MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_011206	CGG	2	6	992606	992611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283151
21003	NC_011206	TCG	2	6	992655	992660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283151
21004	NC_011206	TTC	2	6	992667	992672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283151
21005	NC_011206	CCA	2	6	992683	992688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283151
21006	NC_011206	ATC	2	6	992748	992753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283151
21007	NC_011206	GATC	2	8	992780	992787	25 %	25 %	25 %	25 %	198283151
21008	NC_011206	GCG	3	9	992919	992927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283151
21009	NC_011206	GC	4	8	993014	993021	0 %	0 %	50 %	50 %	198283151
21010	NC_011206	AGA	2	6	993035	993040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283151
21011	NC_011206	GCT	2	6	993074	993079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283151
21012	NC_011206	GGC	2	6	993081	993086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283151
21013	NC_011206	ATC	2	6	993106	993111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283151
21014	NC_011206	TGG	2	6	993142	993147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283151
21015	NC_011206	GCA	2	6	993218	993223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283151
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21017	NC_011206	TCA	2	6	993270	993275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283152
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21019	NC_011206	GTC	2	6	993315	993320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283152
21020	NC_011206	CTG	2	6	993347	993352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283152
21021	NC_011206	GCG	2	6	993357	993362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283152
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21023	NC_011206	CG	3	6	993371	993376	0 %	0 %	50 %	50 %	198283152
21024	NC_011206	CTGGCG	2	12	993377	993388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	198283152
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21040	NC_011206	CT	3	6	994437	994442	0 %	50 %	0 %	50 %	198283153
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21120	NC_011206	TACC	2	8	998226	998233	25 %	25 %	0 %	50 %	198283157
21121	NC_011206	TGC	2	6	998249	998254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283157
21122	NC_011206	TG	3	6	998279	998284	0 %	50 %	50 %	0 %	198283157
21123	NC_011206	TGG	2	6	998291	998296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283157
21124	NC_011206	TGA	2	6	998307	998312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283157
21125	NC_011206	GCG	3	9	998316	998324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283157
21126	NC_011206	GCCA	2	8	998343	998350	25 %	0 %	25 %	50 %	198283157
21127	NC_011206	TGC	2	6	998435	998440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283157
21128	NC_011206	TGG	2	6	998477	998482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283157
21129	NC_011206	ACG	2	6	998494	998499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283157
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21132	NC_011206	GGC	2	6	998559	998564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283157
21133	NC_011206	GCC	2	6	998659	998664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283157
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21135	NC_011206	GCGG	2	8	998734	998741	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21136	NC_011206	AAG	2	6	998783	998788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283158
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21152	NC_011206	GTG	2	6	999980	999985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283158
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21155	NC_011206	ACAG	2	8	1000108	1000115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21156	NC_011206	CCG	2	6	1000158	1000163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283159
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21169	NC_011206	GTTC	2	8	1000833	1000840	0 %	50 %	25 %	25 %	198283160
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21192	NC_011206	CGA	2	6	1002095	1002100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21238	NC_011206	GCG	2	6	1004299	1004304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283161
21239	NC_011206	TTGC	2	8	1004337	1004344	0 %	50 %	25 %	25 %	198283161
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21252	NC_011206	GAAA	2	8	1004820	1004827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21262	NC_011206	T	7	7	1005308	1005314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21354	NC_011206	TTC	2	6	1010165	1010170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283169
21355	NC_011206	GTC	2	6	1010179	1010184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283169
21356	NC_011206	T	7	7	1010187	1010193	0 %	100 %	0 %	0 %	198283169
21357	NC_011206	GGC	2	6	1010194	1010199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283169
21358	NC_011206	TGGCC	2	10	1010254	1010263	0 %	20 %	40 %	40 %	198283169
21359	NC_011206	CTG	2	6	1010291	1010296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283169
21360	NC_011206	TCT	2	6	1010338	1010343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283169
21361	NC_011206	TGGCGG	2	12	1010458	1010469	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	198283169
21362	NC_011206	TGG	2	6	1010541	1010546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283169
21363	NC_011206	GGAT	2	8	1010712	1010719	25 %	25 %	50 %	0 %	198283169
21364	NC_011206	CTG	2	6	1010735	1010740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283169
21365	NC_011206	ACC	2	6	1010741	1010746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283169
21366	NC_011206	CCG	2	6	1010805	1010810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283169
21367	NC_011206	CTT	2	6	1010819	1010824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283169
21368	NC_011206	CGC	2	6	1010827	1010832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283169
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21372	NC_011206	T	7	7	1010902	1010908	0 %	100 %	0 %	0 %	198283169
21373	NC_011206	ATC	2	6	1010936	1010941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283169
21374	NC_011206	T	7	7	1010944	1010950	0 %	100 %	0 %	0 %	198283169
21375	NC_011206	ATTT	2	8	1010990	1010997	25 %	75 %	0 %	0 %	198283169
21376	NC_011206	TCA	2	6	1011144	1011149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283169
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21381	NC_011206	GTTCC	2	10	1011325	1011334	0 %	40 %	20 %	40 %	198283169
21382	NC_011206	GGC	2	6	1011338	1011343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283169
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21468	NC_011206	CAT	2	6	1014901	1014906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283172
21469	NC_011206	GCA	2	6	1015078	1015083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283172
21470	NC_011206	TGC	2	6	1015149	1015154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283172
21471	NC_011206	ATGGC	2	10	1015173	1015182	20 %	20 %	40 %	20 %	198283172
21472	NC_011206	CTG	2	6	1015214	1015219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283172
21473	NC_011206	TGC	2	6	1015300	1015305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283172
21474	NC_011206	TGA	2	6	1015366	1015371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283172
21475	NC_011206	GA	4	8	1015409	1015416	50 %	0 %	50 %	0 %	198283172
21476	NC_011206	GGGCT	2	10	1015449	1015458	0 %	20 %	60 %	20 %	198283172
21477	NC_011206	GGT	2	6	1015532	1015537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283172
21478	NC_011206	ATC	2	6	1015563	1015568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283172
21479	NC_011206	T	6	6	1015606	1015611	0 %	100 %	0 %	0 %	198283172
21480	NC_011206	CTT	2	6	1015615	1015620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283172
21481	NC_011206	TGC	2	6	1015633	1015638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283172
21482	NC_011206	G	6	6	1015642	1015647	0 %	0 %	100 %	0 %	198283172
21483	NC_011206	TGC	2	6	1015654	1015659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283172
21484	NC_011206	GTGC	2	8	1015773	1015780	0 %	25 %	50 %	25 %	198283173
21485	NC_011206	CG	3	6	1015871	1015876	0 %	0 %	50 %	50 %	198283173
21486	NC_011206	CGC	3	9	1015879	1015887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283173
21487	NC_011206	ACC	2	6	1015890	1015895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283173
21488	NC_011206	GCT	2	6	1015928	1015933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283173
21489	NC_011206	TCC	2	6	1015965	1015970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283173
21490	NC_011206	CGGC	2	8	1016006	1016013	0 %	0 %	50 %	50 %	198283173
21491	NC_011206	TGC	2	6	1016142	1016147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283173
21492	NC_011206	TGA	2	6	1016296	1016301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283173
21493	NC_011206	CGC	2	6	1016305	1016310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283173
21494	NC_011206	GGC	2	6	1016373	1016378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283173
21495	NC_011206	CGG	4	12	1016408	1016419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283174
21496	NC_011206	AAG	2	6	1016439	1016444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283174
21497	NC_011206	CGG	2	6	1016510	1016515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283174
21498	NC_011206	TCC	2	6	1016545	1016550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283174
21499	NC_011206	CGCC	2	8	1016567	1016574	0 %	0 %	25 %	75 %	198283174
21500	NC_011206	AGG	2	6	1016626	1016631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283174

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