MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011206	TGG	2	6	113107	113112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282264
2502	NC_011206	TG	4	8	113220	113227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011206	ATTC	2	8	113265	113272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_011206	GGC	2	6	113299	113304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_011206	CGC	2	6	113305	113310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_011206	ATGG	2	8	113311	113318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_011206	CAG	2	6	113362	113367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_011206	TGG	2	6	113412	113417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011206	CGG	2	6	113469	113474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_011206	TCC	2	6	113485	113490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_011206	TGG	2	6	113519	113524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011206	GGC	2	6	113565	113570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282265
2513	NC_011206	CAT	2	6	113649	113654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282265
2514	NC_011206	GA	3	6	113681	113686	50 %	0 %	50 %	0 %	198282265
2515	NC_011206	GGT	2	6	113700	113705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282265
2516	NC_011206	ATG	2	6	113715	113720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282265
2517	NC_011206	CAG	2	6	113760	113765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282265
2518	NC_011206	GTC	2	6	113776	113781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282265
2519	NC_011206	GGT	2	6	113958	113963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011206	G	6	6	113975	113980	0 %	0 %	100 %	0 %	198282266
2521	NC_011206	CGG	2	6	114039	114044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2522	NC_011206	CGG	2	6	114114	114119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2523	NC_011206	GAC	2	6	114121	114126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282266
2524	NC_011206	TGG	2	6	114210	114215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282266
2525	NC_011206	GAG	2	6	114241	114246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282266
2526	NC_011206	CAG	2	6	114328	114333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282266
2527	NC_011206	GACGC	2	10	114382	114391	20 %	0 %	40 %	40 %	198282266
2528	NC_011206	GGC	2	6	114478	114483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2529	NC_011206	CGG	2	6	114525	114530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2530	NC_011206	TGC	2	6	114563	114568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282266
2531	NC_011206	GAAA	2	8	114600	114607	75 %	0 %	25 %	0 %	198282266
2532	NC_011206	CGG	2	6	114779	114784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2533	NC_011206	CAG	2	6	114909	114914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282266
2534	NC_011206	CGG	2	6	114920	114925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2535	NC_011206	ATT	2	6	114994	114999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282266
2536	NC_011206	GGC	2	6	115020	115025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2537	NC_011206	GCG	2	6	115076	115081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282266
2538	NC_011206	GAG	2	6	115093	115098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282266
2539	NC_011206	ATG	2	6	115171	115176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282266
2540	NC_011206	GGCT	2	8	115245	115252	0 %	25 %	50 %	25 %	198282266
2541	NC_011206	TGATG	2	10	115256	115265	20 %	40 %	40 %	0 %	198282266
2542	NC_011206	CAT	2	6	115342	115347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_011206	CAC	2	6	115467	115472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_011206	CAT	2	6	115554	115559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282267
2545	NC_011206	GAC	2	6	115600	115605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282267
2546	NC_011206	A	7	7	115613	115619	100 %	0 %	0 %	0 %	198282267
2547	NC_011206	CTG	2	6	115621	115626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282267
2548	NC_011206	GC	3	6	115679	115684	0 %	0 %	50 %	50 %	198282267
2549	NC_011206	GCA	2	6	115728	115733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282267
2550	NC_011206	GAC	2	6	115797	115802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282267
2551	NC_011206	TCG	2	6	115898	115903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282267
2552	NC_011206	GTTT	2	8	115926	115933	0 %	75 %	25 %	0 %	198282267
2553	NC_011206	GAA	2	6	115978	115983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282267
2554	NC_011206	A	7	7	116016	116022	100 %	0 %	0 %	0 %	198282267
2555	NC_011206	TCA	2	6	116064	116069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282267
2556	NC_011206	CAGATC	2	12	116164	116175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	198282267
2557	NC_011206	ATT	2	6	116373	116378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282268
2558	NC_011206	TGG	2	6	116452	116457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282268
2559	NC_011206	TTC	2	6	116582	116587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_011206	GCA	2	6	116610	116615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_011206	TGG	2	6	116639	116644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011206	TGA	2	6	116690	116695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011206	TAG	2	6	116714	116719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_011206	GT	3	6	116762	116767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011206	CAGG	2	8	116840	116847	25 %	0 %	50 %	25 %	198282269
2566	NC_011206	GC	3	6	116946	116951	0 %	0 %	50 %	50 %	198282269
2567	NC_011206	GAC	2	6	116962	116967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282269
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2569	NC_011206	GGA	2	6	117148	117153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282269
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2571	NC_011206	CT	3	6	117214	117219	0 %	50 %	0 %	50 %	198282270
2572	NC_011206	CCT	2	6	117236	117241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282270
2573	NC_011206	CGG	2	6	117284	117289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282270
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2582	NC_011206	GCT	2	6	117518	117523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282270
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2589	NC_011206	G	6	6	117722	117727	0 %	0 %	100 %	0 %	198282270
2590	NC_011206	CTG	2	6	117759	117764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282270
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2592	NC_011206	CTTCAG	2	12	117782	117793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	198282270
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2598	NC_011206	GC	3	6	118137	118142	0 %	0 %	50 %	50 %	198282270
2599	NC_011206	GGA	3	9	118154	118162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282270
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2601	NC_011206	TCG	2	6	118197	118202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282271
2602	NC_011206	GGC	2	6	118210	118215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282271
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2605	NC_011206	ATC	2	6	118260	118265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282271
2606	NC_011206	GC	3	6	118291	118296	0 %	0 %	50 %	50 %	198282271
2607	NC_011206	CTGC	2	8	118383	118390	0 %	25 %	25 %	50 %	198282271
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2612	NC_011206	CGCAG	2	10	118594	118603	20 %	0 %	40 %	40 %	198282271
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2622	NC_011206	CAG	2	6	118949	118954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282272
2623	NC_011206	GCC	2	6	118982	118987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282272
2624	NC_011206	A	6	6	118997	119002	100 %	0 %	0 %	0 %	198282272
2625	NC_011206	TCC	2	6	119058	119063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282272
2626	NC_011206	GGCG	2	8	119074	119081	0 %	0 %	75 %	25 %	198282272
2627	NC_011206	GGC	2	6	119132	119137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282272
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2633	NC_011206	GCG	2	6	119341	119346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_011206	T	6	6	119356	119361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_011206	CGCGG	2	10	119491	119500	0 %	0 %	60 %	40 %	198282273
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2749	NC_011206	CAC	2	6	125066	125071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2851	NC_011206	AAAT	2	8	130249	130256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2856	NC_011206	GAAC	2	8	130381	130388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2859	NC_011206	ATTT	2	8	130584	130591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2860	NC_011206	GTCA	2	8	130606	130613	25 %	25 %	25 %	25 %	198282288
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2868	NC_011206	AAGCA	2	10	131199	131208	60 %	0 %	20 %	20 %	198282288
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2870	NC_011206	TCA	2	6	131262	131267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282288
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2883	NC_011206	GCT	2	6	131706	131711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282288
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2898	NC_011206	CCT	2	6	132398	132403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282289
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2973	NC_011206	TCA	2	6	136032	136037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282291
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2977	NC_011206	TCA	2	6	136155	136160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282291
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2979	NC_011206	ATCC	2	8	136198	136205	25 %	25 %	0 %	50 %	198282291
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2990	NC_011206	GAA	2	6	137276	137281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282292
2991	NC_011206	TGCA	2	8	137286	137293	25 %	25 %	25 %	25 %	198282292
2992	NC_011206	CGTC	2	8	137331	137338	0 %	25 %	25 %	50 %	198282292
2993	NC_011206	CTT	2	6	137411	137416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2994	NC_011206	GC	3	6	137452	137457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2995	NC_011206	GA	3	6	137487	137492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_011206	T	8	8	137533	137540	0 %	100 %	0 %	0 %	198282293
2997	NC_011206	GGTA	2	8	137576	137583	25 %	25 %	50 %	0 %	198282293
2998	NC_011206	GAGC	2	8	137588	137595	25 %	0 %	50 %	25 %	198282293
2999	NC_011206	ACG	2	6	137692	137697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282293
3000	NC_011206	GCC	2	6	137700	137705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282293

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