MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 70999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011312	A	6	6	23291	23296	100 %	0 %	0 %	0 %	209693654
502	NC_011312	ATTG	2	8	23330	23337	25 %	50 %	25 %	0 %	209693654
503	NC_011312	CTG	2	6	23357	23362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693654
504	NC_011312	ATTT	2	8	23444	23451	25 %	75 %	0 %	0 %	209693654
505	NC_011312	GCC	2	6	23457	23462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693654
506	NC_011312	CAAG	2	8	23466	23473	50 %	0 %	25 %	25 %	209693654
507	NC_011312	A	6	6	23499	23504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011312	TAAC	2	8	23555	23562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_011312	GTT	2	6	23634	23639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011312	A	6	6	23794	23799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011312	T	7	7	23819	23825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011312	TTA	2	6	23913	23918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693655
513	NC_011312	TGC	2	6	23919	23924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693655
514	NC_011312	CTGA	2	8	23933	23940	25 %	25 %	25 %	25 %	209693655
515	NC_011312	GAC	2	6	24002	24007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693655
516	NC_011312	ACG	3	9	24138	24146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693655
517	NC_011312	A	6	6	24154	24159	100 %	0 %	0 %	0 %	209693655
518	NC_011312	GTA	2	6	24162	24167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693655
519	NC_011312	ATC	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693655
520	NC_011312	CTA	2	6	24203	24208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693655
521	NC_011312	ATC	2	6	24217	24222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693655
522	NC_011312	TCT	2	6	24223	24228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693655
523	NC_011312	CTGT	2	8	24244	24251	0 %	50 %	25 %	25 %	209693655
524	NC_011312	AAT	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693655
525	NC_011312	TCG	2	6	24365	24370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693655
526	NC_011312	ATT	2	6	24378	24383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693655
527	NC_011312	ACG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693655
528	NC_011312	TTA	2	6	24454	24459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693655
529	NC_011312	TTC	2	6	24474	24479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693655
530	NC_011312	TCA	2	6	24496	24501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693655
531	NC_011312	CAA	2	6	24538	24543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693655
532	NC_011312	CAG	2	6	24714	24719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693655
533	NC_011312	GCA	2	6	24727	24732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693655
534	NC_011312	AAT	2	6	24739	24744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693655
535	NC_011312	TGT	2	6	24838	24843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693655
536	NC_011312	AT	3	6	24916	24921	50 %	50 %	0 %	0 %	209693655
537	NC_011312	CAA	2	6	24946	24951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693655
538	NC_011312	TTA	2	6	25039	25044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693655
539	NC_011312	GAA	2	6	25046	25051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693655
540	NC_011312	AAT	2	6	25078	25083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693655
541	NC_011312	CAA	2	6	25135	25140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011312	ATA	2	6	25211	25216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693656
543	NC_011312	AAT	2	6	25225	25230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693656
544	NC_011312	TAT	2	6	25292	25297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693656
545	NC_011312	AGT	2	6	25309	25314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693656
546	NC_011312	TCA	2	6	25389	25394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693656
547	NC_011312	GAA	2	6	25465	25470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693656
548	NC_011312	ATT	2	6	25475	25480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693656
549	NC_011312	ATAA	2	8	25516	25523	75 %	25 %	0 %	0 %	209693656
550	NC_011312	TC	3	6	25580	25585	0 %	50 %	0 %	50 %	209693656
551	NC_011312	TCA	3	9	25595	25603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693656
552	NC_011312	TAA	2	6	25614	25619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693656
553	NC_011312	GTT	2	6	25667	25672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693656
554	NC_011312	ATT	2	6	25698	25703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693656
555	NC_011312	TCG	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693656
556	NC_011312	GTG	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693656
557	NC_011312	GATA	2	8	25773	25780	50 %	25 %	25 %	0 %	209693656
558	NC_011312	GTT	2	6	25819	25824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693656
559	NC_011312	GGT	2	6	25825	25830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693656
560	NC_011312	ATT	2	6	25851	25856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693656
561	NC_011312	TGG	2	6	25866	25871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693656
562	NC_011312	GAA	2	6	25888	25893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693656
563	NC_011312	ATCT	2	8	25902	25909	25 %	50 %	0 %	25 %	209693656
564	NC_011312	GTA	2	6	26018	26023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693656
565	NC_011312	AAC	2	6	26048	26053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011312	T	6	6	26112	26117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011312	TTAA	2	8	26137	26144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011312	TCA	2	6	26176	26181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011312	TGTTT	2	10	26201	26210	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011312	TAA	2	6	26255	26260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011312	TA	3	6	26277	26282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011312	TGATA	2	10	26302	26311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011312	AAT	2	6	26320	26325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011312	TCT	2	6	26404	26409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011312	AGT	2	6	26425	26430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011312	ATG	2	6	26524	26529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693657
577	NC_011312	CGA	2	6	26690	26695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693657
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579	NC_011312	GAA	2	6	26763	26768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693657
580	NC_011312	GTA	2	6	26774	26779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693657
581	NC_011312	TTG	2	6	26786	26791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693657
582	NC_011312	TGAC	2	8	26855	26862	25 %	25 %	25 %	25 %	209693657
583	NC_011312	AAGT	2	8	26910	26917	50 %	25 %	25 %	0 %	209693657
584	NC_011312	TTTA	2	8	27005	27012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011312	T	7	7	27060	27066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011312	TTCA	2	8	27085	27092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_011312	TAA	2	6	27236	27241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011312	TATT	2	8	27247	27254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011312	GTT	2	6	27276	27281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011312	GAAAT	2	10	27379	27388	60 %	20 %	20 %	0 %	209693658
591	NC_011312	TATT	2	8	27404	27411	25 %	75 %	0 %	0 %	209693658
592	NC_011312	TG	3	6	27433	27438	0 %	50 %	50 %	0 %	209693658
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596	NC_011312	AATC	2	8	27634	27641	50 %	25 %	0 %	25 %	209693658
597	NC_011312	ACA	2	6	27658	27663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693658
598	NC_011312	TAA	2	6	27714	27719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693658
599	NC_011312	TAA	2	6	27771	27776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693659
600	NC_011312	GCT	2	6	27839	27844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693659
601	NC_011312	TGA	2	6	27865	27870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693659
602	NC_011312	ATCA	2	8	27958	27965	50 %	25 %	0 %	25 %	209693659
603	NC_011312	CTGAAA	2	12	28002	28013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209693659
604	NC_011312	TAA	2	6	28014	28019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693659
605	NC_011312	A	6	6	28018	28023	100 %	0 %	0 %	0 %	209693659
606	NC_011312	TTG	2	6	28024	28029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693659
607	NC_011312	A	6	6	28073	28078	100 %	0 %	0 %	0 %	209693659
608	NC_011312	TGT	2	6	28087	28092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693659
609	NC_011312	TTC	2	6	28098	28103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693659
610	NC_011312	ATT	2	6	28114	28119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693659
611	NC_011312	CAAAA	2	10	28281	28290	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_011312	TGATA	2	10	28344	28353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011312	AAT	2	6	28362	28367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011312	ATTA	2	8	28429	28436	50 %	50 %	0 %	0 %	209693660
615	NC_011312	TGT	3	9	28437	28445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693660
616	NC_011312	TAT	2	6	28467	28472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693660
617	NC_011312	GCAA	2	8	28486	28493	50 %	0 %	25 %	25 %	209693660
618	NC_011312	TAA	2	6	28578	28583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693660
619	NC_011312	TTG	2	6	28611	28616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693660
620	NC_011312	GAT	2	6	28637	28642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693660
621	NC_011312	TGG	2	6	28726	28731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693660
622	NC_011312	CAT	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693660
623	NC_011312	ATT	2	6	28857	28862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693660
624	NC_011312	T	6	6	28861	28866	0 %	100 %	0 %	0 %	209693660
625	NC_011312	TTA	2	6	28931	28936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693660
626	NC_011312	T	6	6	28994	28999	0 %	100 %	0 %	0 %	209693660
627	NC_011312	TG	4	8	29095	29102	0 %	50 %	50 %	0 %	209693660
628	NC_011312	CAC	2	6	29106	29111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693660
629	NC_011312	TAA	2	6	29116	29121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693660
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631	NC_011312	TTCT	2	8	29151	29158	0 %	75 %	0 %	25 %	209693660
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