MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17123	NC_011206	CGC	3	9	808164	808172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282984
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17227	NC_011206	ATT	2	6	813208	813213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17228	NC_011206	ACATT	2	10	813257	813266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17229	NC_011206	CCGG	2	8	813357	813364	0 %	0 %	50 %	50 %	198282991
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17362	NC_011206	GCC	2	6	819863	819868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282998
17363	NC_011206	GGC	2	6	819876	819881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282998
17364	NC_011206	GTGA	2	8	819892	819899	25 %	25 %	50 %	0 %	198282998
17365	NC_011206	GCC	2	6	820033	820038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282998
17366	NC_011206	G	6	6	820092	820097	0 %	0 %	100 %	0 %	198282998
17367	NC_011206	TGG	2	6	820118	820123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282998
17368	NC_011206	ACC	2	6	820124	820129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282998
17369	NC_011206	TGG	3	9	820133	820141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282998
17370	NC_011206	GCGG	2	8	820242	820249	0 %	0 %	75 %	25 %	198282998
17371	NC_011206	GGC	2	6	820330	820335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282999
17372	NC_011206	TGC	2	6	820428	820433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282999
17373	NC_011206	TGC	2	6	820479	820484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282999
17374	NC_011206	GAT	2	6	820499	820504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282999
17375	NC_011206	CAC	2	6	820540	820545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282999
17376	NC_011206	CTG	2	6	820586	820591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282999
17377	NC_011206	AGGCCA	2	12	820593	820604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282999
17378	NC_011206	CGC	2	6	820632	820637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282999
17379	NC_011206	GTG	2	6	820679	820684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282999
17380	NC_011206	CGC	2	6	820738	820743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282999
17381	NC_011206	ATCAC	2	10	820782	820791	40 %	20 %	0 %	40 %	198282999
17382	NC_011206	CCA	2	6	820800	820805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282999
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17385	NC_011206	TGC	2	6	820974	820979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282999
17386	NC_011206	AAC	2	6	820983	820988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282999
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17388	NC_011206	CG	3	6	821023	821028	0 %	0 %	50 %	50 %	198282999
17389	NC_011206	GGCTC	2	10	821112	821121	0 %	20 %	40 %	40 %	198282999
17390	NC_011206	GCC	2	6	821159	821164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282999
17391	NC_011206	TTC	2	6	821323	821328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282999
17392	NC_011206	GCC	2	6	821342	821347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282999
17393	NC_011206	AGG	2	6	821394	821399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282999
17394	NC_011206	CG	3	6	821426	821431	0 %	0 %	50 %	50 %	198283000
17395	NC_011206	GTG	2	6	821474	821479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283000
17396	NC_011206	GATT	2	8	821507	821514	25 %	50 %	25 %	0 %	198283000
17397	NC_011206	GCCC	2	8	821517	821524	0 %	0 %	25 %	75 %	198283000
17398	NC_011206	CGC	2	6	821543	821548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283000
17399	NC_011206	GGA	2	6	821550	821555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198283000
17400	NC_011206	CAC	2	6	821610	821615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283000
17401	NC_011206	CGT	2	6	821625	821630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283000
17402	NC_011206	GCG	2	6	821651	821656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283000
17403	NC_011206	GCG	2	6	821705	821710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283000
17404	NC_011206	GAT	2	6	821778	821783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283000
17405	NC_011206	GCA	2	6	821786	821791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283000
17406	NC_011206	GCGG	2	8	821796	821803	0 %	0 %	75 %	25 %	198283000
17407	NC_011206	GGC	2	6	821808	821813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283000
17408	NC_011206	GTG	2	6	821845	821850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283000
17409	NC_011206	TCA	2	6	821876	821881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283000
17410	NC_011206	CCG	2	6	821885	821890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283000
17411	NC_011206	ATC	2	6	821899	821904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283000
17412	NC_011206	CTG	2	6	821953	821958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283000
17413	NC_011206	GCC	2	6	821986	821991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283000
17414	NC_011206	GC	3	6	822001	822006	0 %	0 %	50 %	50 %	198283000
17415	NC_011206	CGC	2	6	822066	822071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283000
17416	NC_011206	CTG	2	6	822073	822078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283000
17417	NC_011206	GCG	3	9	822079	822087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283000
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17420	NC_011206	GGT	2	6	822279	822284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283000
17421	NC_011206	GCGCT	2	10	822316	822325	0 %	20 %	40 %	40 %	198283000
17422	NC_011206	GAT	2	6	822351	822356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283000
17423	NC_011206	AGC	2	6	822397	822402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283000
17424	NC_011206	CGG	2	6	822408	822413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283000
17425	NC_011206	TCG	2	6	822422	822427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283000
17426	NC_011206	TGG	2	6	822434	822439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283000
17427	NC_011206	GGT	2	6	822544	822549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283001
17428	NC_011206	GTT	2	6	822571	822576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283001
17429	NC_011206	GGT	2	6	822583	822588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283001
17430	NC_011206	CGC	2	6	822633	822638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283001
17431	NC_011206	GTG	2	6	822741	822746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283001
17432	NC_011206	TG	3	6	822761	822766	0 %	50 %	50 %	0 %	198283001
17433	NC_011206	ATC	2	6	822897	822902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283002
17434	NC_011206	TGC	2	6	822963	822968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283002
17435	NC_011206	CGG	2	6	822984	822989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283002
17436	NC_011206	CGG	2	6	823025	823030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283002
17437	NC_011206	GGCT	2	8	823105	823112	0 %	25 %	50 %	25 %	198283002
17438	NC_011206	GAC	2	6	823167	823172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283002
17439	NC_011206	CTG	2	6	823174	823179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283002
17440	NC_011206	A	6	6	823181	823186	100 %	0 %	0 %	0 %	198283002
17441	NC_011206	GGCG	2	8	823200	823207	0 %	0 %	75 %	25 %	198283002
17442	NC_011206	ACC	2	6	823243	823248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283002
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17444	NC_011206	TGG	2	6	823331	823336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283002
17445	NC_011206	GCC	2	6	823363	823368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283002
17446	NC_011206	CGT	2	6	823374	823379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283002
17447	NC_011206	GGT	2	6	823443	823448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283002
17448	NC_011206	CCTGAT	2	12	823515	823526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	198283002
17449	NC_011206	CAA	2	6	823527	823532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198283002
17450	NC_011206	GATC	2	8	823533	823540	25 %	25 %	25 %	25 %	198283002
17451	NC_011206	TGC	2	6	823541	823546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283002
17452	NC_011206	CAT	2	6	823600	823605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283002
17453	NC_011206	CCG	2	6	823625	823630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283002
17454	NC_011206	GC	4	8	823668	823675	0 %	0 %	50 %	50 %	198283002
17455	NC_011206	AGG	2	6	823740	823745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17456	NC_011206	GGC	3	9	823846	823854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283003
17457	NC_011206	GCA	2	6	823874	823879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283003
17458	NC_011206	CCT	2	6	823980	823985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198283003
17459	NC_011206	CGG	2	6	823997	824002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283003
17460	NC_011206	CCG	2	6	824069	824074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283003
17461	NC_011206	CGG	2	6	824085	824090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283003
17462	NC_011206	GTG	2	6	824147	824152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283003
17463	NC_011206	CGG	2	6	824175	824180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283003
17464	NC_011206	TTG	2	6	824186	824191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198283003
17465	NC_011206	GC	3	6	824198	824203	0 %	0 %	50 %	50 %	198283003
17466	NC_011206	GCC	2	6	824290	824295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283003
17467	NC_011206	GGGC	2	8	824304	824311	0 %	0 %	75 %	25 %	198283003
17468	NC_011206	TGG	3	9	824358	824366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283003
17469	NC_011206	CCA	2	6	824370	824375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283003
17470	NC_011206	GAA	2	6	824411	824416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198283003
17471	NC_011206	CG	3	6	824427	824432	0 %	0 %	50 %	50 %	198283003
17472	NC_011206	ATC	2	6	824453	824458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283003
17473	NC_011206	CGT	2	6	824470	824475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283003
17474	NC_011206	CTA	2	6	824479	824484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283003
17475	NC_011206	CTG	2	6	824486	824491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283003
17476	NC_011206	GCG	2	6	824564	824569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283003
17477	NC_011206	CCG	2	6	824622	824627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283003
17478	NC_011206	CAC	2	6	824641	824646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198283003
17479	NC_011206	CGTAC	2	10	824728	824737	20 %	20 %	20 %	40 %	198283003
17480	NC_011206	CTG	2	6	824759	824764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283003
17481	NC_011206	TTC	2	6	824792	824797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283003
17482	NC_011206	GCG	2	6	824834	824839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198283003
17483	NC_011206	TTCT	2	8	824843	824850	0 %	75 %	0 %	25 %	198283003
17484	NC_011206	ATG	2	6	824882	824887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198283003
17485	NC_011206	T	6	6	824890	824895	0 %	100 %	0 %	0 %	198283003
17486	NC_011206	CAT	3	9	824936	824944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283003
17487	NC_011206	ATC	2	6	824975	824980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283003
17488	NC_011206	CCG	2	6	824988	824993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198283003
17489	NC_011206	TTC	2	6	825005	825010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283003
17490	NC_011206	AT	3	6	825025	825030	50 %	50 %	0 %	0 %	198283003
17491	NC_011206	CGGC	2	8	825033	825040	0 %	0 %	50 %	50 %	198283003
17492	NC_011206	GCA	2	6	825228	825233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198283004
17493	NC_011206	GTG	2	6	825243	825248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198283004
17494	NC_011206	TCG	2	6	825265	825270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283004
17495	NC_011206	CTGCAG	2	12	825285	825296	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198283004
17496	NC_011206	TTC	2	6	825316	825321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198283004
17497	NC_011206	GGGGA	2	10	825339	825348	20 %	0 %	80 %	0 %	198283004
17498	NC_011206	CTA	2	6	825458	825463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198283004
17499	NC_011206	TGC	2	6	825475	825480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283004
17500	NC_011206	TCTGGC	2	12	825590	825601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198283004

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