MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_011313	A	6	6	1007772	1007777	100 %	0 %	0 %	0 %	209809678
21503	NC_011313	GTT	2	6	1007857	1007862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809678
21504	NC_011313	AGA	2	6	1007882	1007887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809678
21505	NC_011313	GTC	2	6	1007928	1007933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809678
21506	NC_011313	TGT	3	9	1007948	1007956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809678
21507	NC_011313	AATT	2	8	1007957	1007964	50 %	50 %	0 %	0 %	209809678
21508	NC_011313	TTA	2	6	1008054	1008059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809678
21509	NC_011313	ACA	2	6	1008060	1008065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809678
21510	NC_011313	ATG	2	6	1008092	1008097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809678
21511	NC_011313	GAT	2	6	1008231	1008236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809678
21512	NC_011313	G	6	6	1008242	1008247	0 %	0 %	100 %	0 %	209809678
21513	NC_011313	A	6	6	1008255	1008260	100 %	0 %	0 %	0 %	209809678
21514	NC_011313	ATAAA	2	10	1008275	1008284	80 %	20 %	0 %	0 %	209809678
21515	NC_011313	T	6	6	1008299	1008304	0 %	100 %	0 %	0 %	209809678
21516	NC_011313	AAT	2	6	1008383	1008388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809678
21517	NC_011313	TG	3	6	1008395	1008400	0 %	50 %	50 %	0 %	209809678
21518	NC_011313	AGGG	2	8	1008413	1008420	25 %	0 %	75 %	0 %	209809678
21519	NC_011313	TCCT	2	8	1008506	1008513	0 %	50 %	0 %	50 %	209809678
21520	NC_011313	ATT	2	6	1008615	1008620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809678
21521	NC_011313	ATA	2	6	1008621	1008626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21522	NC_011313	GCA	2	6	1008668	1008673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21523	NC_011313	ATT	2	6	1008735	1008740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21524	NC_011313	A	6	6	1008765	1008770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21525	NC_011313	A	6	6	1008779	1008784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21526	NC_011313	CAAAA	2	10	1008826	1008835	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21527	NC_011313	A	6	6	1008847	1008852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21528	NC_011313	AAT	2	6	1008859	1008864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809679
21529	NC_011313	AAT	2	6	1008921	1008926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809679
21530	NC_011313	AAC	2	6	1008931	1008936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809679
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21533	NC_011313	GAA	2	6	1009105	1009110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809679
21534	NC_011313	CAT	2	6	1009114	1009119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809679
21535	NC_011313	TGG	2	6	1009206	1009211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809679
21536	NC_011313	GAA	2	6	1009243	1009248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809679
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21539	NC_011313	GC	3	6	1009395	1009400	0 %	0 %	50 %	50 %	209809679
21540	NC_011313	CGT	2	6	1009447	1009452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809679
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21545	NC_011313	TAT	2	6	1009668	1009673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809679
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21552	NC_011313	GCT	2	6	1010002	1010007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809679
21553	NC_011313	ATC	2	6	1010026	1010031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809679
21554	NC_011313	CCAA	2	8	1010071	1010078	50 %	0 %	0 %	50 %	209809679
21555	NC_011313	GAA	2	6	1010080	1010085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809679
21556	NC_011313	CAG	2	6	1010098	1010103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809679
21557	NC_011313	TCT	2	6	1010124	1010129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21558	NC_011313	ATG	2	6	1010157	1010162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21559	NC_011313	T	7	7	1010169	1010175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21560	NC_011313	T	6	6	1010177	1010182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21561	NC_011313	TAAT	2	8	1010225	1010232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21562	NC_011313	TAT	2	6	1010258	1010263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21563	NC_011313	CTC	2	6	1010334	1010339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21564	NC_011313	TATTT	2	10	1010347	1010356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21565	NC_011313	TA	3	6	1010401	1010406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21566	NC_011313	TTG	2	6	1010442	1010447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21567	NC_011313	T	6	6	1010449	1010454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21568	NC_011313	ACC	2	6	1010462	1010467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21569	NC_011313	GCT	2	6	1010528	1010533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21570	NC_011313	CTG	2	6	1010565	1010570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21571	NC_011313	TAT	2	6	1010602	1010607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21572	NC_011313	CGTT	2	8	1010611	1010618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21573	NC_011313	ATGA	2	8	1010633	1010640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21574	NC_011313	AGC	2	6	1010706	1010711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21575	NC_011313	TGGT	2	8	1010740	1010747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21576	NC_011313	TGTATG	2	12	1010748	1010759	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21577	NC_011313	ATTG	2	8	1010816	1010823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21578	NC_011313	TG	3	6	1010952	1010957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21579	NC_011313	TCT	2	6	1011056	1011061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21584	NC_011313	ATA	2	6	1011348	1011353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21585	NC_011313	GAG	2	6	1011413	1011418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21586	NC_011313	GAT	2	6	1011437	1011442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21587	NC_011313	CTG	2	6	1011516	1011521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21588	NC_011313	AAG	3	9	1011570	1011578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21589	NC_011313	TGA	2	6	1011628	1011633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21590	NC_011313	CT	3	6	1011660	1011665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21591	NC_011313	TGA	2	6	1011670	1011675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21592	NC_011313	GAAT	2	8	1011685	1011692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21593	NC_011313	GCT	2	6	1011784	1011789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21594	NC_011313	TTAT	2	8	1011844	1011851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21595	NC_011313	TAA	2	6	1011879	1011884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21596	NC_011313	CAT	2	6	1011969	1011974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21597	NC_011313	CTT	2	6	1012037	1012042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21598	NC_011313	TGA	2	6	1012108	1012113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21599	NC_011313	ATA	2	6	1012128	1012133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21600	NC_011313	AG	3	6	1012210	1012215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21601	NC_011313	CAA	2	6	1012263	1012268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21602	NC_011313	ATG	2	6	1012400	1012405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21603	NC_011313	AGT	2	6	1012508	1012513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21604	NC_011313	AAT	2	6	1012553	1012558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21605	NC_011313	GCA	2	6	1012600	1012605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21606	NC_011313	AGC	2	6	1012624	1012629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21607	NC_011313	TGGG	2	8	1012650	1012657	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21608	NC_011313	CAT	2	6	1012709	1012714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21609	NC_011313	AGC	2	6	1012717	1012722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21610	NC_011313	AG	3	6	1012732	1012737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21611	NC_011313	GACC	2	8	1012747	1012754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21612	NC_011313	CTG	2	6	1012755	1012760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21613	NC_011313	CGA	2	6	1012779	1012784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21614	NC_011313	GA	3	6	1012816	1012821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21615	NC_011313	TCAT	2	8	1012897	1012904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21616	NC_011313	AAC	2	6	1012939	1012944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21617	NC_011313	TAT	2	6	1013149	1013154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21618	NC_011313	TTAT	2	8	1013198	1013205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21619	NC_011313	AATTAT	2	12	1013209	1013220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21620	NC_011313	TGA	2	6	1013302	1013307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21621	NC_011313	ATT	2	6	1013327	1013332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21622	NC_011313	CAA	2	6	1013342	1013347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21623	NC_011313	CAA	2	6	1013397	1013402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21624	NC_011313	CA	3	6	1013430	1013435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21985	NC_011313	CTT	2	6	1030403	1030408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21986	NC_011313	TGA	2	6	1030422	1030427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21987	NC_011313	TTACT	2	10	1030436	1030445	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21988	NC_011313	A	8	8	1030460	1030467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21989	NC_011313	AC	3	6	1030487	1030492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21990	NC_011313	TAT	2	6	1030522	1030527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21991	NC_011313	TTA	2	6	1030565	1030570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21992	NC_011313	CTT	2	6	1030623	1030628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21993	NC_011313	CTTTGC	3	18	1030630	1030647	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21994	NC_011313	TAC	2	6	1030649	1030654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21995	NC_011313	AAC	2	6	1030677	1030682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21996	NC_011313	CAA	2	6	1030706	1030711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21997	NC_011313	TC	3	6	1030739	1030744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21998	NC_011313	CTT	2	6	1030837	1030842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21999	NC_011313	GCTT	2	8	1030857	1030864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22000	NC_011313	CAG	2	6	1030903	1030908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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