MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011206	GCG	2	6	184423	184428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282339
4002	NC_011206	GAT	2	6	184445	184450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282339
4003	NC_011206	CAC	2	6	184499	184504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282339
4004	NC_011206	GAA	2	6	184548	184553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282339
4005	NC_011206	TGGC	2	8	184554	184561	0 %	25 %	50 %	25 %	198282339
4006	NC_011206	GAG	2	6	184593	184598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282339
4007	NC_011206	GCC	2	6	184626	184631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282339
4008	NC_011206	CGA	2	6	184648	184653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282339
4009	NC_011206	ACC	2	6	184659	184664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282339
4010	NC_011206	CTG	2	6	184665	184670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282339
4011	NC_011206	TGCG	2	8	184702	184709	0 %	25 %	50 %	25 %	198282339
4012	NC_011206	GGGC	2	8	184748	184755	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_011206	TCC	2	6	184771	184776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_011206	CAT	2	6	184800	184805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_011206	TGA	2	6	184833	184838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282340
4016	NC_011206	CAT	2	6	184852	184857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282340
4017	NC_011206	ATCC	2	8	184900	184907	25 %	25 %	0 %	50 %	198282340
4018	NC_011206	CAT	2	6	184918	184923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282340
4019	NC_011206	TTTC	2	8	184930	184937	0 %	75 %	0 %	25 %	198282340
4020	NC_011206	GAA	2	6	184938	184943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282340
4021	NC_011206	AAG	2	6	185021	185026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282340
4022	NC_011206	GAC	2	6	185070	185075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282340
4023	NC_011206	CGG	2	6	185119	185124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282340
4024	NC_011206	ATG	2	6	185142	185147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282340
4025	NC_011206	TATT	2	8	185169	185176	25 %	75 %	0 %	0 %	198282340
4026	NC_011206	GAC	2	6	185201	185206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282340
4027	NC_011206	TGA	2	6	185251	185256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282340
4028	NC_011206	AAG	2	6	185273	185278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282340
4029	NC_011206	AT	3	6	185303	185308	50 %	50 %	0 %	0 %	198282340
4030	NC_011206	GCCT	2	8	185375	185382	0 %	25 %	25 %	50 %	198282340
4031	NC_011206	GA	3	6	185398	185403	50 %	0 %	50 %	0 %	198282340
4032	NC_011206	G	6	6	185406	185411	0 %	0 %	100 %	0 %	198282340
4033	NC_011206	AAT	2	6	185417	185422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282340
4034	NC_011206	TCT	2	6	185436	185441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282340
4035	NC_011206	GA	3	6	185460	185465	50 %	0 %	50 %	0 %	198282340
4036	NC_011206	ATC	2	6	185501	185506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282340
4037	NC_011206	CCG	2	6	185741	185746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282340
4038	NC_011206	GCG	2	6	185795	185800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282340
4039	NC_011206	GAA	2	6	185953	185958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282340
4040	NC_011206	AAG	2	6	185973	185978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282340
4041	NC_011206	CGAA	2	8	185983	185990	50 %	0 %	25 %	25 %	198282340
4042	NC_011206	CAC	2	6	186025	186030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_011206	TTAG	2	8	186137	186144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011206	CGC	2	6	186187	186192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_011206	T	6	6	186219	186224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011206	G	6	6	186321	186326	0 %	0 %	100 %	0 %	198282341
4047	NC_011206	GCG	2	6	186337	186342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282341
4048	NC_011206	TTC	2	6	186387	186392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282341
4049	NC_011206	CCG	2	6	186413	186418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282341
4050	NC_011206	CCG	2	6	186440	186445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282341
4051	NC_011206	TGC	2	6	186497	186502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4052	NC_011206	GAT	2	6	186572	186577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282341
4053	NC_011206	GCC	2	6	186583	186588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282341
4054	NC_011206	ATCC	2	8	186615	186622	25 %	25 %	0 %	50 %	198282341
4055	NC_011206	T	6	6	186770	186775	0 %	100 %	0 %	0 %	198282341
4056	NC_011206	GCT	2	6	186795	186800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4057	NC_011206	CTG	2	6	186837	186842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4058	NC_011206	CTG	2	6	186872	186877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4059	NC_011206	TCG	2	6	186887	186892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4060	NC_011206	TGCG	2	8	186897	186904	0 %	25 %	50 %	25 %	198282341
4061	NC_011206	GCA	2	6	187018	187023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4062	NC_011206	TCG	2	6	187072	187077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4063	NC_011206	GAC	2	6	187239	187244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4064	NC_011206	ATC	2	6	187260	187265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282341
4065	NC_011206	AGC	2	6	187270	187275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4066	NC_011206	CGA	2	6	187289	187294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282341
4067	NC_011206	CAT	2	6	187401	187406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282341
4068	NC_011206	CTAA	2	8	187572	187579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_011206	A	6	6	187612	187617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011206	CG	3	6	187646	187651	0 %	0 %	50 %	50 %	198282342
4071	NC_011206	TTTGG	2	10	187657	187666	0 %	60 %	40 %	0 %	198282342
4072	NC_011206	CTC	2	6	187691	187696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282342
4073	NC_011206	GTC	2	6	187718	187723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282342
4074	NC_011206	ACG	2	6	187770	187775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282342
4075	NC_011206	AGT	2	6	187839	187844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282342
4076	NC_011206	ATG	2	6	187848	187853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282342
4077	NC_011206	TGA	2	6	187899	187904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282343
4078	NC_011206	TGC	2	6	187940	187945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282343
4079	NC_011206	TCT	2	6	187989	187994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282343
4080	NC_011206	GCA	2	6	188037	188042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282343
4081	NC_011206	TTG	2	6	188093	188098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282343
4082	NC_011206	CAT	2	6	188179	188184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282343
4083	NC_011206	CCA	2	6	188448	188453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_011206	GCC	2	6	188499	188504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_011206	TGA	2	6	188623	188628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282344
4086	NC_011206	GCCA	2	8	188737	188744	25 %	0 %	25 %	50 %	198282344
4087	NC_011206	CGTG	2	8	188777	188784	0 %	25 %	50 %	25 %	198282344
4088	NC_011206	CTGT	2	8	188839	188846	0 %	50 %	25 %	25 %	198282344
4089	NC_011206	TAG	2	6	188875	188880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282344
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4091	NC_011206	CAG	2	6	188939	188944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282344
4092	NC_011206	AGG	2	6	189035	189040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011206	CGT	2	6	189102	189107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_011206	ATA	2	6	189143	189148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_011206	A	7	7	189159	189165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011206	GTT	2	6	189238	189243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011206	GAT	2	6	189355	189360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282345
4098	NC_011206	TCG	2	6	189686	189691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282345
4099	NC_011206	CTG	2	6	189729	189734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282345
4100	NC_011206	GGC	2	6	189737	189742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282345
4101	NC_011206	GGA	2	6	189796	189801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282345
4102	NC_011206	GGTTTC	2	12	189803	189814	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	198282345
4103	NC_011206	CTT	2	6	190130	190135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282345
4104	NC_011206	TAG	2	6	190241	190246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282345
4105	NC_011206	GCT	2	6	190269	190274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282345
4106	NC_011206	ATT	2	6	190277	190282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282345
4107	NC_011206	AG	3	6	190304	190309	50 %	0 %	50 %	0 %	198282345
4108	NC_011206	CGA	2	6	190341	190346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282345
4109	NC_011206	CACCT	2	10	190349	190358	20 %	20 %	0 %	60 %	198282345
4110	NC_011206	T	6	6	190386	190391	0 %	100 %	0 %	0 %	198282345
4111	NC_011206	TGT	2	6	190506	190511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282345
4112	NC_011206	TAT	2	6	190543	190548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282345
4113	NC_011206	T	6	6	190584	190589	0 %	100 %	0 %	0 %	198282345
4114	NC_011206	GCC	2	6	190605	190610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282345
4115	NC_011206	A	7	7	190613	190619	100 %	0 %	0 %	0 %	198282345
4116	NC_011206	TGA	2	6	190749	190754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282345
4117	NC_011206	GGT	2	6	190836	190841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011206	TCCT	2	8	190842	190849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_011206	TAC	2	6	190896	190901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_011206	TG	3	6	190910	190915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011206	A	6	6	190946	190951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011206	GTC	2	6	191019	191024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_011206	ACCAG	2	10	191072	191081	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4124	NC_011206	TTAA	2	8	191090	191097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4130	NC_011206	TGG	2	6	191333	191338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4247	NC_011206	ATT	2	6	196903	196908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_011206	TGC	2	6	197083	197088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282353
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4275	NC_011206	TCG	2	6	198162	198167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282354
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4353	NC_011206	AAGA	2	8	201577	201584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4354	NC_011206	GGT	2	6	201637	201642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4371	NC_011206	CCG	2	6	202736	202741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282359
4372	NC_011206	GTG	2	6	202794	202799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282359
4373	NC_011206	CCAG	2	8	202807	202814	25 %	0 %	25 %	50 %	198282359
4374	NC_011206	CCGC	2	8	202864	202871	0 %	0 %	25 %	75 %	198282359
4375	NC_011206	GTG	2	6	202875	202880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282359
4376	NC_011206	GAAG	2	8	202892	202899	50 %	0 %	50 %	0 %	198282359
4377	NC_011206	TCA	2	6	202903	202908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282359
4378	NC_011206	CGC	2	6	202946	202951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282359
4379	NC_011206	GC	3	6	202986	202991	0 %	0 %	50 %	50 %	198282359
4380	NC_011206	ATCG	2	8	203075	203082	25 %	25 %	25 %	25 %	198282359
4381	NC_011206	AGAAC	2	10	203084	203093	60 %	0 %	20 %	20 %	198282359
4382	NC_011206	GCG	2	6	203124	203129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282359
4383	NC_011206	AGG	2	6	203176	203181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282359
4384	NC_011206	AGCG	2	8	203182	203189	25 %	0 %	50 %	25 %	198282359
4385	NC_011206	GCT	2	6	203192	203197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282359
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4388	NC_011206	GCC	2	6	203289	203294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282359
4389	NC_011206	CCAGTC	2	12	203363	203374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198282359
4390	NC_011206	TGC	2	6	203377	203382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282359
4391	NC_011206	GCA	2	6	203397	203402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282359
4392	NC_011206	ACG	2	6	203428	203433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282359
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4399	NC_011206	GCC	2	6	203808	203813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282359
4400	NC_011206	CCAC	2	8	203817	203824	25 %	0 %	0 %	75 %	198282359
4401	NC_011206	GGA	2	6	203828	203833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282359
4402	NC_011206	GC	3	6	203869	203874	0 %	0 %	50 %	50 %	198282360
4403	NC_011206	CG	3	6	203903	203908	0 %	0 %	50 %	50 %	198282360
4404	NC_011206	ATC	2	6	204158	204163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282360
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4407	NC_011206	GCG	2	6	204285	204290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282360
4408	NC_011206	TGG	2	6	204333	204338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282360
4409	NC_011206	GAC	2	6	204344	204349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282360
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4411	NC_011206	CCA	2	6	204406	204411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282360
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4413	NC_011206	TCG	2	6	204435	204440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282360
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4416	NC_011206	TCGA	2	8	204510	204517	25 %	25 %	25 %	25 %	198282360
4417	NC_011206	CCTG	2	8	204626	204633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4418	NC_011206	T	6	6	204683	204688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4419	NC_011206	GAC	2	6	204818	204823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282361
4420	NC_011206	CTGA	2	8	205017	205024	25 %	25 %	25 %	25 %	198282361
4421	NC_011206	CTTG	2	8	205072	205079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4422	NC_011206	AAG	2	6	205118	205123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4423	NC_011206	CGAA	2	8	205143	205150	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4424	NC_011206	CAG	2	6	205166	205171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4425	NC_011206	CGC	2	6	205220	205225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4426	NC_011206	GGCCCC	2	12	205246	205257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4427	NC_011206	CGTC	2	8	205266	205273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4428	NC_011206	CCA	2	6	205280	205285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282362
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4430	NC_011206	GGC	2	6	205437	205442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282362
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4433	NC_011206	CGC	2	6	205532	205537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4434	NC_011206	CGC	2	6	205617	205622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282363
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4441	NC_011206	CAT	2	6	205837	205842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282363
4442	NC_011206	TAG	2	6	205853	205858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282363
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4444	NC_011206	CAT	2	6	205939	205944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282363
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4446	NC_011206	TCC	2	6	206055	206060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4447	NC_011206	GAT	2	6	206170	206175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282364
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4449	NC_011206	AAC	2	6	206362	206367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282364
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4452	NC_011206	CTG	2	6	206648	206653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
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4454	NC_011206	TCAG	2	8	206792	206799	25 %	25 %	25 %	25 %	198282365
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4461	NC_011206	TCCA	2	8	207296	207303	25 %	25 %	0 %	50 %	198282365
4462	NC_011206	TAT	2	6	207327	207332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282365
4463	NC_011206	CAC	2	6	207393	207398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
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4470	NC_011206	CAT	2	6	207688	207693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282365
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4472	NC_011206	ACT	2	6	207773	207778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282365
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4476	NC_011206	CTG	2	6	207961	207966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4477	NC_011206	CTT	2	6	207967	207972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282365
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4480	NC_011206	C	6	6	208040	208045	0 %	0 %	0 %	100 %	198282365
4481	NC_011206	AAT	2	6	208068	208073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282365
4482	NC_011206	GC	3	6	208094	208099	0 %	0 %	50 %	50 %	198282365
4483	NC_011206	CGG	2	6	208186	208191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282365
4484	NC_011206	GTC	2	6	208221	208226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4485	NC_011206	TCC	2	6	208267	208272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282365
4486	NC_011206	ACC	2	6	208312	208317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
4487	NC_011206	CCA	2	6	208318	208323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
4488	NC_011206	GCC	2	6	208393	208398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282365
4489	NC_011206	TCT	2	6	208442	208447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282365
4490	NC_011206	GCA	2	6	208460	208465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282365
4491	NC_011206	GAG	2	6	208486	208491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282365
4492	NC_011206	CGG	2	6	208501	208506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282365
4493	NC_011206	ATG	2	6	208541	208546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282365
4494	NC_011206	TAGC	2	8	208557	208564	25 %	25 %	25 %	25 %	198282365
4495	NC_011206	CCT	2	6	208566	208571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282365
4496	NC_011206	GAGC	2	8	208602	208609	25 %	0 %	50 %	25 %	198282365
4497	NC_011206	CCA	2	6	208671	208676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282365
4498	NC_011206	TCCAC	2	10	208704	208713	20 %	20 %	0 %	60 %	198282365
4499	NC_011206	CGC	2	6	208918	208923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282366
4500	NC_011206	CAA	2	6	209024	209029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282366

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