MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 70999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011312	TGCACC	2	12	145097	145108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209693733
3002	NC_011312	ACC	2	6	145208	145213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693733
3003	NC_011312	ACT	2	6	145269	145274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693733
3004	NC_011312	TTC	2	6	145302	145307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693734
3005	NC_011312	ATA	2	6	145346	145351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693734
3006	NC_011312	TTC	2	6	145359	145364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693734
3007	NC_011312	TGA	2	6	145413	145418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693734
3008	NC_011312	TCA	2	6	145429	145434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693734
3009	NC_011312	ATTTCA	2	12	145438	145449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	209693734
3010	NC_011312	A	6	6	145505	145510	100 %	0 %	0 %	0 %	209693734
3011	NC_011312	AT	3	6	145538	145543	50 %	50 %	0 %	0 %	209693734
3012	NC_011312	CTT	2	6	145589	145594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693734
3013	NC_011312	ATA	2	6	145656	145661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_011312	TGA	2	6	145680	145685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011312	GAA	2	6	145688	145693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011312	GA	3	6	145721	145726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011312	TTTTA	2	10	145779	145788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011312	ATTA	2	8	145800	145807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011312	ATT	2	6	145870	145875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011312	AT	3	6	145918	145923	50 %	50 %	0 %	0 %	209693735
3021	NC_011312	GAT	2	6	145935	145940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693735
3022	NC_011312	TTG	2	6	145978	145983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693735
3023	NC_011312	GA	3	6	145992	145997	50 %	0 %	50 %	0 %	209693735
3024	NC_011312	GTCA	2	8	146008	146015	25 %	25 %	25 %	25 %	209693735
3025	NC_011312	CTA	2	6	146023	146028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693735
3026	NC_011312	TCA	2	6	146057	146062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693735
3027	NC_011312	TCA	2	6	146105	146110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693735
3028	NC_011312	GCCTA	2	10	146168	146177	20 %	20 %	20 %	40 %	209693735
3029	NC_011312	TG	3	6	146188	146193	0 %	50 %	50 %	0 %	209693735
3030	NC_011312	TTG	2	6	146236	146241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693735
3031	NC_011312	ATT	2	6	146382	146387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693735
3032	NC_011312	TGAG	2	8	146497	146504	25 %	25 %	50 %	0 %	209693735
3033	NC_011312	A	6	6	146546	146551	100 %	0 %	0 %	0 %	209693735
3034	NC_011312	GAA	2	6	146633	146638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693735
3035	NC_011312	TC	3	6	146641	146646	0 %	50 %	0 %	50 %	209693735
3036	NC_011312	A	7	7	146723	146729	100 %	0 %	0 %	0 %	209693735
3037	NC_011312	ATA	2	6	147001	147006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693736
3038	NC_011312	ATC	2	6	147099	147104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693736
3039	NC_011312	TTA	2	6	147195	147200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693736
3040	NC_011312	ATCA	2	8	147208	147215	50 %	25 %	0 %	25 %	209693736
3041	NC_011312	CCA	2	6	147237	147242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693737
3042	NC_011312	TTG	2	6	147300	147305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693737
3043	NC_011312	ATAA	2	8	147458	147465	75 %	25 %	0 %	0 %	209693737
3044	NC_011312	AGC	2	6	147486	147491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693737
3045	NC_011312	AAC	2	6	147550	147555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693737
3046	NC_011312	AGG	2	6	147586	147591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_011312	GATT	2	8	147597	147604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011312	TAT	2	6	147610	147615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011312	TA	3	6	147619	147624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011312	ATAAA	2	10	147641	147650	80 %	20 %	0 %	0 %	209693738
3051	NC_011312	AAAT	2	8	147702	147709	75 %	25 %	0 %	0 %	209693738
3052	NC_011312	TCT	2	6	147717	147722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693738
3053	NC_011312	GGCT	2	8	147734	147741	0 %	25 %	50 %	25 %	209693738
3054	NC_011312	GACTC	2	10	147775	147784	20 %	20 %	20 %	40 %	209693738
3055	NC_011312	AGA	3	9	147807	147815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693738
3056	NC_011312	ATC	2	6	147817	147822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693738
3057	NC_011312	ATG	2	6	147830	147835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693738
3058	NC_011312	AC	3	6	147836	147841	50 %	0 %	0 %	50 %	209693738
3059	NC_011312	TTA	2	6	147908	147913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693738
3060	NC_011312	ATGC	2	8	147958	147965	25 %	25 %	25 %	25 %	209693738
3061	NC_011312	A	7	7	148061	148067	100 %	0 %	0 %	0 %	209693738
3062	NC_011312	ATT	2	6	148153	148158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693738
3063	NC_011312	ATT	2	6	148225	148230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693738
3064	NC_011312	TAA	2	6	148256	148261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693738
3065	NC_011312	TAA	2	6	148287	148292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693738
3066	NC_011312	AAC	2	6	148316	148321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693738
3067	NC_011312	TGA	2	6	148335	148340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693738
3068	NC_011312	AAC	2	6	148341	148346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693738
3069	NC_011312	CACG	2	8	148576	148583	25 %	0 %	25 %	50 %	209693738
3070	NC_011312	CGA	2	6	148585	148590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693738
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3072	NC_011312	CAGA	2	8	148726	148733	50 %	0 %	25 %	25 %	209693738
3073	NC_011312	TGA	2	6	148863	148868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693738
3074	NC_011312	AGCG	2	8	148901	148908	25 %	0 %	50 %	25 %	209693738
3075	NC_011312	A	7	7	149176	149182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_011312	GTG	2	6	149186	149191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_011312	ATA	2	6	149257	149262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_011312	TTG	2	6	149285	149290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011312	TTC	2	6	149328	149333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693739
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3081	NC_011312	TAA	2	6	149384	149389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693739
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3083	NC_011312	CAG	2	6	149410	149415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693739
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3090	NC_011312	AAGA	2	8	149754	149761	75 %	0 %	25 %	0 %	209693739
3091	NC_011312	T	6	6	149807	149812	0 %	100 %	0 %	0 %	209693739
3092	NC_011312	TTC	2	6	149867	149872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693739
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3095	NC_011312	TTTG	2	8	150032	150039	0 %	75 %	25 %	0 %	209693739
3096	NC_011312	ATGA	2	8	150045	150052	50 %	25 %	25 %	0 %	209693739
3097	NC_011312	TATT	2	8	150060	150067	25 %	75 %	0 %	0 %	209693739
3098	NC_011312	AAT	2	6	150082	150087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693739
3099	NC_011312	TAT	2	6	150130	150135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693739
3100	NC_011312	ATC	2	6	150143	150148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693739
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3103	NC_011312	T	6	6	150289	150294	0 %	100 %	0 %	0 %	209693739
3104	NC_011312	AAAT	2	8	150296	150303	75 %	25 %	0 %	0 %	209693739
3105	NC_011312	CGTTG	2	10	150387	150396	0 %	40 %	40 %	20 %	209693739
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3108	NC_011312	TTG	2	6	150496	150501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693739
3109	NC_011312	CAT	2	6	150502	150507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693739
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3112	NC_011312	TTA	2	6	150640	150645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693739
3113	NC_011312	CCTGT	2	10	150652	150661	0 %	40 %	20 %	40 %	209693739
3114	NC_011312	CAGT	2	8	150691	150698	25 %	25 %	25 %	25 %	209693739
3115	NC_011312	GAC	2	6	150763	150768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693739
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3117	NC_011312	T	7	7	150865	150871	0 %	100 %	0 %	0 %	209693739
3118	NC_011312	AATCC	2	10	150895	150904	40 %	20 %	0 %	40 %	209693739
3119	NC_011312	ATC	3	9	151001	151009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693739
3120	NC_011312	GCT	2	6	151053	151058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_011312	TTAT	2	8	151125	151132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011312	ATTT	2	8	151216	151223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011312	CAA	2	6	151226	151231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_011312	CAG	2	6	151312	151317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693740
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3376	NC_011312	TAAAA	2	10	162427	162436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3377	NC_011312	AGA	2	6	162437	162442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_011312	G	6	6	168246	168251	0 %	0 %	100 %	0 %	209693755
3500	NC_011312	T	6	6	168252	168257	0 %	100 %	0 %	0 %	209693755

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