MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011313	TAA	2	6	189066	189071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011313	CTT	2	6	189109	189114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_011313	AC	3	6	189144	189149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_011313	AAATT	2	10	189198	189207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011313	CAT	3	9	189214	189222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_011313	GTAA	2	8	189275	189282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011313	ATA	2	6	189314	189319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011313	CA	3	6	189333	189338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_011313	TCA	2	6	189366	189371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_011313	ACGCAT	2	12	189388	189399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_011313	A	6	6	189409	189414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011313	GCTT	2	8	189490	189497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_011313	GCCA	2	8	189521	189528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_011313	AGAT	2	8	189559	189566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011313	A	7	7	189698	189704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011313	CAG	2	6	189772	189777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_011313	ATA	2	6	189781	189786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011313	CAT	2	6	189800	189805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_011313	ATA	2	6	189923	189928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011313	AAC	2	6	189941	189946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_011313	CAC	2	6	189980	189985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_011313	GA	3	6	190016	190021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011313	ATG	2	6	190073	190078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808985
4024	NC_011313	CAC	2	6	190130	190135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808985
4025	NC_011313	AAT	2	6	190165	190170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808985
4026	NC_011313	TCA	2	6	190228	190233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808985
4027	NC_011313	TCA	2	6	190399	190404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808985
4028	NC_011313	GAAT	2	8	190448	190455	50 %	25 %	25 %	0 %	209808985
4029	NC_011313	ATA	2	6	190458	190463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808985
4030	NC_011313	GATA	2	8	190543	190550	50 %	25 %	25 %	0 %	209808985
4031	NC_011313	CTAA	2	8	190605	190612	50 %	25 %	0 %	25 %	209808985
4032	NC_011313	TAA	2	6	190651	190656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808985
4033	NC_011313	AATGAT	2	12	190670	190681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209808985
4034	NC_011313	TAG	2	6	190711	190716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808985
4035	NC_011313	TCA	2	6	190786	190791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808985
4036	NC_011313	TAA	2	6	190820	190825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808985
4037	NC_011313	CAGTG	2	10	190826	190835	20 %	20 %	40 %	20 %	209808985
4038	NC_011313	CAA	2	6	190861	190866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808985
4039	NC_011313	TCC	2	6	190928	190933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209808985
4040	NC_011313	TCTCAA	2	12	190970	190981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_011313	A	6	6	191124	191129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011313	ATAA	2	8	191137	191144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011313	TTA	2	6	191148	191153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011313	CA	3	6	191162	191167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_011313	TTG	2	6	191248	191253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011313	T	7	7	191276	191282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011313	AGA	2	6	191291	191296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011313	AT	3	6	191319	191324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011313	AAAC	2	8	191371	191378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_011313	AT	3	6	191394	191399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011313	TCT	2	6	191677	191682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808986
4052	NC_011313	ATT	2	6	191687	191692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808986
4053	NC_011313	TTC	2	6	191705	191710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808986
4054	NC_011313	TGC	2	6	191766	191771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808986
4055	NC_011313	TTG	2	6	191772	191777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808986
4056	NC_011313	T	6	6	191792	191797	0 %	100 %	0 %	0 %	209808986
4057	NC_011313	TTA	2	6	191879	191884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808986
4058	NC_011313	TTTG	2	8	191895	191902	0 %	75 %	25 %	0 %	209808986
4059	NC_011313	ACC	2	6	191912	191917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808986
4060	NC_011313	GCA	2	6	191945	191950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808986
4061	NC_011313	GGC	2	6	191953	191958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808986
4062	NC_011313	CGC	2	6	191965	191970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808986
4063	NC_011313	AGG	2	6	191974	191979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209808986
4064	NC_011313	CA	3	6	191990	191995	50 %	0 %	0 %	50 %	209808986
4065	NC_011313	CT	4	8	192042	192049	0 %	50 %	0 %	50 %	209808986
4066	NC_011313	GGT	2	6	192133	192138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808986
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4072	NC_011313	A	6	6	192456	192461	100 %	0 %	0 %	0 %	209808987
4073	NC_011313	TTC	2	6	192496	192501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808987
4074	NC_011313	ATT	2	6	192647	192652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808987
4075	NC_011313	GCG	2	6	192670	192675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209808987
4076	NC_011313	TAC	2	6	192690	192695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808987
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4079	NC_011313	ATT	2	6	192851	192856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808987
4080	NC_011313	CAT	2	6	192858	192863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808987
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4083	NC_011313	GCTTGG	2	12	192981	192992	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209808987
4084	NC_011313	GAA	2	6	193013	193018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808987
4085	NC_011313	GAT	2	6	193023	193028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808987
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4089	NC_011313	TTA	2	6	193252	193257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808988
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4091	NC_011313	A	7	7	193284	193290	100 %	0 %	0 %	0 %	209808988
4092	NC_011313	CTT	2	6	193295	193300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808988
4093	NC_011313	TTGT	2	8	193335	193342	0 %	75 %	25 %	0 %	209808988
4094	NC_011313	ATCT	2	8	193364	193371	25 %	50 %	0 %	25 %	209808988
4095	NC_011313	TCA	2	6	193463	193468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808988
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4097	NC_011313	CAAAA	2	10	193593	193602	80 %	0 %	0 %	20 %	209808989
4098	NC_011313	A	7	7	193624	193630	100 %	0 %	0 %	0 %	209808989
4099	NC_011313	GAA	2	6	193637	193642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808989
4100	NC_011313	TGA	2	6	193662	193667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808989
4101	NC_011313	A	6	6	193679	193684	100 %	0 %	0 %	0 %	209808989
4102	NC_011313	TGCT	2	8	193686	193693	0 %	50 %	25 %	25 %	209808989
4103	NC_011313	TC	3	6	193755	193760	0 %	50 %	0 %	50 %	209808989
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4112	NC_011313	AAT	2	6	194141	194146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808990
4113	NC_011313	CTT	2	6	194161	194166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808990
4114	NC_011313	A	6	6	194184	194189	100 %	0 %	0 %	0 %	209808990
4115	NC_011313	ATC	2	6	194240	194245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808990
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4117	NC_011313	A	6	6	194293	194298	100 %	0 %	0 %	0 %	209808990
4118	NC_011313	TGATT	2	10	194302	194311	20 %	60 %	20 %	0 %	209808990
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4122	NC_011313	CAT	2	6	194510	194515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808990
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4124	NC_011313	T	6	6	194530	194535	0 %	100 %	0 %	0 %	209808990
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4157	NC_011313	AAAG	2	8	195947	195954	75 %	0 %	25 %	0 %	209808992
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4252	NC_011313	TGA	2	6	200365	200370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808997
4253	NC_011313	AGCG	2	8	200403	200410	25 %	0 %	50 %	25 %	209808997
4254	NC_011313	CATT	2	8	200648	200655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4255	NC_011313	A	6	6	200663	200668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_011313	A	6	6	200676	200681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_011313	GCCT	2	8	200682	200689	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_011313	AGGC	2	8	200705	200712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4259	NC_011313	TCGT	2	8	200717	200724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4260	NC_011313	ATCGA	2	10	200734	200743	40 %	20 %	20 %	20 %	209808998
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4263	NC_011313	CAAT	2	8	200833	200840	50 %	25 %	0 %	25 %	209808998
4264	NC_011313	TCT	2	6	200898	200903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808998
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4269	NC_011313	TGA	2	6	201261	201266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808998
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4271	NC_011313	AATT	2	8	201347	201354	50 %	50 %	0 %	0 %	209808998
4272	NC_011313	GAA	2	6	201472	201477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808998
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4281	NC_011313	CTG	2	6	201841	201846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808998
4282	NC_011313	CTTT	2	8	201880	201887	0 %	75 %	0 %	25 %	209808998
4283	NC_011313	T	6	6	201885	201890	0 %	100 %	0 %	0 %	209808998
4284	NC_011313	ACG	2	6	201899	201904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808998
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4290	NC_011313	TTTGT	2	10	202192	202201	0 %	80 %	20 %	0 %	209808998
4291	NC_011313	ACGA	2	8	202249	202256	50 %	0 %	25 %	25 %	209808998
4292	NC_011313	GTG	2	6	202296	202301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209808998
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4296	NC_011313	CG	3	6	202547	202552	0 %	0 %	50 %	50 %	209808998
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4300	NC_011313	CAT	2	6	202697	202702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808998
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4302	NC_011313	CTT	3	9	202738	202746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4303	NC_011313	ACTG	2	8	202813	202820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4304	NC_011313	TTA	2	6	202828	202833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4306	NC_011313	TTAG	2	8	202854	202861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4309	NC_011313	GTTTG	2	10	202946	202955	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4319	NC_011313	CTT	2	6	203452	203457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809000
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4335	NC_011313	ATTTG	2	10	204349	204358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4357	NC_011313	ATA	2	6	205475	205480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4358	NC_011313	A	6	6	205494	205499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4359	NC_011313	GAA	2	6	205504	205509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4360	NC_011313	GAT	2	6	205544	205549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_011313	TAT	2	6	205572	205577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_011313	TAAA	2	8	205585	205592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_011313	TA	3	6	205630	205635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_011313	ATT	2	6	205645	205650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_011313	GCT	2	6	205675	205680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4366	NC_011313	ATC	2	6	205719	205724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809002
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4370	NC_011313	TGA	2	6	206058	206063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809002
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4373	NC_011313	TCA	2	6	206202	206207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809002
4374	NC_011313	TTAA	2	8	206218	206225	50 %	50 %	0 %	0 %	209809002
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4500	NC_011313	TCAAT	2	10	211282	211291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

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