MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 6298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009927	GT	3	6	5	10	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009927	GTA	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009927	GA	3	6	132	137	50 %	0 %	50 %	0 %	158339872
4	NC_009927	TCA	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339872
5	NC_009927	AAC	2	6	176	181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339872
6	NC_009927	TCA	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339872
7	NC_009927	ATT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339872
8	NC_009927	CAA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339872
9	NC_009927	GATG	2	8	536	543	25 %	25 %	50 %	0 %	158339872
10	NC_009927	TC	3	6	549	554	0 %	50 %	0 %	50 %	158339872
11	NC_009927	ACG	2	6	597	602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339872
12	NC_009927	AT	3	6	613	618	50 %	50 %	0 %	0 %	158339872
13	NC_009927	CAG	2	6	642	647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339872
14	NC_009927	ACG	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339872
15	NC_009927	CT	3	6	858	863	0 %	50 %	0 %	50 %	158339872
16	NC_009927	CAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339872
17	NC_009927	GA	3	6	1000	1005	50 %	0 %	50 %	0 %	158339872
18	NC_009927	AAT	2	6	1128	1133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339872
19	NC_009927	TGGA	2	8	1134	1141	25 %	25 %	50 %	0 %	158339872
20	NC_009927	TAT	2	6	1260	1265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009927	ATT	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339873
22	NC_009927	ATG	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339873
23	NC_009927	CAT	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339873
24	NC_009927	CAA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339873
25	NC_009927	AATT	2	8	1591	1598	50 %	50 %	0 %	0 %	158339873
26	NC_009927	T	6	6	1678	1683	0 %	100 %	0 %	0 %	158339873
27	NC_009927	GC	3	6	1853	1858	0 %	0 %	50 %	50 %	158339873
28	NC_009927	CCAA	2	8	1860	1867	50 %	0 %	0 %	50 %	158339873
29	NC_009927	T	6	6	2117	2122	0 %	100 %	0 %	0 %	158339874
30	NC_009927	AGG	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339874
31	NC_009927	GGA	2	6	2173	2178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339874
32	NC_009927	TGT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339874
33	NC_009927	GGC	2	6	2241	2246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339874
34	NC_009927	T	6	6	2255	2260	0 %	100 %	0 %	0 %	158339874
35	NC_009927	GCT	3	9	2293	2301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
36	NC_009927	GCA	2	6	2340	2345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339874
37	NC_009927	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339874
38	NC_009927	TTTGCC	2	12	2534	2545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158339874
39	NC_009927	CCA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339874
40	NC_009927	GAC	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339874
41	NC_009927	TGC	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
42	NC_009927	CTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
43	NC_009927	AGAT	2	8	2868	2875	50 %	25 %	25 %	0 %	158339874
44	NC_009927	TTC	2	6	2892	2897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339874
45	NC_009927	TGT	2	6	2947	2952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339874
46	NC_009927	CA	3	6	2980	2985	50 %	0 %	0 %	50 %	158339874
47	NC_009927	TCG	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339874
48	NC_009927	CGG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339874
49	NC_009927	CCT	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339874
50	NC_009927	GAT	2	6	3146	3151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339874
51	NC_009927	GCA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339874
52	NC_009927	CA	3	6	3465	3470	50 %	0 %	0 %	50 %	158339874
53	NC_009927	GGC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339874
54	NC_009927	T	6	6	3704	3709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009927	CA	3	6	3739	3744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009927	TTC	2	6	3797	3802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009927	GTC	2	6	3849	3854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009927	TAA	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339875
59	NC_009927	CAG	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009927	TC	3	6	4143	4148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009927	TGG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009927	GAG	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009927	GGT	2	6	4286	4291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009927	GAT	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
65	NC_009927	AAC	2	6	4372	4377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339876
66	NC_009927	CAG	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339876
67	NC_009927	CCTA	2	8	4434	4441	25 %	25 %	0 %	50 %	158339876
68	NC_009927	TGG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339876
69	NC_009927	CGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339876
70	NC_009927	TCTT	2	8	4686	4693	0 %	75 %	0 %	25 %	158339876
71	NC_009927	GGC	2	6	4694	4699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339876
72	NC_009927	ATCCT	2	10	4796	4805	20 %	40 %	0 %	40 %	158339876
73	NC_009927	GCAA	2	8	4813	4820	50 %	0 %	25 %	25 %	158339876
74	NC_009927	TGA	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
75	NC_009927	ATG	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
76	NC_009927	ACA	2	6	5123	5128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339876
77	NC_009927	TGA	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339876
78	NC_009927	ATGA	2	8	5236	5243	50 %	25 %	25 %	0 %	158339877
79	NC_009927	TTGA	2	8	5265	5272	25 %	50 %	25 %	0 %	158339877
80	NC_009927	T	7	7	5316	5322	0 %	100 %	0 %	0 %	158339877
81	NC_009927	AGC	2	6	5417	5422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009927	ACT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009927	ATT	2	6	5511	5516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339878
84	NC_009927	GTC	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339878
85	NC_009927	ACT	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339878
86	NC_009927	ACCA	2	8	5791	5798	50 %	0 %	0 %	50 %	158339878
87	NC_009927	GCC	2	6	5800	5805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158339878
88	NC_009927	CTG	3	9	5964	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339878
89	NC_009927	TAA	2	6	5982	5987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339878
90	NC_009927	GAC	2	6	6002	6007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339878
91	NC_009927	TCG	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339878
92	NC_009927	CAG	2	6	6098	6103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339878
93	NC_009927	TAGG	2	8	6105	6112	25 %	25 %	50 %	0 %	158339878
94	NC_009927	GAT	2	6	6140	6145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339878
95	NC_009927	CTTG	2	8	6170	6177	0 %	50 %	25 %	25 %	158339878
96	NC_009927	CAC	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339878
97	NC_009927	GGCT	2	8	6268	6275	0 %	25 %	50 %	25 %	158339878
98	NC_009927	CAG	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339878
99	NC_009927	TTC	2	6	6378	6383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339878
100	NC_009927	ATC	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339878
101	NC_009927	ACT	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339878
102	NC_009927	TTGAT	2	10	6709	6718	20 %	60 %	20 %	0 %	158339878
103	NC_009927	GCTGCA	2	12	6730	6741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158339878
104	NC_009927	CCA	2	6	6742	6747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158339878
105	NC_009927	GCCAA	2	10	6751	6760	40 %	0 %	20 %	40 %	158339878
106	NC_009927	TCC	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339878
107	NC_009927	AGA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339878
108	NC_009927	CAGA	2	8	6897	6904	50 %	0 %	25 %	25 %	158339878
109	NC_009927	CA	3	6	6909	6914	50 %	0 %	0 %	50 %	158339878
110	NC_009927	TC	3	6	6922	6927	0 %	50 %	0 %	50 %	158339878
111	NC_009927	CAA	2	6	6982	6987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339878
112	NC_009927	GAA	2	6	7003	7008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339878
113	NC_009927	GGAA	2	8	7078	7085	50 %	0 %	50 %	0 %	158339878
114	NC_009927	TTG	2	6	7086	7091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339878
115	NC_009927	CTC	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009927	CTG	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339879
117	NC_009927	AAT	2	6	7261	7266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339879
118	NC_009927	TGT	2	6	7324	7329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009927	ATA	3	9	7366	7374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009927	ATC	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339880
121	NC_009927	ATC	2	6	7444	7449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339880
122	NC_009927	AGG	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339880
123	NC_009927	TGGGA	2	10	7544	7553	20 %	20 %	60 %	0 %	158339880
124	NC_009927	GTG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339880
125	NC_009927	T	6	6	7620	7625	0 %	100 %	0 %	0 %	158339880
126	NC_009927	CTG	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339880
127	NC_009927	TGGC	2	8	7704	7711	0 %	25 %	50 %	25 %	158339880
128	NC_009927	GGA	2	6	7733	7738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339880
129	NC_009927	ATA	2	6	7748	7753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339880
130	NC_009927	CAA	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339880
131	NC_009927	GTT	2	6	7938	7943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339880
132	NC_009927	ATC	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339880
133	NC_009927	GCT	2	6	8001	8006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009927	TCT	2	6	8144	8149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009927	AG	4	8	8191	8198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009927	CAG	2	6	8352	8357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339882
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266	NC_009927	GGATGG	2	12	16219	16230	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_009927	CA	3	6	16264	16269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
268	NC_009927	GTA	2	6	16296	16301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_009927	AATC	2	8	16307	16314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
270	NC_009927	ACTG	2	8	16318	16325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
271	NC_009927	A	7	7	16342	16348	100 %	0 %	0 %	0 %	158339890
272	NC_009927	AAT	2	6	16357	16362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339890
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298	NC_009927	TTAA	2	8	17804	17811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_009927	CCAAT	2	10	17825	17834	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
300	NC_009927	TTACC	2	10	17845	17854	20 %	40 %	0 %	40 %	158339893
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385	NC_009927	ATT	2	6	22307	22312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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