MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009633	TTA	2	6	518295	518300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388338
11502	NC_009633	GTA	2	6	518307	518312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388338
11503	NC_009633	ATAC	2	8	518419	518426	50 %	25 %	0 %	25 %	150388338
11504	NC_009633	ATAAG	2	10	518499	518508	60 %	20 %	20 %	0 %	150388338
11505	NC_009633	ATC	2	6	518651	518656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388338
11506	NC_009633	TTC	2	6	518660	518665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388338
11507	NC_009633	GAA	2	6	518741	518746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388338
11508	NC_009633	CATTC	2	10	518808	518817	20 %	40 %	0 %	40 %	150388338
11509	NC_009633	ATT	2	6	518827	518832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388338
11510	NC_009633	ATT	2	6	518906	518911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388338
11511	NC_009633	ACT	2	6	518938	518943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388338
11512	NC_009633	AGC	2	6	518953	518958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388338
11513	NC_009633	A	6	6	519010	519015	100 %	0 %	0 %	0 %	150388338
11514	NC_009633	TGGG	2	8	519120	519127	0 %	25 %	75 %	0 %	150388338
11515	NC_009633	GCA	2	6	519146	519151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388338
11516	NC_009633	CAG	2	6	519156	519161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388338
11517	NC_009633	ATG	2	6	519236	519241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388338
11518	NC_009633	GCA	2	6	519329	519334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388338
11519	NC_009633	CGGTGC	2	12	519346	519357	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	150388338
11520	NC_009633	ATA	2	6	519378	519383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388338
11521	NC_009633	AT	3	6	519439	519444	50 %	50 %	0 %	0 %	150388338
11522	NC_009633	ATC	2	6	519470	519475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388338
11523	NC_009633	TAATT	2	10	519531	519540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_009633	A	6	6	519642	519647	100 %	0 %	0 %	0 %	150388339
11525	NC_009633	A	6	6	519722	519727	100 %	0 %	0 %	0 %	150388339
11526	NC_009633	AGA	2	6	519742	519747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388339
11527	NC_009633	TAAA	2	8	519783	519790	75 %	25 %	0 %	0 %	150388339
11528	NC_009633	ATG	2	6	519885	519890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388339
11529	NC_009633	TA	3	6	519899	519904	50 %	50 %	0 %	0 %	150388339
11530	NC_009633	TGTT	2	8	519952	519959	0 %	75 %	25 %	0 %	150388339
11531	NC_009633	CTT	2	6	519981	519986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388339
11532	NC_009633	CAA	2	6	520041	520046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388339
11533	NC_009633	TATT	2	8	520047	520054	25 %	75 %	0 %	0 %	150388339
11534	NC_009633	GA	3	6	520159	520164	50 %	0 %	50 %	0 %	150388339
11535	NC_009633	CAGC	2	8	520215	520222	25 %	0 %	25 %	50 %	150388339
11536	NC_009633	ATGT	2	8	520231	520238	25 %	50 %	25 %	0 %	150388339
11537	NC_009633	GGCTC	2	10	520265	520274	0 %	20 %	40 %	40 %	150388339
11538	NC_009633	TCC	2	6	520299	520304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150388339
11539	NC_009633	GAAG	2	8	520378	520385	50 %	0 %	50 %	0 %	150388339
11540	NC_009633	ATT	2	6	520400	520405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388339
11541	NC_009633	CTA	2	6	520428	520433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388339
11542	NC_009633	TGA	2	6	520498	520503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388339
11543	NC_009633	GGA	2	6	520580	520585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388339
11544	NC_009633	CTT	2	6	520690	520695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388339
11545	NC_009633	TGA	2	6	520843	520848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388339
11546	NC_009633	GAA	2	6	520892	520897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388339
11547	NC_009633	GA	3	6	520923	520928	50 %	0 %	50 %	0 %	150388339
11548	NC_009633	TGTAAT	2	12	520942	520953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150388339
11549	NC_009633	TTGT	2	8	521013	521020	0 %	75 %	25 %	0 %	150388339
11550	NC_009633	TGAC	2	8	521052	521059	25 %	25 %	25 %	25 %	150388339
11551	NC_009633	GTG	2	6	521082	521087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388339
11552	NC_009633	GCT	2	6	521114	521119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388339
11553	NC_009633	AGG	2	6	521122	521127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388339
11554	NC_009633	TGT	2	6	521191	521196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388339
11555	NC_009633	TCA	2	6	521219	521224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388339
11556	NC_009633	TTG	2	6	521244	521249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388339
11557	NC_009633	ACC	2	6	521278	521283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388339
11558	NC_009633	ACC	2	6	521375	521380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_009633	TA	3	6	521385	521390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_009633	TA	3	6	521427	521432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_009633	TA	3	6	521556	521561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_009633	TA	3	6	521575	521580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_009633	ATT	2	6	521589	521594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_009633	AT	3	6	521617	521622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_009633	AGG	2	6	521663	521668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_009633	ACA	2	6	521695	521700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388340
11567	NC_009633	AC	3	6	521714	521719	50 %	0 %	0 %	50 %	150388340
11568	NC_009633	TA	3	6	521729	521734	50 %	50 %	0 %	0 %	150388340
11569	NC_009633	ATGA	2	8	521797	521804	50 %	25 %	25 %	0 %	150388340
11570	NC_009633	TGG	2	6	521861	521866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388340
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11572	NC_009633	ATG	2	6	521936	521941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388340
11573	NC_009633	TGA	2	6	521976	521981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388340
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11575	NC_009633	TGA	2	6	521997	522002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388340
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11581	NC_009633	A	7	7	522230	522236	100 %	0 %	0 %	0 %	150388340
11582	NC_009633	TTC	2	6	522306	522311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388340
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11587	NC_009633	TAAAA	3	15	522567	522581	80 %	20 %	0 %	0 %	150388340
11588	NC_009633	AGG	2	6	522599	522604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_009633	AGA	2	6	522644	522649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388341
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11592	NC_009633	GT	3	6	522925	522930	0 %	50 %	50 %	0 %	150388341
11593	NC_009633	ATTG	2	8	522993	523000	25 %	50 %	25 %	0 %	150388341
11594	NC_009633	CCAT	2	8	523053	523060	25 %	25 %	0 %	50 %	150388341
11595	NC_009633	TAA	2	6	523153	523158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388341
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11597	NC_009633	TGA	2	6	523205	523210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388341
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11603	NC_009633	TGG	2	6	523468	523473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388341
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11607	NC_009633	TCTA	2	8	523555	523562	25 %	50 %	0 %	25 %	150388341
11608	NC_009633	ACA	2	6	523616	523621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388341
11609	NC_009633	TA	3	6	523671	523676	50 %	50 %	0 %	0 %	150388341
11610	NC_009633	AAGA	2	8	523695	523702	75 %	0 %	25 %	0 %	150388341
11611	NC_009633	AT	3	6	523705	523710	50 %	50 %	0 %	0 %	150388341
11612	NC_009633	A	6	6	523785	523790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_009633	G	6	6	523805	523810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_009633	TGT	2	6	523858	523863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388342
11615	NC_009633	AGCT	2	8	523878	523885	25 %	25 %	25 %	25 %	150388342
11616	NC_009633	GGC	2	6	523990	523995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150388342
11617	NC_009633	AGA	2	6	524110	524115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388342
11618	NC_009633	GCT	2	6	524135	524140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388342
11619	NC_009633	GCT	2	6	524186	524191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388342
11620	NC_009633	AAGA	2	8	524210	524217	75 %	0 %	25 %	0 %	150388342
11621	NC_009633	GAA	2	6	524237	524242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388342
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11989	NC_009633	CAG	2	6	541244	541249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388355
11990	NC_009633	CCA	3	9	541250	541258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388355
11991	NC_009633	AGAT	2	8	541384	541391	50 %	25 %	25 %	0 %	150388355
11992	NC_009633	ATC	2	6	541422	541427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388355
11993	NC_009633	TCA	2	6	541576	541581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388355
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11995	NC_009633	CCA	2	6	541638	541643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388355
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11997	NC_009633	GAT	2	6	541725	541730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388355
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11999	NC_009633	A	7	7	541746	541752	100 %	0 %	0 %	0 %	150388355
12000	NC_009633	TAT	2	6	541760	541765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388355

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