MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_011206	GC	5	10	1159089	1159098	0 %	0 %	50 %	50 %	198283310
24503	NC_011206	CCG	2	6	1159106	1159111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283310
24504	NC_011206	CGG	2	6	1159166	1159171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283310
24505	NC_011206	GC	3	6	1159197	1159202	0 %	0 %	50 %	50 %	198283310
24506	NC_011206	TCA	2	6	1159271	1159276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283310
24507	NC_011206	GGC	2	6	1159279	1159284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283310
24508	NC_011206	GCG	2	6	1159317	1159322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283310
24509	NC_011206	GGT	2	6	1159341	1159346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283310
24510	NC_011206	CA	3	6	1159383	1159388	50 %	0 %	0 %	50 %	198283310
24511	NC_011206	CG	3	6	1159393	1159398	0 %	0 %	50 %	50 %	198283310
24512	NC_011206	TCG	2	6	1159442	1159447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283310
24513	NC_011206	AGG	2	6	1159472	1159477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283310
24514	NC_011206	ATC	2	6	1159495	1159500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283310
24515	NC_011206	GGGC	2	8	1159510	1159517	0 %	0 %	75 %	25 %	198283310
24516	NC_011206	TCA	2	6	1159527	1159532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283310
24517	NC_011206	TGG	2	6	1159541	1159546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283310
24518	NC_011206	GGC	2	6	1159569	1159574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283310
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24520	NC_011206	CCG	2	6	1159601	1159606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283310
24521	NC_011206	GATG	2	8	1159611	1159618	25 %	25 %	50 %	0 %	198283310
24522	NC_011206	CGC	2	6	1159659	1159664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283310
24523	NC_011206	AGG	2	6	1159685	1159690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283310
24524	NC_011206	CTG	2	6	1159699	1159704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283310
24525	NC_011206	GGGC	2	8	1159750	1159757	0 %	0 %	75 %	25 %	198283310
24526	NC_011206	ACT	2	6	1159782	1159787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283310
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24528	NC_011206	CGA	2	6	1159842	1159847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283310
24529	NC_011206	CGA	2	6	1159851	1159856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283310
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24534	NC_011206	TGG	2	6	1160111	1160116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283310
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24543	NC_011206	CTGG	2	8	1160596	1160603	0 %	25 %	50 %	25 %	198283311
24544	NC_011206	CGCA	2	8	1160629	1160636	25 %	0 %	25 %	50 %	198283311
24545	NC_011206	GCA	2	6	1160709	1160714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283311
24546	NC_011206	GTC	2	6	1160722	1160727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283311
24547	NC_011206	CGAA	2	8	1160732	1160739	50 %	0 %	25 %	25 %	198283311
24548	NC_011206	AGA	2	6	1160772	1160777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283311
24549	NC_011206	TGG	2	6	1160841	1160846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24550	NC_011206	TGA	2	6	1160860	1160865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283312
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24552	NC_011206	CGG	2	6	1160929	1160934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283312
24553	NC_011206	CG	3	6	1161179	1161184	0 %	0 %	50 %	50 %	198283312
24554	NC_011206	CGG	2	6	1161195	1161200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283312
24555	NC_011206	TCA	2	6	1161237	1161242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283312
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24559	NC_011206	GCA	2	6	1161337	1161342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283312
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24563	NC_011206	A	6	6	1161451	1161456	100 %	0 %	0 %	0 %	198283312
24564	NC_011206	GCGG	2	8	1161510	1161517	0 %	0 %	75 %	25 %	198283312
24565	NC_011206	TCA	2	6	1161626	1161631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283313
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24574	NC_011206	CGG	2	6	1162049	1162054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283314
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24576	NC_011206	GCA	2	6	1162169	1162174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283314
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24585	NC_011206	CTTC	2	8	1162693	1162700	0 %	50 %	0 %	50 %	198283315
24586	NC_011206	TCAG	2	8	1162710	1162717	25 %	25 %	25 %	25 %	198283315
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24598	NC_011206	ACC	2	6	1163331	1163336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283317
24599	NC_011206	TCCG	2	8	1163406	1163413	0 %	25 %	25 %	50 %	198283317
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24601	NC_011206	ATC	2	6	1163493	1163498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283317
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24603	NC_011206	ATC	2	6	1163587	1163592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283317
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24605	NC_011206	GCGCG	2	10	1163719	1163728	0 %	0 %	60 %	40 %	198283318
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24609	NC_011206	ATC	2	6	1163988	1163993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283318
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24612	NC_011206	GAG	2	6	1164119	1164124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283318
24613	NC_011206	TTG	2	6	1164195	1164200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283318
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24615	NC_011206	T	6	6	1164377	1164382	0 %	100 %	0 %	0 %	198283318
24616	NC_011206	CAC	2	6	1164416	1164421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283318
24617	NC_011206	CCTC	2	8	1164438	1164445	0 %	25 %	0 %	75 %	198283318
24618	NC_011206	CGGT	2	8	1164447	1164454	0 %	25 %	50 %	25 %	198283318
24619	NC_011206	CGT	2	6	1164500	1164505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283318
24620	NC_011206	CCT	2	6	1164529	1164534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283318
24621	NC_011206	GGA	2	6	1164571	1164576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283318
24622	NC_011206	GAT	2	6	1164671	1164676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283318
24623	NC_011206	TCG	2	6	1164696	1164701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283318
24624	NC_011206	ATG	2	6	1164714	1164719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283318
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24626	NC_011206	CGG	2	6	1164913	1164918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283319
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24665	NC_011206	CCGG	2	8	1167061	1167068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24666	NC_011206	CCG	2	6	1167093	1167098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24723	NC_011206	CAA	2	6	1169524	1169529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283322
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24727	NC_011206	AATA	2	8	1169699	1169706	75 %	25 %	0 %	0 %	198283322
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24851	NC_011206	CCA	2	6	1177030	1177035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283331
24852	NC_011206	TGA	2	6	1177069	1177074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283331
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24855	NC_011206	CAT	2	6	1177242	1177247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283332
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24877	NC_011206	CAT	2	6	1178698	1178703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283333
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24883	NC_011206	GGA	2	6	1178928	1178933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24912	NC_011206	ATC	2	6	1180638	1180643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283335
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24952	NC_011206	CAG	2	6	1182894	1182899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283337
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24954	NC_011206	CTG	2	6	1183110	1183115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283337
24955	NC_011206	TGA	2	6	1183129	1183134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283337
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24959	NC_011206	GGGTT	2	10	1183402	1183411	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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24967	NC_011206	GAT	2	6	1184065	1184070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283338
24968	NC_011206	CCG	2	6	1184114	1184119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283338
24969	NC_011206	AGGC	2	8	1184198	1184205	25 %	0 %	50 %	25 %	198283338
24970	NC_011206	GGC	3	9	1184203	1184211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283338
24971	NC_011206	CGT	2	6	1184213	1184218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283338
24972	NC_011206	CCA	2	6	1184244	1184249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283338
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24975	NC_011206	CCG	2	6	1184303	1184308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283338
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24995	NC_011206	CGG	2	6	1185431	1185436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283339
24996	NC_011206	GCA	2	6	1185437	1185442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283339
24997	NC_011206	GC	3	6	1185548	1185553	0 %	0 %	50 %	50 %	198283339
24998	NC_011206	GA	3	6	1185829	1185834	50 %	0 %	50 %	0 %	198283339
24999	NC_011206	GAC	2	6	1185846	1185851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283339
25000	NC_011206	GGC	2	6	1185911	1185916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283339

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