MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	ATA	2	6	86	91	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011313	AG	3	6	111	116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011313	AAC	2	6	120	125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011313	AACAC	2	10	157	166	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011313	ATA	2	6	225	230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011313	T	6	6	266	271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011313	A	6	6	275	280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011313	TTAAA	2	10	298	307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011313	GAA	3	9	355	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011313	TAA	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011313	AAC	2	6	424	429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011313	ATC	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011313	A	6	6	652	657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011313	CAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011313	AAAAAT	2	12	683	694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011313	TTC	2	6	761	766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011313	A	6	6	861	866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011313	A	8	8	890	897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011313	AAT	3	9	998	1006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011313	T	7	7	1006	1012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011313	CTTT	2	8	1013	1020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011313	ATG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011313	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011313	AAAAG	2	10	1107	1116	80 %	0 %	20 %	0 %	209808848
25	NC_011313	ATTT	2	8	1154	1161	25 %	75 %	0 %	0 %	209808848
26	NC_011313	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
27	NC_011313	CAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
28	NC_011313	ATT	2	6	1300	1305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
29	NC_011313	ACA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
30	NC_011313	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
31	NC_011313	CAG	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808848
32	NC_011313	TGC	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
33	NC_011313	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
34	NC_011313	AATT	2	8	1454	1461	50 %	50 %	0 %	0 %	209808848
35	NC_011313	CAAGAA	2	12	1501	1512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209808848
36	NC_011313	TGA	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
37	NC_011313	CAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
38	NC_011313	CTGGG	2	10	1638	1647	0 %	20 %	60 %	20 %	209808848
39	NC_011313	ATA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
40	NC_011313	CAC	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
41	NC_011313	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
42	NC_011313	TGA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
43	NC_011313	ATC	3	9	1820	1828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
44	NC_011313	GAT	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
45	NC_011313	AAACGA	2	12	1847	1858	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209808848
46	NC_011313	AAG	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
47	NC_011313	GAATT	2	10	1958	1967	40 %	40 %	20 %	0 %	209808848
48	NC_011313	AAG	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
49	NC_011313	TA	3	6	2129	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	209808848
50	NC_011313	ATG	2	6	2159	2164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
51	NC_011313	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
52	NC_011313	CTT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
53	NC_011313	CCA	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
54	NC_011313	CTT	2	6	2244	2249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
55	NC_011313	GACA	2	8	2274	2281	50 %	0 %	25 %	25 %	209808848
56	NC_011313	TGAG	2	8	2291	2298	25 %	25 %	50 %	0 %	209808848
57	NC_011313	CTCG	2	8	2311	2318	0 %	25 %	25 %	50 %	209808848
58	NC_011313	A	7	7	2364	2370	100 %	0 %	0 %	0 %	209808848
59	NC_011313	TTAT	2	8	2398	2405	25 %	75 %	0 %	0 %	209808848
60	NC_011313	GAA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
61	NC_011313	CAA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
62	NC_011313	GCC	2	6	2684	2689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808848
63	NC_011313	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
64	NC_011313	AGA	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
65	NC_011313	TGC	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
66	NC_011313	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
67	NC_011313	TAA	2	6	2928	2933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
68	NC_011313	GGTAG	2	10	3060	3069	20 %	20 %	60 %	0 %	209808848
69	NC_011313	TC	3	6	3142	3147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011313	TAA	2	6	3221	3226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011313	T	7	7	3254	3260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011313	TTC	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011313	ATCA	2	8	3328	3335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011313	T	6	6	3355	3360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011313	TTA	2	6	3369	3374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011313	AATG	2	8	3650	3657	50 %	25 %	25 %	0 %	209808849
77	NC_011313	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808849
78	NC_011313	ATAA	2	8	3770	3777	75 %	25 %	0 %	0 %	209808849
79	NC_011313	TACT	2	8	3784	3791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011313	T	7	7	3854	3860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011313	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011313	ATC	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011313	GGT	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011313	GGT	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011313	AGA	2	6	4077	4082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011313	TCA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011313	ATA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011313	ATC	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011313	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011313	CT	3	6	4290	4295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011313	TTA	2	6	4324	4329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011313	AT	3	6	4335	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011313	AGG	2	6	4344	4349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011313	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011313	AAT	2	6	4417	4422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011313	T	6	6	4426	4431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011313	ATT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011313	AAT	2	6	4486	4491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011313	CAA	2	6	4537	4542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011313	GT	3	6	4559	4564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011313	TGG	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011313	AGA	2	6	4575	4580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011313	TTG	2	6	4607	4612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011313	TGAGT	2	10	4629	4638	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011313	ATT	2	6	4673	4678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011313	TATT	2	8	4713	4720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011313	AAG	2	6	4787	4792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011313	GCA	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011313	TGTT	2	8	4979	4986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011313	CAGT	2	8	5141	5148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011313	TGA	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011313	CAT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011313	TTTA	2	8	5306	5313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011313	T	8	8	5329	5336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011313	TGT	2	6	5354	5359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011313	T	6	6	5361	5366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011313	TTGG	2	8	5368	5375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011313	TGA	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011313	TTC	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011313	TTCA	2	8	5480	5487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011313	CTT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011313	TAT	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011313	GTT	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011313	TAA	2	6	5643	5648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011313	A	6	6	5647	5652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011313	GCAA	2	8	5701	5708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011313	GTT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011313	TGA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011313	GAA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011313	GTTT	2	8	5960	5967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011313	TC	3	6	5975	5980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011313	GAAA	2	8	6202	6209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011313	TGA	2	6	6264	6269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011313	ATC	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011313	ATTA	2	8	6354	6361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011313	TGA	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011313	CAG	2	6	6398	6403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011313	AAG	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011313	A	6	6	6418	6423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011313	TGAAT	2	10	6438	6447	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011313	TCAC	2	8	6452	6459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011313	AAG	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011313	TCA	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011313	AG	3	6	6582	6587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011313	GCA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011313	CAG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011313	TGAT	2	8	6656	6663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011313	GAT	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011313	TAA	2	6	6777	6782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011313	ATTA	2	8	6812	6819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011313	CCA	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_011313	CGT	2	6	6876	6881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011313	T	6	6	6904	6909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011313	GT	3	6	6918	6923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011313	GT	3	6	6954	6959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011313	TGG	3	9	6974	6982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011313	TGC	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_011313	GAT	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_011313	ATT	2	6	7764	7769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_011313	A	7	7	8617	8623	100 %	0 %	0 %	0 %	209808851
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185	NC_011313	ATAA	2	8	8939	8946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011313	AGC	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_011313	TA	3	6	9100	9105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_011313	ATAAA	2	10	9122	9131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_011313	AAAT	2	8	9183	9190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011313	TCT	2	6	9198	9203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_011313	ATC	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_011313	T	6	6	13884	13889	0 %	100 %	0 %	0 %	209808853
284	NC_011313	GTAA	2	8	13927	13934	50 %	25 %	25 %	0 %	209808853
285	NC_011313	CGA	2	6	14033	14038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808853
286	NC_011313	AAT	2	6	14041	14046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808853
287	NC_011313	TTC	2	6	14086	14091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808853
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291	NC_011313	TCA	2	6	14234	14239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808853
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317	NC_011313	T	7	7	15349	15355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_011313	AAT	2	6	19767	19772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808858
412	NC_011313	CAA	2	6	19824	19829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_011313	A	7	7	19885	19891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_011313	T	6	6	19909	19914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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