MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011313	CAGA	2	8	584631	584638	50 %	0 %	25 %	25 %	209809313
12502	NC_011313	TGC	2	6	584677	584682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809313
12503	NC_011313	CTT	2	6	584718	584723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809313
12504	NC_011313	TTG	2	6	584743	584748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809313
12505	NC_011313	TCA	2	6	584762	584767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809313
12506	NC_011313	ACA	2	6	584769	584774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809313
12507	NC_011313	CAA	2	6	584812	584817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809313
12508	NC_011313	AAAG	2	8	584843	584850	75 %	0 %	25 %	0 %	209809313
12509	NC_011313	TAA	2	6	584857	584862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809313
12510	NC_011313	TGT	2	6	584982	584987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809313
12511	NC_011313	CAA	2	6	585060	585065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809313
12512	NC_011313	AAT	2	6	585089	585094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809313
12513	NC_011313	GC	3	6	585117	585122	0 %	0 %	50 %	50 %	209809313
12514	NC_011313	T	6	6	585253	585258	0 %	100 %	0 %	0 %	209809313
12515	NC_011313	CAT	2	6	585259	585264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809313
12516	NC_011313	TGCCTT	2	12	585300	585311	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209809313
12517	NC_011313	CTT	2	6	585429	585434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809313
12518	NC_011313	AGA	2	6	585446	585451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809313
12519	NC_011313	AGCG	2	8	585509	585516	25 %	0 %	50 %	25 %	209809313
12520	NC_011313	CGT	2	6	585601	585606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809313
12521	NC_011313	ATAC	2	8	585608	585615	50 %	25 %	0 %	25 %	209809313
12522	NC_011313	GTT	2	6	585675	585680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809313
12523	NC_011313	GCG	2	6	585690	585695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809313
12524	NC_011313	ATG	2	6	585709	585714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809313
12525	NC_011313	CAA	2	6	585739	585744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809313
12526	NC_011313	AATA	2	8	585837	585844	75 %	25 %	0 %	0 %	209809314
12527	NC_011313	GT	3	6	586006	586011	0 %	50 %	50 %	0 %	209809314
12528	NC_011313	ATG	2	6	586185	586190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809314
12529	NC_011313	TGG	2	6	586225	586230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809314
12530	NC_011313	ACCAA	2	10	586269	586278	60 %	0 %	0 %	40 %	209809314
12531	NC_011313	G	6	6	586327	586332	0 %	0 %	100 %	0 %	209809314
12532	NC_011313	CCG	2	6	586420	586425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209809314
12533	NC_011313	TCT	3	9	586461	586469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809314
12534	NC_011313	ACC	2	6	586491	586496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809314
12535	NC_011313	CAT	2	6	586499	586504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809314
12536	NC_011313	CCAA	2	8	586566	586573	50 %	0 %	0 %	50 %	209809314
12537	NC_011313	TCT	2	6	586680	586685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809314
12538	NC_011313	CAC	3	9	586734	586742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809314
12539	NC_011313	TGT	2	6	586756	586761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809314
12540	NC_011313	TGA	2	6	586770	586775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809315
12541	NC_011313	TGA	2	6	586779	586784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809315
12542	NC_011313	AGT	2	6	586786	586791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809315
12543	NC_011313	TCA	2	6	586840	586845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809315
12544	NC_011313	GTT	2	6	586853	586858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809315
12545	NC_011313	GATT	2	8	586859	586866	25 %	50 %	25 %	0 %	209809315
12546	NC_011313	TTC	2	6	586942	586947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809315
12547	NC_011313	CCA	2	6	586974	586979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809315
12548	NC_011313	GCTT	2	8	587032	587039	0 %	50 %	25 %	25 %	209809315
12549	NC_011313	TAA	2	6	587040	587045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809315
12550	NC_011313	T	6	6	587118	587123	0 %	100 %	0 %	0 %	209809315
12551	NC_011313	GAT	2	6	587166	587171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809315
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12553	NC_011313	ATT	2	6	587299	587304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809315
12554	NC_011313	TGA	2	6	587354	587359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809316
12555	NC_011313	ATTGC	2	10	587383	587392	20 %	40 %	20 %	20 %	209809316
12556	NC_011313	TGT	2	6	587395	587400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809316
12557	NC_011313	TTG	3	9	587426	587434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809316
12558	NC_011313	TGG	2	6	587446	587451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809316
12559	NC_011313	AGAGA	2	10	587454	587463	60 %	0 %	40 %	0 %	209809316
12560	NC_011313	TAT	2	6	587485	587490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809316
12561	NC_011313	ATC	2	6	587547	587552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809316
12562	NC_011313	TGA	2	6	587629	587634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809316
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12564	NC_011313	ACT	2	6	587726	587731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809316
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12566	NC_011313	T	6	6	587758	587763	0 %	100 %	0 %	0 %	209809316
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12569	NC_011313	GCT	2	6	587971	587976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809316
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12571	NC_011313	GT	4	8	588000	588007	0 %	50 %	50 %	0 %	209809316
12572	NC_011313	CGAA	2	8	588041	588048	50 %	0 %	25 %	25 %	209809316
12573	NC_011313	TGA	2	6	588114	588119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809316
12574	NC_011313	CATT	2	8	588124	588131	25 %	50 %	0 %	25 %	209809316
12575	NC_011313	AATG	2	8	588168	588175	50 %	25 %	25 %	0 %	209809316
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12577	NC_011313	TTC	2	6	588252	588257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809316
12578	NC_011313	TTAT	2	8	588269	588276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_011313	ACTA	2	8	588304	588311	50 %	25 %	0 %	25 %	209809317
12580	NC_011313	AAG	2	6	588387	588392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809317
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12588	NC_011313	CTT	2	6	588812	588817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809317
12589	NC_011313	GGC	2	6	588918	588923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209809317
12590	NC_011313	TGGC	2	8	588932	588939	0 %	25 %	50 %	25 %	209809317
12591	NC_011313	GATA	2	8	589019	589026	50 %	25 %	25 %	0 %	209809317
12592	NC_011313	GCAA	2	8	589168	589175	50 %	0 %	25 %	25 %	209809317
12593	NC_011313	CAAT	2	8	589178	589185	50 %	25 %	0 %	25 %	209809317
12594	NC_011313	ATT	2	6	589295	589300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_011313	TGA	2	6	589311	589316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_011313	TAA	2	6	589333	589338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_011313	ATT	2	6	589356	589361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_011313	ATT	2	6	589391	589396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_011313	TAT	2	6	589508	589513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_011313	TTG	2	6	589537	589542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_011313	A	7	7	589546	589552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_011313	TGA	2	6	589567	589572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_011313	AAC	2	6	589579	589584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12604	NC_011313	TGG	2	6	589615	589620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_011313	AAG	2	6	589632	589637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_011313	TAT	2	6	589642	589647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_011313	TCA	2	6	589649	589654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_011313	CTGATA	2	12	589701	589712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12609	NC_011313	GAA	2	6	589724	589729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_011313	ACA	2	6	589753	589758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_011313	ATG	2	6	589770	589775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_011313	CGG	2	6	589797	589802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_011313	ATT	2	6	589803	589808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_011313	CTT	2	6	589822	589827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_011313	TTC	2	6	589859	589864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_011313	TGTT	2	8	589932	589939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_011313	ATT	2	6	590005	590010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_011313	ATGG	2	8	590051	590058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_011313	TGT	2	6	590119	590124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_011313	GAAGA	2	10	590127	590136	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_011313	A	6	6	590153	590158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12623	NC_011313	AGC	2	6	590377	590382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_011313	TGT	2	6	590413	590418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_011313	TGA	2	6	590464	590469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12628	NC_011313	CAG	2	6	590565	590570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12632	NC_011313	CAG	2	6	590915	590920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809318
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12997	NC_011313	ATTT	2	8	610815	610822	25 %	75 %	0 %	0 %	209809342
12998	NC_011313	TGC	2	6	610841	610846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809342
12999	NC_011313	GCTT	2	8	610900	610907	0 %	50 %	25 %	25 %	209809342
13000	NC_011313	GAT	2	6	610946	610951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809343

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