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011585	AAT	2	6	2675	2680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011585	ATT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011585	TA	3	6	2738	2743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011585	T	6	6	2756	2761	0 %	100 %	0 %	0 %	213155362
60	NC_011585	AGAC	2	8	2878	2885	50 %	0 %	25 %	25 %	213155362
61	NC_011585	GAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155362
62	NC_011585	TGG	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213155362
63	NC_011585	TGA	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155362
64	NC_011585	ATC	2	6	2984	2989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155362
65	NC_011585	GCAAG	2	10	3002	3011	40 %	0 %	40 %	20 %	213155362
66	NC_011585	CA	3	6	3055	3060	50 %	0 %	0 %	50 %	213155363
67	NC_011585	GCTT	2	8	3109	3116	0 %	50 %	25 %	25 %	213155363
68	NC_011585	TGA	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155363
69	NC_011585	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155363
70	NC_011585	CTTG	2	8	3255	3262	0 %	50 %	25 %	25 %	213155363
71	NC_011585	ATGA	2	8	3297	3304	50 %	25 %	25 %	0 %	213155363
72	NC_011585	ATGCT	2	10	3316	3325	20 %	40 %	20 %	20 %	213155363
73	NC_011585	A	6	6	3335	3340	100 %	0 %	0 %	0 %	213155363
74	NC_011585	TCA	2	6	3341	3346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155363
75	NC_011585	G	6	6	3390	3395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011585	TAG	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011585	TTATA	2	10	3443	3452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011585	GTT	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011585	TAAA	2	8	3482	3489	75 %	25 %	0 %	0 %	213155364
80	NC_011585	TAC	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
81	NC_011585	TGA	2	6	3594	3599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
82	NC_011585	ATTC	2	8	3715	3722	25 %	50 %	0 %	25 %	213155364
83	NC_011585	TAT	2	6	3753	3758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155364
84	NC_011585	AGGA	2	8	3767	3774	50 %	0 %	50 %	0 %	213155364
85	NC_011585	AAT	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
86	NC_011585	GTG	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213155364
87	NC_011585	TAC	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
88	NC_011585	CAG	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155364
89	NC_011585	CTC	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213155364
90	NC_011585	AGA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155364
91	NC_011585	ATA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
92	NC_011585	ATG	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
93	NC_011585	A	6	6	4380	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	213155364
94	NC_011585	TAT	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155364
95	NC_011585	GATG	2	8	4410	4417	25 %	25 %	50 %	0 %	213155364
96	NC_011585	ATTA	2	8	4426	4433	50 %	50 %	0 %	0 %	213155364
97	NC_011585	TCA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
98	NC_011585	TC	3	6	4487	4492	0 %	50 %	0 %	50 %	213155364
99	NC_011585	ATG	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
100	NC_011585	TA	3	6	4594	4599	50 %	50 %	0 %	0 %	213155364
101	NC_011585	ATT	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213155364
102	NC_011585	T	6	6	4642	4647	0 %	100 %	0 %	0 %	213155364
103	NC_011585	ATA	2	6	4739	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
104	NC_011585	AAG	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155364
105	NC_011585	ACC	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213155364
106	NC_011585	CAG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155364
107	NC_011585	ACTTT	2	10	4868	4877	20 %	60 %	0 %	20 %	213155364
108	NC_011585	A	6	6	4931	4936	100 %	0 %	0 %	0 %	213155364
109	NC_011585	TAA	2	6	4962	4967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
110	NC_011585	A	7	7	4988	4994	100 %	0 %	0 %	0 %	213155364
111	NC_011585	TAA	2	6	4995	5000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
112	NC_011585	AAGA	2	8	5132	5139	75 %	0 %	25 %	0 %	213155364
113	NC_011585	CTA	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155364
114	NC_011585	AAT	2	6	5233	5238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
115	NC_011585	GAT	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
116	NC_011585	TACT	2	8	5289	5296	25 %	50 %	0 %	25 %	213155364
117	NC_011585	TA	4	8	5314	5321	50 %	50 %	0 %	0 %	213155364
118	NC_011585	CTG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213155364
119	NC_011585	CT	3	6	5466	5471	0 %	50 %	0 %	50 %	213155364
120	NC_011585	CCT	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213155364
121	NC_011585	TGA	2	6	5628	5633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155364
122	NC_011585	ATA	2	6	5678	5683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
123	NC_011585	CA	3	6	5758	5763	50 %	0 %	0 %	50 %	213155364
124	NC_011585	AAT	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213155364
125	NC_011585	AT	3	6	5835	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	213155364
126	NC_011585	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213155364
127	NC_011585	TTTAG	2	10	5860	5869	20 %	60 %	20 %	0 %	213155364
128	NC_011585	AGATA	2	10	5888	5897	60 %	20 %	20 %	0 %	213155364
129	NC_011585	TCT	2	6	5904	5909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011585	AGA	2	6	5923	5928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011585	GATTA	2	10	5944	5953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011585	T	6	6	5990	5995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011585	CAG	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011585	T	7	7	6123	6129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011585	CT	3	6	6210	6215	0 %	50 %	0 %	50 %	213155365
136	NC_011585	CAA	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155365
137	NC_011585	A	9	9	6234	6242	100 %	0 %	0 %	0 %	213155365
138	NC_011585	AAC	2	6	6255	6260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213155365
139	NC_011585	ACT	2	6	6319	6324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155365
140	NC_011585	ATG	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155365
141	NC_011585	TGA	2	6	6442	6447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155365
142	NC_011585	GCA	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213155365
143	NC_011585	TCA	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155365
144	NC_011585	TGA	2	6	6574	6579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213155365
145	NC_011585	TTGAT	2	10	6636	6645	20 %	60 %	20 %	0 %	213155365
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147	NC_011585	AATC	2	8	6785	6792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011585	CAAA	2	8	6822	6829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011585	TCA	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011585	CA	3	6	7059	7064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_011585	ACT	2	6	7148	7153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213155366
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157	NC_011585	TTA	2	6	7533	7538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_011585	TAAA	2	8	7583	7590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_011585	TAA	2	6	7594	7599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011585	AATT	2	8	7629	7636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011585	T	7	7	7671	7677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011585	T	6	6	7699	7704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011585	A	7	7	7729	7735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011585	GTT	2	6	7738	7743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_011585	A	6	6	8716	8721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.