MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23004	NC_011206	GGC	2	6	1084861	1084866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283237
23005	NC_011206	CTG	2	6	1084871	1084876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283237
23006	NC_011206	TCG	2	6	1084908	1084913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283237
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23008	NC_011206	GCT	2	6	1084957	1084962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283237
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23012	NC_011206	GCGA	2	8	1085009	1085016	25 %	0 %	50 %	25 %	198283237
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23117	NC_011206	TCG	2	6	1089357	1089362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283240
23118	NC_011206	GCT	2	6	1089440	1089445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283240
23119	NC_011206	GCTTT	2	10	1089723	1089732	0 %	60 %	20 %	20 %	198283241
23120	NC_011206	TGC	2	6	1089748	1089753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283241
23121	NC_011206	TGC	2	6	1089775	1089780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283241
23122	NC_011206	TCG	2	6	1089781	1089786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283241
23123	NC_011206	TGC	2	6	1089787	1089792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283241
23124	NC_011206	GGT	2	6	1089800	1089805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283241
23125	NC_011206	TGT	2	6	1089856	1089861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283241
23126	NC_011206	CGG	2	6	1089872	1089877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283241
23127	NC_011206	TGC	2	6	1089907	1089912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283241
23128	NC_011206	GC	3	6	1089923	1089928	0 %	0 %	50 %	50 %	198283241
23129	NC_011206	GCG	2	6	1089973	1089978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283241
23130	NC_011206	CG	3	6	1089987	1089992	0 %	0 %	50 %	50 %	198283241
23131	NC_011206	CGC	2	6	1090010	1090015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283241
23132	NC_011206	CTG	2	6	1090081	1090086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283241
23133	NC_011206	GCTG	2	8	1090092	1090099	0 %	25 %	50 %	25 %	198283241
23134	NC_011206	CCG	2	6	1090107	1090112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283242
23135	NC_011206	ACGGC	2	10	1090115	1090124	20 %	0 %	40 %	40 %	198283242
23136	NC_011206	GGT	2	6	1090131	1090136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283242
23137	NC_011206	TTC	2	6	1090162	1090167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283242
23138	NC_011206	GCA	2	6	1090170	1090175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283242
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23140	NC_011206	GGC	2	6	1090291	1090296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283242
23141	NC_011206	GC	3	6	1090295	1090300	0 %	0 %	50 %	50 %	198283242
23142	NC_011206	TCG	2	6	1090307	1090312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283242
23143	NC_011206	CGC	2	6	1090327	1090332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283242
23144	NC_011206	GTCC	2	8	1090375	1090382	0 %	25 %	25 %	50 %	198283242
23145	NC_011206	TGGT	2	8	1090395	1090402	0 %	50 %	50 %	0 %	198283242
23146	NC_011206	GC	3	6	1090447	1090452	0 %	0 %	50 %	50 %	198283242
23147	NC_011206	CAA	2	6	1090470	1090475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283242
23148	NC_011206	GCC	2	6	1090478	1090483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283242
23149	NC_011206	CACC	2	8	1090485	1090492	25 %	0 %	0 %	75 %	198283242
23150	NC_011206	CAG	2	6	1090501	1090506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283242
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23153	NC_011206	GC	4	8	1090793	1090800	0 %	0 %	50 %	50 %	198283242
23154	NC_011206	TGC	2	6	1090854	1090859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283242
23155	NC_011206	CGT	2	6	1090939	1090944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283242
23156	NC_011206	CGCC	3	12	1090983	1090994	0 %	0 %	25 %	75 %	198283242
23157	NC_011206	CCA	2	6	1091022	1091027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283242
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23161	NC_011206	GCA	2	6	1091223	1091228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283242
23162	NC_011206	C	6	6	1091343	1091348	0 %	0 %	0 %	100 %	198283242
23163	NC_011206	GAT	2	6	1091386	1091391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283242
23164	NC_011206	CTGC	2	8	1091400	1091407	0 %	25 %	25 %	50 %	198283242
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23167	NC_011206	ATC	2	6	1091521	1091526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283242
23168	NC_011206	CGCC	2	8	1091527	1091534	0 %	0 %	25 %	75 %	198283242
23169	NC_011206	CGG	2	6	1091592	1091597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283242
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23171	NC_011206	AAG	2	6	1091730	1091735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23172	NC_011206	GCA	2	6	1091770	1091775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283243
23173	NC_011206	CGG	2	6	1091776	1091781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283243
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23177	NC_011206	GTATC	2	10	1092014	1092023	20 %	40 %	20 %	20 %	198283243
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23179	NC_011206	TTA	2	6	1092153	1092158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198283243
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23188	NC_011206	AAG	2	6	1092640	1092645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283244
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23195	NC_011206	GGT	3	9	1092899	1092907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283244
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23197	NC_011206	GTCTG	2	10	1092955	1092964	0 %	40 %	40 %	20 %	198283244
23198	NC_011206	TGC	2	6	1093102	1093107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23199	NC_011206	GAT	2	6	1093117	1093122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23200	NC_011206	AGC	2	6	1093141	1093146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23201	NC_011206	TG	3	6	1093179	1093184	0 %	50 %	50 %	0 %	198283245
23202	NC_011206	TGG	2	6	1093288	1093293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283245
23203	NC_011206	AGT	2	6	1093337	1093342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283245
23204	NC_011206	ACG	2	6	1093353	1093358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283245
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23214	NC_011206	GAA	2	6	1093667	1093672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283245
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23216	NC_011206	GAT	2	6	1093806	1093811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283245
23217	NC_011206	CGTT	2	8	1093822	1093829	0 %	50 %	25 %	25 %	198283245
23218	NC_011206	GGTCA	2	10	1093887	1093896	20 %	20 %	40 %	20 %	198283245
23219	NC_011206	TGGC	2	8	1094018	1094025	0 %	25 %	50 %	25 %	198283245
23220	NC_011206	GGTG	2	8	1094087	1094094	0 %	25 %	75 %	0 %	198283245
23221	NC_011206	CCG	2	6	1094205	1094210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283245
23222	NC_011206	TGG	2	6	1094212	1094217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283245
23223	NC_011206	CCG	2	6	1094227	1094232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283245
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23225	NC_011206	CCG	2	6	1094332	1094337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283245
23226	NC_011206	CGG	2	6	1094342	1094347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283245
23227	NC_011206	CGG	2	6	1094467	1094472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283245
23228	NC_011206	GTGAT	2	10	1094494	1094503	20 %	40 %	40 %	0 %	198283245
23229	NC_011206	CAG	3	9	1094517	1094525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283245
23230	NC_011206	GCC	2	6	1094535	1094540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283245
23231	NC_011206	TGG	2	6	1094554	1094559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283245
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23350	NC_011206	GAG	2	6	1100318	1100323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283251
23351	NC_011206	GC	3	6	1100380	1100385	0 %	0 %	50 %	50 %	198283252
23352	NC_011206	GGC	2	6	1100412	1100417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283252
23353	NC_011206	TCG	2	6	1100420	1100425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283252
23354	NC_011206	CTG	2	6	1100595	1100600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283252
23355	NC_011206	ACC	2	6	1100629	1100634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283252
23356	NC_011206	CGACCC	2	12	1100727	1100738	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	198283252
23357	NC_011206	GGC	2	6	1100751	1100756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283252
23358	NC_011206	GAA	2	6	1100833	1100838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283252
23359	NC_011206	GCA	2	6	1100857	1100862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283252
23360	NC_011206	GCCAT	2	10	1100969	1100978	20 %	20 %	20 %	40 %	198283252
23361	NC_011206	CGG	2	6	1101011	1101016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283252
23362	NC_011206	GAT	2	6	1101053	1101058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283252
23363	NC_011206	CTG	2	6	1101141	1101146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283253
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23365	NC_011206	AGG	2	6	1101223	1101228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283253
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23367	NC_011206	CGGG	2	8	1101301	1101308	0 %	0 %	75 %	25 %	198283253
23368	NC_011206	CG	3	6	1101333	1101338	0 %	0 %	50 %	50 %	198283253
23369	NC_011206	GTG	2	6	1101420	1101425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283253
23370	NC_011206	GGA	2	6	1101435	1101440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283253
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23372	NC_011206	CGG	2	6	1101626	1101631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23373	NC_011206	GCGCTT	2	12	1101632	1101643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23374	NC_011206	CGC	2	6	1101703	1101708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23375	NC_011206	TGC	2	6	1101848	1101853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23376	NC_011206	GCG	2	6	1101870	1101875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23377	NC_011206	GAAG	2	8	1101914	1101921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23378	NC_011206	GCG	2	6	1101924	1101929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23379	NC_011206	CCGGA	2	10	1101948	1101957	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23380	NC_011206	CAG	2	6	1101989	1101994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23382	NC_011206	CGG	2	6	1102096	1102101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23383	NC_011206	TCC	2	6	1102112	1102117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23384	NC_011206	TGG	2	6	1102146	1102151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23385	NC_011206	GGC	2	6	1102192	1102197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283254
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23388	NC_011206	GGT	2	6	1102327	1102332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283254
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23413	NC_011206	GGCT	2	8	1103872	1103879	0 %	25 %	50 %	25 %	198283255
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23418	NC_011206	ATC	2	6	1104096	1104101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23419	NC_011206	CCA	2	6	1104154	1104159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23420	NC_011206	TGA	2	6	1104169	1104174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23421	NC_011206	GCGGA	2	10	1104192	1104201	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23422	NC_011206	GCG	2	6	1104224	1104229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23423	NC_011206	AT	3	6	1104267	1104272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23424	NC_011206	GTG	2	6	1104417	1104422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23425	NC_011206	GGC	2	6	1104538	1104543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23428	NC_011206	GGA	2	6	1104603	1104608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23431	NC_011206	CGG	2	6	1104772	1104777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23432	NC_011206	CGTG	2	8	1104779	1104786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23433	NC_011206	TCG	2	6	1104869	1104874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283256
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23450	NC_011206	GCT	2	6	1105506	1105511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283256
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23452	NC_011206	GAA	2	6	1105525	1105530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283256
23453	NC_011206	CCAT	2	8	1105556	1105563	25 %	25 %	0 %	50 %	198283256
23454	NC_011206	CGG	2	6	1105646	1105651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283256
23455	NC_011206	GCA	2	6	1105690	1105695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283256
23456	NC_011206	TCG	2	6	1105700	1105705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283256
23457	NC_011206	CGT	2	6	1105725	1105730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283256
23458	NC_011206	GAC	2	6	1105783	1105788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283257
23459	NC_011206	CT	3	6	1105906	1105911	0 %	50 %	0 %	50 %	198283257
23460	NC_011206	CTG	2	6	1105916	1105921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283257
23461	NC_011206	TACCT	2	10	1106022	1106031	20 %	40 %	0 %	40 %	198283257
23462	NC_011206	GCG	2	6	1106134	1106139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283257
23463	NC_011206	G	6	6	1106139	1106144	0 %	0 %	100 %	0 %	198283257
23464	NC_011206	TGT	2	6	1106145	1106150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283257
23465	NC_011206	GAT	2	6	1106204	1106209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283257
23466	NC_011206	CTT	2	6	1106221	1106226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283257
23467	NC_011206	AAC	2	6	1106472	1106477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283257
23468	NC_011206	TGC	2	6	1106490	1106495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283257
23469	NC_011206	GC	3	6	1106592	1106597	0 %	0 %	50 %	50 %	198283258
23470	NC_011206	GAT	2	6	1106607	1106612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283258
23471	NC_011206	CG	3	6	1106618	1106623	0 %	0 %	50 %	50 %	198283258
23472	NC_011206	GCT	2	6	1106663	1106668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283258
23473	NC_011206	TGG	2	6	1106680	1106685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283258
23474	NC_011206	ACC	2	6	1106703	1106708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283258
23475	NC_011206	GCT	2	6	1106762	1106767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283258
23476	NC_011206	CGG	3	9	1106782	1106790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283258
23477	NC_011206	GAG	2	6	1106817	1106822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283258
23478	NC_011206	GGATCG	2	12	1106888	1106899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198283258
23479	NC_011206	TGG	2	6	1106911	1106916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283258
23480	NC_011206	CGCC	2	8	1106974	1106981	0 %	0 %	25 %	75 %	198283258
23481	NC_011206	GGC	2	6	1107005	1107010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283258
23482	NC_011206	GCA	2	6	1107011	1107016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283258
23483	NC_011206	ATCGG	2	10	1107096	1107105	20 %	20 %	40 %	20 %	198283258
23484	NC_011206	CTG	2	6	1107114	1107119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283258
23485	NC_011206	TTC	2	6	1107139	1107144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283258
23486	NC_011206	GGA	2	6	1107158	1107163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283258
23487	NC_011206	AGC	2	6	1107184	1107189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283258
23488	NC_011206	TCCTGT	2	12	1107201	1107212	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	198283258
23489	NC_011206	AAGCGG	2	12	1107253	1107264	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	198283258
23490	NC_011206	CGGATA	2	12	1107334	1107345	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	198283258
23491	NC_011206	CTG	2	6	1107351	1107356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283258
23492	NC_011206	GA	3	6	1107436	1107441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23493	NC_011206	TGCA	2	8	1107530	1107537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23494	NC_011206	GCT	2	6	1107604	1107609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23495	NC_011206	GC	3	6	1107660	1107665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23496	NC_011206	GC	3	6	1107712	1107717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23497	NC_011206	GTC	2	6	1107740	1107745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23498	NC_011206	CTGT	2	8	1107749	1107756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23499	NC_011206	GCGGT	2	10	1107763	1107772	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23500	NC_011206	GGT	2	6	1107806	1107811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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