MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011206	AGG	2	6	658661	658666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282840
14002	NC_011206	TGGCCT	2	12	658709	658720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282840
14003	NC_011206	GTG	2	6	658740	658745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282840
14004	NC_011206	CCT	2	6	658790	658795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282840
14005	NC_011206	GGC	2	6	658821	658826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282840
14006	NC_011206	AGA	2	6	658883	658888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282840
14007	NC_011206	GAT	2	6	658916	658921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282840
14008	NC_011206	TGG	2	6	658940	658945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282840
14009	NC_011206	CGT	2	6	658946	658951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282840
14010	NC_011206	GCG	2	6	659257	659262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14011	NC_011206	GAC	2	6	659301	659306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14012	NC_011206	TC	3	6	659342	659347	0 %	50 %	0 %	50 %	198282841
14013	NC_011206	GCT	2	6	659459	659464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14014	NC_011206	TAGCA	2	10	659478	659487	40 %	20 %	20 %	20 %	198282841
14015	NC_011206	GCC	2	6	659517	659522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282841
14016	NC_011206	TGC	2	6	659588	659593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14017	NC_011206	TCT	2	6	659599	659604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282841
14018	NC_011206	GGCC	2	8	659626	659633	0 %	0 %	50 %	50 %	198282841
14019	NC_011206	GCG	2	6	659653	659658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14020	NC_011206	GGCGCA	2	12	659798	659809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	198282841
14021	NC_011206	GGCG	2	8	659876	659883	0 %	0 %	75 %	25 %	198282841
14022	NC_011206	G	6	6	659933	659938	0 %	0 %	100 %	0 %	198282841
14023	NC_011206	GCCCA	2	10	660082	660091	20 %	0 %	20 %	60 %	198282841
14024	NC_011206	AGA	2	6	660167	660172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282841
14025	NC_011206	CGG	2	6	660173	660178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14026	NC_011206	GCG	2	6	660207	660212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14027	NC_011206	CGT	2	6	660311	660316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14028	NC_011206	CAG	2	6	660318	660323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14029	NC_011206	GCCA	2	8	660349	660356	25 %	0 %	25 %	50 %	198282841
14030	NC_011206	AGC	2	6	660409	660414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14031	NC_011206	TG	3	6	660490	660495	0 %	50 %	50 %	0 %	198282841
14032	NC_011206	GA	3	6	660553	660558	50 %	0 %	50 %	0 %	198282841
14033	NC_011206	GGC	2	6	660618	660623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14034	NC_011206	CTG	2	6	660876	660881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14035	NC_011206	ATC	2	6	660882	660887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282841
14036	NC_011206	GCAG	2	8	660896	660903	25 %	0 %	50 %	25 %	198282841
14037	NC_011206	TGC	2	6	661010	661015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14038	NC_011206	GCAGG	2	10	661016	661025	20 %	0 %	60 %	20 %	198282841
14039	NC_011206	GGC	2	6	661028	661033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14040	NC_011206	GAT	2	6	661041	661046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282841
14041	NC_011206	GCC	2	6	661083	661088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282841
14042	NC_011206	T	6	6	661095	661100	0 %	100 %	0 %	0 %	198282841
14043	NC_011206	GCG	2	6	661185	661190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14044	NC_011206	GAG	2	6	661215	661220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282841
14045	NC_011206	GC	3	6	661254	661259	0 %	0 %	50 %	50 %	198282841
14046	NC_011206	GCC	2	6	661318	661323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282841
14047	NC_011206	GGCGCA	2	12	661358	661369	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	198282841
14048	NC_011206	CAGC	2	8	661422	661429	25 %	0 %	25 %	50 %	198282841
14049	NC_011206	TGT	2	6	661454	661459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282841
14050	NC_011206	GTCT	2	8	661476	661483	0 %	50 %	25 %	25 %	198282841
14051	NC_011206	CGCC	2	8	661540	661547	0 %	0 %	25 %	75 %	198282841
14052	NC_011206	TTG	2	6	661594	661599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282841
14053	NC_011206	TGC	2	6	661651	661656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14054	NC_011206	GC	3	6	661673	661678	0 %	0 %	50 %	50 %	198282841
14055	NC_011206	GGC	2	6	661683	661688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14056	NC_011206	GAT	2	6	661731	661736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282841
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14058	NC_011206	GC	3	6	661746	661751	0 %	0 %	50 %	50 %	198282841
14059	NC_011206	CGC	2	6	661828	661833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282841
14060	NC_011206	AAG	2	6	661922	661927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282841
14061	NC_011206	TTC	2	6	661953	661958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282841
14062	NC_011206	GCA	2	6	661981	661986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282841
14063	NC_011206	GCG	2	6	661993	661998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282841
14064	NC_011206	CTCC	2	8	662076	662083	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14065	NC_011206	TC	3	6	662091	662096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_011206	GCG	2	6	662152	662157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_011206	CAG	2	6	662213	662218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_011206	GTT	2	6	662256	662261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_011206	GAT	2	6	662288	662293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_011206	CCG	2	6	662350	662355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282842
14071	NC_011206	CGG	2	6	662359	662364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282842
14072	NC_011206	GCT	2	6	662368	662373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282842
14073	NC_011206	CGT	2	6	662377	662382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282842
14074	NC_011206	TGG	2	6	662424	662429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282842
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14077	NC_011206	G	6	6	662634	662639	0 %	0 %	100 %	0 %	198282842
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14079	NC_011206	TGGC	2	8	662701	662708	0 %	25 %	50 %	25 %	198282842
14080	NC_011206	GAA	2	6	662739	662744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282842
14081	NC_011206	TGC	2	6	662745	662750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282842
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14086	NC_011206	ACG	2	6	663120	663125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282842
14087	NC_011206	TGGAA	2	10	663173	663182	40 %	20 %	40 %	0 %	198282842
14088	NC_011206	TCC	2	6	663188	663193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282842
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14090	NC_011206	GCT	2	6	663298	663303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282842
14091	NC_011206	CGC	2	6	663307	663312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282842
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14099	NC_011206	TC	3	6	664027	664032	0 %	50 %	0 %	50 %	198282842
14100	NC_011206	GCC	2	6	664041	664046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282842
14101	NC_011206	TGC	2	6	664164	664169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282842
14102	NC_011206	T	6	6	664171	664176	0 %	100 %	0 %	0 %	198282842
14103	NC_011206	GGGGCA	2	12	664234	664245	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	198282842
14104	NC_011206	GGTCG	2	10	664298	664307	0 %	20 %	60 %	20 %	198282842
14105	NC_011206	CCGCG	2	10	664464	664473	0 %	0 %	40 %	60 %	198282842
14106	NC_011206	GGC	2	6	664504	664509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282842
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14110	NC_011206	CCTGG	2	10	664756	664765	0 %	20 %	40 %	40 %	198282842
14111	NC_011206	GGCA	2	8	664791	664798	25 %	0 %	50 %	25 %	198282842
14112	NC_011206	TGGG	2	8	664812	664819	0 %	25 %	75 %	0 %	198282842
14113	NC_011206	ACC	2	6	664823	664828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282842
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14118	NC_011206	GGC	3	9	665014	665022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282842
14119	NC_011206	CG	4	8	665079	665086	0 %	0 %	50 %	50 %	198282842
14120	NC_011206	CCG	2	6	665090	665095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282842
14121	NC_011206	GGAG	2	8	665191	665198	25 %	0 %	75 %	0 %	198282842
14122	NC_011206	TGC	2	6	665271	665276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282842
14123	NC_011206	GGGC	2	8	665331	665338	0 %	0 %	75 %	25 %	198282842
14124	NC_011206	GC	3	6	665502	665507	0 %	0 %	50 %	50 %	198282842
14125	NC_011206	CAC	2	6	665617	665622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282842
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14128	NC_011206	GCG	2	6	665775	665780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282842
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14131	NC_011206	CTG	2	6	666072	666077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282843
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14144	NC_011206	TCG	2	6	666514	666519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282843
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14146	NC_011206	GCC	2	6	666609	666614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282843
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14148	NC_011206	GTA	2	6	666658	666663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282843
14149	NC_011206	ATC	2	6	666666	666671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282843
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14152	NC_011206	GGGC	2	8	666854	666861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14153	NC_011206	TCC	2	6	666892	666897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14154	NC_011206	GGT	2	6	666912	666917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14156	NC_011206	CTT	2	6	666992	666997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14157	NC_011206	TGG	2	6	667067	667072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282844
14158	NC_011206	GAG	2	6	667079	667084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282844
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14184	NC_011206	CGCC	2	8	668401	668408	0 %	0 %	25 %	75 %	198282844
14185	NC_011206	GCA	2	6	668410	668415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282844
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14221	NC_011206	T	6	6	669802	669807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14223	NC_011206	TGG	2	6	669839	669844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14224	NC_011206	GCT	2	6	669851	669856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14232	NC_011206	AGC	2	6	670205	670210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282847
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14237	NC_011206	CA	3	6	670362	670367	50 %	0 %	0 %	50 %	198282848
14238	NC_011206	GCG	2	6	670413	670418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282848
14239	NC_011206	CAG	2	6	670423	670428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282848
14240	NC_011206	TCG	2	6	670486	670491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282848
14241	NC_011206	CCT	2	6	670496	670501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282848
14242	NC_011206	CAG	2	6	670539	670544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282848
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14248	NC_011206	CAG	2	6	670811	670816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282848
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14355	NC_011206	GGTGA	2	10	675776	675785	20 %	20 %	60 %	0 %	198282851
14356	NC_011206	CGA	2	6	675853	675858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282851
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14480	NC_011206	TCGT	2	8	682014	682021	0 %	50 %	25 %	25 %	198282859
14481	NC_011206	ACC	2	6	682026	682031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282859
14482	NC_011206	GGA	2	6	682037	682042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282859
14483	NC_011206	TGCG	2	8	682119	682126	0 %	25 %	50 %	25 %	198282859
14484	NC_011206	GCG	2	6	682141	682146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282859
14485	NC_011206	GGT	2	6	682172	682177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282859
14486	NC_011206	TCACC	2	10	682246	682255	20 %	20 %	0 %	60 %	198282859
14487	NC_011206	CAG	2	6	682267	682272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282859
14488	NC_011206	CTC	2	6	682325	682330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282859
14489	NC_011206	TGC	2	6	682401	682406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282859
14490	NC_011206	GGA	2	6	682465	682470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282859
14491	NC_011206	CTG	2	6	682472	682477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282859
14492	NC_011206	ATC	2	6	682482	682487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282859
14493	NC_011206	GAT	2	6	682516	682521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282859
14494	NC_011206	CCA	2	6	682593	682598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282859
14495	NC_011206	CGT	2	6	682658	682663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282859
14496	NC_011206	CGG	2	6	682704	682709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282859
14497	NC_011206	GAT	2	6	682750	682755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282859
14498	NC_011206	CCGA	2	8	682760	682767	25 %	0 %	25 %	50 %	198282859
14499	NC_011206	AGC	2	6	682779	682784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282859
14500	NC_011206	TGG	2	6	682839	682844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282859

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