MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011206	GAG	2	6	23615	23620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282169
502	NC_011206	GAC	2	6	23639	23644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282169
503	NC_011206	CGG	2	6	23646	23651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282169
504	NC_011206	GAA	2	6	23779	23784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282169
505	NC_011206	GGA	2	6	23785	23790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282169
506	NC_011206	GGC	2	6	23805	23810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282169
507	NC_011206	GCA	2	6	23943	23948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282169
508	NC_011206	GTG	3	9	23972	23980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282169
509	NC_011206	GCC	2	6	24157	24162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282170
510	NC_011206	GCT	2	6	24210	24215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282170
511	NC_011206	TGGT	2	8	24256	24263	0 %	50 %	50 %	0 %	198282170
512	NC_011206	TTG	2	6	24313	24318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282170
513	NC_011206	GAG	2	6	24334	24339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282170
514	NC_011206	A	6	6	24448	24453	100 %	0 %	0 %	0 %	198282170
515	NC_011206	GC	3	6	24460	24465	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
516	NC_011206	TGA	2	6	24470	24475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282170
517	NC_011206	GGC	2	6	24561	24566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
518	NC_011206	GC	3	6	24565	24570	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
519	NC_011206	GC	3	6	24573	24578	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
520	NC_011206	GGCC	2	8	24596	24603	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
521	NC_011206	GC	3	6	24623	24628	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
522	NC_011206	CGG	2	6	24679	24684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
523	NC_011206	GCG	2	6	24730	24735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
524	NC_011206	TGCC	2	8	24742	24749	0 %	25 %	25 %	50 %	198282170
525	NC_011206	GGC	2	6	24825	24830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
526	NC_011206	CGG	2	6	24885	24890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
527	NC_011206	AGG	2	6	24990	24995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282170
528	NC_011206	GGC	2	6	25011	25016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
529	NC_011206	GCG	2	6	25021	25026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
530	NC_011206	TGG	2	6	25039	25044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282170
531	NC_011206	CGC	2	6	25105	25110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282170
532	NC_011206	GCC	2	6	25130	25135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282170
533	NC_011206	CTG	2	6	25177	25182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282170
534	NC_011206	CGG	2	6	25209	25214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282170
535	NC_011206	GAG	2	6	25249	25254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282170
536	NC_011206	GAA	2	6	25258	25263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282170
537	NC_011206	CGC	2	6	25269	25274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282170
538	NC_011206	GC	3	6	25297	25302	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
539	NC_011206	ATGG	2	8	25351	25358	25 %	25 %	50 %	0 %	198282170
540	NC_011206	AGC	2	6	25398	25403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282170
541	NC_011206	GTCG	2	8	25415	25422	0 %	25 %	50 %	25 %	198282171
542	NC_011206	GCAG	2	8	25429	25436	25 %	0 %	50 %	25 %	198282171
543	NC_011206	GTC	2	6	25446	25451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282171
544	NC_011206	T	6	6	25474	25479	0 %	100 %	0 %	0 %	198282171
545	NC_011206	GGC	2	6	25490	25495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282171
546	NC_011206	GCA	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282171
547	NC_011206	TTA	2	6	25727	25732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282171
548	NC_011206	CAG	2	6	25764	25769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282171
549	NC_011206	GTC	2	6	25803	25808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282171
550	NC_011206	CG	3	6	25859	25864	0 %	0 %	50 %	50 %	198282171
551	NC_011206	CGT	2	6	25967	25972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282171
552	NC_011206	AGC	2	6	26028	26033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
553	NC_011206	CTGCTC	2	12	26063	26074	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	198282172
554	NC_011206	G	6	6	26117	26122	0 %	0 %	100 %	0 %	198282172
555	NC_011206	ATT	2	6	26133	26138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282172
556	NC_011206	CGG	2	6	26160	26165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
557	NC_011206	GGT	2	6	26203	26208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282172
558	NC_011206	GCT	2	6	26212	26217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282172
559	NC_011206	GCG	2	6	26227	26232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
560	NC_011206	TGG	2	6	26265	26270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282172
561	NC_011206	TCA	3	9	26271	26279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282172
562	NC_011206	T	6	6	26290	26295	0 %	100 %	0 %	0 %	198282172
563	NC_011206	CGT	2	6	26305	26310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282172
564	NC_011206	CAG	2	6	26359	26364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
565	NC_011206	GGCG	2	8	26407	26414	0 %	0 %	75 %	25 %	198282172
566	NC_011206	GGC	2	6	26443	26448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
567	NC_011206	TGG	2	6	26469	26474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282172
568	NC_011206	CAG	2	6	26485	26490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
569	NC_011206	AGC	2	6	26534	26539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
570	NC_011206	ATC	2	6	26567	26572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282172
571	NC_011206	CCA	2	6	26574	26579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282172
572	NC_011206	CCA	2	6	26655	26660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282172
573	NC_011206	CTG	2	6	26684	26689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282172
574	NC_011206	TGATGC	2	12	26826	26837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	198282172
575	NC_011206	TCAGC	2	10	26860	26869	20 %	20 %	20 %	40 %	198282172
576	NC_011206	TGC	2	6	26883	26888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282172
577	NC_011206	GCTGT	2	10	26891	26900	0 %	40 %	40 %	20 %	198282172
578	NC_011206	CGG	2	6	26901	26906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
579	NC_011206	CGA	2	6	26930	26935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
580	NC_011206	CG	3	6	26950	26955	0 %	0 %	50 %	50 %	198282172
581	NC_011206	GGC	2	6	26959	26964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
582	NC_011206	ACG	2	6	27021	27026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
583	NC_011206	CAA	2	6	27052	27057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282172
584	NC_011206	AGC	2	6	27084	27089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
585	NC_011206	GGC	4	12	27091	27102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
586	NC_011206	AGC	2	6	27117	27122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
587	NC_011206	GCG	2	6	27212	27217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
588	NC_011206	AGG	2	6	27231	27236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282172
589	NC_011206	TGG	2	6	27303	27308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282172
590	NC_011206	GC	3	6	27396	27401	0 %	0 %	50 %	50 %	198282172
591	NC_011206	CGC	2	6	27466	27471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282172
592	NC_011206	GCC	2	6	27482	27487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282172
593	NC_011206	GCG	2	6	27502	27507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
594	NC_011206	CCG	2	6	27552	27557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282172
595	NC_011206	GCG	2	6	27565	27570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
596	NC_011206	CGA	2	6	27592	27597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282172
597	NC_011206	CAT	2	6	27628	27633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282172
598	NC_011206	TGG	2	6	27660	27665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282172
599	NC_011206	AG	3	6	27763	27768	50 %	0 %	50 %	0 %	198282172
600	NC_011206	C	7	7	27806	27812	0 %	0 %	0 %	100 %	198282172
601	NC_011206	AAT	2	6	27848	27853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282172
602	NC_011206	GACG	2	8	27934	27941	25 %	0 %	50 %	25 %	198282172
603	NC_011206	GT	3	6	27969	27974	0 %	50 %	50 %	0 %	198282172
604	NC_011206	GAG	2	6	28088	28093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282172
605	NC_011206	CGG	2	6	28096	28101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282172
606	NC_011206	AGG	2	6	28183	28188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011206	TGG	2	6	28218	28223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282173
608	NC_011206	GGA	2	6	28267	28272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282173
609	NC_011206	CCG	2	6	28293	28298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282173
610	NC_011206	TGG	2	6	28338	28343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282173
611	NC_011206	CTC	2	6	28352	28357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282173
612	NC_011206	GGT	2	6	28429	28434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282173
613	NC_011206	GAT	2	6	28435	28440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282173
614	NC_011206	CCA	2	6	28452	28457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282173
615	NC_011206	CGG	2	6	28464	28469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282173
616	NC_011206	TGCG	2	8	28590	28597	0 %	25 %	50 %	25 %	198282173
617	NC_011206	GGC	2	6	28672	28677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282173
618	NC_011206	TGC	2	6	28695	28700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282173
619	NC_011206	CG	3	6	28732	28737	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
620	NC_011206	CGA	2	6	28748	28753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282173
621	NC_011206	CGG	2	6	28757	28762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282173
622	NC_011206	GCC	3	9	28790	28798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282173
623	NC_011206	CGCC	2	8	28801	28808	0 %	0 %	25 %	75 %	198282173
624	NC_011206	GAG	2	6	28838	28843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282173
625	NC_011206	GGC	2	6	28883	28888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282173
626	NC_011206	CGA	2	6	28900	28905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282173
627	NC_011206	GC	3	6	28934	28939	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
628	NC_011206	GCG	2	6	28960	28965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282173
629	NC_011206	CAT	2	6	28966	28971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282173
630	NC_011206	GAC	2	6	28984	28989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282173
631	NC_011206	GCCCGT	2	12	28990	29001	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	198282173
632	NC_011206	CTA	2	6	29077	29082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282173
633	NC_011206	GCC	2	6	29110	29115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282173
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636	NC_011206	TGC	2	6	29226	29231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282173
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642	NC_011206	GC	3	6	29431	29436	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
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649	NC_011206	GAGGGG	2	12	29585	29596	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	198282173
650	NC_011206	AT	3	6	29670	29675	50 %	50 %	0 %	0 %	198282174
651	NC_011206	GTCTG	2	10	29725	29734	0 %	40 %	40 %	20 %	198282174
652	NC_011206	GTG	2	6	29741	29746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282174
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657	NC_011206	TG	3	6	29957	29962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
658	NC_011206	TCCA	2	8	29966	29973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
659	NC_011206	TCAG	2	8	30098	30105	25 %	25 %	25 %	25 %	198282176
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742	NC_011206	TGA	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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