MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 114291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009925	AATA	2	8	1	8	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009925	ATGA	2	8	39	46	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009925	ATTT	2	8	209	216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009925	TA	3	6	229	234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009925	ATT	2	6	305	310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009925	AAT	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009925	CAT	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009925	AAC	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009925	ATTAA	2	10	580	589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009925	AGT	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009925	ACC	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009925	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009925	TGT	3	9	732	740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009925	TTG	2	6	755	760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009925	TTG	2	6	794	799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009925	CCG	2	6	809	814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009925	TGTC	2	8	824	831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009925	GGT	2	6	858	863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009925	TCA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009925	TCG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009925	GGTA	2	8	963	970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009925	TTG	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009925	GAC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009925	CGG	2	6	1082	1087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009925	GCA	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009925	CGA	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009925	TTG	2	6	1150	1155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009925	GGAT	2	8	1181	1188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009925	AGT	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009925	AAC	2	6	1299	1304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009925	GGTTA	2	10	1366	1375	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009925	TGT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009925	TCT	2	6	1509	1514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009925	AT	3	6	1583	1588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009925	GCT	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009925	TGT	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333234
37	NC_009925	GCA	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333234
38	NC_009925	TCA	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333234
39	NC_009925	GCT	2	6	1815	1820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333234
40	NC_009925	AGT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333234
41	NC_009925	GTA	2	6	2026	2031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333234
42	NC_009925	GAT	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333234
43	NC_009925	CG	3	6	2052	2057	0 %	0 %	50 %	50 %	158333234
44	NC_009925	GCT	2	6	2088	2093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333234
45	NC_009925	TCT	2	6	2120	2125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333234
46	NC_009925	TCT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333234
47	NC_009925	CATC	2	8	2160	2167	25 %	25 %	0 %	50 %	158333234
48	NC_009925	GATC	2	8	2241	2248	25 %	25 %	25 %	25 %	158333234
49	NC_009925	ATAGG	2	10	2318	2327	40 %	20 %	40 %	0 %	158333234
50	NC_009925	ATG	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009925	CGA	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333235
52	NC_009925	AAT	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333235
53	NC_009925	GGT	2	6	2520	2525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333235
54	NC_009925	GC	3	6	2564	2569	0 %	0 %	50 %	50 %	158333235
55	NC_009925	AGG	2	6	2670	2675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333235
56	NC_009925	TGG	2	6	2720	2725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333235
57	NC_009925	AAC	2	6	2769	2774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333235
58	NC_009925	GAG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333235
59	NC_009925	AGA	2	6	3000	3005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333235
60	NC_009925	CGA	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333235
61	NC_009925	GCTC	2	8	3099	3106	0 %	25 %	25 %	50 %	158333235
62	NC_009925	TTA	2	6	3169	3174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158333235
63	NC_009925	GAC	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333235
64	NC_009925	AGG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333235
65	NC_009925	CAT	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333236
66	NC_009925	CGA	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333236
67	NC_009925	A	6	6	3323	3328	100 %	0 %	0 %	0 %	158333236
68	NC_009925	GAT	2	6	3341	3346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333236
69	NC_009925	TAT	2	6	3416	3421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158333236
70	NC_009925	TGA	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333236
71	NC_009925	AGG	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333236
72	NC_009925	CGG	2	6	3636	3641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333236
73	NC_009925	GGC	2	6	3657	3662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333236
74	NC_009925	ACC	2	6	3701	3706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333236
75	NC_009925	GAA	2	6	3734	3739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333236
76	NC_009925	GCGATA	2	12	3858	3869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158333236
77	NC_009925	GCGG	2	8	3884	3891	0 %	0 %	75 %	25 %	158333236
78	NC_009925	TGG	2	6	3910	3915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333236
79	NC_009925	GCA	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333236
80	NC_009925	GGT	2	6	3973	3978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333236
81	NC_009925	ATCA	2	8	4183	4190	50 %	25 %	0 %	25 %	158333237
82	NC_009925	G	6	6	4230	4235	0 %	0 %	100 %	0 %	158333237
83	NC_009925	AAC	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333237
84	NC_009925	CAG	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333237
85	NC_009925	C	6	6	4409	4414	0 %	0 %	0 %	100 %	158333237
86	NC_009925	TGA	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333237
87	NC_009925	CGC	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158333237
88	NC_009925	CAG	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333237
89	NC_009925	TGAT	2	8	4703	4710	25 %	50 %	25 %	0 %	158333237
90	NC_009925	ATTC	2	8	4715	4722	25 %	50 %	0 %	25 %	158333237
91	NC_009925	CTG	2	6	4774	4779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333237
92	NC_009925	CTG	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333237
93	NC_009925	TTG	2	6	4877	4882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333237
94	NC_009925	GGC	2	6	4935	4940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333237
95	NC_009925	G	6	6	5066	5071	0 %	0 %	100 %	0 %	158333237
96	NC_009925	GTCC	2	8	5114	5121	0 %	25 %	25 %	50 %	158333237
97	NC_009925	GCTC	2	8	5137	5144	0 %	25 %	25 %	50 %	158333237
98	NC_009925	TG	3	6	5158	5163	0 %	50 %	50 %	0 %	158333237
99	NC_009925	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158333237
100	NC_009925	TGC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333237
101	NC_009925	GGC	2	6	5238	5243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333237
102	NC_009925	CGG	2	6	5252	5257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333237
103	NC_009925	AGGA	2	8	5282	5289	50 %	0 %	50 %	0 %	158333237
104	NC_009925	GGT	2	6	5313	5318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333237
105	NC_009925	ACC	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333237
106	NC_009925	CAG	2	6	5383	5388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333237
107	NC_009925	GTG	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333237
108	NC_009925	TGGG	2	8	5554	5561	0 %	25 %	75 %	0 %	158333237
109	NC_009925	GTG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333237
110	NC_009925	AGTC	2	8	5701	5708	25 %	25 %	25 %	25 %	158333237
111	NC_009925	TGC	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333237
112	NC_009925	AAC	2	6	5753	5758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333237
113	NC_009925	CGA	2	6	5932	5937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333237
114	NC_009925	GTT	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333237
115	NC_009925	GGC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333237
116	NC_009925	C	6	6	5987	5992	0 %	0 %	0 %	100 %	158333237
117	NC_009925	GAT	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333238
118	NC_009925	T	7	7	6083	6089	0 %	100 %	0 %	0 %	158333238
119	NC_009925	CAGC	2	8	6177	6184	25 %	0 %	25 %	50 %	158333238
120	NC_009925	CG	3	6	6199	6204	0 %	0 %	50 %	50 %	158333238
121	NC_009925	G	6	6	6266	6271	0 %	0 %	100 %	0 %	158333238
122	NC_009925	GGA	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333238
123	NC_009925	CGA	2	6	6358	6363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333238
124	NC_009925	CAC	2	6	6433	6438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333238
125	NC_009925	GAT	2	6	6443	6448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333238
126	NC_009925	GGC	2	6	6635	6640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333238
127	NC_009925	GGA	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333238
128	NC_009925	T	6	6	6656	6661	0 %	100 %	0 %	0 %	158333238
129	NC_009925	G	6	6	6704	6709	0 %	0 %	100 %	0 %	158333238
130	NC_009925	GAT	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333238
131	NC_009925	GGC	2	6	6769	6774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333238
132	NC_009925	GCT	2	6	6809	6814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333238
133	NC_009925	ATT	2	6	6831	6836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158333238
134	NC_009925	TG	3	6	6858	6863	0 %	50 %	50 %	0 %	158333238
135	NC_009925	GAC	2	6	6876	6881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333238
136	NC_009925	TACT	2	8	6930	6937	25 %	50 %	0 %	25 %	158333238
137	NC_009925	AGA	2	6	6938	6943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333238
138	NC_009925	TTC	2	6	6947	6952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333238
139	NC_009925	GGT	3	9	6956	6964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333238
140	NC_009925	GGT	2	6	6971	6976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333238
141	NC_009925	TCC	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158333238
142	NC_009925	TG	3	6	7106	7111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009925	GCT	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009925	AAT	2	6	7146	7151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009925	T	7	7	7164	7170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009925	T	8	8	7234	7241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009925	AGG	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009925	CT	3	6	7329	7334	0 %	50 %	0 %	50 %	158333239
149	NC_009925	TGT	2	6	7358	7363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333239
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161	NC_009925	ATT	2	6	7848	7853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158333239
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168	NC_009925	ATCA	2	8	8125	8132	50 %	25 %	0 %	25 %	158333240
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170	NC_009925	ATG	2	6	8190	8195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333240
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178	NC_009925	AT	4	8	8739	8746	50 %	50 %	0 %	0 %	158333241
179	NC_009925	CTG	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333241
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246	NC_009925	TCAG	2	8	12834	12841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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257	NC_009925	GAT	2	6	13257	13262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333246
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263	NC_009925	CT	3	6	13975	13980	0 %	50 %	0 %	50 %	158333246
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265	NC_009925	TC	3	6	14087	14092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
266	NC_009925	TGT	2	6	14198	14203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333247
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268	NC_009925	GA	3	6	14265	14270	50 %	0 %	50 %	0 %	158333247
269	NC_009925	CTT	3	9	14319	14327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333247
270	NC_009925	AAT	2	6	14380	14385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333247
271	NC_009925	ATC	2	6	14420	14425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333247
272	NC_009925	TGC	2	6	14529	14534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333247
273	NC_009925	TGC	2	6	14546	14551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333247
274	NC_009925	CGTC	2	8	14618	14625	0 %	25 %	25 %	50 %	158333247
275	NC_009925	GTT	2	6	14682	14687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333247
276	NC_009925	TGT	2	6	14735	14740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333247
277	NC_009925	TCT	2	6	14810	14815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333247
278	NC_009925	GCAT	2	8	15002	15009	25 %	25 %	25 %	25 %	158333247
279	NC_009925	TAC	2	6	15022	15027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333247
280	NC_009925	AAC	2	6	15030	15035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333247
281	NC_009925	AAT	2	6	15083	15088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333247
282	NC_009925	CA	3	6	15295	15300	50 %	0 %	0 %	50 %	158333247
283	NC_009925	CAG	2	6	15397	15402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333247
284	NC_009925	CAT	2	6	15460	15465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333247
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287	NC_009925	AAT	2	6	15556	15561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333247
288	NC_009925	TGA	2	6	15710	15715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333247
289	NC_009925	ACC	2	6	15731	15736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333247
290	NC_009925	GAC	2	6	15767	15772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333247
291	NC_009925	CTG	3	9	15795	15803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333247
292	NC_009925	ACA	2	6	15813	15818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333247
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294	NC_009925	ACCAC	2	10	15843	15852	40 %	0 %	0 %	60 %	158333247
295	NC_009925	ATC	2	6	15853	15858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333247
296	NC_009925	CTG	2	6	15907	15912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333247
297	NC_009925	TCGC	2	8	15957	15964	0 %	25 %	25 %	50 %	158333247
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299	NC_009925	GAGAA	2	10	16174	16183	60 %	0 %	40 %	0 %	158333247
300	NC_009925	C	8	8	16185	16192	0 %	0 %	0 %	100 %	158333247
301	NC_009925	CAC	2	6	16275	16280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333247
302	NC_009925	TCG	2	6	16310	16315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333247
303	NC_009925	TC	3	6	16334	16339	0 %	50 %	0 %	50 %	158333247
304	NC_009925	TCA	3	9	16361	16369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333247
305	NC_009925	CCA	2	6	16403	16408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
306	NC_009925	GTC	2	6	16417	16422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_009925	CAG	2	6	16617	16622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333248
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351	NC_009925	AAT	2	6	19262	19267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_009925	GAACA	2	10	19278	19287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
353	NC_009925	ATT	2	6	19292	19297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_009925	ATT	2	6	19309	19314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
355	NC_009925	AGAA	2	8	19344	19351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
356	NC_009925	ACA	2	6	19371	19376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
357	NC_009925	AG	3	6	19508	19513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_009925	AGCTAA	2	12	21057	21068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158333251
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391	NC_009925	T	6	6	21660	21665	0 %	100 %	0 %	0 %	158333251
392	NC_009925	CAG	2	6	21808	21813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_009925	TGGG	2	8	21831	21838	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
394	NC_009925	TGC	2	6	21888	21893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_009925	AGC	2	6	21921	21926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_009925	TTGA	2	8	21933	21940	25 %	50 %	25 %	0 %	158333252
397	NC_009925	GCC	2	6	21963	21968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158333252
398	NC_009925	ATCCC	2	10	21970	21979	20 %	20 %	0 %	60 %	158333252
399	NC_009925	AG	3	6	21983	21988	50 %	0 %	50 %	0 %	158333252
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403	NC_009925	CTT	2	6	22288	22293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333252
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