MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 25879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011313	TAT	2	6	512864	512869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_011313	AGC	2	6	512924	512929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809246
11003	NC_011313	TAA	2	6	512939	512944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809246
11004	NC_011313	CTT	3	9	512953	512961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809246
11005	NC_011313	AAG	2	6	512967	512972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809246
11006	NC_011313	TAT	2	6	513019	513024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809246
11007	NC_011313	AG	3	6	513082	513087	50 %	0 %	50 %	0 %	209809246
11008	NC_011313	TAA	2	6	513116	513121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_011313	A	6	6	513134	513139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_011313	T	7	7	513155	513161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_011313	ATAC	2	8	513194	513201	50 %	25 %	0 %	25 %	209809247
11012	NC_011313	CT	3	6	513358	513363	0 %	50 %	0 %	50 %	209809247
11013	NC_011313	CAC	2	6	513429	513434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809247
11014	NC_011313	TCA	2	6	513527	513532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809247
11015	NC_011313	TCA	2	6	513548	513553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809247
11016	NC_011313	AAT	2	6	513559	513564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809247
11017	NC_011313	TCG	2	6	513585	513590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809247
11018	NC_011313	T	8	8	513597	513604	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11019	NC_011313	CGA	2	6	513626	513631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809247
11020	NC_011313	T	6	6	513676	513681	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11021	NC_011313	T	7	7	513689	513695	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11022	NC_011313	T	6	6	513709	513714	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11023	NC_011313	TTCTGA	2	12	513727	513738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209809247
11024	NC_011313	CCA	2	6	513791	513796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809247
11025	NC_011313	AAT	2	6	513820	513825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809247
11026	NC_011313	T	8	8	513847	513854	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11027	NC_011313	TAA	2	6	513929	513934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809247
11028	NC_011313	TTC	2	6	513954	513959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809247
11029	NC_011313	TGA	2	6	513965	513970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809247
11030	NC_011313	ATTT	2	8	514041	514048	25 %	75 %	0 %	0 %	209809247
11031	NC_011313	T	6	6	514084	514089	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11032	NC_011313	T	6	6	514127	514132	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11033	NC_011313	AAT	2	6	514139	514144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809247
11034	NC_011313	ATC	2	6	514183	514188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809247
11035	NC_011313	TAT	2	6	514309	514314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809247
11036	NC_011313	GA	3	6	514321	514326	50 %	0 %	50 %	0 %	209809247
11037	NC_011313	GTA	2	6	514339	514344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809247
11038	NC_011313	ATTG	2	8	514400	514407	25 %	50 %	25 %	0 %	209809247
11039	NC_011313	AG	3	6	514447	514452	50 %	0 %	50 %	0 %	209809247
11040	NC_011313	GTAG	2	8	514547	514554	25 %	25 %	50 %	0 %	209809247
11041	NC_011313	TAA	2	6	514558	514563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809247
11042	NC_011313	T	6	6	514593	514598	0 %	100 %	0 %	0 %	209809247
11043	NC_011313	ATAA	2	8	514634	514641	75 %	25 %	0 %	0 %	209809247
11044	NC_011313	TTC	2	6	514654	514659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809247
11045	NC_011313	CT	3	6	514664	514669	0 %	50 %	0 %	50 %	209809247
11046	NC_011313	CTT	2	6	514794	514799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_011313	GATA	2	8	514900	514907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_011313	ATT	2	6	514916	514921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_011313	AC	3	6	514927	514932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_011313	AC	3	6	514972	514977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_011313	CA	3	6	515023	515028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11052	NC_011313	ACG	2	6	515178	515183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809248
11053	NC_011313	CTG	2	6	515189	515194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809248
11054	NC_011313	A	6	6	515234	515239	100 %	0 %	0 %	0 %	209809248
11055	NC_011313	CA	3	6	515257	515262	50 %	0 %	0 %	50 %	209809248
11056	NC_011313	A	7	7	515281	515287	100 %	0 %	0 %	0 %	209809248
11057	NC_011313	TTGG	2	8	515309	515316	0 %	50 %	50 %	0 %	209809248
11058	NC_011313	A	6	6	515351	515356	100 %	0 %	0 %	0 %	209809248
11059	NC_011313	AG	3	6	515401	515406	50 %	0 %	50 %	0 %	209809248
11060	NC_011313	TGCT	2	8	515420	515427	0 %	50 %	25 %	25 %	209809248
11061	NC_011313	A	6	6	515437	515442	100 %	0 %	0 %	0 %	209809248
11062	NC_011313	ACAA	2	8	515444	515451	75 %	0 %	0 %	25 %	209809248
11063	NC_011313	AT	3	6	515498	515503	50 %	50 %	0 %	0 %	209809248
11064	NC_011313	GAT	2	6	515524	515529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809248
11065	NC_011313	ATG	2	6	515677	515682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809248
11066	NC_011313	ATTT	2	8	515776	515783	25 %	75 %	0 %	0 %	209809248
11067	NC_011313	TGAA	2	8	515816	515823	50 %	25 %	25 %	0 %	209809248
11068	NC_011313	T	6	6	515847	515852	0 %	100 %	0 %	0 %	209809248
11069	NC_011313	CGAG	2	8	515954	515961	25 %	0 %	50 %	25 %	209809248
11070	NC_011313	GT	3	6	515978	515983	0 %	50 %	50 %	0 %	209809248
11071	NC_011313	TAA	2	6	516008	516013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_011313	AAT	2	6	516061	516066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_011313	TAA	2	6	516074	516079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_011313	T	6	6	516094	516099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_011313	CAA	2	6	516121	516126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_011313	TGA	2	6	516149	516154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_011313	CTG	2	6	516173	516178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_011313	TAGG	2	8	516197	516204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_011313	GAA	2	6	516210	516215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_011313	GATT	2	8	516247	516254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_011313	T	6	6	516281	516286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_011313	ATT	2	6	516314	516319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_011313	TGCT	2	8	516377	516384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11084	NC_011313	ATA	2	6	516466	516471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_011313	TAA	2	6	516485	516490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_011313	CGT	2	6	516500	516505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_011313	GCTGA	2	10	516613	516622	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11088	NC_011313	TAA	2	6	516704	516709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_011313	TTC	2	6	516710	516715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_011313	AGA	2	6	516723	516728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_011313	GCA	2	6	516733	516738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_011313	TGG	2	6	516747	516752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_011313	AAGT	2	8	516755	516762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_011313	AT	3	6	516781	516786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_011313	AGC	2	6	516833	516838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_011313	TTGT	2	8	516870	516877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_011313	TCAATT	2	12	516912	516923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11098	NC_011313	TAA	2	6	516935	516940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_011313	GT	4	8	517018	517025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_011313	TCA	2	6	517044	517049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_011313	TCT	2	6	517050	517055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_011313	TGA	2	6	517062	517067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_011313	CTT	2	6	517078	517083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_011313	AGTA	2	8	517123	517130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_011313	TTATC	2	10	517270	517279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11106	NC_011313	CTTA	2	8	517302	517309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_011313	GTA	2	6	517313	517318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_011313	TGT	2	6	517386	517391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_011313	TGAT	2	8	517518	517525	25 %	50 %	25 %	0 %	209809249
11110	NC_011313	AAATC	2	10	517649	517658	60 %	20 %	0 %	20 %	209809249
11111	NC_011313	CAT	2	6	517680	517685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809249
11112	NC_011313	A	6	6	517717	517722	100 %	0 %	0 %	0 %	209809249
11113	NC_011313	CCAA	2	8	517766	517773	50 %	0 %	0 %	50 %	209809249
11114	NC_011313	TTG	2	6	517815	517820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809249
11115	NC_011313	CCG	2	6	517892	517897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209809249
11116	NC_011313	T	7	7	517900	517906	0 %	100 %	0 %	0 %	209809249
11117	NC_011313	TAA	2	6	517935	517940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809249
11118	NC_011313	CAC	2	6	517944	517949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809249
11119	NC_011313	GT	3	6	517954	517959	0 %	50 %	50 %	0 %	209809249
11120	NC_011313	ACC	2	6	517960	517965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809249
11121	NC_011313	CAG	2	6	518022	518027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809249
11122	NC_011313	TTGACC	2	12	518035	518046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209809249
11123	NC_011313	ATC	2	6	518062	518067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809249
11124	NC_011313	CTTG	2	8	518109	518116	0 %	50 %	25 %	25 %	209809249
11125	NC_011313	GTT	2	6	518118	518123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809249
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11127	NC_011313	CTT	2	6	518244	518249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809249
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11129	NC_011313	TCT	2	6	518312	518317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809249
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11131	NC_011313	ATA	2	6	518335	518340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809249
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11237	NC_011313	CCA	2	6	524142	524147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809254
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11239	NC_011313	AAT	2	6	524179	524184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809255
11240	NC_011313	A	6	6	524186	524191	100 %	0 %	0 %	0 %	209809255
11241	NC_011313	CACTT	2	10	524202	524211	20 %	40 %	0 %	40 %	209809255
11242	NC_011313	ATA	2	6	524234	524239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809255
11243	NC_011313	ATA	2	6	524357	524362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809255
11244	NC_011313	TGG	2	6	524410	524415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809255
11245	NC_011313	ACT	2	6	524433	524438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809255
11246	NC_011313	AG	3	6	524475	524480	50 %	0 %	50 %	0 %	209809255
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11248	NC_011313	AAT	2	6	524497	524502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809255
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