MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 70799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	TTAT	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009922	AT	4	8	7	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009922	ATT	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009922	AGG	2	6	36	41	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009922	A	6	6	77	82	100 %	0 %	0 %	0 %	158319060
6	NC_009922	TTAAT	2	10	86	95	40 %	60 %	0 %	0 %	158319060
7	NC_009922	ACAA	2	8	252	259	75 %	0 %	0 %	25 %	158319060
8	NC_009922	AGA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
9	NC_009922	A	6	6	302	307	100 %	0 %	0 %	0 %	158319060
10	NC_009922	GAA	2	6	319	324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
11	NC_009922	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
12	NC_009922	AAT	2	6	385	390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319060
13	NC_009922	CGTT	2	8	416	423	0 %	50 %	25 %	25 %	158319060
14	NC_009922	CTT	2	6	455	460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
15	NC_009922	GGT	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319060
16	NC_009922	ATGC	2	8	541	548	25 %	25 %	25 %	25 %	158319060
17	NC_009922	TTC	2	6	600	605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
18	NC_009922	TTA	2	6	626	631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319060
19	NC_009922	TAG	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319060
20	NC_009922	AG	3	6	726	731	50 %	0 %	50 %	0 %	158319060
21	NC_009922	TTC	2	6	745	750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
22	NC_009922	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319060
23	NC_009922	TA	3	6	914	919	50 %	50 %	0 %	0 %	158319060
24	NC_009922	A	7	7	976	982	100 %	0 %	0 %	0 %	158319060
25	NC_009922	TTG	2	6	1025	1030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319060
26	NC_009922	TTC	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
27	NC_009922	GTT	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319060
28	NC_009922	AAAT	2	8	1149	1156	75 %	25 %	0 %	0 %	158319060
29	NC_009922	ATA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319060
30	NC_009922	AGA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
31	NC_009922	AAGAA	2	10	1186	1195	80 %	0 %	20 %	0 %	158319060
32	NC_009922	TATC	2	8	1231	1238	25 %	50 %	0 %	25 %	158319060
33	NC_009922	AG	3	6	1240	1245	50 %	0 %	50 %	0 %	158319060
34	NC_009922	CCTA	2	8	1260	1267	25 %	25 %	0 %	50 %	158319060
35	NC_009922	ACA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319060
36	NC_009922	ATGC	2	8	1309	1316	25 %	25 %	25 %	25 %	158319060
37	NC_009922	A	6	6	1322	1327	100 %	0 %	0 %	0 %	158319060
38	NC_009922	GAC	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319060
39	NC_009922	A	6	6	1364	1369	100 %	0 %	0 %	0 %	158319060
40	NC_009922	GT	3	6	1421	1426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009922	A	6	6	1458	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009922	T	7	7	1464	1470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009922	TGTT	2	8	1472	1479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009922	CTA	3	9	1576	1584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009922	TAC	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009922	GTT	2	6	1596	1601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009922	ATT	2	6	1602	1607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009922	T	6	6	1616	1621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009922	TTC	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319061
50	NC_009922	CAT	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319061
51	NC_009922	AGA	2	6	1827	1832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
52	NC_009922	TCG	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319061
53	NC_009922	ATT	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
54	NC_009922	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
55	NC_009922	TGC	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319061
56	NC_009922	AGA	3	9	2004	2012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
57	NC_009922	AGA	2	6	2124	2129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
58	NC_009922	TAA	2	6	2202	2207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319061
59	NC_009922	GAA	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
60	NC_009922	TTTA	2	8	2307	2314	25 %	75 %	0 %	0 %	158319061
61	NC_009922	CTT	2	6	2344	2349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319061
62	NC_009922	ATC	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319061
63	NC_009922	TTA	2	6	2425	2430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
64	NC_009922	GA	3	6	2440	2445	50 %	0 %	50 %	0 %	158319061
65	NC_009922	CTT	2	6	2447	2452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319061
66	NC_009922	GAAG	2	8	2460	2467	50 %	0 %	50 %	0 %	158319061
67	NC_009922	AAT	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319061
68	NC_009922	GAG	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319061
69	NC_009922	TTGA	2	8	2557	2564	25 %	50 %	25 %	0 %	158319061
70	NC_009922	TGA	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319061
71	NC_009922	GAT	2	6	2632	2637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319061
72	NC_009922	TAT	2	6	2679	2684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
73	NC_009922	ACAAT	2	10	2702	2711	60 %	20 %	0 %	20 %	158319061
74	NC_009922	ATC	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319061
75	NC_009922	ATA	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009922	GTA	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009922	A	7	7	2851	2857	100 %	0 %	0 %	0 %	158319062
78	NC_009922	GAAA	2	8	3000	3007	75 %	0 %	25 %	0 %	158319062
79	NC_009922	AGG	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009922	GAT	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
81	NC_009922	AGTTAA	2	12	3249	3260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319063
82	NC_009922	AATCG	2	10	3352	3361	40 %	20 %	20 %	20 %	158319063
83	NC_009922	AAGC	2	8	3431	3438	50 %	0 %	25 %	25 %	158319063
84	NC_009922	TAAAG	2	10	3451	3460	60 %	20 %	20 %	0 %	158319063
85	NC_009922	A	6	6	3509	3514	100 %	0 %	0 %	0 %	158319063
86	NC_009922	AAG	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319063
87	NC_009922	TTA	2	6	3676	3681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319063
88	NC_009922	ATA	2	6	3696	3701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319063
89	NC_009922	AGAT	2	8	3750	3757	50 %	25 %	25 %	0 %	158319063
90	NC_009922	TGC	3	9	3781	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319063
91	NC_009922	TA	3	6	3807	3812	50 %	50 %	0 %	0 %	158319063
92	NC_009922	GTTAAA	2	12	3911	3922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319063
93	NC_009922	ATG	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
94	NC_009922	AAAGA	2	10	3947	3956	80 %	0 %	20 %	0 %	158319063
95	NC_009922	AG	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	158319063
96	NC_009922	TGA	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
97	NC_009922	CTTT	2	8	4103	4110	0 %	75 %	0 %	25 %	158319063
98	NC_009922	AGCTGG	2	12	4122	4133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158319063
99	NC_009922	ATT	2	6	4209	4214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319063
100	NC_009922	ACC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319063
101	NC_009922	ATG	2	6	4259	4264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
102	NC_009922	AGA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319063
103	NC_009922	TAAT	2	8	4331	4338	50 %	50 %	0 %	0 %	158319063
104	NC_009922	TAA	2	6	4383	4388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009922	AGG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319064
106	NC_009922	AAG	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319064
107	NC_009922	TAT	2	6	4550	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319064
108	NC_009922	GAA	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319064
109	NC_009922	TTA	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319064
110	NC_009922	GAA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319064
111	NC_009922	A	6	6	4616	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	158319064
112	NC_009922	TCAAA	2	10	4637	4646	60 %	20 %	0 %	20 %	158319064
113	NC_009922	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	158319064
114	NC_009922	AGAAC	2	10	4736	4745	60 %	0 %	20 %	20 %	158319064
115	NC_009922	AT	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	158319064
116	NC_009922	GCT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009922	AGA	2	6	4793	4798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009922	TTTAT	2	10	4814	4823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009922	TTA	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009922	T	6	6	4862	4867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009922	AGG	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009922	A	6	6	4879	4884	100 %	0 %	0 %	0 %	158319065
123	NC_009922	TA	3	6	4971	4976	50 %	50 %	0 %	0 %	158319065
124	NC_009922	AAC	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319065
125	NC_009922	CAT	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319065
126	NC_009922	GTT	2	6	5019	5024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319065
127	NC_009922	ATA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319065
128	NC_009922	AGG	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319065
129	NC_009922	AGA	2	6	5084	5089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319065
130	NC_009922	TACT	2	8	5173	5180	25 %	50 %	0 %	25 %	158319065
131	NC_009922	GGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319065
132	NC_009922	GGT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319065
133	NC_009922	GGA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319065
134	NC_009922	TGG	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319065
135	NC_009922	TGT	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319065
136	NC_009922	ATT	2	6	5358	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319065
137	NC_009922	AAC	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319065
138	NC_009922	TAT	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319065
139	NC_009922	GAA	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319065
140	NC_009922	GA	3	6	5462	5467	50 %	0 %	50 %	0 %	158319065
141	NC_009922	TAC	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319065
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145	NC_009922	GAAAAA	2	12	5625	5636	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	158319065
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148	NC_009922	AAAAG	2	10	5804	5813	80 %	0 %	20 %	0 %	158319065
149	NC_009922	T	6	6	5822	5827	0 %	100 %	0 %	0 %	158319065
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154	NC_009922	A	7	7	6050	6056	100 %	0 %	0 %	0 %	158319065
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163	NC_009922	A	6	6	6504	6509	100 %	0 %	0 %	0 %	158319065
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170	NC_009922	A	6	6	6802	6807	100 %	0 %	0 %	0 %	158319066
171	NC_009922	A	6	6	6814	6819	100 %	0 %	0 %	0 %	158319066
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260	NC_009922	AGA	2	6	10105	10110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319068
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267	NC_009922	GA	3	6	10359	10364	50 %	0 %	50 %	0 %	158319069
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269	NC_009922	TA	3	6	10400	10405	50 %	50 %	0 %	0 %	158319069
270	NC_009922	TAAA	2	8	10433	10440	75 %	25 %	0 %	0 %	158319069
271	NC_009922	CTT	2	6	10472	10477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319069
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