MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011206	TGG	2	6	611099	611104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_011206	CGT	2	6	611111	611116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_011206	GAT	3	9	611223	611231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_011206	TCC	2	6	611275	611280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_011206	GCGCC	2	10	611410	611419	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13006	NC_011206	ATT	2	6	611599	611604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_011206	AT	3	6	611624	611629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_011206	AGG	2	6	611674	611679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_011206	AG	3	6	611707	611712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_011206	CGT	2	6	611748	611753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_011206	GCA	2	6	611800	611805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_011206	AC	4	8	611824	611831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_011206	TCG	2	6	611874	611879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_011206	GCA	2	6	611887	611892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_011206	TCG	2	6	611897	611902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_011206	GCG	2	6	611905	611910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_011206	GGT	2	6	611935	611940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_011206	ACCCA	2	10	611977	611986	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13019	NC_011206	AAT	2	6	612054	612059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_011206	TTA	2	6	612080	612085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282793
13021	NC_011206	GCG	2	6	612216	612221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282793
13022	NC_011206	CTG	2	6	612225	612230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282793
13023	NC_011206	CCG	2	6	612256	612261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282793
13024	NC_011206	TGG	2	6	612263	612268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282793
13025	NC_011206	GCC	2	6	612307	612312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13026	NC_011206	CAA	2	6	612313	612318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_011206	CAGC	2	8	612338	612345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_011206	GCTG	2	8	612357	612364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13029	NC_011206	ACG	2	6	612432	612437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282794
13030	NC_011206	GATC	2	8	612451	612458	25 %	25 %	25 %	25 %	198282794
13031	NC_011206	CTCTAT	2	12	612559	612570	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	198282794
13032	NC_011206	CAT	3	9	612583	612591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282794
13033	NC_011206	TCC	2	6	612603	612608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282794
13034	NC_011206	CGAG	2	8	612861	612868	25 %	0 %	50 %	25 %	198282794
13035	NC_011206	GC	3	6	612931	612936	0 %	0 %	50 %	50 %	198282794
13036	NC_011206	TC	3	6	612967	612972	0 %	50 %	0 %	50 %	198282794
13037	NC_011206	GCG	2	6	613042	613047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282795
13038	NC_011206	GCTT	2	8	613052	613059	0 %	50 %	25 %	25 %	198282795
13039	NC_011206	CG	3	6	613063	613068	0 %	0 %	50 %	50 %	198282795
13040	NC_011206	CGC	2	6	613074	613079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282795
13041	NC_011206	GAGAA	2	10	613119	613128	60 %	0 %	40 %	0 %	198282795
13042	NC_011206	AAC	2	6	613137	613142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282795
13043	NC_011206	TTA	2	6	613190	613195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282795
13044	NC_011206	CGA	3	9	613205	613213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282795
13045	NC_011206	CG	3	6	613236	613241	0 %	0 %	50 %	50 %	198282795
13046	NC_011206	TGAT	2	8	613261	613268	25 %	50 %	25 %	0 %	198282795
13047	NC_011206	GC	3	6	613313	613318	0 %	0 %	50 %	50 %	198282795
13048	NC_011206	CAG	2	6	613335	613340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282795
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13050	NC_011206	GACC	2	8	613391	613398	25 %	0 %	25 %	50 %	198282795
13051	NC_011206	CTGG	2	8	613405	613412	0 %	25 %	50 %	25 %	198282795
13052	NC_011206	GAA	2	6	613542	613547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282795
13053	NC_011206	GCGG	2	8	613574	613581	0 %	0 %	75 %	25 %	198282795
13054	NC_011206	CCG	2	6	613614	613619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282796
13055	NC_011206	GGC	2	6	613683	613688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282796
13056	NC_011206	CTG	2	6	613706	613711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282796
13057	NC_011206	GAC	2	6	613802	613807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282796
13058	NC_011206	AAC	2	6	613817	613822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282796
13059	NC_011206	GCT	2	6	613930	613935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282796
13060	NC_011206	GCT	2	6	614032	614037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282796
13061	NC_011206	CAA	2	6	614108	614113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_011206	GC	3	6	614135	614140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_011206	AT	3	6	614310	614315	50 %	50 %	0 %	0 %	198282797
13064	NC_011206	TGA	2	6	614474	614479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282797
13065	NC_011206	GCAA	2	8	614534	614541	50 %	0 %	25 %	25 %	198282797
13066	NC_011206	CTA	2	6	614565	614570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282797
13067	NC_011206	ACCG	2	8	614608	614615	25 %	0 %	25 %	50 %	198282797
13068	NC_011206	CAG	2	6	614629	614634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282797
13069	NC_011206	GCC	2	6	614667	614672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_011206	TTGG	2	8	614789	614796	0 %	50 %	50 %	0 %	198282798
13071	NC_011206	GAA	2	6	614804	614809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282798
13072	NC_011206	GTT	2	6	614862	614867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282798
13073	NC_011206	CGA	2	6	614882	614887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282798
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13075	NC_011206	TGCCG	2	10	614965	614974	0 %	20 %	40 %	40 %	198282798
13076	NC_011206	TTC	2	6	615030	615035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282798
13077	NC_011206	CGAG	2	8	615058	615065	25 %	0 %	50 %	25 %	198282798
13078	NC_011206	CGC	2	6	615093	615098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282798
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13081	NC_011206	AGC	2	6	615196	615201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282798
13082	NC_011206	CAG	2	6	615247	615252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282798
13083	NC_011206	GACTC	2	10	615362	615371	20 %	20 %	20 %	40 %	198282798
13084	NC_011206	ACG	2	6	615391	615396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282798
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13091	NC_011206	CA	3	6	615788	615793	50 %	0 %	0 %	50 %	198282798
13092	NC_011206	CGG	2	6	615809	615814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282798
13093	NC_011206	CGG	2	6	615911	615916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_011206	ATC	2	6	616072	616077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282799
13095	NC_011206	CATT	2	8	616086	616093	25 %	50 %	0 %	25 %	198282799
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13098	NC_011206	GTAG	2	8	616310	616317	25 %	25 %	50 %	0 %	198282799
13099	NC_011206	TGC	2	6	616318	616323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282799
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13101	NC_011206	CGC	2	6	616413	616418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13102	NC_011206	AACA	2	8	616512	616519	75 %	0 %	0 %	25 %	198282800
13103	NC_011206	CGA	2	6	616550	616555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282800
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13105	NC_011206	ATC	2	6	616578	616583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282800
13106	NC_011206	TGGC	2	8	616588	616595	0 %	25 %	50 %	25 %	198282800
13107	NC_011206	GTTG	2	8	616682	616689	0 %	50 %	50 %	0 %	198282800
13108	NC_011206	CTA	2	6	616721	616726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282800
13109	NC_011206	GCG	2	6	616840	616845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_011206	TAC	2	6	616920	616925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282801
13111	NC_011206	TTATCT	2	12	616930	616941	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	198282801
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13119	NC_011206	A	7	7	617268	617274	100 %	0 %	0 %	0 %	198282801
13120	NC_011206	GCG	2	6	617295	617300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282801
13121	NC_011206	CGG	2	6	617317	617322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_011206	AAC	2	6	617326	617331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_011206	TCC	2	6	617465	617470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13124	NC_011206	GAG	2	6	617496	617501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_011206	CAG	2	6	617504	617509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_011206	GGCA	2	8	617526	617533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13127	NC_011206	ACC	2	6	617675	617680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_011206	G	10	10	617751	617760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_011206	GAT	2	6	617784	617789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_011206	ATG	2	6	617808	617813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_011206	GAA	2	6	617987	617992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_011206	GAA	2	6	618122	618127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282803
13133	NC_011206	ACC	2	6	618134	618139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282803
13134	NC_011206	TGG	2	6	618151	618156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282803
13135	NC_011206	CTG	2	6	618241	618246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282803
13136	NC_011206	CTG	2	6	618323	618328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282803
13137	NC_011206	TGG	2	6	618422	618427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282803
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13144	NC_011206	CTGA	2	8	618667	618674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13145	NC_011206	GCA	2	6	618709	618714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13146	NC_011206	C	6	6	618754	618759	0 %	0 %	0 %	100 %	198282804
13147	NC_011206	ATC	2	6	618792	618797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282804
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13150	NC_011206	TCC	2	6	618961	618966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282804
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13154	NC_011206	GC	3	6	619193	619198	0 %	0 %	50 %	50 %	198282804
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13163	NC_011206	CCG	2	6	619414	619419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282804
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13242	NC_011206	TGA	2	6	624249	624254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282809
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13244	NC_011206	GGC	2	6	624334	624339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282809
13245	NC_011206	CCCG	2	8	624410	624417	0 %	0 %	25 %	75 %	198282809
13246	NC_011206	GAG	2	6	624435	624440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282809
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13248	NC_011206	CGA	2	6	624494	624499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282810
13249	NC_011206	GCC	2	6	624501	624506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282810
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13256	NC_011206	T	6	6	624707	624712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_011206	GCC	2	6	624715	624720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13275	NC_011206	TCTA	2	8	625593	625600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13350	NC_011206	GCAT	2	8	628867	628874	25 %	25 %	25 %	25 %	198282814
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13354	NC_011206	GA	3	6	629042	629047	50 %	0 %	50 %	0 %	198282814
13355	NC_011206	GC	3	6	629090	629095	0 %	0 %	50 %	50 %	198282814
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13357	NC_011206	GGC	2	6	629124	629129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282814
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13364	NC_011206	TCACC	2	10	629336	629345	20 %	20 %	0 %	60 %	198282815
13365	NC_011206	GC	3	6	629355	629360	0 %	0 %	50 %	50 %	198282815
13366	NC_011206	CTT	2	6	629415	629420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282815
13367	NC_011206	ATC	2	6	629434	629439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282815
13368	NC_011206	GCCA	2	8	629485	629492	25 %	0 %	25 %	50 %	198282815
13369	NC_011206	GCA	2	6	629534	629539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282815
13370	NC_011206	CCA	2	6	629570	629575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282815
13371	NC_011206	ACG	2	6	629614	629619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282815
13372	NC_011206	CGG	2	6	629656	629661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282815
13373	NC_011206	G	6	6	629693	629698	0 %	0 %	100 %	0 %	198282815
13374	NC_011206	CG	3	6	629726	629731	0 %	0 %	50 %	50 %	198282815
13375	NC_011206	TGG	2	6	629747	629752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282815
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13379	NC_011206	GAGAA	2	10	630082	630091	60 %	0 %	40 %	0 %	198282815
13380	NC_011206	TGG	2	6	630112	630117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282815
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13382	NC_011206	ATC	2	6	630228	630233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282815
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13385	NC_011206	TCG	2	6	630352	630357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282815
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13391	NC_011206	CAG	2	6	630642	630647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282815
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13394	NC_011206	TTC	2	6	630768	630773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282815
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13398	NC_011206	CGA	2	6	630923	630928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282815
13399	NC_011206	GTT	2	6	630936	630941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282815
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13401	NC_011206	GC	3	6	631041	631046	0 %	0 %	50 %	50 %	198282815
13402	NC_011206	CTT	2	6	631077	631082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282815
13403	NC_011206	CTT	2	6	631106	631111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282815
13404	NC_011206	TTCT	2	8	631182	631189	0 %	75 %	0 %	25 %	198282815
13405	NC_011206	CCG	2	6	631268	631273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282815
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13407	NC_011206	CCG	2	6	631343	631348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282815
13408	NC_011206	CAGA	2	8	631394	631401	50 %	0 %	25 %	25 %	198282815
13409	NC_011206	CAG	2	6	631455	631460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282815
13410	NC_011206	TGAT	2	8	631525	631532	25 %	50 %	25 %	0 %	198282815
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13412	NC_011206	CTG	2	6	631680	631685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282816
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13419	NC_011206	GCGG	2	8	631985	631992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13420	NC_011206	A	8	8	631995	632002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13421	NC_011206	TTTG	2	8	632027	632034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13422	NC_011206	GGC	2	6	632099	632104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282817
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13451	NC_011206	TGC	2	6	633726	633731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282819
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13473	NC_011206	TGA	2	6	634671	634676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282819
13474	NC_011206	CCAT	2	8	634820	634827	25 %	25 %	0 %	50 %	198282819
13475	NC_011206	T	6	6	634831	634836	0 %	100 %	0 %	0 %	198282819
13476	NC_011206	CTGA	2	8	634882	634889	25 %	25 %	25 %	25 %	198282819
13477	NC_011206	CAG	2	6	634993	634998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282819
13478	NC_011206	CAGGG	2	10	635064	635073	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13479	NC_011206	CGC	3	9	635181	635189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282820
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13482	NC_011206	CG	3	6	635438	635443	0 %	0 %	50 %	50 %	198282820
13483	NC_011206	ACCGG	2	10	635447	635456	20 %	0 %	40 %	40 %	198282820
13484	NC_011206	CGA	2	6	635484	635489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282820
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13486	NC_011206	GGT	2	6	635548	635553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282820
13487	NC_011206	GCT	2	6	635559	635564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282820
13488	NC_011206	CGC	2	6	635575	635580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282820
13489	NC_011206	CTG	2	6	635626	635631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282820
13490	NC_011206	GCCT	2	8	635636	635643	0 %	25 %	25 %	50 %	198282820
13491	NC_011206	GAT	2	6	635655	635660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282820
13492	NC_011206	GCC	2	6	635693	635698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282820
13493	NC_011206	GCA	2	6	635711	635716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282820
13494	NC_011206	CGT	2	6	635726	635731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282820
13495	NC_011206	CGG	2	6	635736	635741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282820
13496	NC_011206	CTT	2	6	635760	635765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282820
13497	NC_011206	TGA	2	6	635768	635773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282820
13498	NC_011206	CGG	2	6	635853	635858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282820
13499	NC_011206	GCG	2	6	635888	635893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282820
13500	NC_011206	GC	3	6	635928	635933	0 %	0 %	50 %	50 %	198282820

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