MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011314	CTA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011314	CTA	2	6	79	84	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011314	AT	3	6	158	163	50 %	50 %	0 %	0 %	209967945
4	NC_011314	T	8	8	316	323	0 %	100 %	0 %	0 %	209967945
5	NC_011314	CT	3	6	386	391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011314	ACT	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967946
7	NC_011314	TCA	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967946
8	NC_011314	AGT	3	9	468	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967946
9	NC_011314	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
10	NC_011314	ATT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
11	NC_011314	GAA	2	6	582	587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967946
12	NC_011314	TTA	2	6	592	597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
13	NC_011314	ATT	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
14	NC_011314	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
15	NC_011314	A	7	7	647	653	100 %	0 %	0 %	0 %	209967946
16	NC_011314	TCA	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967946
17	NC_011314	TTA	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
18	NC_011314	GTT	2	6	736	741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967946
19	NC_011314	AAT	2	6	864	869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967946
20	NC_011314	T	7	7	894	900	0 %	100 %	0 %	0 %	209967946
21	NC_011314	GAAAA	2	10	908	917	80 %	0 %	20 %	0 %	209967946
22	NC_011314	AT	3	6	944	949	50 %	50 %	0 %	0 %	209967946
23	NC_011314	AAT	3	9	966	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967946
24	NC_011314	GGT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967946
25	NC_011314	T	8	8	1120	1127	0 %	100 %	0 %	0 %	209967946
26	NC_011314	AT	3	6	1129	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	209967946
27	NC_011314	TAG	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011314	ACA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011314	GGTTA	2	10	1186	1195	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011314	ATT	2	6	1262	1267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011314	TCA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011314	GTA	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011314	TGGT	2	8	1508	1515	0 %	50 %	50 %	0 %	209967947
34	NC_011314	ATG	2	6	1633	1638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967947
35	NC_011314	A	6	6	1671	1676	100 %	0 %	0 %	0 %	209967947
36	NC_011314	ACCA	2	8	1703	1710	50 %	0 %	0 %	50 %	209967947
37	NC_011314	CA	3	6	1713	1718	50 %	0 %	0 %	50 %	209967947
38	NC_011314	CAT	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967947
39	NC_011314	ATG	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967947
40	NC_011314	CAAT	2	8	1768	1775	50 %	25 %	0 %	25 %	209967947
41	NC_011314	ATG	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967947
42	NC_011314	GGC	2	6	1796	1801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209967947
43	NC_011314	A	6	6	1912	1917	100 %	0 %	0 %	0 %	209967947
44	NC_011314	GGA	2	6	2125	2130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209967948
45	NC_011314	ATC	2	6	2151	2156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967948
46	NC_011314	T	6	6	2171	2176	0 %	100 %	0 %	0 %	209967948
47	NC_011314	AGG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209967948
48	NC_011314	A	8	8	2226	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	209967948
49	NC_011314	CCTAA	2	10	2242	2251	40 %	20 %	0 %	40 %	209967948
50	NC_011314	CT	3	6	2289	2294	0 %	50 %	0 %	50 %	209967948
51	NC_011314	TCAA	2	8	2323	2330	50 %	25 %	0 %	25 %	209967948
52	NC_011314	AAC	2	6	2480	2485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967949
53	NC_011314	TTC	2	6	2488	2493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967949
54	NC_011314	AG	3	6	2510	2515	50 %	0 %	50 %	0 %	209967949
55	NC_011314	AAG	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967949
56	NC_011314	CAT	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967949
57	NC_011314	T	6	6	2645	2650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011314	AAAT	2	8	2657	2664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011314	ATTTTT	2	12	2685	2696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011314	AATT	2	8	2707	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011314	AAC	2	6	2736	2741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011314	TCAC	2	8	2747	2754	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011314	CT	3	6	2787	2792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011314	CTTCA	2	10	2802	2811	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011314	AAT	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011314	CT	3	6	2890	2895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011314	TC	3	6	3074	3079	0 %	50 %	0 %	50 %	209967950
68	NC_011314	CTT	2	6	3106	3111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967950
69	NC_011314	GCTT	2	8	3123	3130	0 %	50 %	25 %	25 %	209967950
70	NC_011314	GTC	2	6	3167	3172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967950
71	NC_011314	AAC	2	6	3384	3389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967950
72	NC_011314	CAA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967950
73	NC_011314	ATC	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967950
74	NC_011314	T	6	6	3523	3528	0 %	100 %	0 %	0 %	209967950
75	NC_011314	TGT	2	6	3567	3572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967950
76	NC_011314	AAG	2	6	3581	3586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967950
77	NC_011314	T	7	7	3654	3660	0 %	100 %	0 %	0 %	209967950
78	NC_011314	ACA	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967950
79	NC_011314	AACA	2	8	3785	3792	75 %	0 %	0 %	25 %	209967950
80	NC_011314	GATA	2	8	3920	3927	50 %	25 %	25 %	0 %	209967950
81	NC_011314	TAG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967950
82	NC_011314	CTG	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967951
83	NC_011314	CAC	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209967951
84	NC_011314	TAC	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967951
85	NC_011314	TGG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967951
86	NC_011314	TAT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967951
87	NC_011314	CAA	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967952
88	NC_011314	TTA	2	6	4380	4385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
89	NC_011314	ATT	2	6	4508	4513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
90	NC_011314	A	7	7	4545	4551	100 %	0 %	0 %	0 %	209967952
91	NC_011314	CATT	2	8	4573	4580	25 %	50 %	0 %	25 %	209967952
92	NC_011314	ATC	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967952
93	NC_011314	TGA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967952
94	NC_011314	GGC	2	6	4696	4701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209967952
95	NC_011314	TGT	2	6	4769	4774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967952
96	NC_011314	TTG	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967952
97	NC_011314	TCT	2	6	4802	4807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967952
98	NC_011314	TGC	3	9	4830	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967952
99	NC_011314	TAT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
100	NC_011314	CTC	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209967952
101	NC_011314	A	6	6	4938	4943	100 %	0 %	0 %	0 %	209967952
102	NC_011314	ATA	2	6	4953	4958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967952
103	NC_011314	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
104	NC_011314	AAT	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011314	CCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011314	TAAT	2	8	5076	5083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011314	TAAT	2	8	5134	5141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011314	T	7	7	5155	5161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011314	AAT	2	6	5217	5222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967953
110	NC_011314	TCA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967953
111	NC_011314	GCA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967954
112	NC_011314	TAA	2	6	5499	5504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967954
113	NC_011314	CCA	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209967954
114	NC_011314	ATG	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967954
115	NC_011314	TCA	2	6	5570	5575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967954
116	NC_011314	AATT	2	8	5590	5597	50 %	50 %	0 %	0 %	209967954
117	NC_011314	ATA	2	6	5612	5617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967954
118	NC_011314	T	6	6	5761	5766	0 %	100 %	0 %	0 %	209967954
119	NC_011314	TCTT	2	8	5813	5820	0 %	75 %	0 %	25 %	209967954
120	NC_011314	ATG	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967954
121	NC_011314	GCTC	2	8	5874	5881	0 %	25 %	25 %	50 %	209967954
122	NC_011314	CTT	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967954
123	NC_011314	A	7	7	6002	6008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011314	ATT	2	6	6127	6132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011314	GCA	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011314	TAA	2	6	6202	6207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011314	AAT	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011314	ATAC	2	8	6372	6379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011314	ACG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011314	CA	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	209967955
131	NC_011314	CAT	2	6	6426	6431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967955
132	NC_011314	TTC	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967955
133	NC_011314	GCT	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967955
134	NC_011314	TTG	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967955
135	NC_011314	ATA	2	6	6632	6637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967955
136	NC_011314	TA	4	8	6654	6661	50 %	50 %	0 %	0 %	209967955
137	NC_011314	ATT	2	6	6701	6706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967955
138	NC_011314	ATC	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011314	GTT	2	6	6753	6758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011314	AG	3	6	6851	6856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011314	GAT	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011314	GTT	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011314	CTGG	2	8	7105	7112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011314	TCT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011314	ATTT	2	8	7211	7218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_011314	T	6	6	12751	12756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_011314	TAA	2	6	12813	12818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_011314	TTCT	2	8	12829	12836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
271	NC_011314	ACA	2	6	12840	12845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_011314	ATCC	2	8	12852	12859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
273	NC_011314	TA	4	8	12917	12924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_011314	A	6	6	12927	12932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011314	CAT	2	6	12988	12993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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411	NC_011314	TAT	2	6	19537	19542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967967
412	NC_011314	GAT	2	6	19543	19548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967967
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414	NC_011314	CAA	2	6	19599	19604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967967
415	NC_011314	T	6	6	19621	19626	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
416	NC_011314	AAG	2	6	19646	19651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967967
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418	NC_011314	ATCC	2	8	19788	19795	25 %	25 %	0 %	50 %	209967967
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422	NC_011314	TA	3	6	19960	19965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_011314	T	6	6	19994	19999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011314	GTA	2	6	20009	20014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
425	NC_011314	GAT	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_011314	GAG	2	6	20188	20193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_011314	CGAT	2	8	20210	20217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
429	NC_011314	CAA	2	6	20244	20249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_011314	TAT	2	6	20410	20415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_011314	A	6	6	20430	20435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_011314	ATC	2	6	20446	20451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_011314	AAAT	2	8	20599	20606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_011314	AGC	2	6	20624	20629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_011314	GAA	2	6	20707	20712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
437	NC_011314	AGCA	2	8	20791	20798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
438	NC_011314	CAG	2	6	20823	20828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_011314	ATT	2	6	20881	20886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_011314	T	6	6	20885	20890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_011314	GTTA	2	8	20897	20904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_011314	TAAA	2	8	20928	20935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_011314	A	6	6	20994	20999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_011314	T	7	7	21019	21025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_011314	TTA	2	6	21113	21118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967968
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499	NC_011314	T	6	6	23094	23099	0 %	100 %	0 %	0 %	209967969
500	NC_011314	TAAGT	2	10	23210	23219	40 %	40 %	20 %	0 %	209967969

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