MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 60358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011206	CTT	2	6	209039	209044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282366
4502	NC_011206	CCA	2	6	209052	209057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282366
4503	NC_011206	AT	3	6	209116	209121	50 %	50 %	0 %	0 %	198282366
4504	NC_011206	CGC	2	6	209195	209200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282366
4505	NC_011206	TCA	2	6	209241	209246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282366
4506	NC_011206	CGT	2	6	209311	209316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282366
4507	NC_011206	ATC	2	6	209374	209379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282366
4508	NC_011206	GTG	2	6	209419	209424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282366
4509	NC_011206	GACA	2	8	209455	209462	50 %	0 %	25 %	25 %	198282366
4510	NC_011206	CTT	2	6	209532	209537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282366
4511	NC_011206	GC	3	6	209545	209550	0 %	0 %	50 %	50 %	198282366
4512	NC_011206	TA	3	6	209636	209641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_011206	T	6	6	209668	209673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_011206	TAT	2	6	209686	209691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_011206	TTTAT	2	10	209704	209713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_011206	GAA	2	6	209736	209741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282367
4517	NC_011206	ATAG	2	8	209750	209757	50 %	25 %	25 %	0 %	198282367
4518	NC_011206	CCA	2	6	209815	209820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282367
4519	NC_011206	GAT	2	6	209852	209857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282367
4520	NC_011206	TAGC	2	8	209881	209888	25 %	25 %	25 %	25 %	198282367
4521	NC_011206	CCG	2	6	209901	209906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282367
4522	NC_011206	ACA	2	6	209950	209955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282367
4523	NC_011206	CAA	2	6	209968	209973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282367
4524	NC_011206	TTC	2	6	209990	209995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282367
4525	NC_011206	GTT	2	6	210051	210056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282367
4526	NC_011206	TAT	2	6	210165	210170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282368
4527	NC_011206	TAG	2	6	210263	210268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282368
4528	NC_011206	ATT	2	6	210416	210421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282368
4529	NC_011206	ATA	2	6	210428	210433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282368
4530	NC_011206	ATC	2	6	210454	210459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282368
4531	NC_011206	T	8	8	210652	210659	0 %	100 %	0 %	0 %	198282369
4532	NC_011206	ATCA	2	8	210803	210810	50 %	25 %	0 %	25 %	198282369
4533	NC_011206	CCA	2	6	210823	210828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282369
4534	NC_011206	CAT	2	6	210833	210838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282369
4535	NC_011206	T	6	6	210865	210870	0 %	100 %	0 %	0 %	198282369
4536	NC_011206	A	6	6	210993	210998	100 %	0 %	0 %	0 %	198282369
4537	NC_011206	TCA	2	6	211023	211028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282369
4538	NC_011206	ATT	2	6	211065	211070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282369
4539	NC_011206	TCT	2	6	211151	211156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282369
4540	NC_011206	ATT	2	6	211239	211244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282369
4541	NC_011206	T	6	6	211260	211265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011206	TGG	2	6	211267	211272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_011206	TCAT	2	8	211285	211292	25 %	50 %	0 %	25 %	198282370
4544	NC_011206	GTT	2	6	211372	211377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282370
4545	NC_011206	CTG	2	6	211489	211494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
4546	NC_011206	GAT	2	6	211600	211605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282370
4547	NC_011206	TGC	2	6	211607	211612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
4548	NC_011206	GAA	2	6	211720	211725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282370
4549	NC_011206	TGG	2	6	211800	211805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
4550	NC_011206	TGC	2	6	211821	211826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
4551	NC_011206	TCGG	2	8	211871	211878	0 %	25 %	50 %	25 %	198282370
4552	NC_011206	GGTAGA	2	12	211880	211891	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	198282370
4553	NC_011206	GCT	2	6	211909	211914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
4554	NC_011206	ATG	3	9	211969	211977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282370
4555	NC_011206	GAT	2	6	212041	212046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282370
4556	NC_011206	TGG	2	6	212136	212141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
4557	NC_011206	TGG	2	6	212148	212153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
4558	NC_011206	T	7	7	212159	212165	0 %	100 %	0 %	0 %	198282370
4559	NC_011206	TGC	2	6	212202	212207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
4560	NC_011206	TCT	2	6	212253	212258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282370
4561	NC_011206	TGAT	2	8	212261	212268	25 %	50 %	25 %	0 %	198282370
4562	NC_011206	GGC	2	6	212284	212289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282370
4563	NC_011206	TCT	2	6	212319	212324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282370
4564	NC_011206	GAG	2	6	212443	212448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282370
4565	NC_011206	ATC	3	9	212449	212457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282370
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4567	NC_011206	TGG	3	9	212481	212489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
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4569	NC_011206	GCC	2	6	212683	212688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282370
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4573	NC_011206	TGG	2	6	212808	212813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
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4584	NC_011206	TTCA	2	8	213559	213566	25 %	50 %	0 %	25 %	198282370
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4591	NC_011206	TA	3	6	213836	213841	50 %	50 %	0 %	0 %	198282371
4592	NC_011206	TGG	2	6	213847	213852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282371
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4596	NC_011206	TGC	2	6	213935	213940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282371
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4601	NC_011206	TTC	2	6	214233	214238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282371
4602	NC_011206	TCG	2	6	214278	214283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282371
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4605	NC_011206	GCG	2	6	214324	214329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282371
4606	NC_011206	TTG	2	6	214336	214341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282371
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4608	NC_011206	ATA	2	6	214412	214417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282371
4609	NC_011206	TGG	2	6	214459	214464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282371
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4615	NC_011206	CAG	2	6	214765	214770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282371
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4620	NC_011206	TCT	2	6	214956	214961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282372
4621	NC_011206	TCCG	2	8	215019	215026	0 %	25 %	25 %	50 %	198282372
4622	NC_011206	GTA	2	6	215038	215043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282372
4623	NC_011206	CAC	2	6	215083	215088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282372
4624	NC_011206	CCCG	2	8	215116	215123	0 %	0 %	25 %	75 %	198282372
4625	NC_011206	CTGA	2	8	215177	215184	25 %	25 %	25 %	25 %	198282372
4626	NC_011206	CGC	2	6	215226	215231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282372
4627	NC_011206	GCC	2	6	215236	215241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282372
4628	NC_011206	TGC	2	6	215264	215269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282372
4629	NC_011206	CTG	2	6	215311	215316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282372
4630	NC_011206	CCT	2	6	215319	215324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282372
4631	NC_011206	ACC	2	6	215335	215340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282372
4632	NC_011206	CAC	2	6	215359	215364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282372
4633	NC_011206	ATG	2	6	215462	215467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282372
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4635	NC_011206	CGT	2	6	215610	215615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282372
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4639	NC_011206	CCA	2	6	215690	215695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282372
4640	NC_011206	GTC	2	6	215950	215955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282372
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4642	NC_011206	GCC	2	6	216005	216010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282372
4643	NC_011206	TCC	2	6	216032	216037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282372
4644	NC_011206	A	7	7	216113	216119	100 %	0 %	0 %	0 %	198282372
4645	NC_011206	GGA	2	6	216157	216162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282372
4646	NC_011206	GGA	2	6	216177	216182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282372
4647	NC_011206	TC	3	6	216220	216225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4648	NC_011206	CGGT	2	8	216229	216236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4649	NC_011206	GTT	2	6	216238	216243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_011206	AT	3	6	216244	216249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4651	NC_011206	TCTA	2	8	216313	216320	25 %	50 %	0 %	25 %	198282373
4652	NC_011206	TCT	2	6	216493	216498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282373
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4654	NC_011206	AG	3	6	216630	216635	50 %	0 %	50 %	0 %	198282373
4655	NC_011206	AGCG	2	8	216748	216755	25 %	0 %	50 %	25 %	198282374
4656	NC_011206	TCAA	2	8	216777	216784	50 %	25 %	0 %	25 %	198282374
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4660	NC_011206	TCA	2	6	216897	216902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4661	NC_011206	ATG	2	6	216912	216917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4662	NC_011206	GAT	3	9	216969	216977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4663	NC_011206	TGT	2	6	216983	216988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4664	NC_011206	CCGA	2	8	217014	217021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4665	NC_011206	AG	3	6	217078	217083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4666	NC_011206	GGAAC	2	10	217090	217099	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4667	NC_011206	AAG	2	6	217108	217113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4668	NC_011206	GC	3	6	217228	217233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4669	NC_011206	AG	3	6	217323	217328	50 %	0 %	50 %	0 %	198282375
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4677	NC_011206	AT	3	6	217527	217532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4681	NC_011206	CG	3	6	217785	217790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4682	NC_011206	GGC	2	6	217943	217948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282376
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4734	NC_011206	GCGG	2	8	220682	220689	0 %	0 %	75 %	25 %	198282379
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4740	NC_011206	CGGG	2	8	221217	221224	0 %	0 %	75 %	25 %	198282379
4741	NC_011206	CG	4	8	221252	221259	0 %	0 %	50 %	50 %	198282379
4742	NC_011206	GGC	2	6	221288	221293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282379
4743	NC_011206	GGC	3	9	221303	221311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282379
4744	NC_011206	AACCGC	2	12	221358	221369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198282379
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4869	NC_011206	CTC	2	6	229182	229187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282385
4870	NC_011206	CAT	2	6	229362	229367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282385
4871	NC_011206	TTC	2	6	229443	229448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282385
4872	NC_011206	GTC	3	9	229450	229458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282385
4873	NC_011206	CTG	2	6	229459	229464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282385
4874	NC_011206	TCG	2	6	229517	229522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282385
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4877	NC_011206	CTGG	2	8	229627	229634	0 %	25 %	50 %	25 %	198282385
4878	NC_011206	ATC	2	6	229639	229644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282385
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4889	NC_011206	GTC	2	6	230165	230170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282386
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4899	NC_011206	GCGGGA	2	12	230492	230503	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	198282386
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4990	NC_011206	GGT	2	6	234639	234644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282391
4991	NC_011206	CGT	2	6	234723	234728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4992	NC_011206	CCG	2	6	234737	234742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282391
4993	NC_011206	CTT	2	6	234783	234788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282391
4994	NC_011206	CCG	2	6	234879	234884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282391
4995	NC_011206	TGA	2	6	234968	234973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282391
4996	NC_011206	CTG	2	6	235003	235008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282391
4997	NC_011206	TGGG	2	8	235208	235215	0 %	25 %	75 %	0 %	198282391
4998	NC_011206	T	6	6	235252	235257	0 %	100 %	0 %	0 %	198282391
4999	NC_011206	GCA	2	6	235266	235271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282391
5000	NC_011206	GAT	2	6	235276	235281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282391

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