MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_011206	TGC	2	6	476468	476473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282648
10003	NC_011206	GCGG	2	8	476548	476555	0 %	0 %	75 %	25 %	198282648
10004	NC_011206	CGG	3	9	476616	476624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282648
10005	NC_011206	GCC	2	6	476699	476704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282648
10006	NC_011206	ATA	2	6	476719	476724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282649
10007	NC_011206	AGT	2	6	476793	476798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282649
10008	NC_011206	GGC	2	6	476948	476953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282649
10009	NC_011206	ATCG	2	8	477162	477169	25 %	25 %	25 %	25 %	198282649
10010	NC_011206	GTG	2	6	477186	477191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282649
10011	NC_011206	ACC	3	9	477195	477203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282649
10012	NC_011206	ATG	2	6	477211	477216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282649
10013	NC_011206	GTGC	2	8	477331	477338	0 %	25 %	50 %	25 %	198282650
10014	NC_011206	TGG	2	6	477593	477598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282651
10015	NC_011206	AAG	2	6	477599	477604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282651
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10017	NC_011206	GTG	2	6	477737	477742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282651
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10019	NC_011206	CG	3	6	477817	477822	0 %	0 %	50 %	50 %	198282651
10020	NC_011206	TGG	2	6	477840	477845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282651
10021	NC_011206	CGT	2	6	477858	477863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282651
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10028	NC_011206	AAT	2	6	478091	478096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282652
10029	NC_011206	GAC	2	6	478229	478234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282652
10030	NC_011206	CAGA	2	8	478256	478263	50 %	0 %	25 %	25 %	198282652
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10032	NC_011206	GCGT	2	8	478356	478363	0 %	25 %	50 %	25 %	198282652
10033	NC_011206	GAA	3	9	478396	478404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282652
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10035	NC_011206	TAC	2	6	478420	478425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_011206	TCG	2	6	478450	478455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282653
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10039	NC_011206	GGGGC	2	10	478612	478621	0 %	0 %	80 %	20 %	198282653
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10042	NC_011206	GGT	2	6	478870	478875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282654
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10053	NC_011206	AGGT	2	8	479637	479644	25 %	25 %	50 %	0 %	198282656
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10108	NC_011206	GACCAA	2	12	482632	482643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	198282661
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10111	NC_011206	A	6	6	482923	482928	100 %	0 %	0 %	0 %	198282662
10112	NC_011206	TGCG	2	8	482999	483006	0 %	25 %	50 %	25 %	198282662
10113	NC_011206	GCG	2	6	483087	483092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282662
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10120	NC_011206	GAC	2	6	483505	483510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282663
10121	NC_011206	TGT	2	6	483548	483553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282663
10122	NC_011206	TGC	2	6	483590	483595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282663
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10125	NC_011206	GTC	2	6	483720	483725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282663
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10161	NC_011206	CCTG	2	8	485349	485356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10240	NC_011206	CTG	2	6	488416	488421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282670
10241	NC_011206	GAC	2	6	488469	488474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282670
10242	NC_011206	CGG	2	6	488498	488503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282670
10243	NC_011206	CGT	2	6	488547	488552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282670
10244	NC_011206	CTG	2	6	488563	488568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282670
10245	NC_011206	CCT	2	6	488577	488582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282670
10246	NC_011206	TGG	2	6	488639	488644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282670
10247	NC_011206	TGC	2	6	488732	488737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282670
10248	NC_011206	TGG	2	6	488740	488745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282670
10249	NC_011206	TAC	2	6	488776	488781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282670
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10251	NC_011206	GTC	2	6	488836	488841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282670
10252	NC_011206	GC	3	6	488886	488891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10253	NC_011206	CCCG	2	8	488917	488924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10254	NC_011206	TTG	2	6	488980	488985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_011206	CGC	2	6	488991	488996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10256	NC_011206	G	6	6	489033	489038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_011206	GGA	2	6	489042	489047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282671
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10260	NC_011206	TCA	2	6	489105	489110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282671
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10262	NC_011206	GCT	2	6	489157	489162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282671
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10264	NC_011206	GAA	2	6	489426	489431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282672
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10268	NC_011206	CG	3	6	489526	489531	0 %	0 %	50 %	50 %	198282672
10269	NC_011206	GAA	2	6	489577	489582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282672
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10271	NC_011206	GATG	2	8	489630	489637	25 %	25 %	50 %	0 %	198282672
10272	NC_011206	CTG	2	6	489673	489678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282672
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10274	NC_011206	GAG	2	6	489712	489717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282672
10275	NC_011206	GC	3	6	489745	489750	0 %	0 %	50 %	50 %	198282672
10276	NC_011206	AATC	2	8	489817	489824	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10277	NC_011206	ATG	2	6	489857	489862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10278	NC_011206	T	6	6	489961	489966	0 %	100 %	0 %	0 %	198282673
10279	NC_011206	CCGC	2	8	490016	490023	0 %	0 %	25 %	75 %	198282673
10280	NC_011206	AAG	2	6	490039	490044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282673
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10282	NC_011206	AGGC	2	8	490118	490125	25 %	0 %	50 %	25 %	198282673
10283	NC_011206	TCG	2	6	490205	490210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282673
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10341	NC_011206	CA	3	6	492881	492886	50 %	0 %	0 %	50 %	198282676
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10348	NC_011206	AAG	2	6	493042	493047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10349	NC_011206	CTG	2	6	493066	493071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10350	NC_011206	GTC	2	6	493126	493131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282677
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10357	NC_011206	CATGCC	2	12	493504	493515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198282677
10358	NC_011206	GGA	2	6	493684	493689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282677
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10481	NC_011206	CTG	2	6	498772	498777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282680
10482	NC_011206	CCGTC	2	10	498783	498792	0 %	20 %	20 %	60 %	198282680
10483	NC_011206	GGC	2	6	498807	498812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282680
10484	NC_011206	GGT	2	6	498927	498932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282680
10485	NC_011206	GGC	2	6	498937	498942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282680
10486	NC_011206	GCT	2	6	498978	498983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282680
10487	NC_011206	CGC	2	6	499026	499031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282680
10488	NC_011206	GC	3	6	499097	499102	0 %	0 %	50 %	50 %	198282680
10489	NC_011206	GGAT	2	8	499143	499150	25 %	25 %	50 %	0 %	198282680
10490	NC_011206	GC	3	6	499185	499190	0 %	0 %	50 %	50 %	198282680
10491	NC_011206	GCT	2	6	499221	499226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282680
10492	NC_011206	GGC	2	6	499227	499232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282680
10493	NC_011206	CG	3	6	499242	499247	0 %	0 %	50 %	50 %	198282680
10494	NC_011206	TGA	2	6	499353	499358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282680
10495	NC_011206	CGC	3	9	499368	499376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282680
10496	NC_011206	GCG	2	6	499384	499389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282680
10497	NC_011206	GAA	2	6	499396	499401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282680
10498	NC_011206	CTG	2	6	499559	499564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282681
10499	NC_011206	GGC	2	6	499567	499572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282681
10500	NC_011206	GTC	2	6	499656	499661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282681

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