MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009633	ATGA	2	8	716352	716359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_009633	ATT	2	6	716370	716375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_009633	GAG	2	6	716389	716394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_009633	A	6	6	716511	716516	100 %	0 %	0 %	0 %	150388513
16005	NC_009633	ACT	2	6	716519	716524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388513
16006	NC_009633	ATG	2	6	716542	716547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388513
16007	NC_009633	GAA	2	6	716577	716582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388513
16008	NC_009633	GCA	2	6	716658	716663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388513
16009	NC_009633	TTG	2	6	716761	716766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388513
16010	NC_009633	TA	3	6	716778	716783	50 %	50 %	0 %	0 %	150388513
16011	NC_009633	A	7	7	716794	716800	100 %	0 %	0 %	0 %	150388513
16012	NC_009633	AAGT	2	8	716830	716837	50 %	25 %	25 %	0 %	150388513
16013	NC_009633	ATT	2	6	716853	716858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388513
16014	NC_009633	ATT	2	6	716916	716921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388513
16015	NC_009633	TGG	2	6	716963	716968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388513
16016	NC_009633	TCT	2	6	717036	717041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388513
16017	NC_009633	TGA	2	6	717062	717067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388513
16018	NC_009633	TGA	2	6	717125	717130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388513
16019	NC_009633	ATA	2	6	717154	717159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388513
16020	NC_009633	GA	3	6	717292	717297	50 %	0 %	50 %	0 %	150388513
16021	NC_009633	T	6	6	717313	717318	0 %	100 %	0 %	0 %	150388513
16022	NC_009633	TGT	2	6	717350	717355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388513
16023	NC_009633	TGA	2	6	717368	717373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388513
16024	NC_009633	AGA	2	6	717392	717397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388513
16025	NC_009633	GAA	2	6	717414	717419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388513
16026	NC_009633	GCC	2	6	717444	717449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150388513
16027	NC_009633	A	7	7	717466	717472	100 %	0 %	0 %	0 %	150388513
16028	NC_009633	AGT	2	6	717491	717496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388513
16029	NC_009633	GCT	2	6	717513	717518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388513
16030	NC_009633	GAT	2	6	717714	717719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388513
16031	NC_009633	TGG	3	9	717737	717745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388513
16032	NC_009633	GGAG	2	8	717770	717777	25 %	0 %	75 %	0 %	150388513
16033	NC_009633	TTG	2	6	717835	717840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388513
16034	NC_009633	CAG	2	6	717868	717873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388513
16035	NC_009633	AGGG	2	8	717877	717884	25 %	0 %	75 %	0 %	150388513
16036	NC_009633	TA	3	6	717914	717919	50 %	50 %	0 %	0 %	150388513
16037	NC_009633	TAT	2	6	717928	717933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388513
16038	NC_009633	AATC	2	8	718019	718026	50 %	25 %	0 %	25 %	150388513
16039	NC_009633	ATC	2	6	718048	718053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388513
16040	NC_009633	TTA	2	6	718108	718113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388513
16041	NC_009633	TC	3	6	718184	718189	0 %	50 %	0 %	50 %	150388513
16042	NC_009633	GCA	2	6	718233	718238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388513
16043	NC_009633	AAT	2	6	718260	718265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388513
16044	NC_009633	C	7	7	718285	718291	0 %	0 %	0 %	100 %	150388513
16045	NC_009633	ATT	2	6	718299	718304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388513
16046	NC_009633	GTG	2	6	718320	718325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388513
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16048	NC_009633	GTC	2	6	718407	718412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388513
16049	NC_009633	GGA	2	6	718461	718466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388513
16050	NC_009633	AAC	2	6	718478	718483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388513
16051	NC_009633	ATCT	2	8	718521	718528	25 %	50 %	0 %	25 %	150388513
16052	NC_009633	ATA	2	6	718531	718536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388513
16053	NC_009633	GA	3	6	718648	718653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_009633	GAT	2	6	718688	718693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_009633	GTG	2	6	718709	718714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388514
16056	NC_009633	A	6	6	718742	718747	100 %	0 %	0 %	0 %	150388514
16057	NC_009633	TTA	2	6	718794	718799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388514
16058	NC_009633	ATT	2	6	718804	718809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388514
16059	NC_009633	AAT	2	6	718850	718855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388514
16060	NC_009633	GGAT	2	8	719272	719279	25 %	25 %	50 %	0 %	150388514
16061	NC_009633	ATT	2	6	719370	719375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388514
16062	NC_009633	GTAT	2	8	719411	719418	25 %	50 %	25 %	0 %	150388514
16063	NC_009633	CAT	2	6	719488	719493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388514
16064	NC_009633	TGCC	2	8	719517	719524	0 %	25 %	25 %	50 %	150388514
16065	NC_009633	AGAT	2	8	719550	719557	50 %	25 %	25 %	0 %	150388514
16066	NC_009633	CAAG	2	8	719599	719606	50 %	0 %	25 %	25 %	150388514
16067	NC_009633	AGA	2	6	719626	719631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388514
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16069	NC_009633	GA	3	6	719646	719651	50 %	0 %	50 %	0 %	150388514
16070	NC_009633	AC	3	6	719658	719663	50 %	0 %	0 %	50 %	150388514
16071	NC_009633	TGT	2	6	719731	719736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388514
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16073	NC_009633	CAA	2	6	719802	719807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388514
16074	NC_009633	GT	3	6	719814	719819	0 %	50 %	50 %	0 %	150388514
16075	NC_009633	AGT	2	6	719854	719859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388514
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16078	NC_009633	CCCT	2	8	719967	719974	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16079	NC_009633	GGA	2	6	720010	720015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16087	NC_009633	GGT	2	6	720294	720299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388515
16088	NC_009633	AT	3	6	720332	720337	50 %	50 %	0 %	0 %	150388515
16089	NC_009633	AGC	2	6	720392	720397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388515
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16091	NC_009633	CTT	2	6	720556	720561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388515
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16093	NC_009633	CAAA	2	8	720583	720590	75 %	0 %	0 %	25 %	150388515
16094	NC_009633	TCAA	2	8	720643	720650	50 %	25 %	0 %	25 %	150388515
16095	NC_009633	GGTG	2	8	720689	720696	0 %	25 %	75 %	0 %	150388515
16096	NC_009633	GA	3	6	720697	720702	50 %	0 %	50 %	0 %	150388515
16097	NC_009633	GCA	2	6	720726	720731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388515
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16100	NC_009633	TTA	2	6	720918	720923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388515
16101	NC_009633	A	6	6	720928	720933	100 %	0 %	0 %	0 %	150388515
16102	NC_009633	AATAAC	2	12	721027	721038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150388515
16103	NC_009633	CAT	2	6	721078	721083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_009633	T	8	8	721132	721139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_009633	TTA	2	6	721194	721199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_009633	TAA	2	6	721231	721236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_009633	GAA	2	6	721340	721345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388516
16108	NC_009633	GTG	2	6	721376	721381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388516
16109	NC_009633	GCA	2	6	721400	721405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388516
16110	NC_009633	ATG	2	6	721515	721520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388516
16111	NC_009633	TGT	2	6	721525	721530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388516
16112	NC_009633	AC	3	6	721532	721537	50 %	0 %	0 %	50 %	150388516
16113	NC_009633	TAA	2	6	721674	721679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388516
16114	NC_009633	T	6	6	721721	721726	0 %	100 %	0 %	0 %	150388516
16115	NC_009633	CAT	2	6	721785	721790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388516
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16117	NC_009633	ATG	2	6	721878	721883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388516
16118	NC_009633	CACCCA	2	12	721911	721922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388516
16119	NC_009633	TGA	2	6	721969	721974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388516
16120	NC_009633	AGA	2	6	721981	721986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388516
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16122	NC_009633	TGA	2	6	722026	722031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388516
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16352	NC_009633	TGC	2	6	733549	733554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388526
16353	NC_009633	CAAG	2	8	733613	733620	50 %	0 %	25 %	25 %	150388526
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16364	NC_009633	GA	3	6	734306	734311	50 %	0 %	50 %	0 %	150388527
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