MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39118	NC_011206	GTC	2	6	1873423	1873428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283993
39119	NC_011206	GCT	3	9	1873443	1873451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283993
39120	NC_011206	T	6	6	1873459	1873464	0 %	100 %	0 %	0 %	198283993
39121	NC_011206	TGGCTC	2	12	1873519	1873530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283993
39122	NC_011206	GCC	2	6	1873607	1873612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283993
39123	NC_011206	AGG	2	6	1873664	1873669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283993
39124	NC_011206	ACGG	2	8	1873732	1873739	25 %	0 %	50 %	25 %	198283993
39125	NC_011206	CGC	2	6	1873758	1873763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283993
39126	NC_011206	CGA	2	6	1873767	1873772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283993
39127	NC_011206	GC	3	6	1873793	1873798	0 %	0 %	50 %	50 %	198283993
39128	NC_011206	GGT	2	6	1873816	1873821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283993
39129	NC_011206	CGG	2	6	1873839	1873844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283993
39130	NC_011206	TCA	2	6	1873868	1873873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283993
39131	NC_011206	AGG	2	6	1873886	1873891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283993
39132	NC_011206	AC	3	6	1873896	1873901	50 %	0 %	0 %	50 %	198283993
39133	NC_011206	TGG	2	6	1873925	1873930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283993
39134	NC_011206	GGC	2	6	1873935	1873940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283993
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39137	NC_011206	GTCACC	2	12	1874011	1874022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198283993
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39140	NC_011206	TGC	2	6	1874174	1874179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283993
39141	NC_011206	TGG	2	6	1874189	1874194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283993
39142	NC_011206	GC	3	6	1874205	1874210	0 %	0 %	50 %	50 %	198283993
39143	NC_011206	GGC	2	6	1874217	1874222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283993
39144	NC_011206	TGC	2	6	1874237	1874242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283993
39145	NC_011206	GGC	2	6	1874334	1874339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283993
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39151	NC_011206	TGG	2	6	1874618	1874623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283993
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39165	NC_011206	GCA	2	6	1875264	1875269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283993
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39168	NC_011206	TGC	2	6	1875347	1875352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283993
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39171	NC_011206	TGA	2	6	1875428	1875433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283994
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39173	NC_011206	TCA	2	6	1875510	1875515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283994
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39191	NC_011206	AT	3	6	1876398	1876403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39192	NC_011206	TA	3	6	1876432	1876437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39193	NC_011206	GTA	2	6	1876544	1876549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283996
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39203	NC_011206	GGC	3	9	1876786	1876794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283996
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39210	NC_011206	GAG	2	6	1877104	1877109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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39221	NC_011206	TGCCC	2	10	1877523	1877532	0 %	20 %	20 %	60 %	198283997
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39227	NC_011206	CCA	2	6	1877867	1877872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283997
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39231	NC_011206	CACC	2	8	1878179	1878186	25 %	0 %	0 %	75 %	198283997
39232	NC_011206	GGC	2	6	1878196	1878201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283997
39233	NC_011206	TTC	2	6	1878202	1878207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283997
39234	NC_011206	TGGT	2	8	1878255	1878262	0 %	50 %	50 %	0 %	198283997
39235	NC_011206	GGT	2	6	1878280	1878285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283997
39236	NC_011206	TGG	2	6	1878302	1878307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283997
39237	NC_011206	CTC	2	6	1878338	1878343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39238	NC_011206	GTC	2	6	1878377	1878382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39239	NC_011206	G	6	6	1878522	1878527	0 %	0 %	100 %	0 %	198283998
39240	NC_011206	CGT	2	6	1878535	1878540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283998
39241	NC_011206	TCC	2	6	1878546	1878551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283998
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39244	NC_011206	AGT	2	6	1878871	1878876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39245	NC_011206	GCT	2	6	1878934	1878939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39246	NC_011206	AT	3	6	1878970	1878975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39247	NC_011206	ACC	2	6	1878986	1878991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39248	NC_011206	ATC	2	6	1879060	1879065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39249	NC_011206	GCT	2	6	1879175	1879180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283999
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39255	NC_011206	GGAA	2	8	1879587	1879594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39256	NC_011206	CTACG	2	10	1879643	1879652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39257	NC_011206	G	6	6	1879686	1879691	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39258	NC_011206	CGT	2	6	1879745	1879750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39259	NC_011206	GGA	2	6	1879781	1879786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198284000
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39263	NC_011206	TCC	2	6	1879938	1879943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284000
39264	NC_011206	TTC	2	6	1879961	1879966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198284000
39265	NC_011206	A	6	6	1880009	1880014	100 %	0 %	0 %	0 %	198284000
39266	NC_011206	GAT	2	6	1880064	1880069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39267	NC_011206	CATGGA	2	12	1880126	1880137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	198284001
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39270	NC_011206	GGC	2	6	1880352	1880357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284002
39271	NC_011206	TC	3	6	1880459	1880464	0 %	50 %	0 %	50 %	198284002
39272	NC_011206	GGC	2	6	1880636	1880641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198284002
39273	NC_011206	TAG	2	6	1880707	1880712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284002
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39282	NC_011206	ATCACC	2	12	1880913	1880924	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	198284002
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39286	NC_011206	ATC	2	6	1881102	1881107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198284002
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39292	NC_011206	CGT	2	6	1881377	1881382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284002
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39296	NC_011206	CTG	2	6	1881588	1881593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39297	NC_011206	CAAC	2	8	1881723	1881730	50 %	0 %	0 %	50 %	198284003
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39300	NC_011206	ATA	2	6	1881824	1881829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284003
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39303	NC_011206	GCTG	2	8	1881865	1881872	0 %	25 %	50 %	25 %	198284003
39304	NC_011206	TGC	2	6	1881935	1881940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284003
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39308	NC_011206	AT	3	6	1882111	1882116	50 %	50 %	0 %	0 %	198284003
39309	NC_011206	ATA	2	6	1882176	1882181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198284003
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39312	NC_011206	ACACA	2	10	1882243	1882252	60 %	0 %	0 %	40 %	198284003
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39315	NC_011206	TC	3	6	1882492	1882497	0 %	50 %	0 %	50 %	198284004
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39320	NC_011206	CTG	2	6	1882713	1882718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284004
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39322	NC_011206	CTG	2	6	1882744	1882749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198284004
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39325	NC_011206	TTC	2	6	1882915	1882920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39327	NC_011206	CTG	2	6	1883027	1883032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39329	NC_011206	CCT	2	6	1883109	1883114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39330	NC_011206	GCA	2	6	1883116	1883121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39331	NC_011206	CAC	2	6	1883161	1883166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39332	NC_011206	GAA	2	6	1883253	1883258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39333	NC_011206	A	6	6	1883343	1883348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39334	NC_011206	G	6	6	1883352	1883357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39335	NC_011206	TAC	2	6	1883384	1883389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39336	NC_011206	GAC	2	6	1883554	1883559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284005
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39338	NC_011206	GTCT	2	8	1883623	1883630	0 %	50 %	25 %	25 %	198284005
39339	NC_011206	AGA	2	6	1883747	1883752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284005
39340	NC_011206	A	6	6	1883783	1883788	100 %	0 %	0 %	0 %	198284005
39341	NC_011206	CCAG	2	8	1883955	1883962	25 %	0 %	25 %	50 %	198284005
39342	NC_011206	AAG	3	9	1884087	1884095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198284005
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39344	NC_011206	TGA	2	6	1884192	1884197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284005
39345	NC_011206	GTA	2	6	1884235	1884240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198284005
39346	NC_011206	CGA	2	6	1884345	1884350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198284005
39347	NC_011206	CGCC	2	8	1884353	1884360	0 %	0 %	25 %	75 %	198284005
39348	NC_011206	CCA	2	6	1884364	1884369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198284005
39349	NC_011206	TCC	2	6	1884439	1884444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198284005
39350	NC_011206	CCG	2	6	1884492	1884497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198284005
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