MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5

Total Repeats: 3196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009930	AGC	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009930	TGG	2	6	308	313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009930	AGC	2	6	323	328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009930	CGGATG	2	12	373	384	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009930	TCA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009930	AAGA	2	8	694	701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009930	TGA	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009930	G	6	6	807	812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009930	G	6	6	828	833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009930	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009930	CAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009930	A	7	7	957	963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009930	T	6	6	992	997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009930	T	6	6	1065	1070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009930	CTTA	2	8	1082	1089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009930	T	6	6	1119	1124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009930	AGTT	2	8	1156	1163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009930	TA	3	6	1339	1344	50 %	50 %	0 %	0 %	158340919
19	NC_009930	AAT	2	6	1395	1400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
20	NC_009930	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
21	NC_009930	G	6	6	1604	1609	0 %	0 %	100 %	0 %	158340919
22	NC_009930	AGT	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
23	NC_009930	AAT	2	6	1695	1700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
24	NC_009930	AGACA	2	10	1763	1772	60 %	0 %	20 %	20 %	158340919
25	NC_009930	T	6	6	1792	1797	0 %	100 %	0 %	0 %	158340919
26	NC_009930	CAA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340919
27	NC_009930	TTCA	2	8	1859	1866	25 %	50 %	0 %	25 %	158340919
28	NC_009930	ATA	2	6	1976	1981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
29	NC_009930	GAT	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
30	NC_009930	CCA	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340919
31	NC_009930	ATT	2	6	2026	2031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
32	NC_009930	T	6	6	2064	2069	0 %	100 %	0 %	0 %	158340919
33	NC_009930	CCGA	2	8	2072	2079	25 %	0 %	25 %	50 %	158340919
34	NC_009930	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340919
35	NC_009930	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
36	NC_009930	GTCT	2	8	2120	2127	0 %	50 %	25 %	25 %	158340919
37	NC_009930	ATA	2	6	2201	2206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
38	NC_009930	AGAC	2	8	2209	2216	50 %	0 %	25 %	25 %	158340919
39	NC_009930	TGA	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
40	NC_009930	ATAA	2	8	2236	2243	75 %	25 %	0 %	0 %	158340919
41	NC_009930	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340919
42	NC_009930	ATTA	2	8	2394	2401	50 %	50 %	0 %	0 %	158340919
43	NC_009930	TTATC	2	10	2539	2548	20 %	60 %	0 %	20 %	158340919
44	NC_009930	TTC	2	6	2555	2560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340919
45	NC_009930	GAT	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
46	NC_009930	GAT	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
47	NC_009930	AAG	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340919
48	NC_009930	AGA	2	6	2730	2735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340919
49	NC_009930	TC	3	6	2762	2767	0 %	50 %	0 %	50 %	158340919
50	NC_009930	CT	3	6	2846	2851	0 %	50 %	0 %	50 %	158340919
51	NC_009930	ATTT	2	8	2864	2871	25 %	75 %	0 %	0 %	158340919
52	NC_009930	TAC	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340919
53	NC_009930	AGC	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340919
54	NC_009930	AAG	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340919
55	NC_009930	TCA	2	6	2962	2967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340919
56	NC_009930	TGG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340919
57	NC_009930	TTC	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340919
58	NC_009930	ATT	2	6	3027	3032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
59	NC_009930	ATT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
60	NC_009930	TGGT	2	8	3159	3166	0 %	50 %	50 %	0 %	158340919
61	NC_009930	AATG	2	8	3169	3176	50 %	25 %	25 %	0 %	158340919
62	NC_009930	GA	3	6	3228	3233	50 %	0 %	50 %	0 %	158340919
63	NC_009930	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
64	NC_009930	ATA	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
65	NC_009930	A	6	6	3545	3550	100 %	0 %	0 %	0 %	158340920
66	NC_009930	CAA	2	6	3569	3574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340920
67	NC_009930	ACT	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340920
68	NC_009930	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009930	AGGG	2	8	3779	3786	25 %	0 %	75 %	0 %	158340921
70	NC_009930	GAC	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340921
71	NC_009930	ACCC	2	8	3804	3811	25 %	0 %	0 %	75 %	158340921
72	NC_009930	C	6	6	3895	3900	0 %	0 %	0 %	100 %	158340921
73	NC_009930	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340921
74	NC_009930	TCA	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340921
75	NC_009930	GTTT	2	8	4217	4224	0 %	75 %	25 %	0 %	158340921
76	NC_009930	TTA	2	6	4260	4265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009930	G	7	7	4350	4356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009930	TAAAA	2	10	4400	4409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009930	TTC	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009930	A	6	6	4468	4473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009930	T	6	6	4590	4595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009930	TGA	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009930	ATT	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009930	TTC	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340922
85	NC_009930	AAC	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
86	NC_009930	TCT	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340922
87	NC_009930	AGT	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340922
88	NC_009930	TGG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
89	NC_009930	TAT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
90	NC_009930	AGA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340922
91	NC_009930	AAC	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
92	NC_009930	AGA	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340922
93	NC_009930	TAAT	2	8	5354	5361	50 %	50 %	0 %	0 %	158340922
94	NC_009930	GTC	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340922
95	NC_009930	AAC	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
96	NC_009930	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
97	NC_009930	TC	3	6	5613	5618	0 %	50 %	0 %	50 %	158340922
98	NC_009930	CAAT	2	8	5638	5645	50 %	25 %	0 %	25 %	158340922
99	NC_009930	TTG	2	6	5657	5662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
100	NC_009930	A	6	6	5704	5709	100 %	0 %	0 %	0 %	158340922
101	NC_009930	TGA	2	6	5751	5756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340922
102	NC_009930	GCAT	2	8	5775	5782	25 %	25 %	25 %	25 %	158340922
103	NC_009930	TGA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340922
104	NC_009930	AATG	2	8	5895	5902	50 %	25 %	25 %	0 %	158340922
105	NC_009930	CAA	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
106	NC_009930	CAA	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
107	NC_009930	T	7	7	5982	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	158340922
108	NC_009930	ATT	2	6	6027	6032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
109	NC_009930	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340922
110	NC_009930	TGC	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340922
111	NC_009930	TAC	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340922
112	NC_009930	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
113	NC_009930	T	6	6	6565	6570	0 %	100 %	0 %	0 %	158340922
114	NC_009930	GGAT	2	8	6579	6586	25 %	25 %	50 %	0 %	158340922
115	NC_009930	TTA	2	6	6653	6658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
116	NC_009930	GTTT	2	8	6704	6711	0 %	75 %	25 %	0 %	158340922
117	NC_009930	TTG	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
118	NC_009930	GTT	2	6	6769	6774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
119	NC_009930	GATT	2	8	6800	6807	25 %	50 %	25 %	0 %	158340922
120	NC_009930	ATT	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
121	NC_009930	GGT	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
122	NC_009930	GTT	2	6	6925	6930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
123	NC_009930	AAC	2	6	6953	6958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
124	NC_009930	TGG	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
125	NC_009930	CTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340922
126	NC_009930	TGG	2	6	7059	7064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
127	NC_009930	GATTA	2	10	7077	7086	40 %	40 %	20 %	0 %	158340922
128	NC_009930	ACT	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340922
129	NC_009930	TGG	2	6	7095	7100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
130	NC_009930	TGG	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
131	NC_009930	AATG	2	8	7198	7205	50 %	25 %	25 %	0 %	158340922
132	NC_009930	TTA	2	6	7219	7224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
133	NC_009930	GGT	2	6	7234	7239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
134	NC_009930	A	6	6	7318	7323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009930	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009930	CAT	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340923
137	NC_009930	TCGT	2	8	7628	7635	0 %	50 %	25 %	25 %	158340923
138	NC_009930	CGTT	2	8	7648	7655	0 %	50 %	25 %	25 %	158340923
139	NC_009930	CT	3	6	7692	7697	0 %	50 %	0 %	50 %	158340923
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145	NC_009930	CAA	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340923
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269	NC_009930	TCAT	2	8	15183	15190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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273	NC_009930	TTA	2	6	15329	15334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_009930	TAT	2	6	21159	21164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340943
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405	NC_009930	T	6	6	21197	21202	0 %	100 %	0 %	0 %	158340943
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408	NC_009930	ACT	2	6	21287	21292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340943
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437	NC_009930	TGA	2	6	22397	22402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340943
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441	NC_009930	TA	3	6	22489	22494	50 %	50 %	0 %	0 %	158340943
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470	NC_009930	AAT	3	9	23771	23779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_009930	ATT	2	6	23793	23798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_009930	TAT	2	6	23799	23804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_009930	T	8	8	23823	23830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_009930	AACTA	2	10	23850	23859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
475	NC_009930	A	6	6	23905	23910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_009930	AAG	2	6	23924	23929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
477	NC_009930	TCA	2	6	24015	24020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_009930	A	6	6	24033	24038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_009930	TTG	2	6	24221	24226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_009930	TA	5	10	24426	24435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_009930	T	6	6	24455	24460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_009930	ACGGA	2	10	24509	24518	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_009930	TAC	2	6	24743	24748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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