MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011313	ATTA	2	8	611002	611009	50 %	50 %	0 %	0 %	209809343
13002	NC_011313	GAAA	2	8	611059	611066	75 %	0 %	25 %	0 %	209809343
13003	NC_011313	TGA	2	6	611095	611100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809343
13004	NC_011313	ATG	2	6	611127	611132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809343
13005	NC_011313	AAT	2	6	611143	611148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809343
13006	NC_011313	ATT	2	6	611163	611168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809343
13007	NC_011313	TAC	2	6	611206	611211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_011313	TAG	2	6	611276	611281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_011313	T	6	6	611324	611329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_011313	T	6	6	611357	611362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_011313	CTTT	2	8	611389	611396	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13012	NC_011313	TAT	2	6	611438	611443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_011313	GCA	2	6	611533	611538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809344
13014	NC_011313	GTTTC	2	10	611630	611639	0 %	60 %	20 %	20 %	209809344
13015	NC_011313	AAGCG	2	10	611741	611750	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13016	NC_011313	TTGGT	2	10	611823	611832	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_011313	GCG	2	6	611858	611863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_011313	A	6	6	611978	611983	100 %	0 %	0 %	0 %	209809345
13019	NC_011313	GAA	2	6	612000	612005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809345
13020	NC_011313	ACA	2	6	612122	612127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809345
13021	NC_011313	AG	3	6	612169	612174	50 %	0 %	50 %	0 %	209809345
13022	NC_011313	TCA	3	9	612216	612224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809345
13023	NC_011313	GT	3	6	612366	612371	0 %	50 %	50 %	0 %	209809345
13024	NC_011313	TGG	2	6	612438	612443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809345
13025	NC_011313	TGA	2	6	612450	612455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809345
13026	NC_011313	GGTTG	2	10	612457	612466	0 %	40 %	60 %	0 %	209809345
13027	NC_011313	ATG	2	6	612502	612507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809345
13028	NC_011313	GCA	2	6	612544	612549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809345
13029	NC_011313	TAA	2	6	612612	612617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809345
13030	NC_011313	GTT	2	6	612637	612642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809345
13031	NC_011313	GTT	2	6	612676	612681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809345
13032	NC_011313	A	6	6	612717	612722	100 %	0 %	0 %	0 %	209809345
13033	NC_011313	TCA	2	6	612774	612779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809345
13034	NC_011313	A	6	6	612855	612860	100 %	0 %	0 %	0 %	209809345
13035	NC_011313	GCA	2	6	612861	612866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809345
13036	NC_011313	TTG	2	6	612875	612880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809345
13037	NC_011313	GA	3	6	612902	612907	50 %	0 %	50 %	0 %	209809345
13038	NC_011313	TAT	2	6	612965	612970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809345
13039	NC_011313	TGT	2	6	613006	613011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809345
13040	NC_011313	ATTT	2	8	613068	613075	25 %	75 %	0 %	0 %	209809345
13041	NC_011313	T	6	6	613073	613078	0 %	100 %	0 %	0 %	209809345
13042	NC_011313	ATT	2	6	613098	613103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_011313	TGC	3	9	613123	613131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_011313	TTTA	2	8	613162	613169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_011313	AAAT	2	8	613174	613181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_011313	GCT	2	6	613274	613279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_011313	CGT	2	6	613377	613382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_011313	ATT	2	6	613391	613396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_011313	AGAT	2	8	613482	613489	50 %	25 %	25 %	0 %	209809346
13050	NC_011313	T	6	6	613519	613524	0 %	100 %	0 %	0 %	209809346
13051	NC_011313	AGC	2	6	613533	613538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809346
13052	NC_011313	AAG	2	6	613843	613848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809347
13053	NC_011313	CT	3	6	613898	613903	0 %	50 %	0 %	50 %	209809347
13054	NC_011313	GTG	2	6	613912	613917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809347
13055	NC_011313	CTG	2	6	613927	613932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809347
13056	NC_011313	GAAATG	2	12	613998	614009	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209809347
13057	NC_011313	AAG	2	6	614041	614046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809347
13058	NC_011313	TAC	2	6	614284	614289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_011313	TAG	2	6	614354	614359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_011313	T	6	6	614400	614405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_011313	TCA	2	6	614412	614417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_011313	TCT	2	6	614462	614467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_011313	TTG	2	6	614468	614473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_011313	TCA	2	6	614490	614495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_011313	TAT	2	6	614511	614516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_011313	TTA	2	6	614645	614650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_011313	TTG	2	6	614660	614665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_011313	GTTTC	2	10	614703	614712	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13069	NC_011313	AAGCG	2	10	614814	614823	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13070	NC_011313	TTGGT	2	10	614895	614904	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_011313	AGTC	2	8	614906	614913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13072	NC_011313	GCG	2	6	614930	614935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_011313	AGG	2	6	614947	614952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_011313	TGGA	2	8	615003	615010	25 %	25 %	50 %	0 %	209809348
13075	NC_011313	GAA	2	6	615038	615043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809348
13076	NC_011313	CAAT	2	8	615045	615052	50 %	25 %	0 %	25 %	209809348
13077	NC_011313	TCA	2	6	615064	615069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809348
13078	NC_011313	CGTT	2	8	615123	615130	0 %	50 %	25 %	25 %	209809348
13079	NC_011313	TTG	2	6	615172	615177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809348
13080	NC_011313	TAATGA	2	12	615181	615192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209809348
13081	NC_011313	ATT	2	6	615193	615198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809348
13082	NC_011313	ATCAGT	2	12	615202	615213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209809348
13083	NC_011313	GGAA	2	8	615285	615292	50 %	0 %	50 %	0 %	209809348
13084	NC_011313	TAC	2	6	615393	615398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_011313	ATC	2	6	615499	615504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_011313	AATT	2	8	615509	615516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_011313	AAGA	2	8	615542	615549	75 %	0 %	25 %	0 %	209809349
13088	NC_011313	AGC	2	6	615575	615580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809349
13089	NC_011313	GTAA	2	8	615636	615643	50 %	25 %	25 %	0 %	209809349
13090	NC_011313	A	6	6	615750	615755	100 %	0 %	0 %	0 %	209809349
13091	NC_011313	GAG	2	6	615768	615773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209809349
13092	NC_011313	A	6	6	615788	615793	100 %	0 %	0 %	0 %	209809349
13093	NC_011313	CAGA	2	8	615850	615857	50 %	0 %	25 %	25 %	209809350
13094	NC_011313	GTA	2	6	615990	615995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809350
13095	NC_011313	AG	3	6	616038	616043	50 %	0 %	50 %	0 %	209809350
13096	NC_011313	AGTA	2	8	616096	616103	50 %	25 %	25 %	0 %	209809350
13097	NC_011313	TAT	2	6	616147	616152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809350
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13105	NC_011313	T	6	6	616508	616513	0 %	100 %	0 %	0 %	209809350
13106	NC_011313	AT	3	6	616588	616593	50 %	50 %	0 %	0 %	209809350
13107	NC_011313	CAG	2	6	616606	616611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809350
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13109	NC_011313	ATG	2	6	616632	616637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809350
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13111	NC_011313	TTAG	2	8	616669	616676	25 %	50 %	25 %	0 %	209809350
13112	NC_011313	GTC	2	6	616763	616768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_011313	T	6	6	616846	616851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_011313	TTACAA	2	12	616896	616907	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13115	NC_011313	ATT	2	6	616928	616933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_011313	TA	3	6	616951	616956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_011313	ACA	2	6	617081	617086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_011313	ACG	2	6	617155	617160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809351
13119	NC_011313	CAT	2	6	617214	617219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809351
13120	NC_011313	TCG	2	6	617339	617344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809351
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13122	NC_011313	TTTG	2	8	617515	617522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_011313	GGT	2	6	617572	617577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13248	NC_011313	TGA	2	6	623735	623740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809357
13249	NC_011313	CCA	2	6	623830	623835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809357
13250	NC_011313	TGA	3	9	623924	623932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809357
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13252	NC_011313	CTG	2	6	623975	623980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809357
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13350	NC_011313	AAAT	2	8	628445	628452	75 %	25 %	0 %	0 %	209809361
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13354	NC_011313	GAT	2	6	628839	628844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13359	NC_011313	TG	3	6	629158	629163	0 %	50 %	50 %	0 %	209809362
13360	NC_011313	GAT	2	6	629256	629261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809362
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13368	NC_011313	CAACT	2	10	629553	629562	40 %	20 %	0 %	40 %	209809362
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13490	NC_011313	GAAA	2	8	635228	635235	75 %	0 %	25 %	0 %	209809366
13491	NC_011313	GCA	2	6	635259	635264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809366
13492	NC_011313	TGA	2	6	635269	635274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809366
13493	NC_011313	CTTTGT	2	12	635281	635292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	209809366
13494	NC_011313	CCG	2	6	635316	635321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209809366
13495	NC_011313	TTGT	2	8	635324	635331	0 %	75 %	25 %	0 %	209809366
13496	NC_011313	CGG	2	6	635398	635403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809366
13497	NC_011313	TCA	2	6	635427	635432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809366
13498	NC_011313	GT	3	6	635627	635632	0 %	50 %	50 %	0 %	209809366
13499	NC_011313	TGC	2	6	635642	635647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809366
13500	NC_011313	T	8	8	635659	635666	0 %	100 %	0 %	0 %	209809366

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