MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid APP7_A

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010942	GT	3	6	8	13	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010942	TTC	2	6	115	120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010942	TTA	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010942	GTC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010942	ACT	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010942	A	6	6	289	294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010942	T	6	6	324	329	0 %	100 %	0 %	0 %	190151410
8	NC_010942	T	7	7	334	340	0 %	100 %	0 %	0 %	190151410
9	NC_010942	TC	3	6	543	548	0 %	50 %	0 %	50 %	190151410
10	NC_010942	TTC	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010942	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010942	TTA	2	6	800	805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010942	ATAAAA	2	12	834	845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010942	A	7	7	842	848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010942	TAT	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010942	CAA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010942	CAAT	2	8	1124	1131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010942	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010942	CGT	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010942	T	6	6	1335	1340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010942	GTA	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010942	TTTTC	2	10	1480	1489	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010942	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010942	GTT	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010942	A	6	6	1629	1634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010942	T	6	6	1698	1703	0 %	100 %	0 %	0 %	190151411
27	NC_010942	TGAT	2	8	1798	1805	25 %	50 %	25 %	0 %	190151411
28	NC_010942	AT	3	6	1973	1978	50 %	50 %	0 %	0 %	190151411
29	NC_010942	T	6	6	2022	2027	0 %	100 %	0 %	0 %	190151411
30	NC_010942	TTC	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151411
31	NC_010942	CGTCAG	2	12	2070	2081	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190151411
32	NC_010942	ATG	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151411
33	NC_010942	T	6	6	2215	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	190151411
34	NC_010942	AAC	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151411
35	NC_010942	AATA	2	8	2291	2298	75 %	25 %	0 %	0 %	190151411
36	NC_010942	GCT	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151411
37	NC_010942	CGTT	2	8	2483	2490	0 %	50 %	25 %	25 %	190151411
38	NC_010942	T	6	6	2577	2582	0 %	100 %	0 %	0 %	190151411
39	NC_010942	TCA	2	6	2648	2653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151411
40	NC_010942	TG	3	6	2669	2674	0 %	50 %	50 %	0 %	190151411
41	NC_010942	TGA	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010942	CTT	2	6	2705	2710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010942	T	7	7	2709	2715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010942	TTGCT	2	10	2803	2812	0 %	60 %	20 %	20 %	190151412
45	NC_010942	TCT	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151412
46	NC_010942	TTG	2	6	2831	2836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151412
47	NC_010942	CTT	2	6	2844	2849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151412
48	NC_010942	ACC	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190151412
49	NC_010942	CCCGC	2	10	2939	2948	0 %	0 %	20 %	80 %	190151412
50	NC_010942	AGC	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151412
51	NC_010942	CCAA	2	8	3018	3025	50 %	0 %	0 %	50 %	190151412
52	NC_010942	T	6	6	3039	3044	0 %	100 %	0 %	0 %	190151412
53	NC_010942	AATA	2	8	3068	3075	75 %	25 %	0 %	0 %	190151412
54	NC_010942	TTTG	2	8	3096	3103	0 %	75 %	25 %	0 %	190151412
55	NC_010942	AGC	2	6	3236	3241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151412
56	NC_010942	TGT	2	6	3255	3260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151412
57	NC_010942	GCT	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151412
58	NC_010942	TAAC	2	8	3338	3345	50 %	25 %	0 %	25 %	190151412
59	NC_010942	CAA	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151412
60	NC_010942	CATA	2	8	3497	3504	50 %	25 %	0 %	25 %	190151412
61	NC_010942	CTG	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151412
62	NC_010942	TG	3	6	3566	3571	0 %	50 %	50 %	0 %	190151412
63	NC_010942	TTG	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151412
64	NC_010942	AAT	3	9	3659	3667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190151412
65	NC_010942	TAAA	2	8	3714	3721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010942	TTTG	2	8	3770	3777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010942	A	7	7	3784	3790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010942	AAAAC	2	10	3840	3849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010942	GGC	3	9	3893	3901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010942	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010942	ATC	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010942	ATC	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010942	TAAA	2	8	4069	4076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010942	AAT	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010942	T	6	6	4225	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010942	T	6	6	4292	4297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010942	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010942	ATTTAT	2	12	4367	4378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010942	TC	3	6	4387	4392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010942	TTC	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010942	TCT	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010942	TAA	2	6	4464	4469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010942	ACC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010942	TTA	2	6	4535	4540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010942	TTA	2	6	4643	4648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151413
86	NC_010942	CT	3	6	4723	4728	0 %	50 %	0 %	50 %	190151413
87	NC_010942	AGT	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151413
88	NC_010942	ATTT	2	8	4819	4826	25 %	75 %	0 %	0 %	190151413
89	NC_010942	T	6	6	4824	4829	0 %	100 %	0 %	0 %	190151414
90	NC_010942	GTTGA	2	10	4882	4891	20 %	40 %	40 %	0 %	190151414
91	NC_010942	C	6	6	4959	4964	0 %	0 %	0 %	100 %	190151414
92	NC_010942	TTC	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151414
93	NC_010942	T	6	6	5119	5124	0 %	100 %	0 %	0 %	190151414
94	NC_010942	CTG	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151414
95	NC_010942	CT	3	6	5242	5247	0 %	50 %	0 %	50 %	190151414
96	NC_010942	CTG	2	6	5265	5270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151414
97	NC_010942	TTGA	2	8	5342	5349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010942	T	6	6	5354	5359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010942	GTCG	2	8	5415	5422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010942	CCGT	2	8	5456	5463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010942	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010942	T	7	7	5519	5525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010942	GTT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010942	GTA	2	6	5614	5619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.