MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011206	AAC	2	6	261605	261610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282417
5502	NC_011206	TTCA	3	12	261619	261630	25 %	50 %	0 %	25 %	198282417
5503	NC_011206	TGGAG	2	10	261653	261662	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_011206	AC	3	6	261665	261670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_011206	CCA	2	6	261823	261828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282418
5506	NC_011206	ACC	2	6	261833	261838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282418
5507	NC_011206	TGG	2	6	261971	261976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282418
5508	NC_011206	GT	3	6	262011	262016	0 %	50 %	50 %	0 %	198282418
5509	NC_011206	CGG	2	6	262068	262073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282418
5510	NC_011206	GTG	2	6	262183	262188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282418
5511	NC_011206	GCA	2	6	262286	262291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282418
5512	NC_011206	GAT	2	6	262309	262314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282418
5513	NC_011206	AGC	2	6	262334	262339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282418
5514	NC_011206	GCG	2	6	262352	262357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282418
5515	NC_011206	GGC	2	6	262372	262377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282419
5516	NC_011206	A	7	7	262385	262391	100 %	0 %	0 %	0 %	198282419
5517	NC_011206	GAA	3	9	262421	262429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282419
5518	NC_011206	GAA	2	6	262496	262501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282419
5519	NC_011206	AG	3	6	262591	262596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_011206	AAT	2	6	262637	262642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011206	AG	3	6	262647	262652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011206	GGGAC	2	10	262692	262701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5523	NC_011206	ATC	2	6	262743	262748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_011206	CTT	2	6	262824	262829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_011206	ACA	2	6	262861	262866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282420
5526	NC_011206	A	6	6	262877	262882	100 %	0 %	0 %	0 %	198282420
5527	NC_011206	CCA	2	6	262940	262945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282420
5528	NC_011206	GGGC	2	8	262996	263003	0 %	0 %	75 %	25 %	198282420
5529	NC_011206	ACG	2	6	263083	263088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282420
5530	NC_011206	CCCA	2	8	263499	263506	25 %	0 %	0 %	75 %	198282420
5531	NC_011206	CAT	2	6	263537	263542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282420
5532	NC_011206	CAGGG	2	10	263549	263558	20 %	0 %	60 %	20 %	198282420
5533	NC_011206	GCG	2	6	263583	263588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282420
5534	NC_011206	ACA	2	6	263589	263594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282420
5535	NC_011206	CAG	2	6	263606	263611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282420
5536	NC_011206	TTC	2	6	263631	263636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282420
5537	NC_011206	CAG	2	6	263675	263680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282420
5538	NC_011206	GAT	2	6	263732	263737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282420
5539	NC_011206	TGA	2	6	263773	263778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282420
5540	NC_011206	CCG	2	6	263802	263807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282420
5541	NC_011206	GCC	3	9	263816	263824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282420
5542	NC_011206	GCC	3	9	263831	263839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282420
5543	NC_011206	AGGGC	2	10	263875	263884	20 %	0 %	60 %	20 %	198282420
5544	NC_011206	GAA	2	6	263942	263947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282420
5545	NC_011206	GTC	2	6	263976	263981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282420
5546	NC_011206	GGT	2	6	263986	263991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282420
5547	NC_011206	CAG	2	6	264002	264007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282420
5548	NC_011206	AGC	2	6	264048	264053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282420
5549	NC_011206	AGGCC	2	10	264083	264092	20 %	0 %	40 %	40 %	198282420
5550	NC_011206	GCT	2	6	264212	264217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282421
5551	NC_011206	AG	3	6	264222	264227	50 %	0 %	50 %	0 %	198282421
5552	NC_011206	CAG	2	6	264250	264255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282421
5553	NC_011206	ATC	2	6	264256	264261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282421
5554	NC_011206	GCG	2	6	264326	264331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282421
5555	NC_011206	ATG	2	6	264332	264337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282421
5556	NC_011206	CCG	2	6	264342	264347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282421
5557	NC_011206	GAT	2	6	264414	264419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282421
5558	NC_011206	GAT	2	6	264445	264450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282421
5559	NC_011206	C	6	6	264470	264475	0 %	0 %	0 %	100 %	198282421
5560	NC_011206	TGC	2	6	264531	264536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282421
5561	NC_011206	C	6	6	264536	264541	0 %	0 %	0 %	100 %	198282421
5562	NC_011206	CCA	2	6	264598	264603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282421
5563	NC_011206	CAG	2	6	264751	264756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282421
5564	NC_011206	TCA	2	6	264789	264794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282421
5565	NC_011206	CCCA	2	8	264831	264838	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5566	NC_011206	GGGGC	2	10	264858	264867	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5567	NC_011206	TAG	2	6	264947	264952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011206	GTG	2	6	265012	265017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011206	GTC	2	6	265059	265064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_011206	ATC	2	6	265184	265189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_011206	CAA	2	6	265207	265212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_011206	GCT	2	6	265253	265258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_011206	CGT	2	6	265398	265403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282422
5574	NC_011206	AGCG	2	8	265477	265484	25 %	0 %	50 %	25 %	198282422
5575	NC_011206	GAT	2	6	265568	265573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282422
5576	NC_011206	CGG	2	6	265686	265691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_011206	GGC	2	6	265708	265713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_011206	CTGG	2	8	265729	265736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_011206	GGA	2	6	265804	265809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011206	GTC	2	6	265857	265862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_011206	CGT	2	6	265886	265891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_011206	CTT	2	6	265939	265944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_011206	TTTC	2	8	265961	265968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_011206	T	7	7	265978	265984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011206	CGG	2	6	266126	266131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_011206	CAA	2	6	266333	266338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_011206	T	7	7	266354	266360	0 %	100 %	0 %	0 %	198282423
5588	NC_011206	CTT	2	6	266382	266387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5589	NC_011206	CCA	2	6	266406	266411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282423
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5591	NC_011206	CTT	2	6	266451	266456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5592	NC_011206	CTT	2	6	266478	266483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5593	NC_011206	CCG	2	6	266515	266520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282423
5594	NC_011206	GAC	2	6	266539	266544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5595	NC_011206	GTC	2	6	266593	266598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5596	NC_011206	GCC	2	6	266605	266610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282423
5597	NC_011206	ACA	2	6	266623	266628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282423
5598	NC_011206	CTG	2	6	266652	266657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5599	NC_011206	TCC	2	6	266695	266700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282423
5600	NC_011206	GCCC	2	8	266755	266762	0 %	0 %	25 %	75 %	198282423
5601	NC_011206	GA	3	6	266773	266778	50 %	0 %	50 %	0 %	198282423
5602	NC_011206	GAT	2	6	266826	266831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
5603	NC_011206	TGG	2	6	266840	266845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282423
5604	NC_011206	CTTGGC	2	12	266877	266888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5605	NC_011206	ACC	2	6	266902	266907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282423
5606	NC_011206	ATCC	2	8	266939	266946	25 %	25 %	0 %	50 %	198282423
5607	NC_011206	CGG	2	6	266958	266963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
5608	NC_011206	TGCCT	2	10	266971	266980	0 %	40 %	20 %	40 %	198282423
5609	NC_011206	GCG	2	6	267023	267028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
5610	NC_011206	TCA	2	6	267049	267054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282423
5611	NC_011206	GAT	2	6	267207	267212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
5612	NC_011206	ATG	2	6	267268	267273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
5613	NC_011206	GTG	2	6	267276	267281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282423
5614	NC_011206	CGG	2	6	267329	267334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
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5618	NC_011206	GCCTT	2	10	267598	267607	0 %	40 %	20 %	40 %	198282423
5619	NC_011206	CAG	2	6	267635	267640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
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5621	NC_011206	TCC	2	6	267685	267690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282423
5622	NC_011206	GGC	2	6	267702	267707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
5623	NC_011206	GTA	2	6	267735	267740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282423
5624	NC_011206	TCT	2	6	267764	267769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5625	NC_011206	GAC	2	6	267822	267827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5626	NC_011206	CG	3	6	267888	267893	0 %	0 %	50 %	50 %	198282423
5627	NC_011206	GCCA	2	8	267988	267995	25 %	0 %	25 %	50 %	198282423
5628	NC_011206	TGCGT	2	10	267998	268007	0 %	40 %	40 %	20 %	198282423
5629	NC_011206	CCA	2	6	268043	268048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282423
5630	NC_011206	GAC	2	6	268083	268088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5631	NC_011206	GAC	2	6	268090	268095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282423
5632	NC_011206	CTT	2	6	268155	268160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5633	NC_011206	TCT	2	6	268202	268207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282423
5634	NC_011206	GTG	2	6	268219	268224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282423
5635	NC_011206	CAT	2	6	268229	268234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282423
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5637	NC_011206	CGG	2	6	268292	268297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282423
5638	NC_011206	TCA	2	6	268400	268405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282423
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5640	NC_011206	GGA	2	6	268556	268561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5641	NC_011206	ATTTA	2	10	268567	268576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5642	NC_011206	GCCT	2	8	268631	268638	0 %	25 %	25 %	50 %	198282424
5643	NC_011206	ATG	2	6	268645	268650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282424
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5645	NC_011206	TTC	2	6	268835	268840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282424
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5647	NC_011206	GAT	2	6	268955	268960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282425
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5653	NC_011206	CTG	2	6	269255	269260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282425
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5657	NC_011206	TCA	2	6	269702	269707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5658	NC_011206	TGC	2	6	269745	269750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5660	NC_011206	CAG	2	6	269789	269794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5661	NC_011206	GCATT	2	10	269806	269815	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5662	NC_011206	AACCT	2	10	269833	269842	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5663	NC_011206	GAT	2	6	269896	269901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5664	NC_011206	TAT	2	6	269908	269913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5665	NC_011206	ATC	2	6	269963	269968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5666	NC_011206	CG	4	8	269980	269987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5667	NC_011206	GCT	2	6	270104	270109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282426
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5871	NC_011206	CGGGCG	2	12	282011	282022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282435
5872	NC_011206	TGGA	2	8	282039	282046	25 %	25 %	50 %	0 %	198282435
5873	NC_011206	TCA	2	6	282098	282103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282435
5874	NC_011206	CGG	2	6	282117	282122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282435
5875	NC_011206	GGC	2	6	282142	282147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282435
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5883	NC_011206	GAT	2	6	282694	282699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282435
5884	NC_011206	GCA	2	6	282760	282765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282435
5885	NC_011206	GCT	2	6	282777	282782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282435
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5887	NC_011206	TGA	2	6	282897	282902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282435
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5891	NC_011206	CG	3	6	283043	283048	0 %	0 %	50 %	50 %	198282435
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5894	NC_011206	ATGC	2	8	283171	283178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5895	NC_011206	GCC	3	9	283210	283218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5896	NC_011206	GAT	2	6	283265	283270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5897	NC_011206	GCT	2	6	283285	283290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5898	NC_011206	ACC	2	6	283349	283354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5899	NC_011206	ACG	2	6	283377	283382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5901	NC_011206	CTT	2	6	283408	283413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5902	NC_011206	CGT	2	6	283425	283430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5903	NC_011206	TCC	2	6	283437	283442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5904	NC_011206	GCT	2	6	283541	283546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282436
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5912	NC_011206	GAA	2	6	283977	283982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282437
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5950	NC_011206	GCG	2	6	285763	285768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282440
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5971	NC_011206	CGGA	2	8	286572	286579	25 %	0 %	50 %	25 %	198282441
5972	NC_011206	AATC	2	8	286580	286587	50 %	25 %	0 %	25 %	198282441
5973	NC_011206	CGC	2	6	286616	286621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282441
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5976	NC_011206	TAT	2	6	286716	286721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282441
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5979	NC_011206	TGA	2	6	286798	286803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282441
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5981	NC_011206	AAT	2	6	286935	286940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282441
5982	NC_011206	TCAGGG	2	12	287040	287051	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5983	NC_011206	CG	3	6	287073	287078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5984	NC_011206	CCT	2	6	287113	287118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5985	NC_011206	CTGA	2	8	287141	287148	25 %	25 %	25 %	25 %	198282442
5986	NC_011206	TCCA	2	8	287173	287180	25 %	25 %	0 %	50 %	198282442
5987	NC_011206	GAAA	2	8	287221	287228	75 %	0 %	25 %	0 %	198282442
5988	NC_011206	TCA	3	9	287231	287239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282442
5989	NC_011206	CAA	2	6	287259	287264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282442
5990	NC_011206	CAT	2	6	287346	287351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282442
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