MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 70799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009922	TGA	2	6	502078	502083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_009922	AATT	2	8	502162	502169	50 %	50 %	0 %	0 %	158319497
11003	NC_009922	GGATAA	2	12	502190	502201	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158319497
11004	NC_009922	TCC	2	6	502203	502208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319497
11005	NC_009922	T	6	6	502236	502241	0 %	100 %	0 %	0 %	158319497
11006	NC_009922	TGA	2	6	502271	502276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319497
11007	NC_009922	TC	3	6	502314	502319	0 %	50 %	0 %	50 %	158319497
11008	NC_009922	AG	3	6	502345	502350	50 %	0 %	50 %	0 %	158319497
11009	NC_009922	GAAT	2	8	502384	502391	50 %	25 %	25 %	0 %	158319497
11010	NC_009922	ATG	2	6	502399	502404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319497
11011	NC_009922	CAGA	2	8	502423	502430	50 %	0 %	25 %	25 %	158319497
11012	NC_009922	CGG	2	6	502463	502468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319497
11013	NC_009922	ATTA	2	8	502472	502479	50 %	50 %	0 %	0 %	158319497
11014	NC_009922	AGA	2	6	502520	502525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319497
11015	NC_009922	GGT	2	6	502539	502544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319497
11016	NC_009922	ATT	2	6	502580	502585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319497
11017	NC_009922	AGC	2	6	502656	502661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319497
11018	NC_009922	AT	3	6	502685	502690	50 %	50 %	0 %	0 %	158319497
11019	NC_009922	TAG	2	6	502696	502701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319497
11020	NC_009922	A	6	6	502722	502727	100 %	0 %	0 %	0 %	158319497
11021	NC_009922	AGG	2	6	502763	502768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319497
11022	NC_009922	ACAG	2	8	502794	502801	50 %	0 %	25 %	25 %	158319497
11023	NC_009922	TGT	2	6	502808	502813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319497
11024	NC_009922	ATC	2	6	502845	502850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319497
11025	NC_009922	CAA	2	6	502883	502888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319497
11026	NC_009922	TATAT	2	10	502922	502931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_009922	T	7	7	502994	503000	0 %	100 %	0 %	0 %	158319498
11028	NC_009922	CTATA	2	10	503098	503107	40 %	40 %	0 %	20 %	158319498
11029	NC_009922	AGA	2	6	503121	503126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319498
11030	NC_009922	TTCGG	2	10	503173	503182	0 %	40 %	40 %	20 %	158319498
11031	NC_009922	A	6	6	503277	503282	100 %	0 %	0 %	0 %	158319498
11032	NC_009922	TGA	2	6	503300	503305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319498
11033	NC_009922	TTA	2	6	503330	503335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319498
11034	NC_009922	AAG	2	6	503519	503524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319498
11035	NC_009922	CAT	2	6	503619	503624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319498
11036	NC_009922	GGTT	2	8	503666	503673	0 %	50 %	50 %	0 %	158319498
11037	NC_009922	ACC	2	6	503863	503868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319498
11038	NC_009922	AGA	2	6	503886	503891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319498
11039	NC_009922	ATT	2	6	503903	503908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319498
11040	NC_009922	AAT	2	6	503961	503966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_009922	AT	3	6	503965	503970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_009922	TACA	2	8	503979	503986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11043	NC_009922	TA	3	6	503992	503997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_009922	AGG	2	6	504010	504015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_009922	TAT	2	6	504019	504024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319499
11046	NC_009922	TTAGCA	2	12	504036	504047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319499
11047	NC_009922	CAT	2	6	504085	504090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319499
11048	NC_009922	GTA	2	6	504129	504134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319499
11049	NC_009922	G	6	6	504193	504198	0 %	0 %	100 %	0 %	158319499
11050	NC_009922	A	7	7	504223	504229	100 %	0 %	0 %	0 %	158319499
11051	NC_009922	GCA	2	6	504248	504253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319499
11052	NC_009922	A	6	6	504259	504264	100 %	0 %	0 %	0 %	158319499
11053	NC_009922	TGT	2	6	504283	504288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319499
11054	NC_009922	A	6	6	504304	504309	100 %	0 %	0 %	0 %	158319499
11055	NC_009922	ATT	2	6	504333	504338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319499
11056	NC_009922	GAA	2	6	504340	504345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319499
11057	NC_009922	TAA	2	6	504381	504386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319499
11058	NC_009922	A	6	6	504499	504504	100 %	0 %	0 %	0 %	158319499
11059	NC_009922	GCT	2	6	504518	504523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319499
11060	NC_009922	GAA	2	6	504578	504583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319499
11061	NC_009922	AATA	2	8	504602	504609	75 %	25 %	0 %	0 %	158319499
11062	NC_009922	TGA	2	6	504622	504627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319499
11063	NC_009922	GAA	2	6	504677	504682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319499
11064	NC_009922	GAA	2	6	504719	504724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319499
11065	NC_009922	A	6	6	504741	504746	100 %	0 %	0 %	0 %	158319499
11066	NC_009922	GTTA	2	8	504760	504767	25 %	50 %	25 %	0 %	158319499
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11069	NC_009922	TCGAA	2	10	504907	504916	40 %	20 %	20 %	20 %	158319499
11070	NC_009922	TGT	2	6	504939	504944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319499
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11072	NC_009922	AT	3	6	505019	505024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_009922	ATT	2	6	505068	505073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_009922	ATTTT	2	10	505145	505154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_009922	T	6	6	505151	505156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_009922	GAT	2	6	505160	505165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_009922	GAA	2	6	505169	505174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_009922	AAT	2	6	505220	505225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_009922	AT	3	6	505235	505240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_009922	AAT	2	6	505260	505265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_009922	TAT	2	6	505266	505271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_009922	AGA	2	6	505275	505280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_009922	AAT	2	6	505286	505291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_009922	AATT	2	8	505301	505308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_009922	GATG	2	8	505311	505318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_009922	GA	5	10	505321	505330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_009922	ATG	2	6	505333	505338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319500
11088	NC_009922	CAGA	2	8	505340	505347	50 %	0 %	25 %	25 %	158319500
11089	NC_009922	GTT	2	6	505351	505356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319500
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11091	NC_009922	GAATTG	2	12	505390	505401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319500
11092	NC_009922	GAG	2	6	505413	505418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319500
11093	NC_009922	AGA	2	6	505515	505520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319500
11094	NC_009922	ATC	2	6	505561	505566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319500
11095	NC_009922	GAA	2	6	505570	505575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319500
11096	NC_009922	TGT	2	6	505749	505754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319500
11097	NC_009922	G	6	6	505816	505821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_009922	GAA	2	6	505837	505842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319501
11099	NC_009922	AAG	2	6	505869	505874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319501
11100	NC_009922	TTACG	2	10	505932	505941	20 %	40 %	20 %	20 %	158319501
11101	NC_009922	CAA	2	6	505951	505956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319501
11102	NC_009922	AGA	2	6	505962	505967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319501
11103	NC_009922	TAT	2	6	506010	506015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319501
11104	NC_009922	AGA	2	6	506091	506096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319501
11105	NC_009922	AGA	2	6	506109	506114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319501
11106	NC_009922	TAT	2	6	506148	506153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319501
11107	NC_009922	ATA	2	6	506384	506389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319501
11108	NC_009922	TCA	2	6	506456	506461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319501
11109	NC_009922	TCA	2	6	506463	506468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319501
11110	NC_009922	ATT	2	6	506511	506516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319501
11111	NC_009922	TGG	2	6	506535	506540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319501
11112	NC_009922	ATG	2	6	506656	506661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319501
11113	NC_009922	ACT	2	6	506710	506715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319501
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11115	NC_009922	TGA	2	6	506811	506816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319501
11116	NC_009922	ATTGCA	2	12	506839	506850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158319501
11117	NC_009922	A	7	7	506850	506856	100 %	0 %	0 %	0 %	158319501
11118	NC_009922	GAA	2	6	506883	506888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319501
11119	NC_009922	ATC	2	6	506896	506901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319501
11120	NC_009922	TCA	2	6	506951	506956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319501
11121	NC_009922	CATT	2	8	507032	507039	25 %	50 %	0 %	25 %	158319501
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11123	NC_009922	GAT	2	6	507136	507141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319501
11124	NC_009922	TCC	2	6	507192	507197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319501
11125	NC_009922	GGT	2	6	507202	507207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319501
11126	NC_009922	ATCG	2	8	507220	507227	25 %	25 %	25 %	25 %	158319501
11127	NC_009922	TGA	2	6	507230	507235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319501
11128	NC_009922	ATC	2	6	507299	507304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319501
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11130	NC_009922	AAAAGA	2	12	507401	507412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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11132	NC_009922	ATAGT	2	10	507453	507462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_009922	AAT	2	6	507518	507523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11139	NC_009922	GCG	2	6	507805	507810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11143	NC_009922	CGC	2	6	508103	508108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11144	NC_009922	AGG	2	6	508172	508177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11148	NC_009922	AGG	2	6	508388	508393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11153	NC_009922	CCTTC	2	10	508699	508708	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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11155	NC_009922	GTC	2	6	508739	508744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11162	NC_009922	AC	3	6	509071	509076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11163	NC_009922	AGG	2	6	509130	509135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11164	NC_009922	CCT	2	6	509212	509217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11212	NC_009922	T	9	9	512584	512592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11215	NC_009922	A	6	6	512683	512688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11216	NC_009922	TTAAAT	3	18	512728	512745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11225	NC_009922	TA	3	6	512953	512958	50 %	50 %	0 %	0 %	158319502
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11232	NC_009922	GAA	2	6	513148	513153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319502
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11235	NC_009922	GAAT	2	8	513353	513360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_009922	AGA	3	9	513456	513464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_009922	AGAA	2	8	513548	513555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_009922	AAG	2	6	513559	513564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11239	NC_009922	CTT	3	9	513585	513593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11240	NC_009922	ATTTT	2	10	513667	513676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11241	NC_009922	GAG	2	6	513690	513695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11242	NC_009922	A	6	6	513772	513777	100 %	0 %	0 %	0 %	158319503
11243	NC_009922	GAA	2	6	513832	513837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319503
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11247	NC_009922	A	6	6	513989	513994	100 %	0 %	0 %	0 %	158319503
11248	NC_009922	ACT	2	6	514008	514013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319503
11249	NC_009922	ACC	2	6	514050	514055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319503
11250	NC_009922	AGGA	2	8	514112	514119	50 %	0 %	50 %	0 %	158319503
11251	NC_009922	TGG	2	6	514132	514137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319503
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11253	NC_009922	GAGAA	2	10	514185	514194	60 %	0 %	40 %	0 %	158319503
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